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基于转录组测序的乌桕叶色相关基因的挖掘
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作者 王晓晓 郑旭 +2 位作者 赵文静 缪美华 刘兴满 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第8期1521-1532,共12页
乌桕(Triadica sebifera)耐盐碱能力强,叶色随季节变化显著,尤以秋季观赏性最佳,是园林绿化中常用的彩叶植物。为揭示乌桕叶片呈色的分子机制,本研究对自主选育的3个乌桕品种连桕1号、云台红桕、云台金桕转色前后的叶片进行转录组测序,... 乌桕(Triadica sebifera)耐盐碱能力强,叶色随季节变化显著,尤以秋季观赏性最佳,是园林绿化中常用的彩叶植物。为揭示乌桕叶片呈色的分子机制,本研究对自主选育的3个乌桕品种连桕1号、云台红桕、云台金桕转色前后的叶片进行转录组测序,共获得123.78 GB测序数据,70815个高质量单一基因序列(Unigenes),其中48367个Unigenes得到了功能注释。将3个乌桕品种转色前后的转录组数据进行两两对比,各比较组之间鉴定出共有的差异表达基因(DEG)2674个。GO分析发现,DEG主要与细胞过程、细胞、结合等生物学功能相关。通过KEGG Pathway功能分析,筛选出53个与乌桕叶色相关的DEG,包括与花青素合成有关的基因14个,与卟啉和叶绿素代谢有关的基因22个,与类胡萝卜素生物合成有关的基因17个。其中花青素合成途径相关基因在乌桕转色后相对表达量上升,叶绿素、类胡萝卜素合成途径相关基因相对表达量下降,而叶绿素、类胡萝卜素降解途径相关基因相对表达量上升,该结果与叶片中色素含量的变化趋势一致。本研究结果可为探究乌桕叶片呈色机制提供理论依据。 展开更多
关键词 乌桕 叶色变化 转录组 基因挖掘 分子机制 呈色
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洋葱无蜡粉突变体特性初步研究
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作者 惠林冲 潘美红 +6 位作者 陈微 李威亚 何林玉 张仕林 缪美华 陈振泰 杨海峰 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期1376-1385,共10页
为了探索洋葱蜡粉缺失突变体的特征特性和形态学应用价值,选择20份无蜡粉材料进行田间表型特征观察及叶面蜡质成分分析,并对突变株进行SSR引物筛选。结果表明,洋葱无蜡粉叶片呈亮绿色,有光泽,遗传分析发现叶片蜡粉受隐性基因控制;突变... 为了探索洋葱蜡粉缺失突变体的特征特性和形态学应用价值,选择20份无蜡粉材料进行田间表型特征观察及叶面蜡质成分分析,并对突变株进行SSR引物筛选。结果表明,洋葱无蜡粉叶片呈亮绿色,有光泽,遗传分析发现叶片蜡粉受隐性基因控制;突变株表现为苗期长势相对弱,产量与品种特性相关;突变株叶片表现出无或少蓟马危害症状,不使用杀虫剂能够达正常洋葱使用杀虫剂抗葱蓟马的效果,并建立无蜡粉洋葱抗蓟马评价标准;叶表超微结构观察及蜡粉成分分析发现:突变体叶表面蜡粉严重缺失,有少量蜡粉,不足为人眼观察到,但在抽薹开花末期,花薹表面有一层淡淡光亮白色蜡粉。气相色谱分析叶表面蜡质主要成分均为酰胺、酚类、酮类、烃类、酯类,但无蜡粉叶片中16-三十一酮含量差异显著,由相对含量52.66%降至2.79%,导致叶表面无蜡粉现象;对19061单株自交分离的有蜡粉与无蜡粉植株进行SSR引物筛选,引物196和304可作为单株特异标记能够将19061有蜡粉与无蜡粉区分,但不能区分其他无蜡粉与有蜡粉材料。因此,洋葱无蜡粉突变体初步研究为洋葱形态学标记和杂交制种应用、抗葱蓟马研究奠定重要基础。 展开更多
关键词 洋葱 蜡粉 突变体
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洋葱离体雌核诱导与单倍体愈伤再生体系建立的研究 被引量:1
