构建双硫死亡相关长链非编码RNA模型预测胃癌患者预后及免疫相关分析

目的构建双硫死亡相关长链非编码RNA(lncRNA)特征的胃癌预后模型,分析lncRNA与胃癌的肿瘤免疫微环境之间的关联并评估可能的免疫治疗。方法下载TCGA-STAD的RNA测序数据和临床资料。使用共表达网络分析、Cox回归分析和LASSO回归建立与双硫死亡相关的lncRNA风险预后模型;使用受试者操作特征曲线等方法验证模型的预测能力;利用GSEA富集分析分析各组之间生物学功能的差异;评估与肿瘤微环境、免疫细胞、免疫功能间的关系。结果收集了24个双硫死亡相关的基因,9种双硫死亡相关lncRNA用于创建预后模型。将患者分为高、低风险2个亚组,从生存曲线显示2组患者之间的总生存率差异有统计学意义(P<0.001),预测模型1、3、5年的受试者操作特征曲线下面积分别为0.681、0.703和0.789,显示有较强的预测能力,Cox回归分析显示风险评分是影响预后的独立因素(P<0.001)。高、低风险组在部分免疫细胞及免疫功能之间差异有统计学意义(P<0.05)。结论基于9个双硫死亡相关lncRNA的风险评分模型有助于预测胃癌患者预后及免疫反应,可为患者的个体化治疗提供参考依据。

幽门螺杆菌dupA基因在胃十二指肠疾病中的研究进展

幽门螺杆菌感染是一个主要的全球公共卫生问题,在发展中国家更为普遍。最近的一项系统回顾显示,全球幽门螺杆菌感染率约为48.5%,约有44亿人为幽门螺杆菌阳性。幽门螺杆菌感染是慢性胃炎和消化性溃疡的主要病因,同时也是胃癌和胃黏膜相关淋巴组织淋巴瘤的危险因素,幽门螺杆菌具有遗传多样性,不同菌株引起的临床症状存在差异,其与宿主的遗传易感性和生存环境有关,主要与细菌毒力因子有关。目前关于幽门螺杆菌dupA基因的研究取得了一定的进展,本文就幽门螺杆菌dupA基因相关研究的最新进展作一综述。

iceA基因的分布特征及其在胃十二指肠疾病中的作用

幽门螺杆菌感染是一个主要的全球公共卫生问题,在发展中国家更为普遍。研究表明,幽门杆菌感染后可能存在一个从急慢性炎症、慢性萎缩性胃炎、肠上皮化生、异型增生、上皮内瘤变到胃癌的典型过程。幽门螺杆菌毒力基因在该病程中占据重要地位。不同的幽门螺杆菌菌株携带的基因不同,iceA基因自1998年被首次提出,之后相继开展了一系列研究,在幽门螺杆菌iceA基因的致病机制、iceA基因的分布及与临床结果的相关性方面均取得一定的成果。本文就幽门螺杆菌iceA基因相关研究的进展作一综述。

如何规范报告复杂干预性系统评价和Meta分析：PRISMA-CI解读

系统评价和Meta分析优先报告的条目(Preferred Reporting Items for Systematic Review and Meta-analysis,PRISMA)系列报告规范的陆续发表在一定程度上规范了系统评价/Meta分析报告,本文主要介绍PRISMA-CI的报告条目,并对其进行解读,期望为国内研究人员报告复杂干预性系统评价和Meta分析提供借鉴和参考。

国外医学领域专家系统的研究主题与研究者合作能力分析

目的:对国外人工智能专家系统的研究主题与研究者合作能力进行可视化分析,以期为学者开展医学领域专家系统相关研究提供借鉴和参考。方法:通过检索PubM ed数据库,纳入国外专家系统相关研究,采用书目共现分析系统(BICOMS-2)分析软件对主要信息进行提取和整理,并对高频作者和主题词生成共现矩阵,利用NetD raw绘制网络关系图,利用gC LUTO进行聚类分析。结果:共纳入3 254篇文献,42个国家参与了专家系统外文研究的发表,主要集中在欧洲和北美洲,刊载相关研究的1 031种期刊载文量存在明显差异,作者之间存在一定的联系,但合作不够紧密,聚类分析发现研究主题主要有3个。结论:国外专家系统研究的作者和国家存在不平衡性,作者之间的交流需进一步增加,国家之间的合作需进一步加强。研究的主题较局限,仍需进一步拓展。

