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基于网络药理学的刺芒柄花素抗颈动脉粥样硬化斑块的作用靶点及机制
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作者 李珊 赵康 +2 位作者 杨提 王莹 邓生琼 《同济大学学报(医学版)》 2024年第1期24-30,共7页
目的 利用网络药理学方法联合GEO基因芯片数据及分子对接技术探索刺芒柄花素治疗颈动脉粥样硬化斑块的潜在分子作用机制。方法 在PubChem等数据库获取刺芒柄花素的作用靶点,在GeneCards、DisGeNET等数据库获取颈动脉粥样硬化斑块相关靶... 目的 利用网络药理学方法联合GEO基因芯片数据及分子对接技术探索刺芒柄花素治疗颈动脉粥样硬化斑块的潜在分子作用机制。方法 在PubChem等数据库获取刺芒柄花素的作用靶点,在GeneCards、DisGeNET等数据库获取颈动脉粥样硬化斑块相关靶点基因,与GEO芯片筛选的差异基因合并去重后得到颈动脉粥样硬化斑块靶点基因;通过构建韦恩图,得到药物与疾病共有靶点;利用R软件包对共有靶点进行富集分析;利用String在线平台构建共有靶点蛋白互作网络,运用Cytoscape软件对网络进行拓扑学参数筛选得到核心靶点;再运用分子对接技术将筛选出来的核心靶点分别与刺芒柄花素的结合活性进行验证。结果 筛选出413个刺芒柄花素作用靶点及1 244个颈动脉粥样硬化斑块表达差异基因,两者取交集后得到55个刺芒柄花素干预颈动脉粥样硬化斑块的潜在靶点,KEGG富集分析显著富集于PPAR信号通路、MAPK信号等通路,并显示基因功能与炎症及细胞凋亡相关;运用Cytoscape筛选得到核心靶点CAP1、CXCL8、EGFR、FOS、CTSS、IGF1、MMP9、PPARG;分子对接模拟验证显示,CAP1、CXCL8、EGFR、FOS、IGF1、MMP9、PPARG等核心靶点与刺芒柄花素结合强,有较好的结合活性。结论 刺芒柄花素作用于CAP1等多个核心靶点调节炎症相关信号通路,进而发挥抗动脉斑块形成的作用,可为后续临床用药提供数据支持。 展开更多
关键词 网络药理学 GEO数据库 刺芒柄花素 动脉粥样硬化斑块
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基于FAERS数据库的艾塞那肽微球不良事件信号挖掘与研究
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作者 张莲卿 骆岩 +2 位作者 杨提 姚佳晨 李文艳 《药学实践与服务》 CAS 2024年第10期445-450,共6页
目的运用美国FDA不良事件报告系统(FAERS)挖掘艾塞那肽微球使用中不良事件(ADE)风险信号,为临床合理用药和保障用药安全提供参考。方法以“艾塞那肽微球”为目标药物,检索关键词为“exenatide microspheres for injection”“LY05006”... 目的运用美国FDA不良事件报告系统(FAERS)挖掘艾塞那肽微球使用中不良事件(ADE)风险信号,为临床合理用药和保障用药安全提供参考。方法以“艾塞那肽微球”为目标药物,检索关键词为“exenatide microspheres for injection”“LY05006”“AC 2993 LAR”及“bydureon”,利用SAS软件提取FAERS数据库中2012年1月2日至2023年3月31日的ADE报告数据并去重,采用报告比值比法与综合标准法对艾塞那肽微球相关ADE报告进行数据挖掘。结果共检索到艾塞那肽微球ADE报告27248份,涉及27个系统器官分类,其中严重ADE报告4719份。上报人员以消费者为主(18435例,占67.66%),上报国家以美国为主(26295例,占96.50%)。采用报告比值比法(ROR)与综合标准法(MHRA)共获得163个ADE风险信号,包括血胆固醇异常、脂肪酶升高及混合型高脂血症等新发不良反应。结论基于FAERS数据库对艾塞那肽微球上市后的ADE进行挖掘分析,可对临床用药安全和提高患者用药依从性提供参考。 展开更多
关键词 艾塞那肽微球 FDA不良事件报告系统 数据挖掘
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基于FAERS数据库的普乐沙福不良事件信号挖掘与研究
3
作者 张莲卿 杨提 +1 位作者 李文艳 朱海斌 《海峡药学》 2024年第9期105-109,共5页
