长顺绿壳蛋鸡GRIN1基因3′非翻译区的多态性及其与蛋壳品质的关联性

【目的】探索长顺绿壳蛋鸡GRIN1基因3′非翻译区(untranslated region,UTR)多态性对蛋壳品质的影响。【方法】选择185只健康蛋鸡,测定其第45周龄产蛋的蛋质量、蛋形指数、蛋壳强度、蛋壳厚度和蛋壳质量5个指标;使用NCBI和PrimerPremier 3.0设计引物,采用正向测序法筛选GRIN1基因在3′UTR区域的SNP位点。【结果】GRIN1基因的3′UTR检测到4个SNP位点:g.30871C>T、g.31017A>G、g.31158A>C和g.31166G>C,其中仅g.31158A>C和g.31166G>C之间存在强连锁不平衡,且g.30871C>T和g.31017A>G都极显著偏离哈代—温伯格平衡(P<0.01)。g.31017A>G与蛋壳品质的关联分析中,GG基因型的蛋质量显著高于AA基因型(P<0.05)。4个SNP位点共产生5个单倍型(H1、H2、H3、H4、H5)和8个双倍型(H1H1、H1H2、H1H3、H2H2、H2H3、H2H4、H3H5、H4H4),双倍型H3H5的蛋质量显著高于双倍型H2H2和H2H3(P<0.05),双倍型H3H5的蛋壳质量显著高于双倍型H2H2(P<0.05),其他双倍型指标间的差异未达到显著水平(P>0.05)。【结论】长顺绿壳蛋鸡GRIN1基因与蛋壳品质存在显著关联;g.31017A>G对蛋壳品质有显著影响,能够作为改善蛋壳品质的分子标记位点参考。

柯乐猪MMP2基因多态性及其与繁殖性状的关联分析

【目的】探究基质金属蛋白酶2(matrix metallopeptidase 2,MMP2)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)及其与繁殖性状的相关性,筛选与柯乐猪繁殖性状相关的遗传标记。【方法】试验选择212头健康的经产柯乐母猪,采用直接测序法筛选柯乐猪MMP2基因SNP位点,利用RNAfold在线软件预测MMP2基因不同单倍型mRNA二级结构,并通过SPSS 22.0软件分析MMP2基因SNP位点与柯乐猪繁殖性状的相关性。【结果】在柯乐猪MMP2基因第2外显子中检测到1个SNP位点(g.30062403 C>T),在第4外显子中检测到2个SNPs位点(g.30065309 C>T和g.30065312 C>T),均存在3种基因型(CC、CT和CT)。遗传特性分析结果显示,g.30062403 C>T位点为低度多态,g.30065309 C>T和g.30065312 C>T位点属于中度多态。卡方适合性检验结果显示,g.30062403 C>T位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),另2个位点均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。连锁不平衡分析结果显示,g.30065309 C>T和g.30065312 C>T位点之间存在强连锁不平衡。单倍型mRNA二级结构分析显示,单倍型H1的mRNA二级结构与原序列相同,其他3种单倍型均导致mRNA二级结构和最小自由能发生变化。关联分析结果显示,g.30062403 C>T位点TT基因型个体的窝产活仔数显著高于CC基因型,断奶窝重显著高于CT基因型(P<0.05);g.30065309 C>T位点CC基因型个体的断奶仔数显著高于TT基因型(P<0.05);g.30065312 C>T位点TT基因型个体的窝产活仔数、断奶仔数均显著高于CT基因型(P<0.05)。双倍型H2H2为窝产仔数、窝产活仔数、断奶仔数、断奶窝重的优势双倍型,H1H4为初生窝重的优势双倍型。【结论】柯乐猪MMP2基因3个SNPs位点与其窝产仔数、窝产活仔数、初生窝重、断奶仔数及断奶窝重均存在显著关联性,可作为分子育种遗传标记。

