安徽新安江水牛mtDNA D-Loop区遗传多样性与系统进化研究

试验旨在分析安徽省黄山市新安江流域上游地区新安江水牛群体的分子遗传特性,探究其母系起源与遗传多样性。利用PCR扩增和测序技术测定28头新安江水牛的mtDNA D-Loop序列,下载GenBank数据库中24个中国水牛群体的693条D-Loop序列,利用生物信息学分析其遗传多样性,构建Neighbor-joining系统发生树和Media-joining网络,探索不同水牛群体的遗传距离。结果显示,28头新安江水牛的mtDNA D-Loop序列共有117个变异位点,构成25种单倍型,其核苷酸多样性为0.02602±0.00303,单倍型多样性为0.989±0.014。新安江水牛群体的变异性水平与中国其他水牛群体接近。N-J系统进化树显示,新安江水牛25个单倍型分为A、B两个支系,具有A支系和B支系2个母系来源,其中A支系占据主导地位。Media-joining进化网络显示,中国水牛主要为沼泽型水牛,分为沼泽型水牛A支系和B支系,B支系又分为b1亚支系和b2亚支系。综上,新安江水牛群体变异水平与中国其他地方水牛群体接近,群体遗传多样性丰富;且新安江水牛属于沼泽型水牛,具有2个线粒体母系来源,与我国其他地方水牛群体具有一定的遗传距离。

新安江水牛品种资源调查报告

近年来,笔者在调查安徽省地方牛资源时,在黄山地区发现了独特的水牛群体,其体型中等,役肉兼用型,暂命名为新安江水牛。黄山地区饲养水牛历史悠久,但2000—2022年数量下降严重,目前群体规模约为4000头左右。该文通过走访调研和测定,对新安江水牛的外貌特征、分布、饲养和利用、品种形成和变化、生长和生产性能以及开发利用进行阐述,分析发现该群体从外貌特征、历史缘源具有独特性,下一步拟开展本群体的新资源发掘工作。

3个地方品种猪血液生化指标分析

为了解中国地方猪种的血液生化指标,试验用Monarch660全自动生化分析仪检测了通城猪、陆川猪和宁乡猪3个地方猪种24项血液生化指标,统计结果表明,3个品种间有6项指标差异极显著(P<0.01),通城猪和宁乡猪间有4项指标差异不显著(P>0.05),陆川猪和宁乡猪间有3项指标差异不显著(P>0.05)。通过3个地方猪品种间同一指标的比较,以及与人参考值、中国小型猪品种、其他地方猪品种和国外引进猪品种比较,为中国地方猪品种资源的合理保护和利用提供科学依据。

microRNA-155在长白猪和通城猪骨骼肌发育过程中的表达分析

本研究旨在分析miR-155在长白猪(瘦肉型)和通城猪(脂肪型)骨骼肌发育过程中的表达变化,以了解其在猪肌肉发育中的重要作用。选用长白猪和通城猪不同发育时期(胚胎期12个时期,出生后10个时期)骨骼肌为材料,利用Stem-Loop RT-PCR方法检测miR-155的表达变化。此外,本研究还分析了miR-155在成年通城猪各组织的表达。结果,miR-155在长白和通城猪骨骼肌发育过程中差异表达呈现不同的表达模式。在通城猪中,miR-155在小肠和肺中表达量较高,在心脏和胎盘中度表达,而在其他组织中表达较低。结果提示,miR-155可能参与猪肌细胞增殖和分化,从而影响猪骨骼肌发育,与猪肌肉的表型有关。

安徽东流水牛线粒体D-Loop区遗传多样性与系统进化分析

【目的】分析安徽东流水牛群体的分子遗传特性,为今后开展我国地方水牛品种研究提供科学依据。【方法】采用测序技术测定安徽东至县31头东流水牛线粒体DNA(mtDNA)D-Loop序列,结合GenBank数据库中已报道的22个群体的471条中国水牛D-Loop序列进行联合分析,利用DnaSP 5.1软件统计核苷酸多样性和单倍型多样性,利用MEGA 5.10软件构建N-J系统发生树,利用Network 4.60软件构建单倍型的media-joining网络。【结果】在22个中国水牛群体中发现163个变异位点,180个单倍型,其核苷酸多样性为0.018 23±0.002 21,单倍型多样性为0.877 40±0.013 80,其中在东流水牛D-Loop序列中发现70个变异位点,构成35种单倍型,其核苷酸多样性为0.013 31±0.002 08,单倍型多样性为0.944 00±0.023 00,群体变异性水平与中国其他水牛群体接近。N-J系统发生树和media-joining进化网络显示,中国水牛分为沼泽型和江河型,前者又分为A和B支系,B支系包括b1和b22个亚支系,东流水牛分布于A和B支系中。【结论】东流水牛群体遗传多样性丰富,且线粒体具有2个母系来源。

