目的:探索亚裔人群中转化生长因子β(transforming growth factor-β,TGF-β)信号通路基因多态性与非综合征型唇裂合并或不合并腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)的关联及可能存在的基因-基因、基因-...目的:探索亚裔人群中转化生长因子β(transforming growth factor-β,TGF-β)信号通路基因多态性与非综合征型唇裂合并或不合并腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)的关联及可能存在的基因-基因、基因-环境交互作用。方法:选取1038个NSCL/P核心家系作为研究对象。对TGF-β信号通路上的10个基因的343个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点进行了传递不平衡检验(transmission disequilibrium test,TDT),采用条件Logistic回归模型进行基因-基因交互作用分析和基因-环境交互作用分析。研究收集的环境因素包括患儿母亲孕期吸烟、被动吸烟、乙醇摄入量以及维生素使用情况。由于患儿母亲孕期吸烟和饮酒暴露率较低(<3%),因此,仅对母亲孕期被动吸烟及补充多种维生素这两个环境因素与基因之间的交互作用进行了分析。采用Bonferroni法对结果进行多重检验校正,显著性的阈值设置为P=1.46×10-4。结果:共有4个基因的23个SNP位点与NSCL/P之间存在关联(P<0.05),但经过Bonferroni多重检验校正后,这些关联均未达到统计学显著性水平。经过Bonferroni多重检验校正之后,6对SNP[rs4939874(SMAD2)与rs1864615(TGFBR2),rs2796813(TGFB2)与rs2132298(TGFBR2),rs4147358(SMAD3)与rs1346907(TGFBR2),rs4939874(SMAD2)与rs1019855(TGFBR2),rs4939874(SMAD2)与rs12490466(TGFBR2),以及rs2009112(TGFB2)与rs4075748(TGFBR2)]存在显著的统计学交互作用(P<1.46×10-4),基因-环境交互作用的分析没有达到多重检验校正阈值的显著结果。结论:未发现TGF-β通路基因多态性与NSCL/P的关联,该通路上部分基因可能通过基因-基因交互作用影响NSCL/P的发病风险。未来仍需其他独立研究的证据支持,以进一步的探索其中潜在的生物学机制。展开更多
目的:探索非综合征型唇裂伴或不伴腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate, NSCL/P)全基因组常见遗传变异对NSCL/P风险的影响。方法:利用全基因组关联研究(genome-wide association study, GWAS)数据,以全基因组单...目的:探索非综合征型唇裂伴或不伴腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate, NSCL/P)全基因组常见遗传变异对NSCL/P风险的影响。方法:利用全基因组关联研究(genome-wide association study, GWAS)数据,以全基因组单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)遗传度和基因组不同分区SNP遗传度评估基因组上常见变异的效应。对GWAS汇总数据进行质量控制,标准包括数据中无缺失值、弱势等位基因频率≥1%、P值在0~1、SNP正负链明确等。利用连锁不平衡得分回归计算NSCL/P的SNP遗传度,采用分层的连锁不平衡得分回归计算基因组编码区、启动子区、内含子区、增强子区和超级增强子区的分区SNP遗传度,并评估不同分区内的富集度,分析工具为LDSC (v1.0.1)软件。结果:纳入中国人群806个NSCL/P核心家系(2 418人)的GWAS数据,490 593个SNP通过质量控制,被纳入到SNP遗传度的计算中。观测样本中NSCL/P的SNP遗传度为0.55(95%CI:0.28~0.82),由于观测样本患病率较高,按中国人群患病率转换为一般人群后SNP遗传度为0.37(95%CI:0.19~0.55)。SNP遗传度在增强子区的富集度为15.70(P=0.04),在超级增强子区的富集度为3.18(P=0.03)。结论:基因组常见变异有助于解释一部分中国人群NSCL/P目前未被解释的遗传度,同时中国人群NSCL/P的SNP遗传度在增强子分区和超级增强子分区中显著富集,提示该区域中可能存在未被发现的遗传致病因素。展开更多