柯乐猪OPN基因多态性及其与繁殖性状的关联分析

本文旨在研究柯乐猪骨调素(Osteopontin,OPN)基因多态性及其与繁殖性状的关系,为该品种的遗传改良和优化繁殖计划提供理论依据。采用PCR产物直接测序法检测200头柯乐猪OPN基因第6外显子的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)位点,通过RNAfold预测OPN基因突变前后的mRNA二级结构,并利用SPSS 26.0软件分析OPN基因SNP位点与柯乐猪繁殖性状的相关性。结果显示,在OPN基因第6外显子中筛查到5个SNPs位点,分别为g.131083657 A>G、g. 131083770 A>G、g.131083791A>C、g.131083805C>T和g.131083806G>C位点,均产生3种基因型,且均为中度多态,其中g.131083657 A>G和g.131083806G>C位点属于错义突变,分别导致丙氨酸突变为络氨酸、缬氨酸突变为丙氨酸。卡方检验结果显示,5个SNPs位点均符合Hardy-Weinberg平衡,且5个SNPs位点两两之间存在强连锁不平衡。5个SNPs联合产生4种单倍型和5种双倍型,突变后单倍型H3(GAACG)的mRNA二级结构稳定性增加,而H4(GGATC)和H1(AAACG)稳定性减弱,突变后单倍型H1、H3在三级结构第109个氨基酸前后和158个氨基酸处有明显变化。关联分析结果表明,各位点与产活仔猪数、断奶仔猪数和断奶窝重呈显著相关,g.131083657 A>G、g.131083770 A>G和g.131083791A>C位点有利基因型均为AA,g.131083805C>T、g.131083806G>C位点有利基因型分别为CC和GG。双倍型H1H1(AAAAAACCGG)个体产活仔猪数和断奶仔猪数优于双倍型H1H2(AGAGACCTCG)及H3H3个体(GGAAAACCGG)(P<0.05),H1H1和H2H3(GGAGACCTCG)断奶平均重显著低于H1H2。本研究揭示OPN基因第6外显子上的5个突变位点与柯乐猪的产活仔猪数、断奶仔猪数和断奶窝重3个繁殖性能指标均存在显著关联,可作为柯乐猪繁殖性状选择的候选分子标记。

不同配比低蛋白日粮饲喂兴义矮脚鸡的效果试验

为了探究不同配比低蛋白日粮对兴义矮脚鸡的饲喂效果,随机选取1日龄健康兴义矮脚鸡90只,平均分为3组,每组30只,公、母鸡各15只,各组采用不同配比日粮连续饲喂至126日龄,测定体重、料重比、经济效益。结果:(1)126日龄平均体重:Ⅰ组为(1 626.73±47.48)g、Ⅱ组为(1 412.48±50.00)g、Ⅲ组为(1 655.87±48.73)g,Ⅰ、Ⅲ组均显著高于Ⅱ组(P<0.05);(2)料重比:Ⅰ组为8.35、Ⅱ组为9.87、Ⅲ组为7.89,Ⅰ、Ⅲ组饲料转化率较高;(3)养殖效益:126日龄出栏销售,Ⅰ组利润8.00元/只,Ⅱ组利润3.20元/只,Ⅲ组利润6.13元/只。结论:综合比较,试验Ⅰ组日粮配方增重效果和经济效益最好。

