基于多层网络控制的个体化癌症驱动基因识别方法

目的识别癌症驱动基因,特别是罕见或个体特异性癌症驱动基因,对精准肿瘤学至关重要。考虑到肿瘤间的高度异质性,最近有一些方法尝试在个体水平上识别癌症驱动基因。然而,这些方法大多是将多组学数据整合到单一生物分子网络(如基因调控网络或蛋白质相互作用网络)中来识别癌症驱动基因,容易忽略不同网络所特有的重要相互作用信息。为了整合不同生物分子网络的相互作用数据,促进癌症驱动基因识别,迫切需要发展一种多层网络方法。方法本文提出了一种多层网络控制方法(PDGMN),利用多层网络识别个体化癌症驱动基因。首先,利用基因表达数据构建针对个体病人的个体化多层网络,其中包括蛋白质相互作用层和基因相互关联层。然后,整合突变数据,对个体化多层网络中的节点进行加权。最后,设计了一种加权最小顶点覆盖集识别算法,找到个体化多层网络中的最优驱动节点集,以提高个体化癌症驱动基因的识别效果。结果在三个TCGA癌症数据集上的实验结果表明,PDGMN在个体化驱动基因识别方面优于其他现有方法,并能有效识别个体病人的罕见癌症驱动基因。特别是,在不同生物分子网络上的实验结果表明,PDGMN能够捕获不同生物分子网络的独有特征,从而改进癌症驱动基因的识别结果。结论PDGMN能有效识别个体化癌症驱动基因,并从多层网络的视角,加深我们对癌症驱动基因识别的理解。本文所用的源代码和数据集可以从https://github.com/NWPU-903PR/PDGMN获取。

基于支持向量机的蛋白质同源寡聚体分类研究

基于支持向量机和贝叶斯方法 ,从蛋白质一级序列出发对蛋白质同源二聚体、同源三聚体、同源四聚体、同源六聚体进行分类研究 ,结果表明 :基于支持向量机 ,采用“一对多”和“一对一”策略 ,其分类总精度分别为 77 3 6%和 93 43 % ,分别比基于贝叶斯协方差判别法的分类总精度 50 64%提高 2 6 72和 42 79个百分点 .从而说明支持向量机可用于蛋白质同源寡聚体分类 ,且是一种非常有效的方法 .对于多类蛋白质同源寡聚体分类 ,基于相同的机器学习方法 (如支持向量机 ) ,采用“一对一”策略比“一对多”效果好 .

基于支持向量机和贝叶斯方法的蛋白质四级结构分类研究

用支持向量机和贝叶斯两种方法对蛋白质四级结构进行分类研究。结果表明,基于支持向量机的分类结果最好,其10CV检验的总分类精度、正样本正确预测率、Matthes相关系数和假阳性率分别为74.2%、84.6%、0.474、38.9%;基于贝叶斯的分类结果没有支持向量机的分类结果好,但其10CV检验的假阳性率最低(15.9%)。这些结果说明同源寡聚蛋白质一级序列包含四级结构信息,同时特征向量的确表示了埋藏在缔合亚基作用部位接触表面的基本信息。

高超声速风洞进气道流量系数测量精度影响因素研究

进气道是飞行器动力装置的重要组成部分,准确测量进气道流量系数是进气道风洞试验的重要内容。对来流马赫数Ma=4.5,5.0和6.0状态下皮托管进气道开展流量系数测量研究,通过对比理论值和实测值,获取各状态流量系数修正系数。试验结果表明,随着来流马赫数增加,进气道流量系数与理论值偏差较明显,并逐渐增大。超声速风洞试验通常认为测量截面总温与来流总温相等,通过对测量截面总温与来流总温偏差以及测量截面流场畸变情况的分析,判断测量偏差主要是由测量截面总温等于来流总温的假设导致的。在高超声速风洞试验中,由于模型壁面热交换的存在,测量截面总温低于来流总温,进气道流量系数测量时需要进行总温修正,以提高流量测量精度。

基于用户分析的微博用户影响力度量模型

微博用户影响力作为影响力研究在微博领域的延伸,已逐渐成为一个研究热点。该文在传统影响力度量指标的基础上,结合微博价值、消息传播过程中产生的影响力扩散以及用户的活跃程度,提出了三种新影响力度量方法,包括微博影响力、行为影响力以及活跃度影响力。此外,通过有效融合上述三种新度量方法提出了新的微博用户影响力度量模型。最后,针对不同影响力度量指标,该文对它们的内部关系进行分析,并阐述了影响力度量指标之间关联程度及形成原因。

基于概率的信任传播模型

社会网络中,用户之间的信任关系可以为用户判别信息是否可信提供依据。现有的信任计算方法一般是通过搜索节点之间的路径,再在其上添加各种其它限制,如路径长度、信任度下界等来计算信任度,而考虑节点之间的相似性的方法却很少。从节点之间的相似性出发,在信任传播模型的基础上,结合贝叶斯条件概率公式,提出了基于概率的信任传播模型。同时分析了信任传播模型中衰减系数对结果的影响;通过统计分析数据,得出具有信任关系的用户之间的相似度要比不具有信任关系的用户之间的相似度高得多,从而证明了贝叶斯理论可显著提高信任传播算法的有效性。在Epinion数据集上进行的实验证明了该方法的有效性。

