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益气活血复方治疗硬皮病肺部炎症与纤维化的作用机制:基于生物信息学与网络药理学方法
1
作者
胡梦华
谭乔瑞
+7 位作者
濮伟霖
杜敏
屠文震
孙大燕
杨婧漪
顾逸飞
王久存
孔祥贞
《皮肤性病诊疗学杂志》
2024年第5期303-312,共10页
目的通过生物信息学与网络药理学方法鉴定益气活血复方(YQHX)治疗硬皮病肺部炎症与纤维化的有效成分和关键分子,为硬皮病药物靶点开发提供依据。方法利用一次性气管灌注方法,使用博莱霉素诱导建立肺纤维化小鼠模型。将24只小鼠随机分成...
目的通过生物信息学与网络药理学方法鉴定益气活血复方(YQHX)治疗硬皮病肺部炎症与纤维化的有效成分和关键分子,为硬皮病药物靶点开发提供依据。方法利用一次性气管灌注方法,使用博莱霉素诱导建立肺纤维化小鼠模型。将24只小鼠随机分成PBS对照组、博来霉素组、YQHX对照组、YQHX治疗组,每组6只,分别予以PBS或益气活血复方灌胃处理。利用HE染色、Masson染色方法验证YQHX对小鼠肺组织炎症及纤维化的治疗效果。从TCMSP数据库获取YQHX抗纤维成分丹参的活性成分及靶基因。整合PPI网络、GO/KEGG富集分析、分子对接等多种生物信息学分析,确定丹参治疗硬皮病的主要活性成分及关键靶点,分析相关信号通路。利用免疫组化分析小鼠肺组织标本中CD3抗体、p-PI3K抗体及p-AKT抗体表达情况,验证YQHX对炎症治疗及关键通路的影响。结果HE染色及Masson染色结果显示小鼠肺组织纤维化程度及炎症浸润下降,提示YQHX能够显著改善肺部纤维化、炎症及组织破坏程度。生物信息分析提示丹参中关键成分主要为木犀草素。PPI网络分析发现AKT1、EGFR、ESR1、TNF、IL6为丹参治疗硬皮病的核心靶点。KEGG富集发现基因主要富集在PI3K-AKT通路。分子对接分析发现木犀草素与4个关键靶点间存在潜在结合位点。免疫组化结果表明,YQHX显著降低博来霉素诱导的小鼠肺组织CD3+T细胞浸润、p-PI3K和p-AKT水平。结论YQHX对肺部炎症与纤维化具有显著的疗效。木犀草素可能是YQHX中关键有效分子,其可能通过靶向PI3K-AKT通路治疗硬皮病肺部炎症与纤维化。
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关键词
系统性硬化症
益气活血复方
丹参
肺纤维化
肺部炎症
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职称材料
系统性硬化症表观遗传学研究进展
被引量:
2
2
作者
濮伟霖
郭士成
+1 位作者
陈偲玓
王久存
《上海医药》
CAS
2017年第z1期-,共3页
系统性硬化症是一种复杂的自身免疫性疾病,其病因目前尚不清晰.近年来的研究发现,表观遗传因素参与了多种复杂疾病的发病过程.表观遗传因素由于同时受到遗传和环境因素的影响,可更深入地解释疾病发病相关机制.本文介绍系统性硬化症表观...
系统性硬化症是一种复杂的自身免疫性疾病,其病因目前尚不清晰.近年来的研究发现,表观遗传因素参与了多种复杂疾病的发病过程.表观遗传因素由于同时受到遗传和环境因素的影响,可更深入地解释疾病发病相关机制.本文介绍系统性硬化症表观遗传学研究进展.
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关键词
系统性硬化症表观遗传学
DNA甲基化
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职称材料
系统性硬化症遗传学研究进展
被引量:
1
3
作者
濮伟霖
郭士成
王久存
《上海医药》
CAS
2017年第z1期-,共7页
系统性硬化症又称为硬皮病,是一种复杂的自身免疫性疾病,目前对于该疾病的病因了解尚不清晰.多项研究显示,遗传因素在硬皮病的发病过程中起重要作用.因此对于硬皮病遗传因素的探索有助于我们发现硬皮病发病的相关通路和分子机制.本文介...
系统性硬化症又称为硬皮病,是一种复杂的自身免疫性疾病,目前对于该疾病的病因了解尚不清晰.多项研究显示,遗传因素在硬皮病的发病过程中起重要作用.因此对于硬皮病遗传因素的探索有助于我们发现硬皮病发病的相关通路和分子机制.本文介绍并综述了硬皮病截止目前的遗传学相关研究的前沿进展.
