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基于免疫相关基因标记的胃癌预后预测模型的构建和验证
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作者 胡震 赵绍基 +3 位作者 祁玉忠 王光熙 孙开宇 吴文辉 《南昌大学学报(医学版)》 2024年第2期1-10,17,共11页
目的开发一种基于免疫特征的预后预测模型,用于精准识别胃癌免疫敏感人群,以期改进联合免疫疗法并揭示肿瘤免疫交互作用的潜在分子特征。方法使用单样本基因集富集分析(ssGSEA)对胃癌免疫景观进行定量评估,并将其划分为具有不同免疫浸... 目的开发一种基于免疫特征的预后预测模型,用于精准识别胃癌免疫敏感人群,以期改进联合免疫疗法并揭示肿瘤免疫交互作用的潜在分子特征。方法使用单样本基因集富集分析(ssGSEA)对胃癌免疫景观进行定量评估,并将其划分为具有不同免疫浸润丰度的集群。利用最小绝对收缩和选择算法(LASSO)及Cox回归模型对候选基因进行逐步回归,以构建胃癌预后预测模型并进行外部验证。采用Kaplan-Meier分析、受试者工作特征(ROC)曲线、列线图、校准曲线等评估模型的预测能力。采用IMvigor210队列以及“oncoPredict”包预测免疫治疗应答及药物敏感性。结果基于28个免疫相关基因集的免疫状态定量分析确定并验证了2个具有不同预后和免疫浸润模式的功能簇。识别和构建由6个免疫相关基因组成的特征风险模型,并将其划分为具有不同临床病理特征、预后和免疫背景的风险亚群。高风险亚群具有较差的预后,且伴有免疫抑制、高水平的静止细胞亚群浸润、低频基因突变和较低的免疫检查点分子表达,这些特征与免疫逃逸和预后不良密切相关。不同风险组之间的半最大抑制浓度(IC 50)存在显著差异,这能够有效识别“热肿瘤”及免疫治疗敏感药物的筛选。结论建立并验证基于免疫特征的新型风险模型,其在预测胃癌预后和指导临床肿瘤治疗方面显示出潜在的运用价值。 展开更多
关键词 胃癌 肿瘤微环境 列线图 免疫治疗 免疫检查点
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胃癌组蛋白H3第4位赖氨酸的三甲基化修饰相关长链非编码RNA预后模型的构建与验证
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作者 胡震 祁玉忠 +3 位作者 赵绍基 王光熙 孙开宇 吴文辉 《消化肿瘤杂志(电子版)》 2024年第2期183-193,共11页
目的 探索胃癌组蛋白H3第4位赖氨酸的三甲基化(trimethylation of lysine 4 on histone H3,H3K4me3)修饰相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)特征,构建相关预后模型并预测胃癌免疫治疗疗效。方法 从癌症基因组图谱数据库下... 目的 探索胃癌组蛋白H3第4位赖氨酸的三甲基化(trimethylation of lysine 4 on histone H3,H3K4me3)修饰相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)特征,构建相关预后模型并预测胃癌免疫治疗疗效。方法 从癌症基因组图谱数据库下载胃癌相关转录组测序数据和对应的患者临床资料,通过构建H3K4me3相关调节因子基因与LncRNA的共表达网络识别H3K4me3修饰相关LncRNA,并将癌症基因组图谱数据库中370例符合筛选标准的胃癌患者样本(整体组)按1:1随机抽样划分为训练组(n=185)和验证组(n=185)。随后基于单因素Cox回归、Lasoo回归分析构建H3K4me3相关LncRNA预后风险评分模型并进行内部验证。Kaplan-Meier生存分析和受试者操作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC曲线)被用于验证模型的预测性能。通过单因素和多因素Cox回归分析评估风险评分等临床指标的预后预测价值。结合风险评分、年龄和肿瘤TNM分期构建预测胃癌患者总生存率的列线图模型,ROC曲线与校准图被用于评估列线图的预测准确性。借助共识聚类识别异质性聚类亚群并进行免疫治疗疗效预测。结果 基于共表达网络关系识别了14个具有预后价值的H3K4me3相关LncRNA并构建了相关风险模型及评价体系。根据训练组预后风险评分模型获得的中位风险评分将训练组、验证组和整体组胃癌患者划分为高、低风险,Kaplan-Meier生存曲线显示低风险患者的总体生存情况要优于高风险患者(P<0.05)。