基于网站服务器构建亚硝胺类基因毒性化合物数据库

目的:旨在构建一个全面的亚硝胺类杂质信息库,以助力研究人员方便地获取该类杂质的基本信息、毒性预测数据以及高分辨质谱数据。方法:收集可能存在于药物中的亚硝胺类化合物,利用PubChem等数据库对化合物的基本信息进行补充与完善。采用Derek和Sarah软件对化合物的基因毒性进行预测评估。同时,基于QTOF采集化合物的高分辨质谱数据。在完成数据的收集与整理后,运用Java编程语言搭建网站服务器,遵循MTV模式开发数据分析平台,实现数据信息的互联网共享。结果:成功构建了用户友好的亚硝胺类化合物信息查询平台。该平台能够清晰展示化合物的基本信息、基因毒性评估结果以及在标准条件下的质谱数据,方便研究人员快速了解化合物相关属性,并为后续的实验和研究提供参考。结论:所构建的亚硝胺类化合物分析平台不仅丰富了药物安全领域的数据资源,而且通过提供标准的分析结果,为药物的安全性和风险控制工作提供了数据支撑。

基于规定日服用剂量改进药物肝毒性预测方法的研究

目的基于支持向量机算法,研究规定日服用剂量对肝毒性预测模型预测准确度的影响。方法从公开数据库中收集药物肝毒性、结构和规定日服用剂量信息,得到207条数据。将数据集按4∶1分割为训练集和测试集,提取定量评估类药性理化性质作为特征,并加入规定日服用剂量作为新特征,基于支持向量机构建肝毒性预测模型,评估模型性能。对数据随机分割100次,重复上述建模步骤,考察加入新特征后,模型预测性能的变化。结果加入规定日服用剂量后,支持向量机在测试集上的主要评估指标都有所提升,平均准确率、召回率、精准度和受试者工作曲线的AVC分别为0.763、0.773、0.779、0.832,相对于不加入新特征,分别提升了0.088、0.103、0.074、0.105。结论规定日服用剂量能够明显提升肝毒性预测模型的预测准确性。

何首乌肝毒性物质基础研究进展

目的 分析何首乌致肝损伤相关报道,讨论其致肝毒性的物质基础。方法 通过查阅中国知网、万方数据、维普网、PubMed和Web of Science等数据库,对近25年来报道何首乌肝损伤的潜在肝毒性成分进行回顾性研究。结果 何首乌中蒽醌类、二苯乙烯类、萘类成分及真菌毒素等可能是其诱发“固有肝毒性”“特异质肝毒性”“协同作用致肝毒性”“外源污染物致肝毒性”的主要物质基础。结论 何首乌致肝损伤的物质基础较复杂,有必要进一步对其不同类型化学成分进行急性毒性及肝毒性作用机制研究,以期为何首乌肝毒性研究提供参考,并为其临床合理用药提供建议。

实验室小规模微生物琼脂平板发酵培养操作模式优化

微生物发酵主要分为固态和液态两种模式，在实验室和工业生产中，固态和液态发酵培养均具有广泛的应用。在科研单位微生物实验室中，琼脂平板（或培养皿）和摇瓶分别是微生物固态与液态发酵培养的常用器皿；琼脂培养基平板不仅可以用于制备液态发酵的起始种子或孢子悬液，更可以为科研单位微生物实验室提供一定数量的发酵培养物，用于分离纯化或积累目标样品化合物。

基于谱聚类的何首乌天然产物聚类分析

目的对何首乌中的天然产物进行聚类分析,建立一种较为科学的天然产物聚类方法,为后续化合物挑选、药理筛选提供技术指导。方法从文献中收集并整理何首乌天然产物,选择二苯乙烯类、蒽醌类等主要类别化合物作为聚类对象,转换为简化分子线性输入规范(SMILES),并使用rdkit提取化合物的扩展连通性指纹和理化性质作为特征,经过方差筛选得到有效的特征。使用谱聚类算法,对何首乌天然产物进行聚类,以Calinski Harabaz(CH)指数作为评估指标,优化聚类参数。采用优化后最佳参数对化合物进行聚类,分析各类别的特点。随后对3种主要类别的化合物进行主成分分析,查看主要类别的空间分布。最后对主要类别化合物分别计算脂水分配系数和拓扑极性表面积,分析性质分布,验证聚类合理性。结果从文献中挑选13个类别的123个何首乌天然产物。经过特征提取和过滤,共得到207个特征。CH指数表明聚类数量为10,γ为0.004时聚类效果最佳。主成分分析显示3个主要成分组在空间中各自成簇,无重叠情况发生。经过聚类后,脂水分配系数和拓扑极性表面积2个指标倾向更加集中。结论谱聚类算法不仅能够区分何首乌天然产物中差异较大的化合物,也能较好地对复杂化合物进行聚类,聚类结果具有一定的合理性,能够为传统药理筛选提供新的思路。