白羽王鸽MyoG基因多态性及其与体尺和肉质性状的关联分析

【目的】研究白羽王鸽肌细胞生成素(myogenin,MyoG)基因多态性及其与体尺和肉质性状的关系,为该品种的分子标记选育工作提供参考依据。【方法】以108只12周龄的白羽王鸽为研究对象,利用PCR直接测序法筛查白羽王鸽MyoG基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,通过RNAfold预测MyoG基因突变前后的mRNA二级结构,并利用SPSS 26.0软件分析MyoG基因SNP位点与白羽王鸽体尺和肉质性状的相关性。【结果】在白羽王鸽MyoG基因外显子3上检测到4个SNPs位点:g.590075 C>T、g.590084 G>A、g.590102 G>A和g.590114 C>T,均为同义突变,且均产生3种基因型,其中,g.590075 C>T位点呈低度多态,其余3个SNPs位点均呈中度多态。卡方检验结果显示,g.590084 G>A和g.590114 C>T位点均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),且两个位点之间存在强连锁不平衡。g.590084 G>A和g.590102 G>A位点突变导致MyoG基因mRNA序列二级结构和自由能发生改变。4个SNPs联合产生4种单倍型和9种双倍型。关联分析结果表明,g.590075 C>T位点与白羽王鸽龙骨长呈极显著关联(P<0.01);g.590102 G>A位点对体斜长有极显著效应(P<0.01);双倍型H3H3(CCAAAACC)个体的体斜长优于其余双倍型,H4H4(TTGGGGCC)个体在龙骨长和胸宽方面优于其他双倍型。g.590084 G>A和g.590114 C>T位点与白羽王鸽胸肌的剪切力呈极显著或显著关联(P<0.01;P<0.05);双倍型H3H3(CCAAAACC)个体在胸肌的pH和肉色方面优于其余双倍型,而在剪切力和失水率方面,双倍型H2H4(CTGAGGCT)和H4H4(TTGGGGCC)表现较优。【结论】MyoG基因对白羽王鸽部分体尺和肉质性状有显著影响,可作为白羽王鸽新品系培育的候选基因。

贵州省黔西南自治州家禽产业发展情况及建议

文章从养殖品种及规模、区域布局、发展成效方面概述了黔西南自治州家禽产业的发展情况,针对存在的问题提出建立完善良繁体系、实施标准化生产、培育龙头企业、加强产品加工流通、强化招商引资、打造特色品牌的对策建议。

鸭SCD1基因启动子多态性对血清生化指标的遗传效应

【目的】分析鸭SCD1基因启动子多态性与血清生化指标的遗传效应,揭示鸭SCD1基因启动子的生理调控机制,为今后开展畜禽SCD1基因研究及遗传标记选育提供参考依据。【方法】构建基因组DNA池,利用PCR-RFLP结合DNA直接测序技术检测鸭SCD1基因启动子区遗传变异情况,采用Meg Align寻找SNP位点,通过在线启动子分析软件预测SNP位点对鸭SCD1基因启动子g.952260~g.954527区域转录因子的影响,并以SPSS 19.0分析启动子酶切位点变异对父母代樱桃谷鸭血清生化指标的遗传效应。【结果】从樱桃谷鸭SCD1基因启动子g.952260~g.954527区域共检测到11个SNPs位点。其中,g.952323C>A和g.952661A>G位点突变分别致使原有转录因子D1和Sp1消失;g.952702A>G位点突变则产生新的转录因子TEC1;g.952591T>C、g.952868A>T、g.952869T>G、g.952971G>C和g.953301T>C突变区域无转录因子结合位点,也未产生新的转录因子结合位点;g.952873T>G和g.954401T>C位点突变未引起转录因子改变;g.954239C>T位点突变导致原有转录因子Sp1、Sp1、Tra-1和AP-2α改变为Sp1、Tra-1、ETF和Sp1。通过PCR-Bgl II-RFLP和直接测序比对分析,发现g.952868A>T和g.952869T>G双碱基突变造成原始序列AGT_(952868)G_(952869)CT突变成AGA_(952868)T_(952869)CT,而产生新的Bgl II酶切位点,共产生3种基因型:CC(2268 bp)、CD(2268+1659+609 bp)和DD(1659+609 bp),2个等位基因(C和D)。CC基因型和C等位基因分别为优势基因型和优势等位基因,其频率分别为0.710和0.805;有效等位基因数(Ne)和多态信息含量(PIC)分别为1.458和0.265,属中度多态位点;卡方(χ~2)检验结果表明,Bgl II酶切位点突变所产生的基因型分布严重偏离哈代—温伯格平衡(χ~2>χ_(0.01)~2,P<0.01)。Bgl II酶切位点变异与父母代樱桃谷鸭血清生化指标的关联性分析结果表明,总体上以DD基因型樱桃谷鸭的血清生化指标略优于其他两种基因型。【结论】樱桃谷鸭SCD1基因启动子g.952260~g.954527区域共筛查到11个SNPs位点,其中g.952868A>T和g.952869T>G位点变异产生新的Bgl II酶切位点,且该酶切位点变异可能对鸭血清生化指标有调控效应。