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作者 李威亚 潘美红 +6 位作者 惠林冲 陈微 张仕林 缪美华 陈振泰 何林玉 杨海峰 《江西农业学报》 CAS 2023年第7期68-74,共7页
以不同洋葱品种的离体花蕾为外植体,开展了雌核胚状体诱导及单倍体愈伤再生的培养试验。试验结果表明:洋葱的离体花蕾适宜采用0.1%HgCl_(2)溶液消毒;在B5培养基中,2.0 mg/L 2,4-D+2.0 mg/L 6-BA的激素配比最适于洋葱离体花蕾雌核胚状体... 以不同洋葱品种的离体花蕾为外植体,开展了雌核胚状体诱导及单倍体愈伤再生的培养试验。试验结果表明:洋葱的离体花蕾适宜采用0.1%HgCl_(2)溶液消毒;在B5培养基中,2.0 mg/L 2,4-D+2.0 mg/L 6-BA的激素配比最适于洋葱离体花蕾雌核胚状体的诱导,出胚率最高达4.6%;在MS培养基中,1.5 mg/L 2,4-D+2.5 mg/L 6-BA的激素配比最适于洋葱雌核胚状体的愈伤诱导,诱导率接近100%;在不含任何激素的MS培养基中,再生芽的诱导成功率最高,达75%左右;在只含0.5 mg/L 2,4-D的MS培养基中,再生芽均能诱导出根系。经流式细胞仪进行倍性鉴定,洋葱离体雌核单倍体的诱导成功率达97%,洋葱单倍体植株经炼苗、定植后的大田存活率在90%以上。 展开更多
关键词 洋葱 花蕾 愈伤组织 再生体系 单倍体 定植
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基于转录组的洋葱bHLH转录因子家族鉴定与生物信息学分析 被引量:1
4
作者 陈微 潘美红 +6 位作者 惠林冲 李威亚 郇国磊 何林玉 缪美华 陈振泰 杨海峰 《江苏农业科学》 北大核心 2023年第5期11-18,共8页
bHLH转录因子家族是真核生物中重要的转录因子家族,在植物生长发育、次生代谢和逆境应答中发挥重要作用。本研究利用转录组数据对洋葱基因家族成员进行筛选和鉴定,并对家族成员进行理化性质、保守基序、亚细胞定位、系统发育和蛋白互作... bHLH转录因子家族是真核生物中重要的转录因子家族,在植物生长发育、次生代谢和逆境应答中发挥重要作用。本研究利用转录组数据对洋葱基因家族成员进行筛选和鉴定,并对家族成员进行理化性质、保守基序、亚细胞定位、系统发育和蛋白互作生物信息学分析,同时对bHLH基因家族在洋葱幼苗中的表达情况进行分析。结果表明,从洋葱转录组共鉴定到36个bHLH基因,预测编码蛋白质含有的氨基酸数量为127~610个,且均为亲水性蛋白,系统发育分析表明,洋葱bHLH基因家族分为12个亚族,同一亚族的大多数基因具有相似的保守基序,大多数bHLH基因在洋葱幼苗中表达,不同基因的表达量水平差异较大。本研究结果为进一步研究洋葱bHLH转录因子家族的生物学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 洋葱 BHLH 转录因子 生物信息学分析
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洋葱薹木质素含量测定与分析 被引量:3
5
作者 陈微 潘美红 +5 位作者 惠林冲 李威亚 何林玉 缪美华 陈振泰 杨海峰 《浙江农业科学》 2023年第6期1553-1555,共3页
木质素主要存在于植物增厚的细胞壁中,对于细胞壁的结构完整性以及茎的刚度和强度至关重要。另外,木质素含量及其单体组成是影响植物食用口感、可消化性的主要因素。本研究对洋葱薹和大蒜薹中的木质素含量进行分析,并采用番红-固绿进行... 木质素主要存在于植物增厚的细胞壁中,对于细胞壁的结构完整性以及茎的刚度和强度至关重要。另外,木质素含量及其单体组成是影响植物食用口感、可消化性的主要因素。本研究对洋葱薹和大蒜薹中的木质素含量进行分析,并采用番红-固绿进行染色。结果显示,洋葱薹中木质素含量高于大蒜薹,其中洋葱薹中部位置木质素含量较高,在薹的表皮、皮层、分泌细胞、维管束、髓部薄壁细胞都有木质素的存在,其中以皮层最多,研究结果为探讨洋葱薹可食用性奠定基础。 展开更多