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关键词
硬皮病
遗传全基因组关联研究(GWAS)
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职称材料
ColorMeter和VISIA-CR图像提取肤色的方法对比
4
作者
于一帆
马彦云
+4 位作者
蔡希阳
濮伟霖
刘玮
王一宇
王久存
《临床皮肤科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期15-19,共5页
目的:建立基于VISIA-CR图像提取中国人群面部肤色表型的方法,比较VISIA-CR图像提取的肤色参数与ColorMeter肤色仪测量值的一致性,为利用面部图像数据提取肤色表型建立参考方法。方法:基于机器学习模型自建算法自动批量提取VISIA-CR图像...
目的:建立基于VISIA-CR图像提取中国人群面部肤色表型的方法,比较VISIA-CR图像提取的肤色参数与ColorMeter肤色仪测量值的一致性,为利用面部图像数据提取肤色表型建立参考方法。方法:基于机器学习模型自建算法自动批量提取VISIA-CR图像的肤色参数,并比较提取面积、位置和光源模式对结果的影响;随后利用256例健康人群面部VISIA-CR图像提取的肤色参数与ColorMeter肤色仪测量值进行了Pearson相关性分析。结果:VISIA-CR标准光和交叉偏振光两种模式下提取的肤色参数强相关(L^(*),R=0.86;a^(*),R=0.90;b^(*),R=0.85;P<0.05),相邻或对称位置下不同面积的肤色参数也强相关(R>0.82,P<0.05),提示光源模式、相邻或对称位置和测量面积对VISIA-CR图像提取结果的影响不大。VISIA-CR图像提取的肤色参数与ColorMeter测量值有相关性(P<0.05),其中交叉偏振光模式下,较大提取面积的肤色参数L^(*)值与仪器测量值强相关(R>0.73)。结论:该方法可从VISIA-CR图像中准确提取肤色参数且能较好解决肤色不均的测量偏差问题,交叉偏振光模式和较大提取面积下的肤色参数L^(*)值更接近ColorMeter仪器测量结果,推荐用于肤色表型的提取。
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关键词
肤色
肤色仪
图像提取
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职称材料
题名
益气活血复方治疗硬皮病肺部炎症与纤维化的作用机制:基于生物信息学与网络药理学方法
1
作者
胡梦华
谭乔瑞
濮伟霖
杜敏
屠文震
孙大燕
杨婧漪
顾逸飞
王久存
孔祥贞
机构
复旦大学生命科学学院
粤港澳大湾区精准医学研究院
复旦大学附属华东医院
上海中医药大学附属上海市中西医结合医院
首都医科大学附属北京儿童医院
苏州大学附属第二医院
复旦大学人类表型组研究院
出处
《皮肤性病诊疗学杂志》
2024年第5期303-312,共10页
基金
中国医学科学院院外创新单元项目(2019-I2M-5-066)。
文摘
目的通过生物信息学与网络药理学方法鉴定益气活血复方(YQHX)治疗硬皮病肺部炎症与纤维化的有效成分和关键分子,为硬皮病药物靶点开发提供依据。方法利用一次性气管灌注方法,使用博莱霉素诱导建立肺纤维化小鼠模型。将24只小鼠随机分成PBS对照组、博来霉素组、YQHX对照组、YQHX治疗组,每组6只,分别予以PBS或益气活血复方灌胃处理。利用HE染色、Masson染色方法验证YQHX对小鼠肺组织炎症及纤维化的治疗效果。从TCMSP数据库获取YQHX抗纤维成分丹参的活性成分及靶基因。整合PPI网络、GO/KEGG富集分析、分子对接等多种生物信息学分析,确定丹参治疗硬皮病的主要活性成分及关键靶点,分析相关信号通路。利用免疫组化分析小鼠肺组织标本中CD3抗体、p-PI3K抗体及p-AKT抗体表达情况,验证YQHX对炎症治疗及关键通路的影响。结果HE染色及Masson染色结果显示小鼠肺组织纤维化程度及炎症浸润下降,提示YQHX能够显著改善肺部纤维化、炎症及组织破坏程度。生物信息分析提示丹参中关键成分主要为木犀草素。PPI网络分析发现AKT1、EGFR、ESR1、TNF、IL6为丹参治疗硬皮病的核心靶点。KEGG富集发现基因主要富集在PI3K-AKT通路。分子对接分析发现木犀草素与4个关键靶点间存在潜在结合位点。免疫组化结果表明,YQHX显著降低博来霉素诱导的小鼠肺组织CD3+T细胞浸润、p-PI3K和p-AKT水平。结论YQHX对肺部炎症与纤维化具有显著的疗效。木犀草素可能是YQHX中关键有效分子,其可能通过靶向PI3K-AKT通路治疗硬皮病肺部炎症与纤维化。
关键词
系统性硬化症
益气活血复方
丹参
肺纤维化
肺部炎症
Keywords
systemic sclerosis
Yiqi Huoxue Compound Formula
Danshen
pulmonary fibrosis
lung inflammation
分类号
R28 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
系统性硬化症表观遗传学研究进展
被引量:
2
2
作者
濮伟霖
郭士成
陈偲玓
王久存
机构
复旦大学生命科学学院 上海
出处
《上海医药》
CAS
2017年第z1期-,共3页
基金
国家国际科技合作专项项目,美国国家卫生研究所U01项目
文摘
系统性硬化症是一种复杂的自身免疫性疾病,其病因目前尚不清晰.近年来的研究发现,表观遗传因素参与了多种复杂疾病的发病过程.表观遗传因素由于同时受到遗传和环境因素的影响,可更深入地解释疾病发病相关机制.本文介绍系统性硬化症表观遗传学研究进展.