充血性心力衰竭患者血清高敏肌钙蛋白T水平变化及其临床意义

目的:探讨充血性心力衰竭(CHF)患者血清高敏肌钙蛋白T(hs-cTNT)水平变化及临床意义。方法:700例CHF患者采用电化学发光法测定血清N未端B型钠尿肽原(NT-proBNP)和hs-cTNT水平,所有患者根据纽约心功能分级标准分为Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ级组。另随机抽取100例健康体检者为对照组。结果:CHF组血清NT-proBNP及hs-cTNT水平高于非CHF组,心衰组患者随心衰分级增加NT-proBNP及hs-cTNT水平也逐渐增加,各组间差异有统计学意义(P<0.05)。CHF控制前后hs-cTNT及NT-proBNP明显下降,组间差异有统计学意义(P<0.01)。结论:hs-cTNT的水平对CHF的诊断和CHF患者严重程度的评估、疗效评价具有一定临床意义。

数字信息长期保存的要求、难题及策略

Beginning with a discussion on the difficulties in the long-term preservation of digital information,this paper introduces some strategies for the long-term preservation of digital information,e .g .technical strategy,safety strategy and management strategy .

框架结构整体抗震加固试验

目的验证一种新的单一结构体系整体抗震加固方法的可行性.方法通过对一榀框架和采用方钢管混凝土柱加固的双榀框架在水平低周反复荷载作用下的拟静力试验的对比,分析其抗侧承载力、刚度并判断两个框架的抗震能力,与理论值进行比较.结果试件滞回曲线表明,当达到极限荷载后,还能承受数次往复作用,特别是增设剪切型抗侧力单元的加固试件,其骨架曲线的平行段较长,表现了较强的耗能能力,充分体现了方钢管混凝土柱作为加固单元的优点.当加固后构件的抗侧刚度是原来刚度的2.1倍时,提高了框架结构的抗震能力,可以满足抗震设防烈度由7°提高到7.5°的抗震设防要求.结论对于因设防烈度提高而不满足抗震承载力要求的框架结构增设剪切型抗侧力单元,增加其抗侧刚度,有较强的耗能能力,提高了框架结构的抗震承载力.

基于主题模型的新疆暴恐舆情分析

随着互联网的飞速发展,网络舆情引发的问题也越发突出。尤其是近年来发生的新疆暴恐事件,已成为公众关注的焦点。主题演化是网络舆情分析的重要内容之一,为了把握关于新疆的舆情动态,该文从主题热度变化、内容变化及关键词等多方面进行了研究。该文首先抓取了2013年1月到2015年12月互联网中关于新疆暴恐事件的新闻,并以此作为数据集建立了动态主题模型,实现对新闻的主题演化分析。该模型采用两次非负矩阵分解来生成主题,以层级式狄利克雷过程为对比实验,通过可视化分析与比较,总结出新疆暴恐事件的一些规律。

增设翼墙加固钢筋混凝土柱受力性能分析

为了研究轴压比、翼墙厚度对增设翼墙加固的钢筋混凝土柱在低周反复荷载作用下受力性能的影响,在考虑加固柱的二次受力特性的前提下,采用数值模拟的方法分析加固柱的荷载位移滞回曲线和骨架曲线。结果表明:随着轴压比的增大,加固柱承载力、刚度增加,延性降低;翼墙厚度的变化对加固柱的承载力影响较小,但能够提高柱的耗能能力。

装配式夹芯保温板拉结件性能指标评价体系研究

目的研究装配式夹芯保温板墙体拉结件的技术性能,构建评价体系,提供拉结件选用标准,实现装配式夹芯保温墙板质量和安全性能的提升.方法定义材料性能、结构性能、提升性能为一级指标,强度、弹性模量等九项性能为二级指标,通过隶属度分类法获得相似度评分,用层次分析法构建成对比较判别矩阵并确定指标权重,通过调研国内外相关规范指南和技术手册为指标评分提供依据,最后提出装配式夹芯保温墙板拉结件性能指标评价体系.结果选取某装配式夹芯保温墙板项目进行分析,对两种不同材质拉结件进行性能指标评价评分,分别得出评价结果,判别哪一种拉结件更适用于实际工程.同时对高性拉结件进行判别,验证了评价模型应用的可行性.结论针对拉结件深化设计建立指标评价模型,对于提升装配式夹芯保温墙板各方面性能具有重要意义.

作品数字化的复制权问题研究

界定了作品数字化的性质,论述了作品数字化复制权的中外立法概况,分析了作品数字化中临时复制的问题,并对我国作品数字化的复制权作了认真的思考。

虚拟参考咨询服务中的版权保护研究

分析了虚拟参考咨询服务所面临的版权问题,提出了虚拟参考咨询服务的版权保护策略.

