碳青霉烯类抗生素耐药肺炎克雷伯菌耐药基因分布和分子分型

目的探讨碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的耐药基因分布及分子分型特征。方法收集38株临床分离的肺炎克雷伯菌,采用肉汤稀释法药敏实验、改良Hodge试验、PCR电泳、脉冲场凝胶电泳分型及多位点序列分型测定其耐药性、耐药基因型及分子型别。结果对碳青霉烯类药物亚胺培南、美罗培南、厄他培南耐药率分别为18.42%（7/38）、28.95%（11/38）、34.21%（13/38）,其中有7株（18.42%）同时耐3种药物。对阿米卡星、左氧氟沙星、四环素、呋喃妥因、甲氨苄啶/磺胺甲恶唑、庆大霉素耐药率为23.68%~44.74%,阿莫西林/克拉维酸、头孢唑啉、头孢他啶、头孢曲松、头孢吡肟、氨曲南、环丙沙星耐药率均大于52.63%,氨苄西林、哌拉西林耐药率100%。有11株肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶表型检测为阳性,占28.95%（11/38）,其中5株携带blaKPC基因,均为KPC-2型;4株携带blaNDM基因,均为NDM-1型。9株携带blaKPC或blaNDM耐药基因的菌株同源性分析显示有8种不同PFGE带型,5种MLST型别（ST型）。5种ST型为ST11、ST15、ST395、ST1031、ST1412,其中以ST11为主。结论肺炎克雷伯菌耐药及多重耐药现象严重,肺炎克雷伯菌耐碳青霉烯类药物的主要的原因是携带KPC-2或者NDM-1基因,菌株基因型多态性大,提示病例之间不存在关联性。

江西省人感染猪链球菌病原学和基因组特征分析

目的了解江西省2005-2020年猪链球菌菌株病原学和基因组特征,分析15年间分离株之间的关联,为人感染猪链球菌病防控提供参考依据。方法通过聚合酶链反应法扩增猪链球菌基因组上的16S rRNA、cps2j、mr、sly、ef、gapdh毒力基因,通过测定最小抑菌浓度确定菌株的耐药性,通过全基因组测序和序列比对分析菌株之间的遗传多态性。结果10株人源和8株猪源猪链球菌均为血清2型菌株,毒力基因谱不同,至少携带3种毒力基因。对阿奇霉素和四环素耐药率高达89.89%和77.78%,携带氨基糖苷类、大环内酯类、四环素类及叶酸通道拮抗剂4类耐药基因。分为3个ST型,其中ST7型12株、ST1型5株、ST373型1株。全基因组序列分析显示2005年疫情菌株与四川省暴发疫情菌株同源,2006-2020年分离菌株基因组多态性大。结论江西省人感染猪链球菌病均为散发,菌株基因组多态性大,2005年疫情菌株与四川省暴发菌株相关,随后年份为多点平行传播。

江西省部分地区鼠形动物中巴尔通体分布及基因组序列研究

目的了解江西省鼠形动物中巴尔通体的携带状况和基因型特征,为巴尔通体感染的疾病预防控制提供科学依据。方法2018-2019年在南城县、广信区、横峰县、广丰区、铜鼓县5个鼠传疾病监测项目点,采集130只鼠形动物的肝、脾组织标本进行巴尔通体分离培养,挑取形态疑似巴尔通体的菌落纯培养后提取核酸,PCR检测巴尔通体属特异性基因gltA,阳性菌株鉴定为巴尔通体。对巴尔通体菌株进行全基因组测序,并基于全基因组序列构建聚类树。结果从130只鼠形动物的组织样本中分离巴尔通体14株,携带率为10.77%。黄毛鼠携带率最高(2/6),其次为黑线姬鼠(8/72)、褐家鼠(3/27)、臭鼬鼱(1/12)。基因组序列分析显示14株巴尔通体分为5个不同的分支,分为5种基因型,聚类结果显示在分离地区和宿主类型上没有聚集性。结论江西省鼠形动物中存在巴尔通体携带,携带的宿主类型多,菌株基因组多样性大,存在与人类致病性相关的基因型,存在人类感染的风险。

江西省表观健康猪群携带猪链球菌状况分析

目的了解江西省表观健康猪群携带猪链球菌的情况,为有效防控猪链球菌病提供科学依据。方法选取景德镇市、崇仁县为采样点,采集表观健康猪群鼻咽拭子和扁桃体进行猪链球菌病原分离鉴定。结果共采集表观健康猪群鼻咽拭子和扁桃体样本301份,检出2株猪链球菌2型,其毒力基因mrp、sly、ef均为阴性。结论本次调查中江西省表观健康猪携带猪链球菌的带菌率为0.66%。