关键词
系统性硬化症表观遗传学
DNA甲基化
分类号
R593.25 [医药卫生—内科学]
下载PDF
职称材料
题名
系统性硬化症遗传学研究进展
被引量:
1
3
作者
濮伟霖
郭士成
王久存
机构
复旦大学生命科学学院 上海
出处
《上海医药》
CAS
2017年第z1期-,共7页
基金
国家国际科技合作专项,美国NIHU01项目
文摘
系统性硬化症又称为硬皮病,是一种复杂的自身免疫性疾病,目前对于该疾病的病因了解尚不清晰.多项研究显示,遗传因素在硬皮病的发病过程中起重要作用.因此对于硬皮病遗传因素的探索有助于我们发现硬皮病发病的相关通路和分子机制.本文介绍并综述了硬皮病截止目前的遗传学相关研究的前沿进展.
关键词
硬皮病
遗传全基因组关联研究(GWAS)
分类号
R593.25 [医药卫生—内科学]
下载PDF
职称材料
题名
ColorMeter和VISIA-CR图像提取肤色的方法对比
4
作者
于一帆
马彦云
蔡希阳
濮伟霖
刘玮
王一宇
王久存
机构
复旦大学生命科学学院
中国科学院上海营养与健康研究院
中国人民解放军空军特色医学中心皮肤科
出处
《临床皮肤科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期15-19,共5页
基金
上海市市级重大专项“国际人类表型组计划(一期)”项目(基金编号:2017SHZDZX01)
皮肤及皮肤病跨尺度动态特征解析及网络构建项目(基金编号:2019-I2M-5-066)。
文摘
目的:建立基于VISIA-CR图像提取中国人群面部肤色表型的方法,比较VISIA-CR图像提取的肤色参数与ColorMeter肤色仪测量值的一致性,为利用面部图像数据提取肤色表型建立参考方法。方法:基于机器学习模型自建算法自动批量提取VISIA-CR图像的肤色参数,并比较提取面积、位置和光源模式对结果的影响;随后利用256例健康人群面部VISIA-CR图像提取的肤色参数与ColorMeter肤色仪测量值进行了Pearson相关性分析。结果:VISIA-CR标准光和交叉偏振光两种模式下提取的肤色参数强相关(L^(*),R=0.86;a^(*),R=0.90;b^(*),R=0.85;P<0.05),相邻或对称位置下不同面积的肤色参数也强相关(R>0.82,P<0.05),提示光源模式、相邻或对称位置和测量面积对VISIA-CR图像提取结果的影响不大。VISIA-CR图像提取的肤色参数与ColorMeter测量值有相关性(P<0.05),其中交叉偏振光模式下,较大提取面积的肤色参数L^(*)值与仪器测量值强相关(R>0.73)。结论:该方法可从VISIA-CR图像中准确提取肤色参数且能较好解决肤色不均的测量偏差问题,交叉偏振光模式和较大提取面积下的肤色参数L^(*)值更接近ColorMeter仪器测量结果,推荐用于肤色表型的提取。
关键词
肤色
肤色仪
图像提取
Keywords
skin color
color meter
image extraction
分类号
R751 [医药卫生—皮肤病学与性病学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
益气活血复方治疗硬皮病肺部炎症与纤维化的作用机制:基于生物信息学与网络药理学方法
胡梦华
谭乔瑞
濮伟霖
杜敏
屠文震
孙大燕
杨婧漪
顾逸飞
王久存
孔祥贞
《皮肤性病诊疗学杂志》
2024
0
下载PDF
职称材料
2
系统性硬化症表观遗传学研究进展
濮伟霖
郭士成
陈偲玓
王久存
《上海医药》
CAS
2017
2
下载PDF
职称材料
3
系统性硬化症遗传学研究进展
濮伟霖
郭士成
王久存
《上海医药》
CAS
2017
1
下载PDF
职称材料
4
ColorMeter和VISIA-CR图像提取肤色的方法对比
于一帆
马彦云
蔡希阳
濮伟霖
刘玮
王一宇
王久存
《临床皮肤科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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职称材料
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