关键词 洋葱 木质素 番红-固绿
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低温胁迫下海滨木槿的转录组分析
6
作者 赵文静 郑旭 +3 位作者 葛金涛 刘兴满 缪美华 孔祥伟 《江苏农业科学》 北大核心 2023年第5期56-64,共9页
海滨木槿(Hibiscus hamabo Sieb.et Zucc.)是一种典型的耐盐植物,甚至能够在海水中生长,是沿海滩涂绿化的绝佳绿化树种,但在栽培试验中发现海滨木槿不耐寒,很难在北方地区越冬。为探究海滨木槿在低温胁迫下的分子应答机制,挖掘海滨木槿... 海滨木槿(Hibiscus hamabo Sieb.et Zucc.)是一种典型的耐盐植物,甚至能够在海水中生长,是沿海滩涂绿化的绝佳绿化树种,但在栽培试验中发现海滨木槿不耐寒,很难在北方地区越冬。为探究海滨木槿在低温胁迫下的分子应答机制,挖掘海滨木槿的抗寒基因,培育耐寒海滨木槿,通过转录组测序(RNA-seq)的试验方法分析海滨木槿在低温胁迫下的差异基因表达情况。试验结果表明,低温胁迫下的处理组与常温对照相比,共有23689个差异表达基因,其中上调表达基因10256个,下调表达基因13433个。通过GO富集分析,发现差异基因大多富集在代谢过程、细胞过程、膜、催化活性等方面;通过KEGG的富集分析,发现这些差异基因大多富集在代谢途径、次生代谢物的生物合成、光合作用、植物昼夜节律、植物激素信号转导等方面,本研究还筛选了一些潜在的耐寒差异基因,如FKF1、GI、PYL、PP2C、CML、CPK、SNRK2、NCED和BIN2等。本试验结果可为研究海滨木槿的耐寒机制以及培育海滨木槿耐寒品种提供技术参考和基础。 展开更多
关键词 海滨木槿 低温胁迫 转录组 差异基因 耐寒
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橘红心大白菜新品种连红1号的选育
7
作者 李威亚 陈微 +5 位作者 惠林冲 杨海峰 何林玉 缪美华 陈振泰 潘美红 《浙江农业科学》 2023年第5期1147-1149,共3页
连红1号是由连云港云台农场农户提供原始育种材料,经4代典型性状筛选、壮株自交提纯育得的橘红心大白菜新品种。该品种棵型较小,外叶深绿色,叶球切开后会由橘黄色变为橘红色,β-胡萝卜素、维生素C含量高。株高30 cm左右,单株重1.5~2.0 ... 连红1号是由连云港云台农场农户提供原始育种材料,经4代典型性状筛选、壮株自交提纯育得的橘红心大白菜新品种。该品种棵型较小,外叶深绿色,叶球切开后会由橘黄色变为橘红色,β-胡萝卜素、维生素C含量高。株高30 cm左右,单株重1.5~2.0 kg,生长期为70 d,抗软腐病、黑斑病、根肿病等,适合江苏、山东、河南等地区推广种植。 展开更多
关键词 大白菜 连红1号 选育 品种
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尿微量蛋白检测对过敏性紫癜患儿早期肾损伤的临床价值 被引量:6
8
作者 缪美华 邵雪君 +1 位作者 冯建国 丁云芳 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2004年第5期429-431,共3页
目的 :探讨尿微量蛋白检测对过敏性紫癜患儿早期肾损伤的临床价值。方法 :免疫透射比浊法测定尿M Alb ,β2 MG ,α1 MG ,U TRF和U IgG。结果 :过敏性紫癜患儿组 5项尿微量蛋白检测结果与正常儿童对照组有显著性差异 ,但又与肾炎综合征... 目的 :探讨尿微量蛋白检测对过敏性紫癜患儿早期肾损伤的临床价值。方法 :免疫透射比浊法测定尿M Alb ,β2 MG ,α1 MG ,U TRF和U IgG。结果 :过敏性紫癜患儿组 5项尿微量蛋白检测结果与正常儿童对照组有显著性差异 ,但又与肾炎综合征患儿组存在非常显著性差异 ,5项尿微量蛋白联合检测发现过敏性紫癜患儿有早期肾损伤的阳性率达 5 7 14 %。结论 :尿微量蛋白检测可较好地反映肾损害程度 ,有助于过敏性紫癜患儿早期肾损伤的诊断。 展开更多