microRNA let-7调控动物个体发育的研究进展

microRNA（miRNA）是一类广泛存在于多细胞动物中的进化保守的大小为18～25nt的非编码小分子RNA，可以通过与靶基因mRNA的非编码区（3’UTR）结合导致mRNA降解，或阻断mRNA翻译而调节基因表达。let-7是在线虫中发现的具有转录后调节功能的小分子RNA，具有高度的保守性，研究发现，1et-7参与动物个体多个器官组织的发育过程。作者综述了近年来lev7参与调控脑、神经系统、心肺系统和肌肉发育等组织器官的研究成果，初步阐述了1et-7调控组织器官发育的作用机制，以期为进一步探索let-7在动物体内的功能奠定基础。

大别山牛PAX3基因多态性及其与生长性状的关联分析

【目的】探究PAX3基因多态性与大别山牛生长性状的相关性。【方法】采集292头安徽大别山成年(24~48月龄)母牛的耳组织,并测定其体尺数据,提取DNA后,通过PCR和测序技术鉴定出大别山牛群体中PAX3基因的多态性,利用POPGENE、Haploview和SHEsis软件,分别对多态位点进行遗传多样性、哈代-温伯格平衡和单倍型分析,利用SPSS 23.0软件分析其与生长性状的相关性。【结果】在大别山牛PAX3基因第4内含子中检测到3个SNPs位点(g.4718G>C、g.4744T>C和g.4757C>A),第6内含子中检测到1个SNPs位点(g.78920C>T),4个SNPs位点均存在3种基因型。遗传多样性分析发现,g.4718G>C位点属于低度多态(PIC≤0.25),g.4744T>C、g.4757C>A和g.78920C>T位点均属于中度多态(0.25<PIC≤0.50),且除g.4757C>A外,其余3个位点均处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05)。单倍型分析发现,4个SNPs位点间无强连锁相关(r^(2)<0.33),形成13种单倍型,其中频率大于0.03的单倍型有6个。相关性分析发现,g.4718G>C位点与大别山牛的十字部高显著相关(P<0.05);g.4744T>C位点与十字部高、腹围和腰角宽极显著相关(P<0.01);g.4757C>A位点与腰角宽显著相关(P<0.05);g.78920C>T位点与腹围极显著相关(P<0.01),与管围显著相关(P<0.05)。【结论】PAX3基因第4内含子的g.4718G>C、g.4744T>C和g.4757C>A位点以及第6内含子的g.78920C>T位点多态性与大别山牛群体部分生长性状具有显著或极显著的相关性,可以作为大别山牛遗传选育的候选分子标记。

牛PLAG1基因多态性与大别山牛生长性状的相关性分析

以安徽大别山牛为试验群体,采用PCR和直接测序技术检测PLAG1基因的多态性,并探讨其多态性对大别山牛生长性状的影响,为大别山牛体尺性状的标记辅助选择和育种提供理论依据。利用在线软件分析牛PLAG1基因的结构特性,计算等位基因频率、基因型频率和遗传多样性指数,分析HardyWeinberg平衡状态,利用SPSS软件探索PLAG1基因多态性与大别山牛群体体尺性状的相关性。结果显示:牛PLAG1基因编码蛋白质前体结构包含有6个ZnF_C2H2区域和4个low complexity区域,PLAG1基因第1内含子区检测到1个19-bp Indel位点,3’UTR区检测到1个变异位点g.48316C>T,二者均属于中度多态(0.25<PIC<0.50),其中19-bp Indel位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05),且DD基因型个体和WD基因型个体的腰角宽和坐骨端宽均显著优于WW基因型个体(P<0.05);g.48316C>T位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),且CT基因型个体的胸围显著优于TT基因型个体和CC基因型个体(P<0.05)。该研究结果初步表明牛PLAG1基因的多态性与其体尺性状显著相关,可以作为大别山牛体尺性状标记辅助选择候选基因之一。