国内医学领域知识库研究主题分析

目的:分析国内医学领域知识库研究现状,了解研究热点,为今后学者开展医学领域知识库相关研究提供参考。方法:计算机检索中国生物医学文献数据库、中国知网和万方数据知识服务平台中文数据库获取国内知识库研究。研究者按照纳入与排除标准独立筛选,采用书目共现分析系统(BICOMS-2)分析软件对发表时间、期刊、作者、作者单位、省份、关键词等信息进行提取和整理,并生成共现矩阵,针对主要关键词利用Net Draw和g CLUTO软件分别绘制网络关系图和对主要关键词进行聚类分析。结果:知识库研究自2000年起年发文量呈现快速增长趋势,但2016年发文数量开始回落,收录期刊共144种,但总收录量超过30篇的期刊仅16种(11.11%),发文作者共计2 732位,但合作较为紧密的团队仅有两个,各单位间的合作也不密切,仅形成了以中国科学院(文献情报中心、国家图书馆)、北京大学、北京师范大学、上海交通大学为核心的一个较大的单位合作群体,国内省(市)合作则是北京、江苏、广东、上海、天津等省(市)为中心。对主要关键词进行分析,则发现机构知识库、知识库、开放存取/获取、图书馆、知识服务、高校为研究热点,通过聚类分析,共得出4个主题。结论:我国知识库研究数量总体呈上升趋势,参与研究的学者及单位众多,但彼此间的合作不紧密。各学者、团体、单位间应加强合作,进一步探索与开拓新的研究主题。

国内医学领域专家系统的研究主题与研究者合作能力分析

目的:全面分析国内人工智能专家系统的研究主题与研究者合作能力,为学者今后开展医学领域专家系统相关研究提供参考。方法:计算机检索中国生物医学文献数据库、中国知网和万方数据库,纳入相关文献,采用书目共现分析系统(BICOMS-2)分析软件对主要信息进行提取和整理,并生成共现矩阵,采用NetD raw绘制网络图,gC LUTO对主要关键词进行聚类分析。结果:共纳入629篇关于专家系统的研究。近年来研究数量呈波动状态甚至下降趋势,我国共有28个省、自治区和直辖市的研究人员及机构参与了此类研究,作者之间出现6个合作团队,研究主题主要分为3个。结论:我国参与专家系统研究的人员和机构众多,但彼此缺乏合作或合作不够紧密,而且存在明显的地域不均衡性,研究主题较狭窄。建议在今后的研究中,各作者、研究单位、省份之间能进一步加强合作,不断拓展研究主题。

国外医学领域知识库研究主题分析

目的:对国外医学领域知识库研究现状进行可视化分析,了解国外知识库研究热点,为学者今后开展医学领域知识库相关研究提供参考。方法:通过Pub Med纳入国外知识库研究,采用书目共现分析系统(BICOMS-2)分析软件对发表时间、期刊、作者和主题词进行提取和整理,并生成作者和主要主题词共现矩阵,利用Net Draw绘制网络关系图,并利用g CLUTO对主要主题词进行聚类分析。结果:国外医学领域第1篇知识库研究发表于1953年,直至2004年共计发表8篇,自2005年起文献年发表量开始上升,至2016年达到高峰。共有930种期刊刊载知识库相关文献,载文量超过50篇的共计16种期刊,其累计载文量达43.59%。共有25 961位学者参与知识库研究,发文量超过10篇的作者仅21位(0.08%),且作者间无合作关系。纳入文献共包含4 050个主题词,通过对主要主题词聚类发现3个研究主题。结论:国外医学领域知识库研究关注度呈上升趋势,但研究学者间缺乏合作,研究主题较为局限,作者间需加强合作,进一步探索研究医学领域知识库的广度与深度。

老年感染者幽门螺杆菌根除治疗研究进展

幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)感染是常见的慢性感染之一,全世界感染率约50%[1]。多个地区研究显示60岁以上老年人Hp感染率>80%[2-3]。Hp慢性感染可导致慢性胃炎、消化性溃疡、胃癌和胃黏膜相关淋巴组织淋巴瘤等疾病[4]。因此,筛查和根除Hp是一项重要的健康措施。老年人根除治疗Hp的益处不言而喻。