目的利用美国食品药品监督管理局(FDA)不良事件报告系统(FAERS)挖掘普乐沙福不良事件(ADE)风险信号,为临床安全用药提供参考。方法检索FAERS数据库中2009年1月1日~2023年3月31日的ADE报告数据,以“普乐沙福”为目标药物,检索关键词为“p... 目的利用美国食品药品监督管理局(FDA)不良事件报告系统(FAERS)挖掘普乐沙福不良事件(ADE)风险信号,为临床安全用药提供参考。方法检索FAERS数据库中2009年1月1日~2023年3月31日的ADE报告数据,以“普乐沙福”为目标药物,检索关键词为“plerixafor”及“Mozobil”。采用WPS表格统计患者基本信息,包括性别、ADE上报人员和上报国家、ADE严重程度和类型等。采用《ICH国际医学用语词典》(MedDRA)中的首选系统器官分类(SOC)和首选术语(PT)对ADE进行描述、分类和统计。采用比值失衡测量法中的报告比值比法(ROR)和综合标准法(MHRA)对普乐沙福ADE报告进行数据挖掘。结果共检索到普乐沙福ADE报告488份,涉及26个SOC,其中有595例次严重ADE。上报人员以医务人员为主(43.65%),上报国家以美国为主(58.40%)。采用ROR法和MHRA法共获得69个ADE风险信号,包括暗夜恐怖、游离血红蛋白检出、尿胆红素升高等新发不良反应。结论临床在使用普乐沙福时,应注意血小板减少、过敏反应等严重不良反应,还应关注暗夜恐怖、感染、尿胆红素升高等风险,确保患者用药安全。 展开更多
关键词 普乐沙福 FAERS 药品不良事件 暗夜恐怖
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基于美国FAERS数据库的克唑替尼不良事件信号挖掘与分析
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作者 刘红霞 张越 +1 位作者 郑凯乐 杨提 《中国医院用药评价与分析》 2024年第6期748-751,755,共5页
目的:挖掘克唑替尼的药品不良事件(ADE)信号,为临床安全用药提供参考。方法:收集2011年8月26日至2023年3月31日美国食品药品监督管理局不良事件报告系统(FAERS)数据库中的克唑替尼相关ADE报告,利用比例失衡法中的报告比值比(ROR)法和综... 目的:挖掘克唑替尼的药品不良事件(ADE)信号,为临床安全用药提供参考。方法:收集2011年8月26日至2023年3月31日美国食品药品监督管理局不良事件报告系统(FAERS)数据库中的克唑替尼相关ADE报告,利用比例失衡法中的报告比值比(ROR)法和综合标准法(MHRA)进行数据挖掘,采用《ICH国际医学用语词典》(MedDRA)中的首选系统器官分类(SOC)和首选术语(PT)对ADE进行描述、分类和统计。结果:共检索到目标药物克唑替尼相关ADE报告22 493例;以男性患者为主(11 862例,占52.74%),且集中于≥65岁(109例,占0.48%);主要上报国家为美国(12 837例,占57.07%);共涉及严重不良事件18 370例次,以住院为主(4 595例次,占严重不良事件总例次数的25.01%)。共挖掘到61 453个ADE信号,涉及15种SOC,主要为全身性疾病及给药部位各种反应、胃肠道功能疾病。报告例次数排序靠前的ADE信号涉及死亡、腹泻、恶心、疲劳等PT;信号强度排序靠前的ADE信号涉及软组织肉瘤、恶性结缔组织瘤、转移性滑膜肉瘤等PT。结论:克唑替尼所致ADE主要包括全身性异常、胃肠道反应、各项检查指标异常等;使用克唑替尼前,临床应做好用药评估,并在治疗期间重点关注患者的血液指标和全身性反应,以保障治疗的安全性。 展开更多
关键词 克唑替尼 美国食品药品监督管理局不良事件报告系统 药品不良事件 数据挖掘
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补骨脂乙素治疗溃疡性结肠炎的分子作用机制 被引量:1
5
作者 杨提 李珊 邓生琼 《上海大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期253-263,共11页
利用网络药理学方法联合GEO基因芯片及分子对接探索补骨脂乙素治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)的潜在作用机制.通过PubChem等数据库预测补骨脂乙素靶点;在GeneCards、DisGeNET等数据库检索UC作用靶点合并GEO芯片提取的差异基... 利用网络药理学方法联合GEO基因芯片及分子对接探索补骨脂乙素治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)的潜在作用机制.通过PubChem等数据库预测补骨脂乙素靶点;在GeneCards、DisGeNET等数据库检索UC作用靶点合并GEO芯片提取的差异基因去重后得到UC靶点,对药物与疾病交集基因进行富集分析;构建交集基因蛋白互作网络筛选出核心靶点,分子对接初步验证药物与核心靶点的结合活性.结果:筛选出交集基因107个;富集分析显示基因功能多与炎症相关;筛选得到核心靶点AKT1、MMP9、EGFR、IGF1、SRC;分子对接模拟验证显示药物与核心靶点之间有较好的结合活性.提示补骨脂乙素可能通过作用于核心靶点调节炎症相关信号通路进而发挥抗UC的作用,可为后续深入研究提供数据支持. 展开更多