关键词 过敏性紫癜 尿微量蛋白 肾损伤 儿童
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黄皮洋葱新品种连葱6号的选育 被引量:4
9
作者 缪美华 薛萍 +2 位作者 陈振泰 黄晓峰 杨海峰 《中国蔬菜》 北大核心 2007年第6期37-38,共2页
连葱6号是以中甲高黄为母本、以从日本引进的9307为父本杂交后经多代系统选育而成。中熟,生育期250d(天)左右,株高60—70cm;鳞茎圆球形,球形指数0.85以上,外皮金黄色、有光泽,内部鳞片白色,辛辣味淡,有甜味;单球质量300g左... 连葱6号是以中甲高黄为母本、以从日本引进的9307为父本杂交后经多代系统选育而成。中熟,生育期250d(天)左右,株高60—70cm;鳞茎圆球形,球形指数0.85以上,外皮金黄色、有光泽,内部鳞片白色,辛辣味淡,有甜味;单球质量300g左右,分球率低,假茎较细,符合出口标准;耐贮藏;每667m^2产量6000kg左右。 展开更多
关键词 洋葱 连葱6号 黄皮 耐贮藏
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连云港地区梅的栽培品种和栽培技术
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作者 赵文静 郑旭 +3 位作者 王晓晓 缪美华 王都军 刘兴满 《安徽林业科技》 2023年第4期44-46,共3页
梅是我国传统树种,自古以来备受广大人民喜爱和推重。本文介绍了连云港地区梅的主要栽培品种,并从种植、树形选择、修剪、施肥和病虫害管理阐述了其在引种和栽培过程中的一些技术方法,以供广大园林工作者参考。
关键词 品种 栽培 技术
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紫皮洋葱新品种连葱8号的选育 被引量:4
11
作者 缪美华 薛萍 +2 位作者 陈振泰 杨海峰 黄晓峰 《中国蔬菜》 北大核心 2007年第8期37-38,共2页
连葱8号是以日本紫皮为母本、汉城紫玉为父本杂交后经5代系统选育而成。中熟,生育期250d(天)左右;植株生长势强,株高65~75cm,叶片上冲,灰绿色,蜡粉多而厚;鳞茎扁圆形,球形指数0.72,外皮深紫色,有光泽,辣味较淡,商品性好;单球质量250g左... 连葱8号是以日本紫皮为母本、汉城紫玉为父本杂交后经5代系统选育而成。中熟,生育期250d(天)左右;植株生长势强,株高65~75cm,叶片上冲,灰绿色,蜡粉多而厚;鳞茎扁圆形,球形指数0.72,外皮深紫色,有光泽,辣味较淡,商品性好;单球质量250g左右,每667m2产量5000~6000kg;适宜黄淮地区及气候相似地区种植。 展开更多
关键词 洋葱 连葱8号 紫皮
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巨细胞病毒感染对婴幼儿肝脏损害的回顾性分析 被引量:8
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作者 缪美华 邵雪君 +2 位作者 朱宏 徐俊 丁云芳 《中国中西医结合儿科学》 2010年第3期258-259,共2页
目的探讨人巨细胞病毒(HCMV)感染对婴幼儿肝功能的损害。方法采用荧光定量PCR法和ELISA定量法分别对147例疑感染HCMV住院患儿进行HCMV DNA和HCMVIgM抗体的定量检测,并对符合HCMV感染的阳性标本进行肝功能回顾性分析。结果共有72例患儿符... 目的探讨人巨细胞病毒(HCMV)感染对婴幼儿肝功能的损害。方法采用荧光定量PCR法和ELISA定量法分别对147例疑感染HCMV住院患儿进行HCMV DNA和HCMVIgM抗体的定量检测,并对符合HCMV感染的阳性标本进行肝功能回顾性分析。