新型冠状病毒对炎症性肠病药物治疗的影响

全球首例新型冠状病毒感染(COVID-19)患者于2019年12月报道,因此命名为COVID-19,严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)感染是其根本原因。新冠感染患者主要表现为发热、乏力、肌痛、咳嗽、呼吸困难等,但有研究表明,16%的病例仅表现为腹泻、腹痛、食欲不振、恶心和呕吐等胃肠道症状[1]。而且在咽拭子核酸检测阴性的情况下,有近一半的患者粪便核酸呈阳性,这表明胃肠道可能是SARS-CoV-2病毒的入侵场所之一[2]。

不同类型和磁场强度心脏磁共振成像诊断冠状动脉疾病准确性的Meta分析

目的系统评价不同类型和磁场强度心脏磁共振成像（cardiac magnetic resonance，CMR）诊断冠状动脉疾病的准确性。方法计算机检索PubMed、The Cochrane Library、EMbase、WanFang Data、CNKI和CBM数据库，搜集不同类型和磁场强度CMR诊断冠状动脉疾病的研究，检索时限均从建库至2017年5月15日。由2名研究者独立筛选文献、提取资料并评价纳入研究的偏倚风险后，采用MetaDisc1．4、RevMan5．3和Stata12．0软件进行Meta分析，计算合并后的敏感性（Sen）、特异性（Spe）、阳性似然比（＋LR）、阴性似然比（-LR）、诊断比值比（DOR）等性能指标，绘制森林图、受试者工作特征曲线（SROC曲线）并计算SROC曲线下面积（AUC）。结果共纳入20个诊断性试验，包含1357例患者。Meta分析结果显示：①基于患者的Sen合并、Spe合并、＋LR合并、-LR合并、DOR、AUC、验前概率和验后概率分别为[0．87，95％CI（0．82，0．90）]、[0．88，95％CI（0．82，0．92）]、[7．33，95％CI（4．74，11．32）]、10．15，95％CI（0．11，0．20）]、149．53，95％CI（27．46，89．36）]、[0．93，95％CI（O．91，0．95）]、20．00％和65．00％；②基于血管的Sen合并、Spe合并、＋LR合并、-LR合并、DOR、AUC、验前概率和验后概率分别为[0．81，95％CI（0．76，0．85）]、[0．87，95％CI（O．81，0．91）]、16．37，95％CI（4．37，9．30）]、[0．22，95％CI（0．17，O．27）]、[29．58，95％CI（18．53，47．22）]、[O．89，95％CI（O．86，0．92）]、20．00％和61．00％；③亚组分析结果显示：不同类型CMR的AUROC间的差异无统计学意义，但1．5T和3．0T强度CMR的AUROC间的差异有统计学意义。结论当前研究证实CMR可作为冠状动脉疾病的诊断方法之一。

PROSPERO平台注册诊断性试验系统评价/Meta分析的基本特征及合作情况分析

目的评价PROSPERO平台注册诊断性试验系统评价/Meta分析的基本特征及合作情况,为研究人员注册和开展诊断性试验系统评价/Meta分析提供借鉴。方法计算机检索PROSPERO注册平台,搜集注册的诊断性试验系统评价/Meta分析,检索时限截至2017年11月12日。由2名研究员独立筛选文献、提取资料并采用STATA 13.0制作森林图,采用BICOMS(书目信息共现分析系统)分析软件对国家、作者和单位等信息进行抽取并生成共现矩阵。采用Ucinet 6.0软件中NetDraw功能绘制国家、作者和作者单位合作社会网络图。结果 PROSPERO平台共注册了240个诊断性试验系统评价/Meta分析,其在作者(1050个)、机构(360个)和国家(34个)分布方面均不平衡。诊断性试验系统评价/Meta分析涉及21个系统疾病,最多的疾病为肿瘤(52个,22%);组织活检是使用最多的金标准,影像学诊断是使用最多的诊断试验。检索使用频率最高的外文数据库为PubMed、EMbase、The Cochrane Library,使用频率最高的中文数据库为CNKI、WanFang Data和CBM。105个诊断性试验系统评价/Meta分析(43.8%)报道了检索策略,159个(66.3%)使用QUADAS-2评价纳入研究质量,105个(43.8%)报告了基金资助情况。结论 PROSPERO平台注册诊断性试验系统评价/Meta分析的数量相对较少,作者、机构和国家间存在一定的联系,但对诊断性试验系统评价/Meta分析的效应指标和统计方法仍描述不够。