基于单细胞多组学数据解析结直肠癌动态调控扰动

目的探讨结直肠癌恶性转变过程中的分子特征及其调控网络扰动,深入剖析结直肠癌恶性转变的微环境异质性并识别潜在治疗靶点。方法首先从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中收集单细胞转录组测序数据,从欧洲分子生物学实验室(EMBL)收集单细胞ATAC测序数据。数据共涉及来自14例患者的70例样本,包含22例正常样本、43例息肉样本和5例肿瘤样本。首先对scRNA-Seq测序数据进行预处理,基于Seurat包筛除双细胞和低质量细胞,对scATAC-Seq测序数据使用10X Cell Ranger-atac进行原始数据处理,并使用Signac包去除低质量细胞,得到三个阶段的scRNA-Seq和scATAC-Seq细胞图谱。进一步数据整合,基于Pando R包推断T细胞和上皮细胞的转录调控网络,通过mfinder软件分析网络motif和拓扑属性,对转录因子进行分级分析。最后,基于随机森林算法进行细胞分子特征预测及预后分析。结果筛选出202465个scRNA-Seq测序细胞和136422个scATAC-Seq测序细胞。基于数据整合分析,构建不同癌变阶段的细胞图谱。结果发现,随着结直肠癌进展,肿瘤微环境组成发生显著变化,尤其是T细胞和上皮细胞在不同疾病阶段的比例有较大差异。基于单细胞多组学数据整合,利用Pando包推断结直肠癌不同阶段的转录调控网络,揭示了T细胞和上皮细胞中转录因子及其调控关系的动态变化。功能富集分析结果显示在T细胞和上皮细胞中,转录因子所调控的功能在不同的疾病阶段有明显差异。基于转录调控网络分析发现,T细胞和上皮细胞转录调控网络符合无标度网络特性。网络motif分析揭示了在不同阶段存在的特定motif模式,反映了网络拓扑结构的动态变化,且网络中大多数相互作用都具有阶段特异性。共享转录因子的层级在癌变过程中也会发生变化。最后基于转录因子调控网络构建的分类器可以成功识别T细胞和上皮细胞,表明其作为细胞分子特征的有效性。进一步识别出与患者生存显著相关的网络motif,揭示其在结直肠癌预后中的潜在作用。结论基于整合单细胞多组学数据构建转录调控网络,解析随结直肠癌的进展转录调控网络及其功能的动态变化,揭示了结直肠癌进展过程中的细胞分子特征及关键预后motif,为结直肠癌的分子机制及预后评估提供了深刻见解。

“四史”教育融入高校思想政治教育的策略研究

“四史”教育是高校思政教育的核心组成部分,促进其与思政教育有机融合,可进一步增强思政教育的说服力。文章深入解析“四史”教育在高校思想政治教育中开展的价值意蕴,明确二者融合可行性。从聚焦学习者困惑,锤炼教育者本领;加强多元化实践,激发学习者担当;增强四史渗透力,链接内容与场域三个方面入手,促进“四史”教育与高校思想政治教育有机融合,可促进学习者快速树立正确历史观,使其抵御不良思想侵害的能力增强。

细胞程序性死亡调控动物卵泡闭锁的分子机制

卵泡闭锁是一个受高度受调控的复杂过程,与颗粒细胞的程序性死亡密切相关。细胞凋亡、自噬、铁死亡、坏死性凋亡和焦亡等独立或相互作用参与调控卵泡闭锁和影响卵巢功能,本文综述了这5种细胞程序性死亡方式调控动物卵泡闭锁的分子机制及相关影响因素,以期为减少颗粒细胞程序性死亡诱导的卵泡闭锁、提高畜禽的繁殖性能提供参考。