结果共有72例患儿符合HCMV感染诊断标准,回顾性分析肝功能指标血清总胆红素(TBIL)、谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(AST)和谷氨酰转肽酶(GGT)均高于正常值,差异均有统计学意义(P<0.001);按年龄分组,0~3个月组4个指标均高于正常值,差异均有统计学意义(P<0.001),>3个月组TBIL与正常值间差异无统计学意义(P>0.05),余3个指标均高于正常值,差异均有统计学意义(P<0.05)。0~3个月组和>3个月组TBIL和GGT两组间差异均有统计学意义(P<0.001,0.05),ALT和AST两组间差异无统计学意义(P>0.05)。在0~3个月组TBIL与HCMV DNA拷贝数存在相关性。结论 HCMV感染患儿肝脏易受HCMV侵害,造成肝功能损害,尤其是出生至3个月的幼小婴儿,其TBIL与HCMV DNA拷贝数相关。 展开更多
关键词 巨细胞病毒/感染 肝功能损害 传染病 荧光定量PCR HCMV IGM抗体 儿童
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儿童食物不耐受与血清中IgG的关系 被引量:12
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作者 缪美华 邵雪君 朱宏 《中国中西医结合儿科学》 2010年第1期62-64,共3页
目的探讨儿童食物不耐受的病因机制。方法酶联免疫吸附法(ELISA)半定量检测710例临床疑似有食物不耐受症状的住院患儿血清中14种食物特异性IgG抗体,分析不同食物不耐受源在研究群体中的分布;免疫比浊法定量检测血清总IgG抗体,研究其与... 目的探讨儿童食物不耐受的病因机制。方法酶联免疫吸附法(ELISA)半定量检测710例临床疑似有食物不耐受症状的住院患儿血清中14种食物特异性IgG抗体,分析不同食物不耐受源在研究群体中的分布;免疫比浊法定量检测血清总IgG抗体,研究其与食物不耐受敏感度的关系,分析其在不同食物不耐受阳性组间的水平差异。结果研究对象中血清食物特异性IgG抗体阳性率蛋清/蛋黄最高,达72.8%(517/710);牛奶其次,阳性率为41.4%(294/710);鳕鱼阳性率为15.2%(108/710);蟹阳性率为13.4%(95/710);2种以上食物不耐受阳性率在所研究群体中的占比达52.7%,总IgG与食物不耐受累计敏感度存在线性正相关关系。3种以上食物不耐受同时阳性时,总IgG与阴性组差异有统计学意义(P<0.01),1种和2种食物不耐受阳性组与阴性组间差异无统计学意义(P>0.05)。结论在所调查儿童群体中食物不耐受以鸡蛋、牛奶为主,其次为水产海鲜。检测食物特异性IgG、血清总IgG,对了解食物不耐受现象,判断产生不耐受的食物品种,制定饮食计划,禁食或少食不耐受食物,改善病症提供了重要手段。 展开更多
关键词 食物不耐受 免疫球蛋白类 超敏反应 特异性IGG抗体 总IgG抗体 儿童
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婴幼儿人巨细胞病毒感染154例PCR与ELISA检测比较 被引量:5
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作者 缪美华 邵雪君 +2 位作者 朱宏 徐俊 丁云芳 《南通大学学报(医学版)》 2009年第6期447-448,共2页
目的:探讨采用不同的定量方法及不同的标本检测婴幼儿人巨细胞病毒(HCMV)感染阳性率。方法:采用荧光定量PCR法和ELISA定量法分别对154例疑感染HCMV住院患儿进行HCMV DNA和HCMV IgM抗体的定量检测,其中对73例患儿的血及尿标本同时进行HCM... 目的:探讨采用不同的定量方法及不同的标本检测婴幼儿人巨细胞病毒(HCMV)感染阳性率。方法:采用荧光定量PCR法和ELISA定量法分别对154例疑感染HCMV住院患儿进行HCMV DNA和HCMV IgM抗体的定量检测,其中对73例患儿的血及尿标本同时进行HCMV DNA的检测。结果:血和尿HCMV DNA同时检测,尿检出率明显高于血;血和尿HCMVDNA检出率明显高于血清HCMV IgM;两种方法的联合检测进一步提高阳性率。结论:两种方法同时检测可提高HCMV的检出率;尿标本HCMV DNA的检出率明显高于血标本,采用尿标本更方便,且阳性率高。 展开更多