鸭LXRα基因过表达对原代肝细胞及PC3细胞脂质代谢的效应研究

旨在探究鸭LXRα基因对脂肪代谢的表达调控机制,本试验以pEGFP-N3为载体,构建携带HIS标签的LXRα基因真核过表达载体,并将过表达载体分别转染鸭原代肝细胞及PC3细胞,使用鸭HIS标签试剂盒测定LXRα基因在肝细胞及PC3细胞中的过表达量,分析该基因分别在两种细胞中过表达与各脂质指标含量的相关性,进而探究其对鸭肝细胞及PC3细胞脂质代谢的调控作用。试验结果显示,LXRα基因在两种细胞中过表达与三酰甘油含量(triglyceride,TG)及高密度脂蛋白(high density lipoprotein,HDL)含量均呈极显著正相关关系(P<0.01),与总胆固醇(total cholesterol,TC)含量及低密度脂蛋白含量(low density lipoprotein,LDL)则均呈极显著负相关关系(P<0.01)。本研究揭示了LXRα基因过表达对TG和HDL的合成代谢有重要的正向调控作用,对TC和LDL具有反向调控作用,且在这两种类型的细胞中调控机制相似。这一研究结果将对今后深入研究LXRα基因在脂质代谢网络通路中的作用及解决鸭体脂肪过度沉积等问题奠定理论基础。

2种多不饱和脂肪酸对樱桃谷鸭脂质和SREBP1基因表达的效应

多不饱和脂肪酸(polyunsaturated fatty acids,PUFAs)主要通过调控脂肪生成基因和脂肪分解基因的表达来实现畜禽机体脂质的动态平衡。为了探明亚油酸和二十碳五烯酸(eicosapentaenoic acid,EPA)对肉鸭脂质和固醇调节元件结合1(sterol regulatory elemement binding protein 1,SREBP1)基因表达的影响,设置基础饲粮组、基础饲粮+4%亚油酸组、基础饲粮+4%EPA 3个处理饲喂樱桃谷母鸭,4、6、8和10周龄检测SREBP1mRNA表达丰度和脂质含量,分析其表达与脂质指标的相关性。结果表明:饲粮中添加亚油酸和EPA可引起胸肌中饱和脂肪酸(saturated fatty acids,SFA)、多不饱和脂肪酸(PUFA)、必需脂肪酸(essential fatty acids,EFA)和血清甘油三酯(triglyceride,TG)、总胆固醇(total cholesterol,TCHO)、高密度脂蛋白(high density lipoprotein,HDL)的明显升高,说明2种脂肪酸对脂肪酸组成和脂质有影响,且亚油酸的影响效果强于二十碳五烯酸;引起SREBP1基因mRNA表达量下降,表明2种脂肪酸对SREBP1基因的转录具有抑制作用;SREBP1基因表达与腹脂、肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)、不饱和脂肪酸(unsaturated acids,UFA)、多不饱和脂肪酸(PUFA)、必需脂肪酸(EFA)、甘油三酯(TG)、总胆固醇(TCHO)呈显著正相关(P<0.05),表明SREBP1表达对脂质沉积有正向效应。综合结果揭示亚油酸和二十碳五烯酸与SREBP1基因互作调控肉鸭脂肪沉积。

黔画乌鸡肌肉品质测定

为了解黔画乌鸡肌肉品质,试验随机抽取同批出雏、健康无病、饲养管理相同的180日龄黔画乌鸡80只,公、母各半,屠宰后进行肌肉品质测定。结果表明:黔画乌鸡肌肉肉色较好,嫩度及pH值适中;胸肌粗蛋白和粗脂肪含量分别为22.50%和1.56%,水分、Ca和Mg的含量较高,其他化学指标都较为适中;黔画乌鸡胸肌中的11种脂肪酸中油酸、亚油酸、棕榈酸、硬脂酸占总脂肪酸的92.12%,不饱和脂肪酸含量为71.15%,饱和脂肪酸含量为28.85%,经计算必需脂肪酸含量为18.27%;总氨基酸含量为75.63g/(100g),其中必需氨基酸含量为30.38g/(100g),鲜味氨基酸含量为21.52g/(100g),非必需氨基酸含量为23.73g/(100g)。说明黔画乌鸡具有优秀的肌肉品质及脂肪酸、氨基酸组成,可作为优质肉食品加工的理想素材。