目的:在缺血性卒中家系中探讨PDE4D基因rs966221位点多态性与缺血性卒中及其相关性状的关系。方法:采用家系研究设计,应用广义估计方程(generalized estimating equation,GEE)进行多因素的回归分析,并用非参数连锁分析和以家系为基础的...目的:在缺血性卒中家系中探讨PDE4D基因rs966221位点多态性与缺血性卒中及其相关性状的关系。方法:采用家系研究设计,应用广义估计方程(generalized estimating equation,GEE)进行多因素的回归分析,并用非参数连锁分析和以家系为基础的关联检验(family based association test,FBAT)进行连锁和关联分析。结果:共纳入276个缺血性卒中家系,776名研究对象。应用GEE控制混杂因素并调整家系内部相关性后,载脂蛋白B、颈动脉内膜中层厚度、高密度脂蛋白胆固醇及血压水平与缺血性卒中相关(P<0.05)。非参数连锁分析和FBAT分析均未发现rs966221位点多态性与缺血性卒中相关,但该位点与卒中相关的数量性状存在连锁和关联关系。非参数连锁分析发现,在调整可能的混杂因素后,rs966221位点与载脂蛋白B(P<0.001)、超敏C反应蛋白水平(P=0.003)、收缩压(P=0.036)存在连锁;在调整高脂血症、高血压等疾病的患病状态后,rs966221位点TT基因型(P=0.019)和CT基因型(P=0.007)与颈动脉内膜中层厚度相关,显性模型中C等位基因与颈动脉内膜中层厚度具有统计学关联(P=0.019)。结论:血脂、血压的异常以及颈动脉内膜中层增厚与缺血性卒中相关,PDE4D基因rs966221位点与载脂蛋白B、超敏C反应蛋白及收缩压水平存在连锁,该位点C等位基因与颈动脉内膜中层厚度具有统计学关联。展开更多
目的:采集终末期骨关节炎患者接受全膝关节置换术前的功能全面评价指标,并与轻度骨关节炎患者进行比较,评价疼痛、患者自我报告量表、基于表现的躯体功能以及实际日常活动水平之间的相关性。方法:前瞻性研究设计,获取87例因终末期骨...目的:采集终末期骨关节炎患者接受全膝关节置换术前的功能全面评价指标,并与轻度骨关节炎患者进行比较,评价疼痛、患者自我报告量表、基于表现的躯体功能以及实际日常活动水平之间的相关性。方法:前瞻性研究设计,获取87例因终末期骨关节炎而接受单侧全膝关节置换术患者术前的全面躯体功能参数,并招募年龄接近的60例轻度骨关节炎患者[Kellgren-Lawrence(K-L)分级0-2级]采集相同的躯体功能参数。所采集的数据包括患者的年龄、身高、体重、30秒座椅站立测试(30 s chair stand test,30-CST)、40米快速步行测试(40 m fast-paced walk test,40-FPWT)、12级爬楼梯测试(12 steps stair climb test,12-SCT)、3米起立行走测试(timed up&go test,TUG)、6分钟步行测试(6 minute walk test,6-MWT)、美国西部Ontario和Mc Master大学骨关节炎指数评分(The Western Ontario and Mc Master Universities Osteoarthritis Index,WOMAC)、美国膝关节协会评分(knee society score,KSS)、可视化疼痛评分(visual analogue scale,VAS)以及连续7 d的每日步数。使用SPSS 22.0软件进行统计学分析,首先对各项数据的观察值进行描述性报告,使用Kolmogorv-Smirnov检验每一变量是否符合正态分布,结果两组的每一变量均不符合正态分布,因而采用非参数Mann-Whitney检验两组间差异,应用Spearman相关分析评估各项参数之间的相关性。