5个典型体型鹅品种生产性能比较与遗传多样性分析

为掌握我国市场上典型鹅品种的孵化性能、生长速度、屠宰性能以及分子遗传多样性,研究收集霍尔多巴吉鹅(以下简称“霍鹅”)、狮头鹅、扬州鹅、浙东白鹅和太湖鹅5个鹅品种各300个种蛋,开展孵化试验,并进行饲养对比和屠宰试验。结果显示,霍尔多巴吉鹅种蛋受精率最高,达87%;太湖鹅种蛋孵化率最高,为91.03%;狮头鹅生长速度最快,70日龄体重最高,且狮头鹅>霍鹅、浙东白鹅>扬州鹅、太湖鹅。扬州鹅的饲料转化率最高(料肉比为3.1∶1);狮头鹅在体重与屠宰指标上具有明显优势,扬州鹅显著低于浙东白鹅、霍鹅(P<0.05);与其他鹅相比,国外品种霍鹅等位基因数(NO)、平均期望杂合度(He)、多态信息量(PIC)均最低,培育品种扬州鹅遗传多样性最高。研究为优质肉鹅新配套系选育在生长速度、出栏体重、饲料转化效率、群体遗传多样性等方面选择育种素材,提供具体候选品种资源。

樱桃谷鸭、连城白鸭胚胎后期腿肌发育特征研究

本实验旨在研究樱桃谷鸭和连城白鸭胚胎后期腿肌肌纤维发育规律,探究2个品种在胚重和腿肌重上的差异,并分析肌纤维发育相关基因在腿肌发育过程中的表达变化。分别采集樱桃谷鸭和连城白鸭15、17、19、21、23、25胚龄的腿肌组织,利用石蜡切片技术研究腿肌肌纤维发育变化,利用RT-qPCR技术检测肌纤维发育相关基因在腿肌发育过程中的表达变化。结果显示:2个品种鸭在19胚龄时肌纤维已逐渐开始形成,25胚龄时期肌纤维形成完全。在鸭胚胎发育过程中,21~25胚龄樱桃谷鸭胚重和腿肌重显著大于连城白鸭,在23胚龄时樱桃谷鸭的肌纤维直径和面积显著大于连城白鸭。两品种间基因表达结果显示,MyoD、Myf5基因表达量在15胚龄和17胚龄间差异显著,MyoG基因表达量在21胚龄最高,Mrf4基因在15~23胚龄差异显著。本实验结果显示,在胚胎发育后期,樱桃谷鸭腿肌重和胚重均大于连城白鸭,在21胚龄以后樱桃谷鸭的肌纤维直径和面积小于连城白鸭。

鸡marco稳转巨噬细胞系的构建与鉴定

旨在通过慢病毒表达系统构建稳定表达marco基因的HD11细胞系,为研究marco基因的抗病毒免疫功能提供重要工具。首先,以HD11细胞为模板,通过PCR扩增获得marco基因编码区序列,并将其克隆到慢病毒载体上,获得重组慢病毒质粒pLV3-CMV-MCS-Puro-marco;其次,利用四质粒慢病毒包装系统将重组质粒pLV3-CMV-MCS-Puro-marco与辅助质粒pLP1、pLP2、pMD2.G共转染至293T细胞进行慢病毒包装,构建含鸡marco基因的重组慢病毒。最后,用包装成功的重组慢病毒感染HD11细胞72 h后进行嘌呤霉素(2μg·mL^(-1))筛选,通过RT-qPCR检测marco基因表达后最终确认获得稳定表达鸡marco基因的HD11细胞系。本研究成功构建了稳定表达鸡marco基因的HD11细胞系,为后续深入研究marco基因的功能提供了重要基础。