关键词 网络药理学 GEO数据库 补骨脂乙素 溃疡性结肠炎
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基于网络药理学和分子对接技术探讨四磨汤治疗急性呼吸窘迫综合征的分子机制 被引量:1
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作者 肖辉 张卉青 +1 位作者 王学彬 杨提 《中国医院用药评价与分析》 2023年第9期1060-1065,1070,共7页
目的:基于网络药理学方法和分子对接技术分析四磨汤治疗急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的活性成分及分子作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台获取木香、枳壳、乌药和槟榔的化学成分,根据阈值筛选活性成分及潜在靶点;利用GeneC... 目的:基于网络药理学方法和分子对接技术分析四磨汤治疗急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的活性成分及分子作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台获取木香、枳壳、乌药和槟榔的化学成分,根据阈值筛选活性成分及潜在靶点;利用GeneCards、DisGeNET数据库获取ARDS相关靶点,作韦恩图获取两者共有靶点;再构建共有靶点蛋白质-蛋白质相互作用网络,筛选出核心靶点进行富集分析。结果:四磨汤治疗ARDS的关键成分为槲皮素、蜜橘黄素、柚皮素和β-谷甾醇等,关键靶点有原癌基因蛋白(JUN)、丝裂原激活的蛋白激酶8(MAPK8)、原癌基因(FOS)、蛋白激酶B(AKT1)、胱天蛋白酶3(CASP3)和肿瘤坏死因子(TNF)等,涉及的生物学过程主要包括细胞化学应激的应答过程、活性氧的应答过程等,信号通路主要富集于流体剪切应力与动脉粥样硬化、TNF、MAPK以及白细胞介素17等信号通路。结论:本研究初步揭示了四磨汤治疗ARDS的多成分、多靶点、多通路的作用机制,为四磨汤的临床开发利用提供了基础。 展开更多
关键词 四磨汤 急性呼吸窘迫综合征 作用机制 网络药理学 靶点预测
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大明胶囊治疗高脂血症的网络药理学分析及分子对接验证研究
7
作者 张越 张卉青 +1 位作者 杨提 徐春梅 《中国医药科学》 2023年第7期83-87,共5页
目的基于网络药理学方法分析大明胶囊治疗高脂血症的活性成分及其作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索并筛选大明胶囊的主要化学成分及靶点,通过GeneCards、DisGeNET及DrugBank数据库挖掘高脂血症靶点,取交集... 目的基于网络药理学方法分析大明胶囊治疗高脂血症的活性成分及其作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索并筛选大明胶囊的主要化学成分及靶点,通过GeneCards、DisGeNET及DrugBank数据库挖掘高脂血症靶点,取交集得到大明胶囊治疗高脂血症的靶点。将上述靶点导入STRING数据库,构建PPI网络并挖掘网络中潜在的蛋白质功能模块;利用R语言ClusterProfiler GO.R插件对交集靶点进行GO和KEGG通路富集分析。利用Cytoscape 3.7.2软件构建“活性成分-疾病靶点-通路”网络图,并对网络进行拓扑学参数分析筛选活性成分及关键靶点。利用AutoDock Vina软件进行分子对接验证。结果共筛选得到大明胶囊活性成分70个,作用靶点196个,高脂血症相关靶点541个。大明胶囊治疗高脂血症的重点活性成分为山柰酚,核心靶点为HSP90AA1、NCOA2、AKT1、ADRB2、RXRA、TNF、NCOA1、PPARG、MAPK1、IL-6、IL-1β、ESR1。分子对接结果显示,山柰酚与核心靶点具有良好的结合能力。大明胶囊治疗高脂血症主要通过脂质和动脉粥样硬化信号通路、糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路等,其功能主要为调节细胞内受体配体活动等过程。结论本研究初步阐明了大明胶囊治疗高脂血症多成分、多靶点、多通路的作用机制,为大明胶囊治疗高脂血症的中药药理学研究提供理论基础和参考依据。 展开更多
关键词 大明胶囊 高脂血症 网络药理学 靶点预测 分子对接
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基于网络药理学探讨胆宁片治疗慢性胆囊炎的活性成分及其分子作用机制 被引量:5
