不同引物RT-PCR方法检测猪繁殖与呼吸综合征病毒的比较研究

用3对分别针对猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的ORF7、ORF5和ORF5的PCR引物N1/N2、AdGP5.1/AdGP5.2和RFLP5.1/RFLP5.2进行RT-PCR,检测PRRSV,从其敏感性、特异性和临床样品检出率等方面进行比较,在此基础上进一步建立一步法RT-PCR检测方法。结果显示:3对引物对PRRSV均有很高的特异性;应用N1/N2引物病毒最低检测量为7.9 TC ID50,而AdGP5.1/AdGP5.2引物和RFLP5.1/RFLP5.2引物PCR最低检测量为79 TC ID50;运用N1/N2、AdGP5.1/AdGP5.2和RFLP5.1/RFLP5.2引物分别进行RT-PCR扩增检测临床样品,PRRSV检出率分别为28/48、27/48和25/48,且用AdGP5.1/AdGP5.2和RFLP5.1/RFLP5.2引物检测的阳性样品,用N1/N2引物检测也都呈阳性。运用N1/N2引物,通过一步法RT-PCR成功地从PRRSV S1株中扩增出374 bp的目的基因片段。结果表明,用N1/N2引物扩增PRRSV目的基因,其敏感性和临床样品检出率更高,更适合临床样品PRRSV的检测。

猪繁殖与呼吸综合征病毒华东地区分离株RT-PCR-RFLP分析

Porcine reproductive and respiratory syndrome virus(PRRSV) isolates identified in samples from 50 field cases originated from eastern China herds were studied. ORF5 gene of PRRSV isolates was amplified by reverse transcript polymerase chain reaction(RT-PCR) and restriction fragment length polymorphism (RFLP) patterns for enzymes MluⅠ, HincⅡand SacⅡwere determined on these ORF5 genes. The RFLP pattern obtained from 39 isolates was 2-2-1(78%), 3 isolates was 1-1-1(6%) and 8 isolates identified in 2003 was 1-3-1 (16%). The results showed PRRSV strains have variations and existed no less than 3 gene subtypes in the area.

猪圆环病毒2型感染的检测与流行病学调查

根据GenBank上发表的PCV2 ORF2和PRRSV ORF7序列设计合成引物,建立分别用于检测PCV2和PRRSV的PCR和RT-PCR方法,并对2003年9月至2005年5月采自189个可疑发病猪场的389份病料进行了PCV2和PRRSV的检测。结果显示,来自33个猪场的35份样品为PCV2阳性,猪场PCV2阳性率为17.1%;PCV2与PRRSV混合感染率为5.1%,PCV2阳性猪场中PRRSV感染率为57.6%。流行病学统计结果表明,安徽省猪场PCV2阳性率最高;安徽省和广西省猪场PCV2和PRRSV的混合感染最严重;春夏季节PCV2阳性率明显高于秋冬;消瘦、被毛粗乱是PCV2感染的主要特征;淋巴结水肿或出血,肾脏肿大、出血或呈灰白色以及脾脏病变是PCV2感染的主要病理变化;仔猪7～8周龄发病率最高。

副猪嗜血杆菌的分离与鉴定

在通过对上海一发病猪群临床流行病学研究和病理学观察的基础上 ,从发病仔猪肺脏、气管和脾脏检出并分离到 1株革兰氏阴性细小杆菌 ,兼性厌氧。生化试验为 :接触酶阳性 ,氧化酶阴性 ,鸟氨酸脱羧酶、吲哚和脲酶阴性 ;生长需要NAD ,发酵果糖、半乳糖、葡萄糖和蔗糖 ;不分解D 甘露醇、D 山梨醇和海藻糖。用副猪嗜血杆菌的 1 6S小亚单位rRNA和tbpA基因的特异性PCR引物 ,通过PCR技术分别从该分离菌株扩增出 82 2bp及 1 9kb的特异基因片段 。

猪繁殖与呼吸综合征病毒和致病性沙门氏菌的混合感染

2003年9～11月某猪场发生母猪持续性繁殖障碍和7日龄仔猪呼吸困难、寒颤、下痢、体温升高和实质性器官出血为主要特征的疾病.3头发病仔猪的病变组织用RT-PCR检测,均为猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)阳性;由3头发病猪病料中所分离的细菌,可于普通琼脂、伊红美蓝和麦康凯琼脂培养基上生长,革兰氏染色阴性,形态与组织触片镜检及生化反应特性与沙门氏菌一致,可致死小鼠,仅对头孢唑啉呈中度敏感.结合该病的流行病学调查、临床症状、病理剖检,确诊为猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)和致病性沙门氏菌混合感染.