扬州鹅在不同饲养模式下的生长性能及经济效益分析

华东地区是我国肉鹅养殖和消费的主要区域,存在多种养殖模式。为研究扬州鹅在不同饲养模式下的生长性能及经济效益,本试验选用300只平均体重为(832.6±26.3)g的21日龄扬州鹅(公母各半),随机分为4组,每组设3个重复组,每个重复25只扬州鹅,饲养密度为2只/m^(2)。精料饲养组、3%油脂组和牧草补饲组为全程精料(黑麦草+精料)饲养模式,采用全封闭式厚垫料平养舍饲。其中,3%油脂组在63~70日龄添加鸭油添加剂;牧草补饲组在35~70日龄每周补饲牧草2.5 kg;放牧精料组在预试期(21~27日龄)每天训练鹅自行前往指定草地并回鹅舍,28日龄后鹅自由活动、采食,放牧期间提供充足饮水,并进行划区轮牧,密度为15只/667 m^(2),每天放牧8 h。预试期7 d,正试期42 d。结果显示:放牧精料组扬州鹅29~56日龄平均日增重、饲料利用率最高,56日龄体重高于牧草补饲组(P<0.05);牧草补饲组后期(56~70日龄)生长速度加快,日增重、饲料转化率均最高;3%油脂组、放牧精料组的70日龄体重与精料饲养组无差异,但3%油脂组体重大于牧草补饲组(P<0.05)。精料饲养组、3%油脂组的全程死淘率维持在较低水平,牧草补饲组、放牧精料组的死淘率超过17%。3%油脂组的总体养殖经济效益最好,牧草补饲组的饲料成本最低,放牧精料组后期饲料报酬低,总体饲养成本较高。所以,以肉鹅70日龄出栏为节点,添加3%油脂模式组的总体养殖效益最好,本试验结果为肉鹅养殖企业和农户选择合适的饲养模式提供了数据参考。

全基因组关联分析在水禽主要数量性状基因座定位的应用现状

水禽的经济性状多为数量性状,数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL)是调控数量性状表达的遗传基础,因此QTL的定位是分子育种的基础。全基因组关联分析(genome wide association studies,GWAS)作为鉴定表型与基因型关系的一种分析策略,是挖掘畜禽QTL的重要手段,并已经成功应用于猪、牛、鸡等畜禽的遗传育种工作中。利用GWAS可以定位与水禽经济性状相关的QTL,确定影响水禽性状的功能基因或主效基因,从而实现对水禽重要性状的改良。文章综述了GWAS在水禽重要性状研究上的应用效果,并分析了不足之处,以期为完善水禽遗传育种与遗传改良方法提供参考。

家禽产窝外蛋的影响因素与防控策略

家禽产窝外蛋是非笼养模式下的一个常见现象,严重影响动物福利、集蛋效率、孵化性能、生产效益和种禽个体产蛋记录等。家禽产窝外蛋受多种因素影响,主要包括习性、内分泌、遗传、环境、饲养管理等。通常,不同家禽养殖场中窝外蛋的流行程度存在差异,且不可预测。此外,家禽产窝外蛋也被认为是一种不良的母性行为,其生理学调控机制尚不清晰。目前,采取单一措施或简单组合手段难以根本性地解决家禽产窝外蛋难题。深入了解家禽产窝外蛋的诱因,寻求高效的防控措施,能够有效减少窝外蛋的发生,有利于家禽业健康发展。因此,本文综述了家禽产窝外蛋的相关影响因素和防控策略,旨在为家禽生产中有效控制窝外蛋的发生提供科学参考。

优质型肉鸡早熟性育种研究进展

性早熟是优质型肉鸡特有的重要经济性状。性成熟的程度决定产品的等级和卖价,具有性成熟外观(冠大、脸红、毛色光鲜、有一定的皮下脂肪等)是优质型肉鸡上市的基本条件。鸡在接近性成熟时,机体组成发生改变,胴体品质提高,肌间脂肪等风味物质含量增加,鸡肉口感好。性成熟早的鸡,饲养周期短,饲料转化率高,生产成本低。因此,肉鸡性早熟研究和早熟性品种(系)的培育成为优质鸡研究领域的重要方向之一。本文通过阐述早熟性品种(系)特点,探讨优质型肉鸡早熟性的选择依据、早熟性遗传、性成熟调控机制及地方代表性早熟性肉鸡品种选育的方法等,综述了优质型肉鸡早熟性育种的研究进展,并就肉鸡早熟性方面存在的问题和对策作了简要概述。