IP3R1基因表达、变异对蛋鸭蛋壳品质的影响

IP3R1是钙释放通道蛋白,通过调控细胞质内Ca^2+浓度进而发挥其生物学功能。为探讨IP3R1基因对三穗鸭蛋壳品质的遗传效应,采用实时荧光量PCR和PCR产物直接测序法检测54只三穗鸭IP3R1基因的组织表达谱和SNP多态位点。结果表明:IP3R1 mRNA在11个组织中均存在不同程度的表达,其表达顺序为肺>心脏>肌胃>胸肌>肝脏>胰腺>肾脏>腺胃>子宫>小肠>脾脏;首次在IP3R1基因内含子14检测到g.253779 T>C和g.253967 C>A 2个SNPs突变位点,内含子18发现g.257089G>A、g.257159C>G和g.257237T>G 3个SNPs突变位点,5个SNPs位点均为中度多态位点;卡方(χ^2)检验结果表明,除g.257089G>A位点外,其余4个SNPs位点的基因型分布均未偏离Hard-Weinberg平衡;关联分析结果表明,g.257159C>G位点对蛋重和蛋壳重分别具有极显著和显著影响,g.257237T>G位点对蛋形指数的影响达显著水平(P<0.05)。结果提示,g.257159C>G和g.257237T>G可作为鸭蛋壳品质选择的遗传标记。

长顺绿壳蛋鸡IL8RB基因多态性检测

为了提升家禽抗逆性,为生产安全优质禽产品提供参考依据,试验选择长顺绿壳蛋鸡对其IL8RB基因多态性进行检测并采用混合基因池进行PCR扩增,结合直接测序法对IL8RB基因进行单核苷酸多态性(SNP)筛查。结果表明:在长顺绿壳蛋鸡IL8RB基因启动子区g. 22 589 018～g.225 895 571区域检测到5个SNPs位点(g.22 589 318,T<C; g.22 589 424,T<C; g.22 589 468,C>G;g.22 589 477,T<C; g.22 589 486,T<C),基因型CC和等位基因C分别为优势基因型和优势等位基因,其多态信息含量(PIC)只有g.22 589 468一个突变位点呈低度多态,另外4个突变位点呈中度多态,且5个突变位点的等位基因数(Ne)均较为均匀。说明长顺绿壳蛋鸡在自然群体中的遗传多样性较为丰富,应在长顺绿壳蛋鸡的饲养管理、疾病防控、繁殖等方面加强保护,提升其抗逆性。

长顺绿壳蛋鸡OCX-32基因变异对蛋壳品质的效应研究

为了进一步了解蛋壳基质蛋白OCX-32基因对鸡蛋壳品质的遗传效应,试验以长顺绿壳蛋鸡为研究对象,在测定蛋壳质量后翅静脉采血提取DNA,采用PCR扩增并结合PCR产物直接测序法对OCX-32基因进行单核苷酸多态性(SNP)筛查及与蛋壳品质的关联分析。结果表明:在长顺绿壳蛋鸡OCX-32基因中检测到2个SNP位点,即位于外显子4的g.22 598 071 C>T错义突变,产生2种基因型(CC和CT),其中C为优势等位基因,其频率为0.900,属于低度多态位点;位于内含子4的g.22 598 730T>A突变,产生3种基因型(TT、TA和AA),T为优势等位基因,其频率为0.650,属于中度多态位点。关联性分析结果显示,g.22 598 071 C>T位点对长顺绿壳蛋鸡蛋壳强度、蛋比重、蛋壳比例和蛋白高度有显著影响(P<0.05),g.22 598 730 T>A位点对长顺绿壳蛋鸡的蛋品质10个指标无显著影响(P>0.05)。说明g.22 598 071 C>T位点可能作为鸡蛋壳品质选择的一个遗传标记,OCX-32基因与长顺绿壳蛋鸡蛋品质存在一定的相关性,可作为发掘长顺绿壳蛋鸡蛋品质的分子育种标记。