广东省部分猪场细环病毒感染状况

细环病毒(TTV)目前在全世界的猪群中广泛存在。为了调查其在广东省猪群流行情况,我们运用PCR方法对广东省不同地方猪场和散养户送检的445份血清进行了检测。结果表明:TTV总的阳性率为68.1%(303/445),其中TTV1阳性率为43.1%(192/445),TTV2阳性率为24.9%(111/445)。TTV1的阳性率高于TTV2的阳性率,且猪场送检样品阳性率高于散养户。TTV1和TTV2存在混合感染,猪场样品混合阳性率为23.1%(88/381),散养户样品混合阳性率为1.6%(1/64)。几份阳性样品测序和进化分析显示,它们分别属于TTV1和TTV2。调查结果表明TTV在广东猪群中已经广泛存在。

广东省猪瘟流行野毒E2基因的扩增及其序列分析

运用RT-PCR技术对3株广东省近期流行的猪瘟野毒的E2基因进行了扩增,并进行核苷酸序列分析,同时与国内外参考毒株的抗原序列进行了比对分析,绘制系统发育进化树。结果表明,3株流行毒株E2基因间核苷酸序列的相似性为81.9%～90.9%,所推导氨基酸序列相似性为56.6%～77.4%;与石门株之间核苷酸序列的相似性为82.3%～93%,所推导氨基酸序列相似性为57%～84.5%。经系统发育关系分析,1株属于基因1群(group1),2株属于基因2群(group2),提示近期猪瘟流行毒株的变异呈现一定的多样性。

一株猪葡萄球菌的分离鉴定

从患有渗出性皮炎的仔猪分离到1株革兰阳性球菌,生化试验、形态学观察进行初步鉴定,然后进行16 S rRNA基因片段的扩增和测序,将测序结果与GenBank上的已知序列进行同源性比较,结果与猪葡萄球菌的核酸序列同源性达到99.6%,综合可见该分离菌株为猪葡萄球菌,并将其命名为GDSH1。

猪繁殖与呼吸综合征病毒TM株的分离鉴定及其Nsp2序列分析

为了解猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行株的变异特点,本研究从广东省某猪场患有明显呼吸道症状的仔猪肺脏组织中分离到一株病毒,利用RT-PCR、基因序列分析,确定为美洲型PRRSV,命名为TM株。Nsp2基因序列分析发现,与美洲型标准毒株VR-2332相比,该分离株在481位和532位～560位共有30个氨基酸缺失;此外,与近年来国内分离的PRRSV变异株相比,在22位～42位有21个氨基酸的独有缺失。回归试验表明,该分离株可引起仔猪表现明显的临床症状和病毒血症,证实我国已经出现新缺失高致病性PRRSV毒株。

猪瘟病毒、猪圆环病毒2型与猪伤寒沙门氏菌混合感染的诊治

运用针对不同病毒的特异性引物,对广东某地区发病猪群采集的病料进行PCR和RT-PCR检测,结果发现CSFV和PCV2为阳性。无菌条件下分离的细菌可于普通琼脂、伊红美兰和麦康凯琼脂培养基上生长,革兰氏染色为阴性,经生化试验和药敏试验鉴定为沙门氏菌,并结合临床症状、病理特征,确诊为猪瘟病毒、猪圆环病毒2型与猪伤寒沙门氏菌混合感染。

猪繁殖与呼吸综合征病毒反向遗传技术的研究进展

反向遗传操作技术可以在DNA水平上对RNA病毒基因组进行各种修饰或改造,然后通过拯救病毒的表型变化来判断这些基因操作的效果,从而可以对病毒基因组的表达调控机制、病毒致病的分子机理等进行研究。本文就反向遗传操作技术在PRRSV基因功能结构研究以及新型疫苗开发等研究中的应用进行了综述。

PRRSV非结构蛋白2中B细胞线性表位分析

为了筛选出理想的PRRSV标记疫苗血清学阴性标记候选物,选取美洲型PRRSV的1株国内变异株——太平株（TP）为研究对象,通过生物学软件预测TP株Nsp 2中可能存在的B细胞线性表位（B-cell lin-ear epitopes BLE）。利用8头猪的PRRSV TP株抗体阳性血清和Peptide-ELISA方法进一步筛选确认,分析其保守性、免疫源性和免疫反应性。结果显示,在预测的27个BLE中有11个可以与50%~100%的抗体阳性血清产生阳性反应,这些BLE在攻毒后15~22 d的血清中便可以检测到对应的抗体,并且一直持续到攻毒后90 d。在筛选出的11个BLE中有9个与已经确定的BLE有不同程度的重叠区域,2个为新发现的BLE,分别为3-KV10（K243TNRATPEEV252）和11-LN11（L43KRYSPPAEGN53）。其中12-PD15（P76ERVRPS-DDWATDED90）和3-KV10（K243TNRATPEEV252）的保守性、免疫源性和免疫反应性都相对较好,是比较理想的血清学阴性标记候选物,对PRRSV标记疫苗的进一步研制具有较高的参考价值。

