2014-2020年上海市青浦区HIV抗体筛查和确证试验结果分析

目的了解辖区近年HIV检测工作情况,为艾滋病检测质量管理和艾滋病防治提供依据。方法对2014-2020年初筛有反应标本,按照《全国艾滋病检测技术规范(2009年、2015年和2020年修订版)》要求,分别采用四代酶联免疫吸附试验法(ELISA)、三/四带化学发光法、胶体硒法进行复检,对复检任一方法有反应标本采用免疫印迹法(Western Blot)进行确证。结果1374份复检有反应标本进行抗体补充试验,阳性为1156(84.13%),阴性为148份(10.77%),不确定为70份(5.10%);VCT门诊和医疗机构门诊是发现HIV感染的主要方式,ELISA法和胶体硒法复核有反应确证阳性率为95.12%,胶体硒法两种试剂复核均有反应确证阳性率为90.45%,高于单一ELISA法或胶体硒法复核。确证阳性15~40岁人群占多数(70.76%),其次为50岁以上人群(17.56%);男性∶女性为36.3∶1;确证阳性标本的S/CO比值>不确定标本>阴性标本;不确定标本中,p24和gp160条带出现频率分别为62.86%和52.86%,同时含有gp160、p24条带随访进展为阳性的占62.50%(10/16)。结论四代ELISA和胶体硒法联合复核能有效降低假阳性率,复检S/CO比值大小和确证条带分布有一定提示作用,对于不确定但条带有两条以上且筛查S/CO比值较高的标本,应及时进行核酸检测等补充试验或者积极跟进随访;加强青壮年和老年男性的艾滋病防病宣教。

上海市青浦地区成人腹泻病中沙门氏菌的感染状况和流行病学特征

目的了解上海市青浦地区成人腹泻病中沙门氏菌的感染状况和流行病学特征。方法选择2015年1月至2017年12月上海市青浦区某三级医院所有初诊疑似细菌性腹泻病例为研究对象,采集粪便标本进行肠道多病原分离,对实验室检测收集到的沙门氏菌采用玻片凝集试验进行血清分群。结果7 307例腹泻患者中,330例检出沙门氏菌,分离率为4.52%,其中259例(3.54%)为单一感染,71例(0.97%)为混合感染,混合感染占沙门氏菌检出例数的21.52%(71/330);沙门氏菌血清型以B、C群为主(63.03%),沙门氏菌感染引起的腹泻2-11月均有发生,流行以夏秋季多见,60岁以上年龄组(6.38%)和农民(6.46%)的检出率最高;临床症状以水样便腹泻为主,伴随脐周阵发性腹痛和恶心等症状;混合感染以C群沙门氏菌多见(29.11%);与单一感染相比,混合感染发热率较低,呕吐、腹痛和恶心的发生率较高,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论青浦区沙门氏菌混合感染较高,且临床症状较单一感染严重,有特有的流行特征和优势血清型,应强化重点人群健康行为的教育与干预,以降低沙门氏菌腹泻病的发生。

不同标本前处理方法对新型冠状病毒核酸检测结果的影响

目的分析不同标本前处理方法对新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸检测结果的影响。方法选取该院SARS-CoV-2核酸检测结果为阳性的18份未灭活咽拭子标本为研究对象。分别采用56℃金属浴30 min、56℃金属浴60 min、56℃水浴30 min、56℃水浴60 min、化学裂解15 min、化学裂解30 min 6种方法进行标本前处理,分析各方法处理后的检测结果。结果经56℃水浴30 min、56℃水浴60 min处理后,开放读码框1ab(ORF1ab)基因检出率分别为94.44%、100.00%,核衣壳蛋白(N)基因检出率均为100.00%,假阴性率均为0.00%。经56℃金属浴30 min、56℃金属浴60 min处理后,ORF1ab基因检出率分别为83.33%、77.78%,N基因检出率分别为88.89%、77.78%,假阴性率均为5.56%。经化学裂解15 min、化学裂解30 min处理后,ORF1ab基因检出率分别为77.78%、50.00%,N基因检出率分别为77.78%、61.11%,假阴性率分别为11.11%、38.89%。结论SARS-CoV-2核酸检测标本前处理方法应首选56℃水浴60 min和56℃水浴30 min,而化学裂解法对标本核酸检测结果影响最大,不建议在日常实验中使用。

2020年上海市青浦区肉制品中单增李斯特菌分子分型及耐药性分析

为了解2020年上海市青浦区肉制品中单增李斯特菌的污染状况、分子分型及耐药情况,按照《国家食品污染和有害因素风险监测工作手册》检测肉制品中的单增李斯特菌,使用微量肉汤稀释法(MIC法)进行抗菌药物敏感性试验,应用PFGE分子分型并采用BioNumerics软件分析聚类。结果显示,111份肉制品中单增李斯特菌的检出率为12.61%,生、熟肉制品的检出率存在统计学差异(χ_(c)^(2)=29.09,P<0.05)。药敏试验表明,一株菌多重耐药——所有株菌对头孢西丁均耐药(100%),其次为苯唑西林(21.43%)。PFGE结果表明,LM聚类分析呈整体多态性且无聚集。结论为,2020年上海市青浦区肉制品中,鸡肉类生肉制品的单增李斯特菌污染情况严重,对头孢西丁完全耐药,极个别菌株存在多重耐药率。此外,分型带型存在多态性,为散发污染。因此,应加强对肉制品的安全监测,关注耐药菌株发展趋势,预防爆发性食品安全事件。

