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新疆紫泥泉草场绵羊面部湿疹病原真菌的分离鉴定及遗传进化分析
1
作者
赵志国
王琦
+5 位作者
陈佳阔
何欣
贺愚
剡根强
吴洁
刘良波
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2023年第7期78-82,87,134,共7页
为了了解新疆紫泥泉草场绵羊面部湿疹感染的病原真菌及其遗传进化规律,试验利用R语言结合流行病学方法分析绵羊面部湿疹的世界流行情况,对该病高发地新疆紫泥泉草场中的主要病原真菌进行分离与鉴定、PCR-DGGE分析、序列比对、系统进化...
为了了解新疆紫泥泉草场绵羊面部湿疹感染的病原真菌及其遗传进化规律,试验利用R语言结合流行病学方法分析绵羊面部湿疹的世界流行情况,对该病高发地新疆紫泥泉草场中的主要病原真菌进行分离与鉴定、PCR-DGGE分析、序列比对、系统进化树构建和遗传进化分析。结果表明:绵羊面部湿疹主要在温带大陆性气候纬度带流行;样品经分离培养,共鉴定出4种分离率较高的真菌;该草场的优势菌属为皮司霉菌属(Pithomyces sp.)、链格孢菌属(Alternaria sp.)、镰刀菌属(Fusarium sp.)、曲霉菌属(Aspergillus sp.),分离率较高的菌株分别为纸皮司霉菌[Pithomyces chartarum(XJ-Znq)]、链格孢葡萄菌[Alternaria botrytis(XJ-Znq)]、尖孢镰刀菌[Fusarium oxysporum(XJ-Znq)]、黄曲霉菌[Aspergillu flavus(XJ-Znq)];该草场Pithomyces chartarum(XJ-Znq)分离株与同属皮司霉菌属真菌株的同源性高达100%;分离得到的Pithomyces chartarum(XJ-Znq)和Alternariabotrytis(XJ-Znq)序列保守性较好,Fusarium oxysporum(XJ-Znq)和Aspergilluflavus(XJ-Znq)序列单独分支,与同属真菌差异较大。说明新疆紫泥泉草场病原真菌存在一定变异,揭示了绵羊面部湿疹的发病原因。
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关键词
面部湿疹
分离
鉴定
序列比对
遗传进化
R语言
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题名
新疆紫泥泉草场绵羊面部湿疹病原真菌的分离鉴定及遗传进化分析
1
作者
赵志国
王琦
陈佳阔
何欣
贺愚
剡根强
吴洁
刘良波
机构
石河子大学动物科技学院
新疆生产建设兵团第八师石河子市畜牧兽医工作站
出处
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2023年第7期78-82,87,134,共7页
基金
中国博士后科学基金地区专项支持计划项目(2021MD703890)。
文摘
为了了解新疆紫泥泉草场绵羊面部湿疹感染的病原真菌及其遗传进化规律,试验利用R语言结合流行病学方法分析绵羊面部湿疹的世界流行情况,对该病高发地新疆紫泥泉草场中的主要病原真菌进行分离与鉴定、PCR-DGGE分析、序列比对、系统进化树构建和遗传进化分析。结果表明:绵羊面部湿疹主要在温带大陆性气候纬度带流行;样品经分离培养,共鉴定出4种分离率较高的真菌;该草场的优势菌属为皮司霉菌属(Pithomyces sp.)、链格孢菌属(Alternaria sp.)、镰刀菌属(Fusarium sp.)、曲霉菌属(Aspergillus sp.),分离率较高的菌株分别为纸皮司霉菌[Pithomyces chartarum(XJ-Znq)]、链格孢葡萄菌[Alternaria botrytis(XJ-Znq)]、尖孢镰刀菌[Fusarium oxysporum(XJ-Znq)]、黄曲霉菌[Aspergillu flavus(XJ-Znq)];该草场Pithomyces chartarum(XJ-Znq)分离株与同属皮司霉菌属真菌株的同源性高达100%;分离得到的Pithomyces chartarum(XJ-Znq)和Alternariabotrytis(XJ-Znq)序列保守性较好,Fusarium oxysporum(XJ-Znq)和Aspergilluflavus(XJ-Znq)序列单独分支,与同属真菌差异较大。说明新疆紫泥泉草场病原真菌存在一定变异,揭示了绵羊面部湿疹的发病原因。
关键词
面部湿疹
分离
鉴定
序列比对
遗传进化
R语言
Keywords
facial eczema
isolation
identification
sequence alignment
genetic evolution
R language
分类号
S858.26 [农业科学—临床兽医学]
S852.661 [农业科学—基础兽医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
新疆紫泥泉草场绵羊面部湿疹病原真菌的分离鉴定及遗传进化分析
赵志国
王琦
陈佳阔
何欣
贺愚
剡根强
吴洁
刘良波
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2023
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