结果:轻度骨关节炎组患者的VAS评分、WOMAC评分、KSS评分、日均步数以及各项基于表现的躯体功能测试结果均优于终末期骨关节炎组患者,两组间差异有统计学意义(P〈0.05)。轻度骨关节炎组内,各项躯体功能测试均与各项自我报告量表无显著相关性或有较弱相关性;终末期骨关节炎组内,各项躯体功能测试与各项自我报告量表之间有着不同强度的相关性。结论:描述了多项躯体功能参数在中国轻度骨关节炎与终末期骨关节炎患者中的应用,基于表现的躯体功能、实际日常活动水平、患者自我报告量表以及疼痛评分之间并不一定有较好的相关性,需要对骨关节炎患者进行更全面地评估并制定相应的全膝关节置换术手术决策标准。展开更多
文摘目的:探索亚裔人群中转化生长因子β(transforming growth factor-β,TGF-β)信号通路基因多态性与非综合征型唇裂合并或不合并腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)的关联及可能存在的基因-基因、基因-环境交互作用。方法:选取1038个NSCL/P核心家系作为研究对象。对TGF-β信号通路上的10个基因的343个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点进行了传递不平衡检验(transmission disequilibrium test,TDT),采用条件Logistic回归模型进行基因-基因交互作用分析和基因-环境交互作用分析。研究收集的环境因素包括患儿母亲孕期吸烟、被动吸烟、乙醇摄入量以及维生素使用情况。由于患儿母亲孕期吸烟和饮酒暴露率较低(<3%),因此,仅对母亲孕期被动吸烟及补充多种维生素这两个环境因素与基因之间的交互作用进行了分析。采用Bonferroni法对结果进行多重检验校正,显著性的阈值设置为P=1.46×10-4。结果:共有4个基因的23个SNP位点与NSCL/P之间存在关联(P<0.05),但经过Bonferroni多重检验校正后,这些关联均未达到统计学显著性水平。经过Bonferroni多重检验校正之后,6对SNP[rs4939874(SMAD2)与rs1864615(TGFBR2),rs2796813(TGFB2)与rs2132298(TGFBR2),rs4147358(SMAD3)与rs1346907(TGFBR2),rs4939874(SMAD2)与rs1019855(TGFBR2),rs4939874(SMAD2)与rs12490466(TGFBR2),以及rs2009112(TGFB2)与rs4075748(TGFBR2)]存在显著的统计学交互作用(P<1.46×10-4),基因-环境交互作用的分析没有达到多重检验校正阈值的显著结果。结论:未发现TGF-β通路基因多态性与NSCL/P的关联,该通路上部分基因可能通过基因-基因交互作用影响NSCL/P的发病风险。未来仍需其他独立研究的证据支持,以进一步的探索其中潜在的生物学机制。
文摘目的:探索非综合征型唇裂伴或不伴腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate, NSCL/P)全基因组常见遗传变异对NSCL/P风险的影响。方法:利用全基因组关联研究(genome-wide association study, GWAS)数据,以全基因组单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)遗传度和基因组不同分区SNP遗传度评估基因组上常见变异的效应。对GWAS汇总数据进行质量控制,标准包括数据中无缺失值、弱势等位基因频率≥1%、P值在0~1、SNP正负链明确等。利用连锁不平衡得分回归计算NSCL/P的SNP遗传度,采用分层的连锁不平衡得分回归计算基因组编码区、启动子区、内含子区、增强子区和超级增强子区的分区SNP遗传度,并评估不同分区内的富集度,分析工具为LDSC (v1.0.1)软件。结果:纳入中国人群806个NSCL/P核心家系(2 418人)的GWAS数据,490 593个SNP通过质量控制,被纳入到SNP遗传度的计算中。观测样本中NSCL/P的SNP遗传度为0.55(95%CI:0.28~0.82),由于观测样本患病率较高,按中国人群患病率转换为一般人群后SNP遗传度为0.37(95%CI:0.19~0.55)。SNP遗传度在增强子区的富集度为15.70(P=0.04),在超级增强子区的富集度为3.18(P=0.03)。结论:基因组常见变异有助于解释一部分中国人群NSCL/P目前未被解释的遗传度,同时中国人群NSCL/P的SNP遗传度在增强子分区和超级增强子分区中显著富集,提示该区域中可能存在未被发现的遗传致病因素。