此外,该模型在训练组中预测胃癌患者1、3、5年总生存率的曲线下面积(area under curve,AUC)分别为0.708、0.730、0.770,在验证组中分别为0.690、0.648、0.713,而在整体组中分别为0.697、0.670、0.724。多因素Cox回归分析显示基于H3K4me3相关LncRNA构建的风险评分模型是预测胃癌患者预后的独立因素(P<0.001)。构建的列线图预测胃癌患者1、2、3年总生存率的AUC分别为0.727、0.780、0.717,且其校准曲线与理想曲线相接近。基于共识聚类算法进一步识别了2种具有异质性免疫特征的H3K4me3-LncRNA亚群,其中亚组Ⅱ具有更高的免疫细胞浸润水平和更强的免疫应答潜力,并对5-氟尿嘧啶、奥沙利铂等显示出更高的药物敏感性,而亚组Ⅰ则可能对磷脂酰肌醇3-激酶特异性抑制剂具有更高的敏感性。结论 本研究构建了一个H3K4me3-LncRNA风险评分模型以预测胃癌患者的预后,并揭示了其异质性微观特征及在预测免疫治疗疗效方面的潜在价值。 展开更多
关键词 胃癌 组蛋白H3第4位赖氨酸的三甲基化修饰 组蛋白修饰 长链非编码RNA 免疫治疗
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暗娼健康风险减少干预策略与方法探讨 被引量:10
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作者 周月姣 梁绍伶 +8 位作者 刘伟 何波 古雅才 梁凤琴 农丽萍 闭素章 梁红 赵绍基 廖苏苏 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2002年第12期1472-1473,共2页
目的 探讨开展减少暗娼由性服务而引起的健康风险干预的策略与方法及其效果。方法 采用预防干预和治疗服务相结合的策略措施 ,建立妇女健康中心 (WHC) ,一方面深入服务场所 ,利用行为改变理论为暗娼及业主提供多种形式的健康教育、咨... 目的 探讨开展减少暗娼由性服务而引起的健康风险干预的策略与方法及其效果。方法 采用预防干预和治疗服务相结合的策略措施 ,建立妇女健康中心 (WHC) ,一方面深入服务场所 ,利用行为改变理论为暗娼及业主提供多种形式的健康教育、咨询服务 ,引导正确的求医行为和推广安全套的使用 ;另一方面在WHC和诊所内提供性病病征处理服务。结果 妇女性病 /艾滋病知识水平、患病意识及正确的求医行为和安全套的使用率逐年有了不同程度的提高。大部分妇女已处于行为改变的知识掌握阶段 ,但患病意识及正确的求医行为和安全套的使用率还处于较低水平。结论 预防与治疗相结合的策略与方法在暗娼性病艾滋病干预活动中是可行有效的。 展开更多
关键词 健康风险 干预策略 暗娼 性病 艾滋病 方法学
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艾滋病流行区农村妇女艾滋病知识态度与行为现况调查 被引量:10
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作者 周月姣 刘伟 +8 位作者 梁绍伶 梁凤琴 陈锦华 闭素章 农丽萍 梁红 李志军 何波 赵绍基 《中国健康教育》 2004年第6期514-515,共2页
关键词 农村妇女 艾滋病 知识 态度 行为
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服务业妇女STD/AIDS预防干预中性传播疾病病征处理的应用与管理 被引量:2
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作者 梁绍伶 刘伟 +10 位作者 周月姣 李永振 赵绍基 施显勇 何波 古雅才 梁凤琴 农丽萍 闭素章 梁红 廖苏苏 《中国艾滋病性病》 CAS 2003年第4期227-229,共3页
目的 在私人诊所中实施性传播疾病 (STD)病征处理技术 ,探索其有效的服务与管理模式 ,以达到减少服务业妇女STD/AIDS的目标。方法 把私人诊所STD病征处理的培训和实施纳入妇女STD/AIDS预防干预活动之中。采用激励需要型的原理和方法... 目的 在私人诊所中实施性传播疾病 (STD)病征处理技术 ,探索其有效的服务与管理模式 ,以达到减少服务业妇女STD/AIDS的目标。方法 把私人诊所STD病征处理的培训和实施纳入妇女STD/AIDS预防干预活动之中。采用激励需要型的原理和方法提高诊所医生参与活动的内心能动性与积极性 ,用管理循环对诊所医生STD病征处理的培训与实施进行计划、组织、督导、评估与反馈。结果 诊所医生的STD病征处理技术知识水平与能力不断提高 ,妇女STD患者得到规范有效的医疗和健康教育服务 ,有助于服务业妇女STD/AIDS的防治。结论 在诊所实施STD病征处理并进行科学的管理 ,是实现服务业妇女STD/AIDS干预目标的重要策略与措施 。 展开更多