肺泡灌洗液中肿瘤标志物的联合检测在肺癌诊断中的价值

目的:探讨支气管肺泡灌洗液(BALF)3种肿瘤标志物癌胚抗原(CEA)、细胞角蛋白片段211(CY-FRA211)、神经元特异性烯醇化酶(NSE)对肺癌的临床诊断价值。方法:采用电化学发光法分别检测90例肺癌患者、60例肺部良性病变患者血清及BALF中CEA、CYFRA 211和NSE的含量。结果:肺癌患者BALF中3种肿瘤标志物的含量明显高于肺部良性病变患者(P<0.05),且随着TNM临床分期升高,肿瘤标志物的含量也明显升高。在不同病理类型的肺癌中,3种肺癌肿瘤标志物升高的程度均有所不同。BALF中肿瘤标志物的含量与同期血清中的含量相比,出现更早且浓度更高。结论:肺癌患者BALF中CEA、CYFRA211、NSE联合检测对肺癌诊断有更高的临床参考价值。

基于支持向量机的多类蛋白质折叠子预测

基于支持向量机 ,以氨基酸组成成分、氨基酸组成成分与氨基酸残基指数自相关函数组合两种特征提取方法构成的特征向量表示蛋白质序列 ,对多类蛋白质折叠子问题进行了相关研究。结果表明 ,由氨基酸组成成分与氨基酸残基指数自相关函数组合构成的特征参数集 (其参数集以符号HOPT、PARJ、PONP、WOLS表示 ) ,其预测精度比氨基酸组成成分特征参数集有不同程度的提高。对于独立测试样本集 ,HOPT结果较好 ,采用“唯一的一对多”策略 ,其总预测精度为 41 .91 % ,比氨基酸组成成分提高 6.94个百分点 ,这些结果说明自相关函数含有一定的蛋白质空间折叠信息 ,支持向量机对于小样本分类预测是一种非常有效的方法。

基于加权自相关函数特征提取法的多类蛋白质同源寡聚体分类研究

我们提出一种新的特征提取方法,即用蛋白质序列的氨基酸组成成分和一系列的氨基酸残基指数加权自相关函数构成特征向量,表示蛋白质序列,与支持向量机算法组合对蛋白质同源二聚体、同源三聚体、同源四聚体、同源六聚体进行分类研究,得到较好的分类结果。在Jackknife检验下,采用支持向量机算法,基于此新特征提取法所构成的参数集QIANA、QIANB、MEEJ、ROBB和SNEP的总分类精度分别为77.63%、77.16%、76.46%、76.70%、75.06%,分别比传统氨基酸组成成分特征提取法(参数集为COMP)提高6.39、5.92、5.22、5.46、3.82个百分点。对于参数集QIANA,支持向量机的总分类精度为77.63%,比协方差算法提高16.29个百分点。这些结果表明:(1新特征提取法是有效和可行的,基于此特征提取法构成的特征向量包含蛋白质四级结构信息,且可能捕获了埋藏在缔合亚基作用部位接触表面的基本信息;(2)对于蛋白质同源寡聚体分类研究,支持向量机是非常有效的。

心力衰竭患者血清N端脑钠肽前体和同型半胱氨酸的测定及临床意义

目的:探讨心力衰竭(CHF)患者血清N端脑钠肽前体(NT-proBNP)及同型半胱氨酸(Hcy)水平变化及其临床意义。方法:260例CHF患者分别采用电化学发光法测定NT-proBNP和循环酶法测定Hcy水平,所有患者根据纽约心功能分级标准分为、、级组。另随机抽取80例健康体检者为对照组。结果:1CHF组血清NT-proBNP及Hcy水平高于非CHF组,心衰组患者随心衰分级增加NT-proBNP及Hcy水平也逐渐增加,各组间差异有统计学意义(P<0.01)。2心衰患者经治疗后控制组较控制前血清NT-proBNP及Hcy水平明显下降,两组间差异有统计学意义(P<0.01)。3血清NT-proBNP及Hcy水平均与LVEF呈负相关,通过直线相关分析显示HCY的增加与NT-proBNP的增加具有正相关关系。结论:血清NT-proBNP和Hcy联合检测对CHF的诊断和CHF患者严重程度的评估、近期疗效的评价、预后均具有重要的临床指导意义。

预制钢桁架加固钢筋混凝土框架试验

目的验证一种新的框架结构整体抗震加固方法的可行性.方法对已损伤的一榀框架做预制钢桁架加固,并对加固后的试件进行水平低周反复荷载试验,分析其力学性能、变形能力、抗侧力体系的破坏特征,与理论值进行比较判断两个框架的抗震能力.结果加固后试件表现了较强的耗能能力,骨架曲线的平行段较长,其滞回曲线形状饱满,充分体现了预制钢桁架加固钢筋混凝土的优越性.加固后原框架承载力约提高了16%,框架的延性系数是原来的1.2倍,提高了框架结构的变形能力.结论预制钢桁架加固钢筋混凝土的方法可提高试件的承载力、耗能能力以及变形能力.