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ABA信号通路对葡萄果皮花青苷生物合成的调控机制研究
被引量:
8
1
作者
徐献斌
李慧
+2 位作者
耿晓月
郑焕
陶建敏
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第3期406-415,共10页
以‘红巴拉多’葡萄为试验材料,在转色前期(约花后6周)用300 mg/L的ABA对果穗进行处理,以清水处理为对照;测定不同发育时期葡萄果实的单果重、可滴定酸、可溶性固性物等生理指标,同时测定果皮中总花青苷及ABA含量;检测不同发育时期果皮...
以‘红巴拉多’葡萄为试验材料,在转色前期(约花后6周)用300 mg/L的ABA对果穗进行处理,以清水处理为对照;测定不同发育时期葡萄果实的单果重、可滴定酸、可溶性固性物等生理指标,同时测定果皮中总花青苷及ABA含量;检测不同发育时期果皮中ABA信号通路和花青苷生物合成相关基因表达量,克隆6个与花青苷生物合成相关基因的启动子,并预测启动子中的顺式作用元件,在转录调控水平上探讨ABA信号通路对葡萄果皮花青苷生物合成的调控作用。结果表明:(1)ABA处理的葡萄果实可溶性固形物含量明显提高、可滴定酸含量下降。(2)ABA处理显著提高了‘红巴拉多’葡萄果皮的着色水平以及总花青苷和ABA含量。(3)ABA处理后,9个ABA信号通路基因以及6个花青苷生物合成相关基因表达水平明显提高。(4)6个花青苷生物合成相关基因的启动子序列中均含有多个与ABA响应相关的ABRE作用元件。研究发现,9个ABA信号通路基因可能在葡萄果皮着色中发挥着重要作用,其中2个VvABFs转录因子可能直接作用于含有ABRE元件的花青苷生物合成相关基因的启动子序列,推测可通过调控这些基因的转录水平来调控葡萄果皮花青苷的积累。
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关键词
‘红巴拉多’葡萄
ABA
花青苷
基因表达
启动子
下载PDF
职称材料
基于转录组分析ABA促进葡萄花青苷积累相关基因
被引量:
3
2
作者
徐献斌
耿晓月
+3 位作者
李慧
孙丽娟
郑焕
陶建敏
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期134-151,共18页
【目的】分析参与调控ABA促进葡萄着色的相关基因,探讨ABA促进葡萄果实花青苷积累的分子机制。【方法】以‘红巴拉多’葡萄为试材,在转色前期(约花后6周)使用300 mg·L^(-1) ABA对果穗进行浸果处理,以清水处理为对照。观察表型,并...
【目的】分析参与调控ABA促进葡萄着色的相关基因,探讨ABA促进葡萄果实花青苷积累的分子机制。【方法】以‘红巴拉多’葡萄为试材,在转色前期(约花后6周)使用300 mg·L^(-1) ABA对果穗进行浸果处理,以清水处理为对照。观察表型,并利用超高液相色谱质谱联用仪(UPLC-MS)测定花青苷组分及含量,再利用转录组测序技术从分子水平对ABA促进花青苷积累的机制进行生物信息学分析。【结果】外源ABA处理3 d后,葡萄果实着色明显加深,花青苷种类和含量增多,其中芍药素3-O-葡萄糖苷、锦葵色素3-O-葡萄糖苷两种单体花青苷含量增加最为显著。分析ABA处理18 h和3 d后葡萄果实转录水平的差异,并通过KEGG富集分析发现了11个ABA信号通路基因以及52个与花青苷生物合成和转运相关的基因差异表达,它们均在外源ABA处理后表达上调。通过将差异基因与葡萄转录因子库进行比对,共发现297个转录因子差异表达。进一步分析差异转录因子表达模式,筛选与VvMYBA1表达模式相近的转录因子,发现15个MYB、bHLH、bZIP、NAC、Dof、HD-ZIP等家族的转录因子,其可能参与调控花青苷生物合成。启动子顺式作用元件分析表明,大部分筛选到的差异基因启动子中含有ABRE元件,说明这些差异表达基因的启动子可能为ABA诱导型启动子。对部分候选基因的表达模式进行实时荧光定量(qRT-PCR)分析,证实了RNA-seq的准确性。【结论】ABA促进葡萄花青苷积累涉及11个ABA信号转导、52个花青苷合成和转运相关基因,15个转录因子可能参与调控了这一生物过程。研究结果为揭示ABA促进葡萄花青苷积累的分子机制提供了一定基础。
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关键词
葡萄
花青苷
ABA
转录组
启动子
下载PDF
职称材料
题名
ABA信号通路对葡萄果皮花青苷生物合成的调控机制研究
被引量:
8
1
作者
徐献斌
李慧
耿晓月
郑焕
陶建敏
机构
南京农业大学园艺学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第3期406-415,共10页
基金
国家现代农业葡萄产业技术体系(CARS-29)
江苏农业产业技术体系(JATS[2020]398)
+3 种基金
江苏省农业重大新品种创制项目(PZCZ201723)