关键词 服务业 妇女 STD/AIDS 预防 性传播疾病 病征处理 应用 管理
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凭祥市艾滋病防治战略规划制定和实施的效果与体会 被引量:1
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作者 赵绍基 《中华临床医学杂志》 2004年第9期57-59,共3页
1999年10月~2000年3月,作为本市代表之一,我参加了由卫生部及联合国艾滋病规划署支持的《广西艾滋病防治战略规划》制定全程工作,并主持制定了《凭祥市艾滋病防治战略规划》(简称《规划》)。尽管这个《规划》还需要不断调整和完善... 1999年10月~2000年3月,作为本市代表之一,我参加了由卫生部及联合国艾滋病规划署支持的《广西艾滋病防治战略规划》制定全程工作,并主持制定了《凭祥市艾滋病防治战略规划》(简称《规划》)。尽管这个《规划》还需要不断调整和完善,但回顾3年来的工作,《规划》制定和实施已对我市性病艾滋病预防控制工作带来初步效果。 展开更多
关键词 体会 效果 艾滋病预防 性病 控制工作 卫生部 全程 艾滋病防治 代表 联合国
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协调多部门合作 动员全社会参与普及艾滋病知识 控制艾滋病流行
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作者 赵绍基 《中华临床医学杂志》 2004年第10期110-111,共2页
凭祥市多年来在原南宁地委、行署和崇左市委、政府的领导和上级业务部门的指导下,高度重视艾滋病防治工作。市委、政府组织和协调,各部通力合作,全社会共同参与,广泛开展艾滋病防治知识普及教育和重点人群行为干预活动,使我市艾滋... 凭祥市多年来在原南宁地委、行署和崇左市委、政府的领导和上级业务部门的指导下,高度重视艾滋病防治工作。市委、政府组织和协调,各部通力合作,全社会共同参与,广泛开展艾滋病防治知识普及教育和重点人群行为干预活动,使我市艾滋病防治工作取得了初步成效。 展开更多
关键词 艾滋病知识 动员 流行 重点人群 艾滋病防治工作 行为干预 共同参与 部门合作 市委 政府组织
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NOX4在胃癌的高表达与M2样巨噬细胞浸润及不良预后相关
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作者 周星宇 叶锦宁 +3 位作者 房得梁 赵绍基 孙开宇 徐建波 《消化肿瘤杂志(电子版)》 2021年第3期169-177,208,共10页
目的筛选与胃癌免疫相关基因(immune-related genes,IRGs)及其预后分析°方法首先通过R软件,分析TCGA数据库胃癌基因表达数据集获得差异表达IRGs,并进一步筛选出与预后相关的IRGs。分析胃癌组织转录组测序数据获得差异表达IRGs,与... 目的筛选与胃癌免疫相关基因(immune-related genes,IRGs)及其预后分析°方法首先通过R软件,分析TCGA数据库胃癌基因表达数据集获得差异表达IRGs,并进一步筛选出与预后相关的IRGs。分析胃癌组织转录组测序数据获得差异表达IRGs,与前者取交集获得关键IRGs。接着,对关键IRGs进行差异分析、生存分析及临床病理特征相关性分析。然后,使用CIBERSORT方法计算胃癌免疫浸润情况,分析关键IRGs与免疫浸润的相关性,使用TIMER数据库分析免疫浸润与患者生存的关系。最后,使用GEPIA工具分析关键IRGs与巨噬细胞相关趋化因子表达的相关性。结果通过分析TCGA来源的数据集获得32个预后相关IRGs,分析转录组测序数据获得46个IRGs,二者取交集得到基因:巨噬细胞清道夫受体1(macrophage scavenger receptor 1,MSR1)和NADPH氧化酶4(NADPH oxidase 4,NOX4)。与正常组织相比,MSR1和NOX4在胃癌组织均为高表达oN0X4高表达与胃癌患者低生存相关,而MSR1表达与患者生存无显著相关性。NOX4表达与患者临床分期及T分期呈显著正相关,未发现与N和M分期的显著相关性。通过免疫浸润分析发现,NOX4表达与M2样巨噬细胞浸润呈正相关,与浆细胞、记忆B细胞浸润呈负相关。而生存分析发现巨噬细胞高浸润与胃癌患者低生存有关。通过相关性分析发现N0X4与M2样巨噬细胞相关趋化因子呈正相关。结论基于生物信息学筛选出了胃癌免疫浸润的关键基因NOX4,NOX4的高表达与胃癌组织M2样巨噬细胞浸润及不良预后相关。 展开更多