不同抽提方式在流行性感冒病毒检测中的抽提效率研究

目的比较普通抽提法和快速抽提法对实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测流行性感冒(流感)病毒结果的影响。方法采用同一品牌快速核酸抽提试剂和普通核酸抽提试剂抽提经稀释不同倍数的流感病毒毒株,采用实时荧光定量PCR测定抽提核酸的Ct值,比较两种方法的抽提效率和重复性。结果普通抽提法在不同稀释倍数下Ct值均值均小于快速抽提法;普通抽提法在原液至107稀释倍数下Ct值变异系数(CV)均小于快速抽提法;原液至106稀释倍数,普通抽提法和快速抽提法检出率均为100%;107稀释倍数下,普通抽提法和快速抽提法检出率分别为100%、50%;108稀释倍数下,普通抽提法和快速抽提法检出率分别为75%、0;稀释至109稀释倍数后,两者检出率均为0。结论普通抽提法较快速抽提法抽提效率高、重复性好、检出率高,在抽提高病毒含量标本时两种方法均可使用,抽提低病毒含量标本或复杂标本中推荐使用普通抽提法。

上海市青浦区2005-2020年肺结核流行特征分析

目的了解上海市青浦区肺结核的流行特征,为结核病预防控制提供科学依据。方法对2005-2020年青浦区登记管理的活动性肺结核患者数据采用描述性流行病学方法进行分析。结果2005-2020年,青浦区居民的肺结核患者登记率总体呈下降趋势,平均年登记率为25.68/105,其中上海沪籍和非沪籍居民的登记率分别为30.39/105和21.77/105。男性和女性患者的比例为2.37:1。非沪籍患者占比最高的职业为农民工(28.17%)、家政服务(20.38%)、工人(15.13%);沪籍患者占比最高的职业为农民(26.59%)、离退休人员(24.22%)、其他(11.52%)。非沪籍患者年龄以20~29岁(38.82%)、30~39岁(26.03%)及40~49岁(14.62%)为主,沪籍患者年龄以60~69岁(18.46%)和50~59岁(18.11%)为主。非沪籍居民发病高峰在6月份(10.65%),沪籍居民发病高峰在7月份(10.77%)。结论青浦区应加强非沪籍人群的肺结核防控力度,同时也要加强沪籍老年人、农民工和学生的肺结核防控工作。

基于腹泻多病原监测研究副溶血性弧菌的感染状况和疾病负担

目的 了解上海市青浦区副溶血性弧菌腹泻病感染状况和疾病负担。方法 2015年1月至2016年12月,选择上海市青浦区某三级医院所有初诊疑似细菌性腹泻病例为研究对象,采集粪便标本进行肠道多病原分离,对实验室诊断为副溶血性弧菌的食源性腹泻病例通过入户调查方式了解其医疗费用。结果 6 129例腹泻患者中,确诊为细菌性腹泻患者1 092例（17.82%,1 092/6 129）,其中646例检出副溶血性弧菌,分离率为10.54%,578例为单一感染（9.43%）,68例为混合感染（1.10%）;95.50%的副溶血性弧菌菌株携有直接溶血素基因（tdh）;流行峰值7—8月,病例以40~60岁年龄组和农民较常见;混合感染以感染副溶血性弧菌和沙门菌最常见,与单一感染相比,发热率差异有统计学意义（χ~2=8.003,P〈0.05）。副溶血性弧菌阳性病例直接医疗费用为（338.75±191.45）元,直接非医疗费用（59.83±74.94）元;农村患者的直接医疗费用和间接非医疗费用均高于城市（P〈0.05）;治疗中抗生素使用比率较高,且使用抗生素的直接医疗费用高于不使用抗生素组（t=2.531,P〈0.05）。结论 副溶血性弧菌腹泻病例症状较轻,发病率较高,存在一定混合感染;农民的疾病负担较重。应强化重点人群卫生知识宣传,提倡就近治疗和优化诊疗方式,以降低经济负担。

2015-2016年上海市青浦区副溶血性弧菌菌型分布及耐药分析

目的掌握上海市青浦区近几年副溶血性弧菌的菌型分布和耐药情况。方法搜集2015-2016年两年间副溶血性弧菌,利用血清凝集法分析血清型分布、PCR检测毒力基因分布、大流行株基因和耐药抗性基因的携带情况,采用肉汤稀释法测定副溶血性弧菌MIC值并分析其耐药性。结果在获得的202株菌株血清分型中共16种血清型,以O3群(54.95%)为主,其次是O4群(38.12%)。95.62%(n=457)的菌株携带tdh毒力基因;以tdh+的O3∶K6大流行克隆株为主,携带toxRS new和丝状噬菌体(orf8)基因。副溶血性弧菌主要对头孢唑啉、阿莫西林/克拉维酸和氨苄西林出现较严重耐药情况,耐药基因筛选结果:TEM基因有3株阳性,SHV基因有1株阳性,未发现OXA基因阳性。结论上海市青浦区副溶血性弧菌菌型以O3群为主,尤其tdh+的O3∶K6大流行克隆株,携带toxRS new和orf8基因。目前副溶血性弧菌对美国疾控中心推荐用药处于敏感状态,耐药抗性基因值得关注。