医疗机构应对流感大流行的能力与潜力调查

[目的]了解医疗机构应对流感大流行的能力。[方法]采用查阅资料、个人访谈、现场观察的方法在南昌市城区调查省级医院和市级医院各1所。[结果]该省医院接诊呼吸道感染疾病医生42人(占8.8%),护士44人(占8%),病床97张(占6%),每人每日最大诊治病人数达70人～80人,实际工作时间7～8h;全院病床使用率为103%。该市医院接诊呼吸道感染疾病医生42名(占16%),护士69名(占20%),病床84张(占15%),每人每日最大诊治病人数30～40人,实际工作时间6～7h;全院病床使用率为80%。2所医院ICU病床占全院病床的比例偏低(均为1.1%),无ICU负压隔离病房;感染性疾病科设置不规范,医护人员不戴口罩,不规范进行手部卫生。[结论]目前应对流感大流行的能力和潜力有限。

2015年江西省某砖瓦厂诺如病毒性胃肠炎暴发调查

目的调查分析某砖瓦厂胃肠炎暴发疫情的流行特征及暴发原因。方法采用现场流行病调查方法了解病例发生情况及可疑传播途径,采用反转录-聚合酶联反应(RT-PCR)方法对病例粪便及肛拭标本进行诺如病毒核酸检测,对水体及食物进行卫生学检测。结果本次疫情共报告病例45例,总罹患率为58%。饮用2号井水的家庭罹患率为72%,饮用1号井水和山泉水井的家庭罹患率为39%。回顾性队列调查显示饮用2号井水的罹患率是未饮用者2倍(RR=2.1,CI95%1.4-3.2),且饮用2号井水量与发病存在剂量反应关系。10份病例标本中3份为I型诺如病毒阳性,3个水井水样标本中细菌总数、大肠菌群均严重超标。结论本次疫情是一起由I型诺如病毒引起的急性胃肠炎暴发事件,暴发原因是直接饮用污染的2号井水所致。建议该工厂对饮用水源进行消毒处理,尽快将自备井水改成市政供水。

江西省布鲁菌分离株的鉴定及分子特征分析

目的对江西省近几年分离的布鲁菌进行鉴定和分型,同时检测rpoB基因的携带情况并分析其遗传多态性。方法利用BCSP31-PCR对分离的菌株进行布鲁菌鉴定,利用AMOS-PCR对布鲁菌进行种型分析,利用普通PCR对rpoB基因进行检测,将rpoB基因的PCR扩增产物进行测序并用MEGA6.0软件进行多态性分析。结果经鉴定32株布鲁菌全部为羊种布鲁菌,通过对rpoB基因的PCR扩增产物序列分析显示羊种布鲁菌rpoB基因同源性较高。结论江西省近年人感染的布鲁菌均为羊种布鲁菌,且近几年人感染的羊种布鲁菌rpoB基因高度同源。

ELISA法检测血清IgM抗体诊断手足口病急性期患儿EV-A71感染效能的Meta分析

目的 定量评价酶联免疫吸附测定(Enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)法检测血清肠道病毒A组71血清型(Enterovirus A71,EV-A71)IgM抗体的诊断效能。方法 根据研究目的,制定检索策略,系统地检索PubMed、Web of Science、Embase、中国知网、万方数据库等中外文数据库,提取纳入研究文献的相关数据,以手足口病(hand, foot and mouth disease,HFMD)患儿急性期呼吸道或肠道标本EV-A71核酸检测结果为“参考标准”,采用Meta分析定量地评价ELISA法检测血清特异性IgM抗体诊断HFMD患儿EV-A71感染的效能。结果 基于随机效应模型评估29篇原始研究,ELISA法诊断HFMD患儿EV-A71感染效能的合并灵敏度为87%(95%CI:82%~90%),合并特异度为82%(95%CI:78%~87%),合并阳性预测值为79%(95%CI:69%~87%),合并阴性预测值为90%(95%CI:86%~93%),合并曲线下面积为0.93±0.01;Meta回归发现,EV-A71 Ig M抗体检测试剂使用EV-A71 VP1蛋白较使用EV-A71灭活病毒纯化颗粒为抗原,会降低血清IgM抗体ELISA法诊断HFMD患儿EV-A71感染的灵敏度,但会提高特异度。结论 ELISA法检测血清EV-A71 IgM的诊断特异度和灵敏度可接受,可适用于临床EV-A71诊断,特别是在医疗资源贫乏地区。