关键词 巨细胞病毒 荧光定量 聚合酶链反应 人巨细胞病毒IgM抗体 儿童
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黄皮洋葱新品种港葱三号的选育 被引量:1
15
作者 缪美华 陈振泰 +2 位作者 薛萍 黄晓峰 杨海峰 《长江蔬菜》 北大核心 2007年第2期55-56,共2页
港葱三号是以中甲高黄为母本、富永中生为父本配组杂交后,经多代系统选择育成。具有优质、高产、耐贮等优点,平均每667m2产量5000 ̄6500kg,比对照连引洋葱1号增产35.7%。目前已在省内外示范推广1265hm2。
关键词 黄皮洋葱 港葱三号 品种选育 耐贮
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优质高产抗病芦笋新品系“96-1”选育 被引量:2
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作者 缪美华 陈沁滨 +1 位作者 薛萍 陈振秦 《上海农业科技》 2003年第1期58-58,共1页
关键词 96-1品系 抗病品种 品种特性 芦笋 选育
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早熟高效黄皮洋葱品种比较试验 被引量:2
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作者 缪美华 徐秋芳 +2 位作者 陈沁滨 薛萍 陈振泰 《长江蔬菜》 2003年第3期44-44,共1页
关键词 黄皮洋葱 品种比较 试验 产量
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黄皮洋葱新品种连葱6号
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作者 缪美华 陈振泰 +2 位作者 薛萍 王振业 罗利 《长江蔬菜》 北大核心 2008年第6期7-7,共1页
连葱6号是连云港市蔬菜研究所育成的黄皮洋葱新品种,适合黄淮地区及气候相似地区种植,表现高产、耐贮、抗病等特点。2007年1月通过审定,经苏北、鲁南等地试种后,深受农户欢迎。
关键词 黄皮洋葱 新品种 蔬菜研究所 连云港市 黄淮地区 育成 耐贮 抗病
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洋葱新品种港葱四号的选育
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作者 缪美华 薛萍 +2 位作者 陈振泰 杨海峰 黄晓峰 《长江蔬菜》 北大核心 2007年第3期42-43,共2页
1 选育经过 为进一步满足长江流域洋葱生产的需要,从1995年开始,开展了优质、高效的黄皮洋葱新品种的选育工作。经过近10年的努力,育成了优质、高效的黄皮洋葱新品种港葱四号。
关键词 黄皮洋葱 新品种 选育 长江流域 优质
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黄皮洋葱新品种连葱4号的选育
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作者 缪美华 陈振泰 +2 位作者 薛萍 杨海峰 黄晓峰 《长江蔬菜》 北大核心 2006年第5期47-48,共2页
连葱4号是以连引洋葱1号为母本、富永中生为父本配组杂交后,经多代系统选择育成。具有优质、高产、抗病等优点。平均每667m2产量5000~6500kg,适于长江流域地区种植。
关键词 洋葱 连葱4号 优质高产 品种选育
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