长顺绿壳蛋鸡FGF23基因遗传变异分析

为进一步了解长顺绿壳蛋鸡FGF23基因的遗传效应,试验随机抽取同日出雏、健康无病、同等管理条件下饲喂10周龄的100只长顺绿壳蛋鸡,翅静脉采血,提取DNA,采用混合基因池进行PCR扩增,结合直接测序法对FGF23基因进行单核苷酸多态性(SNP)筛查。结果表明,在长顺绿壳蛋鸡FGF23基因启动子区共筛查到3个SNP突变位点(g.73424388,T>C;g.73424577,T<C;g.73424660,G>C),其中,g.73424388和g.73424660两个突变位点呈中度多态,g.73424577呈低度多态,说明长顺绿壳蛋鸡在自然群体中的遗传多样性较为丰富。

鸭ChREBP基因表达载体构建及其对原代肝细胞和PC3细胞脂质性状的影响

【目的】探究鸭原代肝细胞脂质含量与碳水化合物反应元件结合蛋白基因(ChREBP)表达的关联性,为深入研究ChREBP基因对畜禽脂质代谢的遗传调控机制提供参考依据。【方法】采用Ⅳ型胶原酶消化法分离孵化21 d的鸭胚原代肝细胞,以DMEM高糖培养基进行培养。利用RT-PCR扩增鸭ChREBP基因编码区(CDS)序列,构建携带His标签的真核表达载体pEGFP-N3-ChREBP-His,通过脂质体法分别转染鸭胚原代肝细胞和人前列腺癌细胞(PC3);采用His标签检测试剂盒检测ChREBP基因的表达量,以脂质指标测定试剂盒测定甘油三酯(TG)、总胆固醇(TC)、高密度脂蛋白(HDL)和低密度脂蛋白(LDL)的含量,并分析鸭胚原代肝细胞和PC3细胞中ChREBP基因表达与脂质指标含量的相关性。【结果】以构建的真核表达载体pEGFP-N3-ChREBP-His转染鸭原代肝细胞和PC3细胞均能发出绿色荧光,表明携带His标签的ChREBP基因能在鸭原代肝细胞和PC3细胞中表达。ChREBP基因表达量与鸭原代肝细胞和PC3细胞中的TG、TC和HDL含量均呈极显著正相关(P<0.01,下同),与LDL含量呈极显著负相关。【结论】以构建的真核表达载体pEGFP-N3-ChREBP-His转染鸭原代肝细胞和PC3细胞后均能发出绿色荧光,说明ChREBP基因表达对鸭原代肝细胞和PC3细胞中的脂质代谢作用机理相似,可促进细胞脂质累积。

鸭SCD1基因对PC3细胞脂质性状的效应分析

为了探究鸭SCD1基因对PC3细胞脂质性状的影响,本研究构建了鸭SCD1基因的真核表达载体,转染前列腺PC3癌细胞,测定SCD1基因的表达量及脂质指标,分析SCD1基因对各脂质指标的影响,结果表明,鸭SCD1基因表达与甘油三酯、总胆固醇及低密度脂蛋白(LDL)呈极显著正相关,与高密度脂蛋白(HDL)呈极显著负相关,这表明,鸭SCD1基因的表达能够促进PC3细胞的脂质代谢速率,能够为PC3细胞的快速癌变增值提供必要的脂质需求及能量供应,据此推测,鸭SCD1基因的表达有可能对鸭的癌症病变的发生与发展有一定影响,在今后畜禽疾病防控研究中,可以通过分子标记技术,加强SCD1基因的监测,为畜禽的高效生产提供保障。