江西省2015-2022年登革热媒介伊蚊幼蚊监测结果分析

目的研究江西省登革热媒介伊蚊幼蚊的密度水平及变化趋势,为登革热防控提供理论依据。方法2015-2022年每年5-10月,采用布雷图指数(BI)法在全省13个登革热媒介监测点进行监测,分析伊蚊幼蚊密度。利用R 4.3.1软件进行数据分析,不同容器类型的容器指数(CI)比较采用t检验,CI、房屋指数(HI)的变化趋势与BI关联性采用皮尔逊相关性分析,不同容器类型的年均CI变化情况采用Cochran-Armitage趋势检验。用Joinpoint5.0.2软件对年均BI值进行趋势分析。结果2015-2022年白纹伊蚊幼蚊BI为5.88~15.36,CI为6.84%~17.10%,HI为4.73%~10.69%。除2016年略有上升外,江西省年均BI整体呈下降趋势。临时性容器的CI呈下降趋势(Z=-18.514,P<0.001),但整体水平高于永久性容器(t=-2.739,P=0.029)。伊蚊幼蚊密度季节消长呈单峰分布,BI峰值主要出现在每年的5-6月,之后呈下降趋势。CI和HI变化趋势与BI基本相同,相关系数分别为0.827(P<0.001)和0.916(P<0.001)。赣北、赣南地区的年均BI值整体高于赣中地区,且5-8月的月平均BI值均>10,9-10月的月均BI值在5~10。2019年BI值超过传播阈值的监测点次最多,月度分析显示6月超过传播阈值的监测点次最多。结论江西省白纹伊蚊密度虽整体呈下降趋势,但仍存在登革热本地传播流行风险,应加强伊蚊综合治理,降低登革热疫情发生风险。

现代数字技术赋能公共卫生高质量发展

在当今信息多元和数字爆炸的时代,物联网、大数据、人工智能、云计算等现代数字技术相互依托、互为补充,共同推动了我国数字化建设。新冠病毒感染的全球大流行更是加速了数字技术在公共卫生领域的应用和发展,使得公共卫生有关数据来源更加广泛且数据结构愈发多样化。在回顾国内外公共卫生信息化发展进程后,发现物联网、遥感技术、5G通信技术、大数据、人工智能、云计算等前沿技术已在传染病监测预测预警、卫生应急处置、慢性病和免疫规划管理、食品安全管理、人才培养、健康宣教等公共卫生多个领域得到了有效应用并取得了诸多成果。尽管数字技术在公共卫生领域应用过程中面临新的挑战,但毋庸置疑的是,公共卫生数字化发展已成为未来的必然方向。

一起人7型腺病毒引起的幼儿园聚集性疫情调查

目的 分析江西省某幼儿园呼吸道感染聚集性疫情的流行病学特点、病例临床特征及病原学特点,探寻疫情发生原因,为此类疫情的防控提供经验.方法 通过询问幼儿园园长和各班级老师,以及调阅医疗机构的病例信息等方式搜索病例.应用流行病学调查表收集病例的基本信息、临床症状、发病经过,以及流行病学史等内容.使用荧光定量PCR仪对采集的病例标本进行病毒核酸检测,并对阳性标本进行病毒分离,使用基因分析仪对扩增产物进行测序,同时采用高通量测序技术获得病毒全基因组序列.结果 本次疫情发病32例,均为学生,发病率为15.69％（32/204）;90.6％（29/32）的病例集中在4月27日至5月4日发病,主要表现为高热、干咳,并伴有肺部炎性改变;病例中年龄最大的6岁,最小的2岁,发病年龄集中在3～5岁,占病例总数的90.6％（29/32）.大（1）班发病率较高,为17.7％（6/34）,学前班发病率较低,为9.4％ （3/32）,差异无统计学意义（x2=2.79,P=0.74）;男性发病率为17.82％（18/101）,女性为13.59％（14/103）,差异无统计学意义（x=0.69,P=0.45）;一楼学生发病率为13.08％（14/107）,二楼为18.56％（18/9）,差异无统计学意义（x2=1.15,P=0.34）.通过病毒核酸检测和全基因组序列测定在病例标本中检出H7型腺病毒.结论 本次疫情是由人H7型腺病毒引起的聚集性疫情,主要通过密切接触和呼吸道飞沫传播.幼儿园通风条件差、晨午检等制度不健全,是造成疾病蔓延的主要原因.

