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基于生物信息学方法设计鼠伤寒沙门氏菌OmpC-FliC多表位疫苗
1
作者
刘意
张喜悦
+7 位作者
李昕
向祝
郎雨辰
宋时萍
赵格
曲志娜
刘立恒
王君玮
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2024年第18期104-109,116,135,136,共9页
为了设计鼠伤寒沙门氏菌OmpC-FliC多表位疫苗,试验在NCBI网站的Protein数据库中获取OmpC和FliC蛋白的氨基酸序列,采用Expasy服务器分析其理化性质,通过在线工具AllerTopV.2.0和Vexijen分析其抗原性和致敏性,应用NPS~@服务器分析二级结构...
为了设计鼠伤寒沙门氏菌OmpC-FliC多表位疫苗,试验在NCBI网站的Protein数据库中获取OmpC和FliC蛋白的氨基酸序列,采用Expasy服务器分析其理化性质,通过在线工具AllerTopV.2.0和Vexijen分析其抗原性和致敏性,应用NPS~@服务器分析二级结构,应用IEDB在线工具分析OmpC和FliC的B、T细胞表位。选取优势表位设计鼠伤寒沙门氏菌OmpC-FliC多表位疫苗,对其理化性质、抗原性、致敏性及三级结构进行预测。结果表明:OmpC和FliC均是亲水性蛋白,无致敏性,抗原性较高;OmpC和FliC蛋白均筛选出3个B细胞优势表位,2个细胞毒性T细胞(CTL细胞)优势表位,1个辅助T细胞(Th细胞)优势表位。设计的多表位疫苗为亲水性的稳定蛋白,抗原性预测的分数为1.1422分,且为非致敏原,预测三级结构模型的可信度大。说明鼠伤寒沙门氏菌OmpC-FliC多表位疫苗对动物无致敏性,且具有良好的抗原性。
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关键词
沙门氏菌
生物信息学
OMPC
FLIC
表位
疫苗
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职称材料
禽源大肠埃希菌氟喹诺酮类药物耐药研究进展
2
作者
郭皖露
宋时萍
+10 位作者
高玉斌
韩先杰
胡方圆
刘耀蓬
顾鹏坤
刘燕鑫
郎雨辰
曲志娜
刘俊辉
王琳
王君玮
《中国动物检疫》
CAS
2024年第5期72-78,共7页
氟喹诺酮类药物是家禽养殖中常用的抗菌药物之一。近年来,氟喹诺酮类药物在禽养殖业中的广泛过度使用导致大肠埃希菌耐药菌株出现,且该细菌对此类药物的耐药性愈发严重,耐药谱不断扩大;耐药机制越来越复杂,主要通过染色体介导、外排系...
氟喹诺酮类药物是家禽养殖中常用的抗菌药物之一。近年来,氟喹诺酮类药物在禽养殖业中的广泛过度使用导致大肠埃希菌耐药菌株出现,且该细菌对此类药物的耐药性愈发严重,耐药谱不断扩大;耐药机制越来越复杂,主要通过染色体介导、外排系统介导、膜通透性降低和质粒介导4种作用机制;耐药检测技术得到不断发展,目前已有药物敏感试验以及基因芯片、PCR、荧光原位杂交、全基因组测序、宏基因组测序等多种检测方法。针对当前日趋严峻的大肠埃希菌耐药形势,需要大力开展细菌耐药性监测,开发中药、喹诺酮类杂化物等新型药物;通过加强宣传教育,完善监测预警体系,指导合理用药;采取“减抗替抗”等综合防控措施,积极应对细菌耐药性问题。本文以4种常见的氟喹诺酮类代表药物恩诺沙星、环丙沙星、氧氟沙星、萘啶酸为例,综述了该类药物在禽源大肠埃希菌中的耐药进展状况,及其耐药作用机制、检测方法及防控措施研究进展,以期为保障食品动物安全和公共卫生安全提供依据。
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关键词
氟喹诺酮
大肠埃希菌
细菌耐药性
禽
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职称材料
题名
基于生物信息学方法设计鼠伤寒沙门氏菌OmpC-FliC多表位疫苗
1
作者
刘意
张喜悦
李昕
向祝
郎雨辰
宋时萍
赵格
曲志娜
刘立恒
王君玮
机构
中国动物卫生与流行病学中心致病微生物监测室
农业农村部畜禽产品质量安全风险评估实验室(青岛)