8
作者 杨提 王雪 +3 位作者 杨云云 丁楠 王学彬 陈井霞 《中国医院用药评价与分析》 2022年第5期532-538,共7页
目的:基于网络药理学探讨胆宁片治疗慢性胆囊炎的活性成分及其分子作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台数据库和草本组鉴数据库获得中药胆宁片的化学组分,并根据药动学参数筛选有效活性成分和潜在作用靶点;通过GeneCards... 目的:基于网络药理学探讨胆宁片治疗慢性胆囊炎的活性成分及其分子作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台数据库和草本组鉴数据库获得中药胆宁片的化学组分,并根据药动学参数筛选有效活性成分和潜在作用靶点;通过GeneCards、DisGeNET及Drugbank数据库获取慢性胆囊炎的相关靶点,通过Venny 2.1.1绘制韦恩图得到两者共有靶点;应用STRING数据库构建化合物和疾病共有靶点蛋白质-蛋白质相互作用网络图后,运用Cytoscape 3.7.2软件实现可视化并进行网络拓扑学分析筛选核心靶点,最后利用R语言软件Cluster Profiler GO.R插件对核心靶点进行富集分析。结果:中药胆宁片与慢性胆囊炎共有靶点60个,其中关键靶点有肿瘤蛋白p53、Cyclin依赖性激酶抑制剂1、G1/S-特异性Cyclin-D1、原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶1、表皮生长因子受体、血管内皮生长因子A、肿瘤坏死因子、基质金属蛋白酶9、受体酪氨酸蛋白激酶2和视网膜母细胞瘤相关蛋白1等,主要涉及膀胱癌、人巨细胞病毒感染以及磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B等信号通路。结论:胆宁片治疗慢性胆囊炎可能与抗炎、调节胆固醇代谢相关。 展开更多
关键词 网络药理学 胆宁片 慢性胆囊炎 靶点预测 分子机制
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泌尿系统结核伴泌尿道感染1例报道
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作者 杨提 卢曼 +3 位作者 董婧 姚佳晨 刘艳辉 李文艳 《中国当代医药》 2020年第21期183-185,共3页
本文回顾性分析1例泌尿系统结核伴泌尿道感染案例的诊疗过程,临床药师针对患者经验性抗感染治疗以及目标性治疗药物的合理选择等方面发挥自身的专业特长,协助临床医生制定并及时调整抗感染药物治疗方案,旨在促进临床个体化用药,提高药... 本文回顾性分析1例泌尿系统结核伴泌尿道感染案例的诊疗过程,临床药师针对患者经验性抗感染治疗以及目标性治疗药物的合理选择等方面发挥自身的专业特长,协助临床医生制定并及时调整抗感染药物治疗方案,旨在促进临床个体化用药,提高药物治疗效果,保障患者用药安全。 展开更多
关键词 临床药师 泌尿道感染 抗感染治疗 个体化用药
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基于网络药理学探讨益气活血方抗肝纤维化作用的活性成分及其分子机制研究 被引量:1
10
作者 杨提 曾婷婷 +3 位作者 张卉青 叶琳岚 蔺婷婷 丁楠 《药学服务与研究》 CAS 2021年第6期412-418,423,共8页
目的:通过网络药理学方法预测和探讨益气活血方抗肝纤维化的活性成分及其潜在的作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库和分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、中医... 目的:通过网络药理学方法预测和探讨益气活血方抗肝纤维化的活性成分及其潜在的作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库和分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、中医药综合数据库(Traditional Chinese Medicine Integrated Database,TCMID)筛选出益气活血方的活性成分和相关的潜在靶点;利用GeneCards数据库检索肝纤维化相关靶点;基于益气活血方潜在靶点与肝纤维化相关靶点的匹配结果,利用String平台进行蛋白质相互作用分析,构建蛋白质相互作用网络,拓扑分析筛选核心靶点;利用Cytoscape 3.7.2构建益气活血方活性成分-肝纤维化-靶点网络,拓扑分析筛选出关键活性成分;再利用R语言软件对药物与疾病共有靶点分别进行基因本体(gene ontology,GO)功能、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。