江西省3例H10N8禽流感病毒感染者回顾性分析

目的：分析和探讨江西省H10N8禽流感病毒感染患者的感染来源。方法采用江西省2013年底及2014年年初报告的H10N8禽流感病毒感染患者的流行病学个案调查资料和相关标本检测结果进行描述性流行病学分析。结果3例H10N8感染患者均由重症肺炎监测发现，其中2例死亡，1例病程超过6个月；发病前均有活禽或活禽市场暴露史；3例患者的含漱液或下呼吸道抽吸液标本经南昌市及江西省疾病预防控制中心检测，结果显示为甲型流感2009pdmH1、H3、H5、H7、H9等亚型阴性，患者1和患者2的标本为甲型流感通用引物阳性，患者3的标本为H10阳性。3份标本经国家流感中心进行检测，结果显示为H10N8阳性。33名密切接触者在1周的观察期内未出现流感样症状；患者暴露活禽市场环境监测标本中H10N8禽流感病毒RT-PCR检测阳性率为5.19%；落实各项防控措施后，无新发患者。结论江西省3例H10N8禽流感病毒感染患者可能与暴露于活禽市场有关。

江西省1例H10N8禽流感重症肺炎病例回顾性分析

H10N8禽流感病毒属正粘病毒科，为负链分节段RNA病毒，与H5N1、H7N9禽流感病毒均属于禽流感病毒的一种。据文献报道，自1965年从意大利鹌鹑标本中分离到第1株禽流感H10N8病毒以来，全球共分离到11株病毒，已有毒株均为禽类（主要为野鸟）标本中分离所得。1995年，意大利科学家DeMarcoMA在鸡的血清中分离出H10N8禽流感病毒。

2013年江西省人感染H7N9禽流感病例特征分析

2013年2月以来，我国部分省份相继出现人感染H7N9禽流感疫情，各省陆续采取防控措施，疫情得到了有效的控制。目前人们对人感染H7N9禽流感的认识有限，还不能确切掌握其在环境宿主中的感染状况及传播机制。本研究旨在探讨江西省人感染H7N9禽流感病例的流行病学特征，为做好人感染H7N9禽流感防控工作提供科学依据。

手足口病的流行及其预防控制概况

手足口病是可在全球范围内流行的由肠道病毒引起的多发生于5岁以下儿童的传染病。世界各国学者在手足口病流行和防制对策方面做了许多深入研究,积累了一些经验,取得显著成就。但近年手足口病重症病例和死亡病例大幅上升,高发病率所造成的疾病负担不容忽视,目前仍是一个急待解决的公共卫生问题。本文对近年来手足口病流行概况及防制对策的研究进展进行综述。

IFITM3基因rs12252位点多态性与中国人群流感易感性:基于研究的序贯Meta分析

目的系统评价干扰素诱导跨膜蛋白3 ( interferon-induced transmembrane protein 3 ,IFITM3)基因rs12252位点多态性与中国人群流感易感性的定量关系。方法检索Medline、PubMed、Embase、Web of Science以及中国知网、万方、维普数据库,收集IFITM3与中国人群流感易感性相关的文章。采用Meta分析方法对收集的文章进行定量地综合分析。结果本次研究共纳入7篇文献,共计919例流感感染的病例,涉及到甲型流感(H7N9、HlNlpmd09、H3N2)及乙型流感病毒,序贯Meta分析显示本研究纳入的研究总样本已达到了得到稳定阳性结局所需的样本量。Meta分析结果发现,IFITM3基因的“12252多态性与中国人群流感病毒易感性存在关联,携带rS12252 C 等位基因的人群更易发生流感(C vsT: 0R = 1.67 , 95% CI: 1. 45 ~ 1. 92;CC vs TT: OR=2. 61, 95% CI:1.97~3. 46;TC vs TT: OR= 1.55, 95% CI: 1. 20 - 2. 00;CC vs TC +TT: OR =2.01,95% CI:1.49 ~2.72;CC+TC vs TT: 0R =8.90, 95% CI:4. 94 ~ 16. 06)。结论 IFITM3 基因rs12252位点多态性是中国人群发生流感的危险因素。