NLR、CAR、Fib对预测急性胰腺炎患者病情程度和预后的价值分析

目的探讨新型炎症指标中性粒细胞与淋巴细胞比值(NLR)、C反应蛋白与血清白蛋白比值(CAR)及凝血功能指标纤维蛋白原(Fib)对评估急性胰腺炎(AP)患者病情严重程度的价值及预后的关系。方法回顾性分析2018年1月至2020年12月海南医学院第一附属医院收治的166例急性胰腺炎患者的临床资料,根据2012年修订的AP亚特兰大分类标准分为轻度(MAP)组80例,中度(MSAP)组49例、重度(SAP)组37例,比较三组AP患者的NLR、CAR和Fib水平差异,使用受试者工作特征(ROC)曲线评估入院即刻NLR、CAR和Fib单项及其联合检测对AP预后的临床价值。结果三组CAR、Fib水平比较,SAP组>MSAP组>MAP组(P<0.05),SAP组NLR水平显著高于MSAP组和MAP组(P<0.05),但MAP组>MSAP组(P<0.05)。入院即刻NLR、CAR和Fib对AP的预后均具有较高的预测价值(AUC=0.883、0.672、0.666),其最佳截断值分别为10.33、2.18、5.28;三项联合对于AP患者预后的曲线下面积值(AUC=0.882)与NLR单项检测(AUC=0.883)相当,以及灵敏度为83.8%,特异度为78.3%。经模型检验,可见NE、NLR、Fib、CRP、CAR模型超过0.50,认为模型尚可。结论新型炎症指标NLR、CAR和反应凝血功能指标Fib在不同严重程度AP患者中存在差异,其中单项检测NLR对于预测AP的预后具有较高的价值,三者联合检测可以提高预测的特异度。

考虑平台流量补贴的直播电商供应链协同激励契约研究

针对直播电商供应链的收益分配问题以及直播平台与品牌商对主播的协同激励问题,考虑平台对主播的流量补贴,运用双层委托代理理论分别构建主播与直播平台不签约时仅品牌商提供激励情形和签约时直播平台与品牌商协同激励情形下的激励契约模型,研究两种情形下的最优契约,并作对比分析。研究表明,当直播平台与主播不签约时,随着主播影响力的增加,直播平台的收益分成比例固定不变,品牌商的收益分成比例先减小后趋于常值,主播的收益分成比例先增加后趋于常值;当直播平台与主播签约时,存在一个签约门槛使得直播电商供应链各成员的最优期望利润均增加,且随着主播影响力的增大,主播与品牌商的收益分成比例均随之增加,而直播平台的收益分成比例随之减少。此外,直播平台对高风险厌恶主播进行流量补贴能够发挥更大的激励作用,因此,直播平台应加大对高风险厌恶主播的流量补贴力度。

基于卷积自编码的fNIRS信号运动校正算法研究

功能性近红外光谱技术(functional near-infrared spectroscopy,fNIRS)作为一种高时间分辨率、成本低廉、便携性高的脑成像系统,近年来深受脑神经科学等研究领域的关注。但fNIRS信号中的运动伪迹会干扰后期数据分析的结果,且现有的一些算法去噪效果较为单一。因此,本文提出了一种基于多层卷积自编码的fNIRS信号运动伪迹校正算法——MCAN算法,并使用该算法对fNIRS信号中的3种运动伪迹进行校正;然后用仿真数据和实验数据对所提算法的性能进行验证,将其与现有的几种常用算法进行对比,结果表明:MCAN算法在剩余运动伪迹数量、均方误差、信噪比、皮尔逊相关系数的平方、峰峰误差几种指标上表现良好,说明所提算法可作为一种全新的fNIRS信号预处理算法。

种业振兴背景下畜牧专业学位研究生培养模式改革与实践--以家禽种业人才培养为例

为构建种业振兴背景下畜牧专业学位研究生培养新模式,文章从家禽种业人才培养分析入手,对培养目标定位、专业基础知识以及创新实践能力等共性突出问题进行改革,提出了“知识构建+价值塑造+兴趣驱动”人才培养理念,建立了“案例教学+大师讲学+自主学习”精英人才教学模式,形成了“需求+问题”导向的校企联合培养及协同创新机制。并最终构建了以种业需求为导向,以产教融合为牵引的畜牧专业学位家禽种业精英型研究生培养模式,显著提升了专业学位研究生专业素质、跨专业(领域)知识和系统思考能力。