文摘目的:在缺血性卒中家系中探讨PDE4D基因rs966221位点多态性与缺血性卒中及其相关性状的关系。方法:采用家系研究设计,应用广义估计方程(generalized estimating equation,GEE)进行多因素的回归分析,并用非参数连锁分析和以家系为基础的关联检验(family based association test,FBAT)进行连锁和关联分析。结果:共纳入276个缺血性卒中家系,776名研究对象。应用GEE控制混杂因素并调整家系内部相关性后,载脂蛋白B、颈动脉内膜中层厚度、高密度脂蛋白胆固醇及血压水平与缺血性卒中相关(P<0.05)。非参数连锁分析和FBAT分析均未发现rs966221位点多态性与缺血性卒中相关,但该位点与卒中相关的数量性状存在连锁和关联关系。非参数连锁分析发现,在调整可能的混杂因素后,rs966221位点与载脂蛋白B(P<0.001)、超敏C反应蛋白水平(P=0.003)、收缩压(P=0.036)存在连锁;在调整高脂血症、高血压等疾病的患病状态后,rs966221位点TT基因型(P=0.019)和CT基因型(P=0.007)与颈动脉内膜中层厚度相关,显性模型中C等位基因与颈动脉内膜中层厚度具有统计学关联(P=0.019)。结论:血脂、血压的异常以及颈动脉内膜中层增厚与缺血性卒中相关,PDE4D基因rs966221位点与载脂蛋白B、超敏C反应蛋白及收缩压水平存在连锁,该位点C等位基因与颈动脉内膜中层厚度具有统计学关联。
文摘目的:采集终末期骨关节炎患者接受全膝关节置换术前的功能全面评价指标,并与轻度骨关节炎患者进行比较,评价疼痛、患者自我报告量表、基于表现的躯体功能以及实际日常活动水平之间的相关性。方法:前瞻性研究设计,获取87例因终末期骨关节炎而接受单侧全膝关节置换术患者术前的全面躯体功能参数,并招募年龄接近的60例轻度骨关节炎患者[Kellgren-Lawrence(K-L)分级0-2级]采集相同的躯体功能参数。所采集的数据包括患者的年龄、身高、体重、30秒座椅站立测试(30 s chair stand test,30-CST)、40米快速步行测试(40 m fast-paced walk test,40-FPWT)、12级爬楼梯测试(12 steps stair climb test,12-SCT)、3米起立行走测试(timed up&go test,TUG)、6分钟步行测试(6 minute walk test,6-MWT)、美国西部Ontario和Mc Master大学骨关节炎指数评分(The Western Ontario and Mc Master Universities Osteoarthritis Index,WOMAC)、美国膝关节协会评分(knee society score,KSS)、可视化疼痛评分(visual analogue scale,VAS)以及连续7 d的每日步数。使用SPSS 22.0软件进行统计学分析,首先对各项数据的观察值进行描述性报告,使用Kolmogorv-Smirnov检验每一变量是否符合正态分布,结果两组的每一变量均不符合正态分布,因而采用非参数Mann-Whitney检验两组间差异,应用Spearman相关分析评估各项参数之间的相关性。结果:轻度骨关节炎组患者的VAS评分、WOMAC评分、KSS评分、日均步数以及各项基于表现的躯体功能测试结果均优于终末期骨关节炎组患者,两组间差异有统计学意义(P〈0.05)。轻度骨关节炎组内,各项躯体功能测试均与各项自我报告量表无显著相关性或有较弱相关性;终末期骨关节炎组内,各项躯体功能测试与各项自我报告量表之间有着不同强度的相关性。结论:描述了多项躯体功能参数在中国轻度骨关节炎与终末期骨关节炎患者中的应用,基于表现的躯体功能、实际日常活动水平、患者自我报告量表以及疼痛评分之间并不一定有较好的相关性,需要对骨关节炎患者进行更全面地评估并制定相应的全膝关节置换术手术决策标准。