3种致猪腹泻病毒的多重RT-PCR检测

试验建立了用于检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)与猪轮状病毒(PRV)的三重RT-PCR方法,以调查猪群中腹泻病毒感染情况。通过该方法对采自广东省规模化猪场的95份临床疑似病毒性腹泻病料进行了检测,结果表明,猪流行性性腹泻病毒阳性率为33.7%,猪传染性胃肠炎病毒阳性率为4.2%,猪轮状病毒阳性率为20%;猪流行性性腹泻病毒和猪轮状病毒混合感染率为8.4%,猪流行性腹泻病毒和猪传染性胃肠炎病毒混合感染率为2.1%。

我国猪繁殖与呼吸综合征流行概况

猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)是目前危害世界养猪业最严重的传染病之一,并在我国广泛流行。2006年我国出现的美洲型高致病性PRRS病毒(PRRSV)变异株,更是对我国养猪业影响极大。论文概述了近年来我国PRRS的流行特点,对血清学及病原学方面的调查数据进行了统计分析,并对PRRSV分子流行病学进行了探讨。

不同PRRSV毒株间ORF1a基因密码子偏爱性差异分析

运用Codon W、ClustalX、TreeView软件及EMBOSS(The European Molecular Biology Open SoftwareSuite)、CIMMiner在线分析软件对选取的29株PRRSV ORF1a基因进行密码子偏爱性聚类分析.CAI、CBI、Fop、Nc、GC3s和GC含量、基因长度等相关性分析显示PRRSV各毒株编码的ORF1a基因密码子偏爱性各有差异,其中Lelystad virus、LV4.2.1、VR-2332、RespPRRS MLV与国内分离的高致病性PRRSV变异株之间差异较大.密码子使用概率聚类分析表明CC-1、NVSL-97-7895、CH-1a、RespPRRS MLV、LV4.2.1、Lelystad virus与高致病性PRRSV变异株距离较远,而国内分离株相互间的聚类距离则较接近,此结果与基于氨基酸序列比对构建的系统进化树图谱基本一致.由此可见,PRRSV病毒ORF1a基因密码子使用偏爱性的差别与病毒的遗传多样性密切相关.

高致病性PRRSV变异株与经典株混合感染的研究

应用RT-PCR技术对来自广东省某猪场患有明显呼吸道临床症状和高热死亡的仔猪肺脏组织进行检测,结果初步鉴定为PRRSV高致病性变异株(YGhp株)与经典株(YGcl株)混合感染。进一步对2个毒株的NSP2基因进行序列分析,结果发现YGhp株与VR-2332、JXA1和Lelystad株的核苷酸同源性分别为75.1%、99%和35%,而YGcl株与上述毒株的同源性分别为99%、77.7%和34.5%,表明YGhp株为高致病性变异株,YGcl株为经典株,均属美洲型。高致病性PRRSV变异株与经典株混合感染属非常罕见。

猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离与鉴定

从广东地区发病猪场的病料中,分离到1株致Marc-145细胞病变的病毒ShB6。扩增猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)主要结构蛋白基因ORF2-ORF7并进行序列分析,结果表明,该分离株与国内PRRSV分离株HB-1(sh)/2002的同源性为96.9%;与ATCC VR-2332株的同源性为91%;而与Lelystad株的同源性仅为59.8%;用美洲型PRRSV单抗进行免疫组化染色,结果显示在细胞病变处呈现明显的阳性着色(为棕黄色)。综合可见,所分离的病毒为美洲型PRRSV。

猪轮状病毒分离与鉴定

采用MA104细胞从广东省某猪场患有明显腹泻症状的仔猪粪便中分离了1株产生明显细胞病变(CPE)的病毒。电镜观察显示,病毒粒子呈现较为典型的轮状病毒的形态特征;对其VP6基因进行序列分析,结果表明该分离株与A群猪轮状病毒代表株OSU和Gottfried的核苷酸同源分别为86.3%和80.8%,氨基酸序列同源性分别为97.7%和93.2%。综合所见,所分离的毒株为A群猪轮状病毒。