番鸭LXRα基因5'-UTR多态对脂肪酸组成的效应分析

为了探讨LXRα基因5'-UTR多态对番鸭脂肪酸组成的遗传效应,采用PCR-SSCP结合DNA测序的方法筛查白羽番鸭和天柱番鸭LXRα基因5'-UTR多态位点,一般线性模型分析基因型与脂肪酸组成的相关性。结果表明,在番鸭LXRα基因5'-UTR检测到1个SNP:53G>A,产生3种基因型:GG、GA和AA,2个等位基因G和A;53G>A位点在2个番鸭群体中均属于中度多态位点,GG和G均为优势等位基因,3种基因型分布均未偏离Hardy-Weinberg平衡(p>0.05);53G>A位点基因型对C12:1、C15:0和C20:2有显著影响,G和A等位基因间的加性效应未达到显著性差异(p>0.05),C15:0在G和A等位基因间显性效应达显著水平(p<0.05)。

SREBP-1基因表达对血清生化指标的效应分析

为丰富SREBP-1基因的功能研究并更好地选育优质鸭种奠定理论基础。本研究以鸭为试验材料,运用q PCR技术研究SREBP-1基因组织表达规律,并分析其与所测血清生化指标间的关联性。结果表明,SREBP-1基因在鸭9个组织中存在差异性表达。其中,在腹脂中表达最高,皮脂和肾次之,在肝、脾、小肠、肌胃、心及肺中均有少量表达;SREBP-1基因与甘油三酯、低密度胆固醇、总胆固醇,总蛋白及低密度脂蛋白显著或极显著正相关,与高密度胆固醇显著负相关。推测SREBP-1基因对鸭脂质代谢具有调控作用。

鸭FTO基因多态位点筛选和生物信息学分析

为挖掘FTO基因的SNP,为今后进一步研究该基因遗传变异奠定基础。本研究以樱桃谷鸭为试验对象,构建DNA池,对第2外显子、第4外显子和第5外显子直接测序,筛选与脂质性状相关的SNP位点。结果表明:FTO基因存在2个SNPs位点突变,在第5外显子发现1个SNP位点突变,另外一个在g.33942位点处,碱基A突变为碱基G,引起天冬氨酸(GAT)变为甘氨酸(GGT),在g.33781位点处,存在碱基T和A的突变(在内含子处,没有引起氨基酸的改变);RNA二级结构的最小自由能由-475.50 kcal/mol变为-477.40 kcal/mol。蛋白质二级结构分析发现,突变前后,α螺旋、β转角、延伸链和自由卷曲数值均有所改变。其中,α螺旋所占比例有所下降,但比重仍为最大,自由卷曲数量由原来的186个减少到185,比例由33.27%减少32.09%。突变前后多态位点导致FTO基因编码的蛋白三级结构也有所改变。FTO基因筛选出的SNP位点,引起RNA二级结构甚至是其编码的蛋白质结构的改变,可能进一步引起功能的改变。

樱桃谷鸭SREBP1基因变异对脂肪含量及血清生化指标的关联性研究

SREBP1基因在畜禽脂肪沉积过程中起着重要的调控作用,为探究SREBP1基因变异对鸭脂肪含量及血清生化指标的遗传效应,本研究选取10周龄的樱桃谷鸭100只(♂58,♀42)为研究对象,利用DNA直接测序法检测基因的SNP_S位点,一般线性模型分析基因变异与脂肪含量及血清生化指标的关联性。结果表明:在樱桃谷鸭SREBP1基因CDS区第999位碱基发生C/G突变,导致第333个密码子CTC转变成CTG,编码的亮氨酸(L)没有发生改变;第1 124位碱基发生A/G突变,导致第375个密码子GAC转变成GGC,编码的天冬氨酸(D)改变成甘氨酸(G);2个SNPs位点共产生6种基因型:AA、AB、BB、BC、CC、AC,3个等位基因A、B、C,等位基因A为优势等位基因,其频率为0.42,杂合度和多态信息含量分别为0.66和0.58,属于高度多态,χ~2检验表明,樱桃谷鸭群体中该多态座位基因型分布处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。关联分析显示, BB基因型的甘油三酯和肌内脂肪含量最高,显著高于其他5种基因型(P<0.05)。结果揭示BB基因型是脂肪沉积的有利基因型,等位基因B是有利等位基因,可用于选择高脂的樱桃谷鸭品系。