江西农业大学动物科学技术学院
出处
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2024年第18期104-109,116,135,136,共9页
基金
“十四五”国家重点研发计划项目“牛奶安全主要风险因子评估与预警防控关键技术”(2022YFD1301003)。
文摘
为了设计鼠伤寒沙门氏菌OmpC-FliC多表位疫苗,试验在NCBI网站的Protein数据库中获取OmpC和FliC蛋白的氨基酸序列,采用Expasy服务器分析其理化性质,通过在线工具AllerTopV.2.0和Vexijen分析其抗原性和致敏性,应用NPS~@服务器分析二级结构,应用IEDB在线工具分析OmpC和FliC的B、T细胞表位。选取优势表位设计鼠伤寒沙门氏菌OmpC-FliC多表位疫苗,对其理化性质、抗原性、致敏性及三级结构进行预测。结果表明:OmpC和FliC均是亲水性蛋白,无致敏性,抗原性较高;OmpC和FliC蛋白均筛选出3个B细胞优势表位,2个细胞毒性T细胞(CTL细胞)优势表位,1个辅助T细胞(Th细胞)优势表位。设计的多表位疫苗为亲水性的稳定蛋白,抗原性预测的分数为1.1422分,且为非致敏原,预测三级结构模型的可信度大。说明鼠伤寒沙门氏菌OmpC-FliC多表位疫苗对动物无致敏性,且具有良好的抗原性。
关键词
沙门氏菌
生物信息学
OMPC
FLIC
表位
疫苗
Keywords
Salmonella
bioinformatics
OmpC
FliC
epitope
vaccine
分类号
S852.5 [农业科学—基础兽医学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
禽源大肠埃希菌氟喹诺酮类药物耐药研究进展
2
作者
郭皖露
宋时萍
高玉斌
韩先杰
胡方圆
刘耀蓬
顾鹏坤
刘燕鑫
郎雨辰
曲志娜
刘俊辉
王琳
王君玮
机构
中国动物卫生与流行病学中心
青岛农业大学动物医学院
山西农业大学动物医学院
出处
《中国动物检疫》
CAS
2024年第5期72-78,共7页
基金
国家重点研发计划项目(2022YFC2303900)
中国动物卫生与流行病学中心创新基金项目(DW2021018)。
文摘
氟喹诺酮类药物是家禽养殖中常用的抗菌药物之一。近年来,氟喹诺酮类药物在禽养殖业中的广泛过度使用导致大肠埃希菌耐药菌株出现,且该细菌对此类药物的耐药性愈发严重,耐药谱不断扩大;耐药机制越来越复杂,主要通过染色体介导、外排系统介导、膜通透性降低和质粒介导4种作用机制;耐药检测技术得到不断发展,目前已有药物敏感试验以及基因芯片、PCR、荧光原位杂交、全基因组测序、宏基因组测序等多种检测方法。针对当前日趋严峻的大肠埃希菌耐药形势,需要大力开展细菌耐药性监测,开发中药、喹诺酮类杂化物等新型药物;通过加强宣传教育,完善监测预警体系,指导合理用药;采取“减抗替抗”等综合防控措施,积极应对细菌耐药性问题。本文以4种常见的氟喹诺酮类代表药物恩诺沙星、环丙沙星、氧氟沙星、萘啶酸为例,综述了该类药物在禽源大肠埃希菌中的耐药进展状况,及其耐药作用机制、检测方法及防控措施研究进展,以期为保障食品动物安全和公共卫生安全提供依据。
关键词
氟喹诺酮
大肠埃希菌
细菌耐药性
禽
Keywords
fluoroquinolone
Escherichia coli
bacterial resistance
poultry
分类号
S859.7 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物信息学方法设计鼠伤寒沙门氏菌OmpC-FliC多表位疫苗
刘意
张喜悦
李昕
向祝
郎雨辰
宋时萍
赵格
曲志娜
刘立恒
王君玮
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
禽源大肠埃希菌氟喹诺酮类药物耐药研究进展
郭皖露
宋时萍
高玉斌
韩先杰
胡方圆
刘耀蓬
顾鹏坤
刘燕鑫
郎雨辰
曲志娜
刘俊辉
王琳
王君玮
《中国动物检疫》
CAS
2024
0
下载PDF
职称材料
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