肉牛骨骼肌生长发育分子遗传调控研究进展

骨骼肌发育是肉牛生长发育的重要组成部分,直接与肉牛的产肉力等经济性状密切相关。本文总结了肉牛骨骼肌发育过程中的发挥重要作用的基因、miRNA以及表观修饰作用,对影响肉牛肌肉发育的关键因子进行了系统的分析,为牛肉质性状的分子改良提供新的思路。

安格斯牛×大别山牛杂交牛生长发育特性和屠宰特性研究

[目的]研究安格斯牛对大别山牛的杂交效果。[方法]对安格斯牛×大别山牛杂交F1代(安—大F1)和大别山牛各24头进行了初生、6月龄、12月龄和24月龄体重和体尺性状测定,对照组和试验组各随机选择3头持续育肥至24月龄后进行了屠宰测定。[结果]安—大杂交F1代牛具有较高的杂种优势,安—大杂交F1代牛初生、6月龄、12月龄、18月龄和24月龄体重和体尺指标均明显优于大别山牛;24月龄时安—大杂交F1代的宰前体重极显著高于大别山牛(P<0.01),胴体重和净肉重均显著高于大别山牛(P<0.05)。[结论]用安格斯牛与大别山牛杂交,杂交效果明显,具有较高的推广及应用价值。

牛PAX3基因结构分析及蛋白功能预测

试验旨在探究PAX3蛋白的结构和功能,对后期研究其参与的生理机制提供理论依据。利用生物信息学技术对牛PAX3基因结构、蛋白保守结构域、信号肽剪切位点、理化性质、亲疏水性和亚细胞定位进行分析,并对其二级三级结构进行预测。结果显示,牛PAX3基因编码氨基酸在人、小鼠、大鼠、牛、猪、马、鸡7个物种中高度保守,且均含有配对结构域PAX、低复杂性区域和完全同源结构域HOX;牛PAX3蛋白等电点8.81,半衰期30 h,不稳定指数56.68,为亲水性蛋白,在细胞核分布的概率95.70%,二级结构中存在43个α螺旋,441个无规卷曲,不存在β折叠。综上所述,推测PAX3蛋白存在于细胞核中,通过与亲水性蛋白结合发挥其生物学功能。

CFL2基因研究进展

CFL2基因是肌动蛋白结合蛋白家族的重要成员,研究发现,CFL2基因主要在哺乳动物的骨骼肌和心肌中表达,在肌肉组织肌原纤维发生和解聚过程中调节肌动蛋白的转换,对维持肌肉正常的生长发育和功能起着非常重要的作用。文章总结了CFL2基因结构、表达特性及其在细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭以及家畜经济性状(生长性状和肉质性状)中的重要作用,以期为进一步提高家畜养殖的经济效益以及育种改良寻求有效途径。

基于线粒体Cytb基因全序列的东流水牛群体遗传结构分析

[目的]分析安徽东流水牛群体遗传结构,为今后开展地方水牛品种研究提供依据。[方法]利用测序技术对31头东流水牛细胞色素b基因(Cytb)进行序列测定和分析,[结果]发现Cytb基因全长1 140bp,共检测到17个多态位点,构成9种单倍型,单倍型多样度为(0.544±0.107),核苷酸多样度为(0.00112±0.00091)。同时发现东流水牛Cytb基因具有两种终止密码子AGA和AGG。[结论]东流水牛遗传多样性丰富,且起源于2个母系。

牛IGF2基因多态性与大别山牛生长性状的相关性分析

[目的]分析IGF2基因多态性位点与大别山牛体尺性状的相关性。[方法]利用PCR和测序技术检测大别山牛群体中IGF2基因的多态性,利用SPSS 23.0软件分析其与体尺性状的相关性。[结果]在大别山牛群体中,IGF2基因第一内含子共检测到3个SNPs位点(g.22218G>A、g.22421C>T和g.22448G>T),3个SNPs位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),且均属于中度多态(0.25<PIC<0.50);相关性分析结果显示g.22218 G>A位点与大别山牛群体体斜长、胸围显著相关(P<0.05),与腹围极显著相关(P<0.01);g.22421C>T位点与大别山牛群体的体高和腰角宽显著相关(P<0.05),与腹围极显著相关(P<0.01);g.22448G>T位点与大别山牛群体的胸围显著相关(P<0.05),与腹围和腰角宽极显著相关(P<0.01)。[结论]IGF2基因第一内含子的g.22218 G>A、g.22421C>T和g.22448G>T位点多态性与大别山牛群体部分生长性状具有显著或极显著的相关性。

