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Hcy促血管平滑肌细胞增殖迁移相关的miRNAs筛选研究
1
作者
马星
桂娜
+3 位作者
马婷
王秀玉
莫廷润
张鸣号
《宁夏医科大学学报》
2024年第1期7-14,共8页
目的明确同型半胱氨酸(homocysteine,Hcy)对人源血管平滑肌细胞(vascular smooth muscle cell,VSMC)增殖迁移的影响以及分析Hcy干预下VSMC增殖迁移相关差异miRNAs,为探讨Hcy促VSMC增殖迁移的分子机制提供依据。方法体外培养VSMC,分为Con...
目的明确同型半胱氨酸(homocysteine,Hcy)对人源血管平滑肌细胞(vascular smooth muscle cell,VSMC)增殖迁移的影响以及分析Hcy干预下VSMC增殖迁移相关差异miRNAs,为探讨Hcy促VSMC增殖迁移的分子机制提供依据。方法体外培养VSMC,分为Control组和100μmol·L^(-1) Hcy组。采用CCK-8法测量VSMC的增殖活性;采用划痕实验分析VSMC在0 h和48 h的迁移情况。高通量测序分析各组VSMC中差异化表达的miRNAs,采用miRanda和TargetScan软件进行靶基因预测,使用BLAST软件将预测靶基因序列与GO和KEGG数据库比对,分析靶基因的功能,获得与VSMC增殖和迁移相关的靶基因信息。通过RT-qPCR对其中表达上调的miRNAs进行验证。结果Hcy干预能增加VSMC的增殖活力(P<0.01),且VSMC的划痕面积减少(P<0.01)。两组细胞共检测到576个miRNAs,其中已知miRNAs 404个,新预测miRNAs 172个。与Control组相比,Hcy组存在88个差异表达的miRNAs,其中表达上调的20个,表达下调的68个。与VSMC增殖和迁移相关的miRNAs有20个,表达上调的包括miRNA39、miRNA206和miRNA212-5p,表达下调的包括miRNA35等17个。RT-qPCR结果显示,Hcy组miRNA212-5p的表达上调(P<0.05)。结论Hcy致VSMC增殖迁移过程中存在差异表达的miRNAs,miRNA212-5p可能参与了Hcy对VSMC的作用。
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关键词
微小RNA
靶基因预测
高通量测序
同型光胱氨酸
血管平滑肌细胞
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职称材料
题名
Hcy促血管平滑肌细胞增殖迁移相关的miRNAs筛选研究
1
作者
马星
桂娜
马婷
王秀玉
莫廷润
张鸣号
机构
宁夏医科大学基础医学院
国家卫生健康委员会代谢性心血管疾病研究重点实验室
宁夏血管损伤与修复研究重点实验室
宁夏贺兰县人民医院
出处
《宁夏医科大学学报》
2024年第1期7-14,共8页
基金
宁夏回族自治区重点研发计划项目(2021BEG03093)
宁夏回族自治区科技惠民专项项目(2022CMG03036)
+1 种基金
宁夏自然科学基金项目(2022AAC03130)
宁夏医科大学校级科研项目(XT2022028)。
文摘
目的明确同型半胱氨酸(homocysteine,Hcy)对人源血管平滑肌细胞(vascular smooth muscle cell,VSMC)增殖迁移的影响以及分析Hcy干预下VSMC增殖迁移相关差异miRNAs,为探讨Hcy促VSMC增殖迁移的分子机制提供依据。方法体外培养VSMC,分为Control组和100μmol·L^(-1) Hcy组。采用CCK-8法测量VSMC的增殖活性;采用划痕实验分析VSMC在0 h和48 h的迁移情况。高通量测序分析各组VSMC中差异化表达的miRNAs,采用miRanda和TargetScan软件进行靶基因预测,使用BLAST软件将预测靶基因序列与GO和KEGG数据库比对,分析靶基因的功能,获得与VSMC增殖和迁移相关的靶基因信息。通过RT-qPCR对其中表达上调的miRNAs进行验证。结果Hcy干预能增加VSMC的增殖活力(P<0.01),且VSMC的划痕面积减少(P<0.01)。两组细胞共检测到576个miRNAs,其中已知miRNAs 404个,新预测miRNAs 172个。与Control组相比,Hcy组存在88个差异表达的miRNAs,其中表达上调的20个,表达下调的68个。与VSMC增殖和迁移相关的miRNAs有20个,表达上调的包括miRNA39、miRNA206和miRNA212-5p,表达下调的包括miRNA35等17个。RT-qPCR结果显示,Hcy组miRNA212-5p的表达上调(P<0.05)。结论Hcy致VSMC增殖迁移过程中存在差异表达的miRNAs,miRNA212-5p可能参与了Hcy对VSMC的作用。
关键词
微小RNA
靶基因预测
高通量测序
同型光胱氨酸
血管平滑肌细胞
Keywords
miRNAs
target gene prediction
high-throughput sequencing
homocysteine
vascular smooth muscle cell
分类号
R54 [医药卫生—心血管疾病]
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作者
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1
Hcy促血管平滑肌细胞增殖迁移相关的miRNAs筛选研究
马星
桂娜
马婷
王秀玉
莫廷润
张鸣号
《宁夏医科大学学报》
2024
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