考虑平台信誉下多供需方平台供应链价值共创研究

平台进行双方匹配的过程中,经常会出现单一工厂不能满足零售商的订单需求,需要多个工厂共同生产来满足订单需求,或者是由同一个工厂同时生产不同零售商所需的商品,出现多对多的匹配。但是单依靠平台为交易双方做订单匹配并不能完全保证资源的浪费,工厂的产能在转化为零售商所需商品时会有剩余,零售商的订单需求也不一定能完全找到合适的工厂进行生产。为解决如上资源浪费的问题,平台供应链需要协同发展,增加平台供需双方的规模,扩大资源池。因此平台三方需要为平台发展而付出努力,本文研究了补贴影响平台信誉下平台供应链价值共创。考虑平台、共享工厂、零售商合作博弈情形下平台供应链动态发展情况,应用微分博弈,刻画了可以表示平台健康发展的平台信誉,建立了平台信誉的状态方程,和基于平台供应链系统的利润函数,研究了补贴影响平台信誉下平台供应链价值共创问题。

碳税政策下考虑航运竞争的碳减排投资决策研究

碳税政策下航运企业承担随之带来的碳排放成本,从而不得不考虑投资碳减排技术降低企业碳排放,然而如何在航运企业存在竞争的情形下进行投资决策成为亟待解决的问题。以此为背景,构建一个港口与两个航运企业组成的港航供应链。分析对比无企业投资、单一企业投资、两企业投资三种情形下港航供应链成员定价和利润以及碳排放总量的变化情况。结果表明单一企业投资情形下航运企业谁投资则谁受益,两企业均投资时在某些条件下则会导致两航运企业的利润甚至低于无企业投资下的利润,同时在受到竞争环境的影响,单一投资情形下碳减排水平高于两企业投资时的减排水平。研究还发现不同竞争强度下,碳税对于不同情形下的航运企业利润的影响有所不同。

动物遗传育种创新型技能训练设计与实践

随着国家《种业振兴行动方案》的实施,高等农业院校在动物遗传育种课程中增设创新型技能训练已成为当下趋势。在阐明动物遗传育种创新型技能训练必要性的基础上,提出应用“创新素质塑造,项目任务驱动”模式,将理论教学内容运用到实践中,从活体不可测定性状选育方法、育种方案制定、保种方案制定、鸡显性/隐性白羽分子检测、体细胞和配子冷冻保存、转基因克隆动物生产等模块开展专门训练,以提高学生的创新欲望,创造性思维和创新实践能力,满足我国畜禽种业振兴的人才培养的需求。

国外小型家鸭柯尔鸭介绍

柯尔鸭是世界著名的小型鸭、观赏鸭、宠物鸭品种。近年来笔者收集到的《欧洲家禽图鉴》《家禽品种实用指南》《家禽品种》《漂亮的鸭》等国外家禽品种志、饲养书上多有介绍。而国内家鸭品种志书、养鸭书上却少有介绍。

浅析MDT联合PBL的教学模式——在消化科住培教学中的应用效果及问题探索

消化系统疾病复杂、多变,往往会涉及多个脏器,部分疾病的诊断及治疗非常棘手,常常需要通过多个学科会诊进行一次甚至多次的共同讨论,才能最终制订出诊疗方案。鉴于此,需要更新教学理念。开拓教学思维,摸索出适合消化科住培教学的有效方法和手段,以期提高住培教学的质量。围绕基于MDT理念联合PBL的教学模式在消化科住培教学中的应用,简要阐述该教学模式的必要性、在临床教学中的应用方式及效果,以及在应用中存在的问题,最后对此教学模式在未来的应用前景进行展望。

MDT联合PBL在消化科住培教学中的应用

探讨在多学科联合诊疗模式理念下结合基于问题式学习教学模式在消化科住院医师规范化培训中的应用效果。以2020年9月至2021年11月在海南医学院第一附属医院消化科轮转进行住院医师规范化培训的99名住院医师为研究对象,按照入科先后顺序将所有学员随机分为实验组和对照组,通过对比两组学员出科考核成绩及教学满意度,以评价两种教学方法对住培学员的教学效果。实验组理论考试、技能操作、临床实践能力考核的成绩均高于对照组,两组比较差异有统计学意义(P<0.05);问卷调查结果显示实验组的教学满意度高于对照组,两组比较差异有统计学意义(P<0.05)。因此,在消化科住院医师规范化培训中,采用MDT联合PBL的教学模式,有利于提高教学效果。