国家自然科学基金(31901975
31972384)
江苏省农业科技自主创新资金[CX(19)2029]。
文摘
以‘红巴拉多’葡萄为试验材料,在转色前期(约花后6周)用300 mg/L的ABA对果穗进行处理,以清水处理为对照;测定不同发育时期葡萄果实的单果重、可滴定酸、可溶性固性物等生理指标,同时测定果皮中总花青苷及ABA含量;检测不同发育时期果皮中ABA信号通路和花青苷生物合成相关基因表达量,克隆6个与花青苷生物合成相关基因的启动子,并预测启动子中的顺式作用元件,在转录调控水平上探讨ABA信号通路对葡萄果皮花青苷生物合成的调控作用。结果表明:(1)ABA处理的葡萄果实可溶性固形物含量明显提高、可滴定酸含量下降。(2)ABA处理显著提高了‘红巴拉多’葡萄果皮的着色水平以及总花青苷和ABA含量。(3)ABA处理后,9个ABA信号通路基因以及6个花青苷生物合成相关基因表达水平明显提高。(4)6个花青苷生物合成相关基因的启动子序列中均含有多个与ABA响应相关的ABRE作用元件。研究发现,9个ABA信号通路基因可能在葡萄果皮着色中发挥着重要作用,其中2个VvABFs转录因子可能直接作用于含有ABRE元件的花青苷生物合成相关基因的启动子序列,推测可通过调控这些基因的转录水平来调控葡萄果皮花青苷的积累。
关键词
‘红巴拉多’葡萄
ABA
花青苷
基因表达
启动子
Keywords
‘Benibalado’grape
ABA
anthocyanin
gene expression
promoter
分类号
Q945.6+5 [生物学—植物学]
Q789 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
基于转录组分析ABA促进葡萄花青苷积累相关基因
被引量:
3
2
作者
徐献斌
耿晓月
李慧
孙丽娟
郑焕
陶建敏
机构
南京农业大学园艺学院
出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期134-151,共18页
基金
国家现代农业葡萄产业技术体系(CARS-29)
国家自然科学基金(31901975,31972384)
+2 种基金
江苏农业产业技术体系(JATS[2021]450)
江苏省农业重大新品种创制项目(PZCZ201723)
国家重点研发计划(2020YFD1000204)。
文摘
【目的】分析参与调控ABA促进葡萄着色的相关基因,探讨ABA促进葡萄果实花青苷积累的分子机制。【方法】以‘红巴拉多’葡萄为试材,在转色前期(约花后6周)使用300 mg·L^(-1) ABA对果穗进行浸果处理,以清水处理为对照。观察表型,并利用超高液相色谱质谱联用仪(UPLC-MS)测定花青苷组分及含量,再利用转录组测序技术从分子水平对ABA促进花青苷积累的机制进行生物信息学分析。【结果】外源ABA处理3 d后,葡萄果实着色明显加深,花青苷种类和含量增多,其中芍药素3-O-葡萄糖苷、锦葵色素3-O-葡萄糖苷两种单体花青苷含量增加最为显著。分析ABA处理18 h和3 d后葡萄果实转录水平的差异,并通过KEGG富集分析发现了11个ABA信号通路基因以及52个与花青苷生物合成和转运相关的基因差异表达,它们均在外源ABA处理后表达上调。通过将差异基因与葡萄转录因子库进行比对,共发现297个转录因子差异表达。进一步分析差异转录因子表达模式,筛选与VvMYBA1表达模式相近的转录因子,发现15个MYB、bHLH、bZIP、NAC、Dof、HD-ZIP等家族的转录因子,其可能参与调控花青苷生物合成。启动子顺式作用元件分析表明,大部分筛选到的差异基因启动子中含有ABRE元件,说明这些差异表达基因的启动子可能为ABA诱导型启动子。对部分候选基因的表达模式进行实时荧光定量(qRT-PCR)分析,证实了RNA-seq的准确性。【结论】ABA促进葡萄花青苷积累涉及11个ABA信号转导、52个花青苷合成和转运相关基因,15个转录因子可能参与调控了这一生物过程。研究结果为揭示ABA促进葡萄花青苷积累的分子机制提供了一定基础。
关键词
葡萄
花青苷
ABA
转录组
启动子
Keywords
grape
anthocyanin
ABA
RNA-seq
promoter
分类号
S663.1 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
ABA信号通路对葡萄果皮花青苷生物合成的调控机制研究
徐献斌
李慧
耿晓月
郑焕
陶建敏
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
8
下载PDF
职称材料
2
基于转录组分析ABA促进葡萄花青苷积累相关基因
徐献斌
耿晓月
李慧
孙丽娟
郑焕
陶建敏
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022
3
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职称材料
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