珍贵束丝放线菌产生的新代谢产物1-羟基-4-O-鼠李糖-2-萘甲酸甲酯

目的发现珍贵束丝放线菌ATCC 31565产生的新代谢产物。方法TLC和LC-MS等分析珍贵束丝放线菌ATCC 31565培养物的乙酸乙酯提取物,发现目标化合物。采用MCI色谱柱和半制备HPLC等分离纯化目标化合物。对目标化合物的NMR等数据进行分析,确定其化学结构。结果从珍贵束丝放线菌ATCC 31565中发现了一个化学结构为1-羟基-4-O-鼠李糖-2-萘甲酸甲酯的新化合物,并将其命名为珍贵酚。结论推测珍贵酚是1,4-二羟基-2-萘甲酸(甲萘醌的生物合成前体物)和L-鼠李糖这两个初级代谢产物的脱水缩合产物再经过甲酯化形成的。

何首乌中1个新的木脂素酰胺类化合物

目的对何首乌Polygonum multiflorum 70%乙醇提取物进行化学成分研究,并考察部分化合物对正常人L02肝细胞生长的影响。方法采用大孔吸附树脂(DM-8型)、ODS反相硅胶、MCI和制备液相等多种色谱技术进行分离纯化,运用质谱和现代波谱学技术对化合物进行结构鉴定;采用CCK-8法,以细胞抑制率为评价指标,考察部分化合物对L02肝细胞生长的影响。结果从何首乌70%乙醇提取物中分离得到8个化合物,分别鉴定为(E)-2-(4-hydroxy-3-methoxyphenyl)-3-[N-2-(4-hydroxyphenyl)ethyl]carbamoyl-5-[N-2-(4-hydroxyphenyl)ethyl]carbamoylethenyl-7-methoxybenzofuran(1)、cannabisin D(2)、grossamide(3)、eleutherinol(4)、isolariciresinol(5)、N,N-二甲基-色氨酸甲酯(6)、N-反式-阿魏酰酪胺(7)和N-反式阿魏酰-3-甲氧基酪胺(8)。化合物1、7和8对L02肝细胞的半数抑制浓度(IC50)分别为3.02、190.35、300.61μmol/L。结论化合物1为新的木脂素酰胺类化合物,命名为何首乌庚素。化合物2~6均为首次从该植物中分离得到,并通过二维核磁谱补充了化合物4和6的核磁数据。化合物1对正常人L02肝细胞具有较强的抑制作用。

天然药物国际注册数据库的构建设想

本文提出以天然药物为研究对象,系统检索美国、欧盟、日本、韩国、新加坡、中国香港地区、巴西、马来西亚、南非等代表性国家和地区的天然药物注册情况及技术要求,联合世界卫生组织草药产品注册监管联盟等机构,构建天然药物国际注册标准数据库及天然药物国际注册品种数据库。详细说明该数据库建立的主要信息来源、系统框架设计思路、方法和特点。希望能积极推动相关数据库的建设,发挥整合优势,进一步加快中医药国际化前进步伐,为中药走出国门、服务全球提供强有力技术支撑。

基于随机森林预测西洋参药材的生长年限

目的:采用随机森林算法,结合西洋参的理化性质,建立精准预测西洋参生长年限的机器学习模型,为市场上西洋参年限鉴定提供工具。方法:以前期收集的106批2~4年的西洋参样品为基础,采用西洋参醇溶性浸出物含量、人参皂苷Rb_(1)含量、西洋参长度等9种理化特征作为数据特征进行分析。按照随机分割方法将数据集分为训练集和验证集,使用随机森林算法进行建模,并以多元线性回归作为对照模型,分别进行训练和验证。对所有特征的重要性进行分析和筛选,采用筛选后的特征再次进行建模,评估模型的准确性。结果:初步建模结果表明,随机森林模型预测准确度优于多元线性回归,特征重要性分析表明,长度、重量、醇溶性浸出物含量、水溶性浸出物含量、人参皂苷Rb_(1)含量5种理化性质的重要性较高。使用筛选后的特征再次建模,得到改进后的随机森林模型。改进后的模型较原始模型准确性均有一定的提升:验证集上的均方误差为0.017,决定系数为0.950,可用于鉴别2~4年生西洋参。结论:基于我国规范化种植的不同生长年限的西洋参样品,建立了生长年限判定的数学统计分析方法。该方法快速、准确、可靠,可作为西洋参生长年限判断的依据,从而为西洋参质量评价提供了新的研究思路。