结果:益气活血方抗肝纤维化的核心活性成分为槲皮素、木犀草素、山奈酚、柚皮素、丹参酮Ⅱa等。核心靶点有转录激活因子-3(signal transducer and activator of transcription-3,STAT3)、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶-1(serine/threonine protein kinase-1,AKT1)、原癌基因(proto-oncogene,JUN)、抑癌基因TP53等,主要涉及营养元素和脂多糖的应答过程、氧化应激反应、类固醇代谢应答过程、脂多糖的反应、活性氧代谢过程、小分子代谢过程的调控等生物过程。主要富集在磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶-蛋白激酶B(phosphatidylinositol-4,5-biphosphate 3-kinase-protein kinase B,PI3K-Akt)、流体剪应力与动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的糖基化终末产物及其受体(advanced glycation and products-receptor of AGE,AGE-RAGE)、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)、TNF-α、白介素17(interleukin-17,IL-17)等信号通路。结论:益气活血方抗肝纤维化具有多成分、多靶点、多通路的作用特点,本研究为益气活血方抗肝纤维化机制的后续实验研究提供了理论基础和参考依据。 展开更多
关键词 益气活血方 网络药理学 肝纤维化 活性成分 靶点预测
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芳烃抽提运行工艺的优化 被引量:5
11
作者 樊春江 何勇 +2 位作者 史学义 赵秀娟 杨提 《石化技术与应用》 CAS 2006年第5期393-395,共3页
介绍了中国石油兰州石化分公司40万t/a芳烃抽提装置运行工艺优化的情况。通过采取精细原料切割、优化操作条件、完善精馏工艺流程、改善溶剂质量等措施,使装置的原料处理量由37t/h提高至50t/h,三苯收率由43.8%提高至45.4%,三苯馏出口质... 介绍了中国石油兰州石化分公司40万t/a芳烃抽提装置运行工艺优化的情况。通过采取精细原料切割、优化操作条件、完善精馏工艺流程、改善溶剂质量等措施,使装置的原料处理量由37t/h提高至50t/h,三苯收率由43.8%提高至45.4%,三苯馏出口质量合格率由98.4%提高至99.1%,溶剂消耗由0.40kg/t下降至0.19kg/t,实现了满负荷运行。 展开更多
关键词 芳烃抽提 工艺参数 优化 生产负荷
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四种抗菌药物治疗老年患者社区获得性下尿路感染的成本-效果分析 被引量:2
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作者 杨提 陆燕 +3 位作者 陈丽文 刘艳辉 姚佳晨 李文艳 《医学信息》 2022年第2期157-159,共3页
目的应用药物经济学原理对四种抗菌药物治疗老年尿路感染的成本-效果比进行分析,从中找出最佳的药物治疗方案。方法选取2018年7月-2019年9月我院门诊确诊的老年尿路感染患者320例,根据抗菌药物治疗方案分为A组、B组、C组及D组,每组80例... 目的应用药物经济学原理对四种抗菌药物治疗老年尿路感染的成本-效果比进行分析,从中找出最佳的药物治疗方案。方法选取2018年7月-2019年9月我院门诊确诊的老年尿路感染患者320例,根据抗菌药物治疗方案分为A组、B组、C组及D组,每组80例。A组口服头孢克肟分散片,B组口服磷霉素氨丁三醇散,C组口服盐酸左氧氟沙星分散片,D组口服左氧氟沙星片,比较各组临床疗效及不良反应,根据各组患者的药物治疗效果进行成本-效果及敏感度分析。结果A组、B组、C组及D组的总有效率分别为76.25%、72.50%、61.25%和73.75%,四组间比较,差异无统计学意义(P>0.05);四组患者不良反应轻且均在可耐受范围内;A组、B组、C组及D组的成本-效果比分别为1.89、2.80、0.52和1.04,C组最低,D组次之;敏感度分析显示,C组<D组<A组<B组。结论从药物经济学角度分析,考虑药物治疗成本与疗效后,左氧氟沙星片的成本-效果比最低,为最佳给药方案。 展开更多
关键词 抗菌药物 成本-效果 敏感度 药物经济学
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