关键词 胃癌 免疫浸润 巨噬细胞 NADPH氧化酶4
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广西凭祥市艾滋病预防干预教育经验回顾
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作者 郑卫红 赵绍基 黄全胜 《科技视界》 2015年第13期26-26,共1页
本文初步梳理了十多年来广西凭祥市在预防、干预艾滋病传播的经验和体会。政府正面应对、卫生技术部门多重培训、多部门跨部门协调、全覆盖宣传教育及跨国合作等等都是可以借鉴的成功经验。
关键词 广西 边境地区 少数民族 艾滋病教育 预防干预
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2009年凭祥市孕产妇艾滋病哨点监测结果分析 被引量:15
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作者 农丽萍 何波 +3 位作者 赵绍基 张建明 钟海东 黄斯静 《华南预防医学》 2010年第2期70-71,共2页
目的了解凭祥市孕产妇艾滋病、梅毒、丙肝的感染情况及艾滋病相关知识水平,为预防控制工作提供依据。方法2009年4—5月对首次到市妇幼保健院和市人民医院建卡或进行围产期保健的孕产妇进行问卷调查,并采集血样进行HIV、梅毒、丙肝抗体... 目的了解凭祥市孕产妇艾滋病、梅毒、丙肝的感染情况及艾滋病相关知识水平,为预防控制工作提供依据。方法2009年4—5月对首次到市妇幼保健院和市人民医院建卡或进行围产期保健的孕产妇进行问卷调查,并采集血样进行HIV、梅毒、丙肝抗体检测。结果共调查400名孕产妇,其艾滋病知识总知晓率(答对8道知识题中的6道及以上)为75.75%。检出1例HIV抗体阳性者,HIV抗体阳性率为0.25%;检出梅毒7例,梅毒感染率为1.75%;检出丙肝3例,丙肝感染率为0.75%。结论凭祥市HIV已由高危人群向一般人群传播,加强宣传教育,减少危险行为是切断母婴垂直传播的有效方法和措施。 展开更多
关键词 孕产妇 HIV 梅毒 肝炎 丙型
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2009年凭祥市吸毒人群艾滋病行为学和血清学监测结果分析 被引量:7
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作者 何波 农丽萍 +2 位作者 赵绍基 张建明 黄祖斌 《华南预防医学》 2010年第6期48-50,53,共4页
目的了解凭祥市吸毒人群的高危行为特征及HIV、梅毒、丙肝感染状况,为制定艾滋病预防控制策略提供科学依据。方法 2009年4—5月在凭祥市社区采用滚雪球、同伴传达等非随机抽样方法调查社区吸毒者,如完成社区调查后仍不能满足样本量要求... 目的了解凭祥市吸毒人群的高危行为特征及HIV、梅毒、丙肝感染状况,为制定艾滋病预防控制策略提供科学依据。方法 2009年4—5月在凭祥市社区采用滚雪球、同伴传达等非随机抽样方法调查社区吸毒者,如完成社区调查后仍不能满足样本量要求时,再从当地戒毒所在监测期内新进入所的吸毒人群中进行补充。对调查对象进行一对一问卷调查,并采集血样进行HIV、梅毒、丙肝抗体检测。结果共调查吸毒者283人,男性占96.82%,女性占3.18%,年龄以20~44岁为主(占93.64%)。艾滋病知识知晓率为99.29%(281/283)。吸毒人群中,静脉注射毒品者占85.51%(242/283),注射吸毒人群注射吸毒时与别人共用针具的比例为15.64%(33/211),最近1次发生性行为时使用安全套的比例为65.67%(88/134)。检出HIV抗体阳性者15例,阳性率为5.30%;检出梅毒7例,感染率为2.47%;检出丙肝183例,感染率为64.66%;HIV、梅毒、丙肝合并三重感染率为0.35%,HIV、丙肝合并感染率为4.95%,梅毒、丙肝合并感染率为1.41%。结论凭祥市吸毒人群中不仅存在因静脉吸毒经血液传播HIV的危险,还存在经性接触传播的危险因素。今后工作重点是针对特定的高危人群采取合理的预防干预措施,同时,提高行为干预的覆盖面和覆盖率。 展开更多
关键词 吸毒人群 HIV 梅毒 HCV 感染 危险行为
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