大别山牛种质资源特性和杂交利用浅析

[目的]研究大别山牛的遗传发育特性,探讨其杂交利用效果。[方法]对大别山牛24头(公牛10头,母牛14头)进行了初生、6月龄、12月龄和24月龄体重和体尺性状测定,随机选择3头大别山牛阉牛持续育肥至24月龄后进行了屠宰测定、肉质营养成分测定和风味物质检测。[结果]大别山牛公母牛在0-6月龄、12-24月龄时是体重增长高峰期,大别山牛肉肉质细嫩、风味浓郁,必需氨基酸占总氨基酸比例(39.65±2.32)%。[结论]大别山牛是我国优良的地方品种牛之一,具有独特的遗传发育特性,亟需加以保护和开发利用,且杂交改良可能是提高其养殖效益的有效途径之一。

皖南牛种质资源特性和杂交改良效果分析

[目的]研究皖南牛的种质资源特性,探讨其杂交利用效果。[方法]对皖南牛和和-皖杂交F1代牛进行了初生、6月龄、12月龄和24月龄体重和体尺性状测定。[结果]皖南牛和和-皖杂交F1代牛公母牛在0~6月龄、12~24月龄时是体重增长高峰期,利用日本和牛对皖南牛进行杂交改良,可显著改善其个体小、生长慢等不足,杂交优势明显。[结论]皖南牛是我国优良的地方品种牛之一,具有独特的遗传发育特性,亟需加以保护和开发利用,且杂交改良可能是提高其养殖效益的有效途径之一。

大别山牛CART基因多态性与体尺性状相关性研究

[目的]为了探索CART基因与大别山牛体尺性状的相关性。[方法]采用PCR扩增、测序和生物信息学方法。[结果]发现大别山牛CART基因第一内含子存在T253C变异,第二内含子存在A1467G变异,关联分析发现T253C位点突变与大别山牛体高和腹围显著相关(P<0.05),A1467G位点突变与管围和腰角宽差异相关(P<0.05)。[结论]CART基因SNPs对大别山牛体高、腹围、腰角宽和坐骨端宽的体尺性状均有不同程度的影响,可以尝试将其作为大别山牛新品系培育的主效候选基因或与主基因紧密连锁的分子标记。

GDF8基因研究进展

生长分化因子8(GDF8),又名肌肉生长抑制素基因(MSTN),是转化生长因子-β(TGF-β)超家族成员之一。GDF8基因在哺乳动物的胚胎期和成年期呈现不同的表达模式,对骨骼肌的发育起着非常重要的调控作用。文章总结了GDF8基因的分子结构、组织表达特性以及在家畜经济性状(生长性状和肉质性状)、人类疾病发生发展和细胞增殖分化中的重要作用,以期为进一步提高家畜养殖的经济效益以及育种改良寻求有效途径。

牛GDF8基因编码蛋白结构和功能预测

旨在探究GDF8基因(Growth differentiation factor 8)编码蛋白的结构和功能,对后期研究其生理机制提供理论依据。利用生物信息学技术对牛GDF8蛋白二级和三级结构进行了预测,分析了保守结构域、信号肽剪切位点、理化性质、亲疏水性、亚细胞定位和蛋白网络通路。结果显示,牛GDF8蛋白与人和小鼠具有相似的保守结构域,不稳定指数85.52,属于不稳定蛋白,其亲水性氨基酸明显多于疏水性氨基酸,为亲水性蛋白;牛GDF8蛋白在内质网分布的概率44.4%,在线粒体分布的概率33.3%,二级结构以无规则卷曲为主,折叠缠绕后形成三级结构;牛GDF8蛋白PPI网络图有11个节点,其KEGG通路主要与骨骼肌纤维发育、活化素受体信号通路、成肌细胞融合等相关。综上,推测GDF8蛋白存在于内质网和线粒体中,通过与亲水性蛋白结合调节机体生物学功能。

中国肉牛分子育种研究进展

目前,我国肉牛业发展迅速,已经成为世界上第三大肉牛生产国,肉牛生产对于调整膳食结构、增加农民收入、促进农村经济发展和提高人民生活水平具有重要意义。本文全面地论述了我国现阶段肉牛分子育种研究的内容与特点、发展概况和存在的不足,重点总结了功能基因DNA分子多态与地方黄牛品种生产性状关联研究的成就,指出了我国肉牛分子育种研究存在的问题和不足,提出了今后加快肉牛分子育种研究的思路。