江西省2017-2022年其他感染性腹泻流行趋势和预测分析

目的分析江西省2017-2022年其他感染性腹泻流行趋势, 探讨自回归移动平均(ARIMA)模型在江西省其他感染性腹泻发病预测中的应用, 为开展其他感染性腹泻预测和防控工作提供参考。方法对江西省2017-2022年其他感染性腹泻病例进行描述性流行病学分析, 建立ARIMA模型对2023年其他感染性腹泻发病数进行预测。结果 2017-2022年江西省累计报告其他感染性腹泻为204 842例, 年均报告发病率为74.32/10万。全年龄段均有病例报告, 发病呈明显的季节性特征, 存在冬春季(1-3月)和夏秋季(7-9月)两个发病高峰, 且冬春季峰值较高。ARIMA(0, 1, 2)(2, 1, 0)12和ARIMA(1, 0, 0)(2, 1, 0)12模型的各项参数均有统计学意义(P<0.05), 且贝叶斯信息准则值最小分别为13.83和9.12, 残差系列均为白噪声(P>0.05);模型预测值与实际值较为吻合, 预测趋势与实际趋势一致, 模型预测效果较好。结论 2017-2022年其他感染性腹泻发病仍居江西省法定传染病发病前列, 防控形势不可忽视, 应在流行季加强对防控重点人群≤3岁儿童和散居儿童家庭的疾病监测和健康宣教工作。ARIMA模型可用于江西省其他感染性腹泻发病的短期预测和趋势分析。

婺源县肠道症状病例发病趋势预测预警分析

目的探讨自回归移动平均模型(ARIMA)在肠道传染病早期预测预警中的可行性,为早期防控提供参考。方法以婺源县2017—2022年肠道症状监测病例月发病数为基础构建ARIMA乘积季节模型并用2022年月发病数验证评估,预测2023年发病趋势。结果婺源县2017—2022年共报告肠道症状病例2409例,发病数时间序列图显示每年存在春季(3~4月)和秋季(9~10月)2个发病高峰,有较明显的季节性和周期性趋势;构建的最优模型为ARIMA(0,1,1)(1,1,0)12,2022年1~12月预测值和实际值比较结果显示,2022年各月实际发病数均在模型预测的95%CI内,拟合值和实际值相差较小,相对误差9.4%,模型整体拟合效果较好;预测2023年全年发病数349例,时间分布与往年基本一致,将在4月和9月出现发病高峰。结论建立的ARIMA乘积季节模型对监测点肠道症状病例发病数拟合效果较好,可用于短期预测和动态分析。

江西省2013―2018年肾综合征出血热空间自相关分析

目的对江西省2013―2018年肾综合征出血热(hemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS)进行空间自相关分析,探索其空间分布特征。方法利用Excel 2003软件和SPSS 23.0软件对HFRS发病数据进行搜集整理,运用ArcGIS 10.2软件制作省级县区矢量地图,采用空间自相关统计方法对HFRS监测数据在县区级尺度上进行全局及局部聚集性分析。结果2013―2018年江西省累计报告HFRS 3861例,年均发病率为1.41/10万;60岁以上人群发病率最高,为2.22/10万;全局空间自相关分析发现2013―2018年Moran’s I系数在0.233~0.343之间(均有Moran’s I>0,均有P<0.05);局部空间自相关分析显示HFRS发病率呈现出"高-高"、"低-高"、"低-低"三种空间聚集性模式,且均有统计学意义(均有P≤0.05),其中"高-高"聚集区主要集中在宜春市中东部,与高发病率地区描述性分析一致;吉安市、赣州市则表现为"低-低"聚集。结论江西省HFRS发病率整体呈现空间聚集性,"高-高"聚集区主要集中在宜春市的宜丰县、高安市、上高县和奉新县,需重点防控。

江西省2011-2017年人间布鲁氏菌病疫情分析

目的掌握江西省2011-2017年人间布鲁氏菌病疫情特征,为今后的防控工作提供参考依据。方法结合省内监测资料,对江西省2011-2017年在传染病报告信息管理系统中报告的布病病例进行分析。结果 2011-2017年江西省共报告布病239例,年均发病率为0. 08/10万。病例和聚集性疫情集中在南昌市地区(48例/4起)。地市分布由2011年的1个地级市至2016年全覆盖,涉及县(区)数由2011年的1个增长至2017年的68个,扩增趋势明显(x^2趋势=94. 31,P <0. 001)。男女性别比为3. 12∶1(181∶58)。年龄集中在40～65岁年龄组。职业分布以农牧民为主,占59. 83%(143/239)。5～9月为发病高峰(5～6月大高峰和9月小高峰)。2012-2017年共采集血清样本7 160份,阳性率1. 33%(95/7 160)。2013-2017年从193例病例血液中分离出布病菌株62株,羊Ⅰ4株,羊Ⅲ54株,猪Ⅰ4株。结论江西省人间布病疫情呈上升势态,流行范围在不断扩大。有关部门加强监管力度、扩充监测内容可能为今后的布病防控重点。