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鲤属鱼类mtDNA控制区(D-环区)序列的变异性分析 被引量:27
1
作者 郑冰蓉 张亚平 +2 位作者 肖蘅 蓝家湖 昝瑞光 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期289-294,共6页
采用PCR-测序技术对我国鲤属7个种、亚种和2个品种共62个个体(其中鲤的样品包括采自长江、黄河、松花江三个水系的共4个种群),进行了mtDNA控制区(D-环区)始自3’端共459bp碱基的序列测定,发现其D-环区3’端至中央保守区之间不似其他鱼... 采用PCR-测序技术对我国鲤属7个种、亚种和2个品种共62个个体(其中鲤的样品包括采自长江、黄河、松花江三个水系的共4个种群),进行了mtDNA控制区(D-环区)始自3’端共459bp碱基的序列测定,发现其D-环区3’端至中央保守区之间不似其他鱼类和哺乳类是一个单一的高变区,而是在其内部还插有一段长约110bp的保守区,这很可能是鲤属鱼类mtDNA D-环区自身的一个特点。 展开更多
关键词 鲤属 鱼类 MTDNA控制区 D-环区 变异性 线粒体 序列分析
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洱海四种鲤鱼线粒体DNA遗传相似性的初步研究 被引量:13
2
作者 郑冰蓉 张亚平 昝瑞光 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期544-546,共3页
用 6种限制性内切酶对洱海的四种鲤鱼———洱海鲤 (C .barbatus)、春鲤 (C .longipectoralis)、大眼鲤 (C .megalophthalmus)和杞麓鲤 (C .carpiochila) ,其中前三种为洱海特有 ,进行了线粒体DNA(mtDNA)的限制性片段长度多态 (RFLP)分... 用 6种限制性内切酶对洱海的四种鲤鱼———洱海鲤 (C .barbatus)、春鲤 (C .longipectoralis)、大眼鲤 (C .megalophthalmus)和杞麓鲤 (C .carpiochila) ,其中前三种为洱海特有 ,进行了线粒体DNA(mtDNA)的限制性片段长度多态 (RFLP)分析 ,构建了它们的mtDNA限制性内切酶图谱。结果表明 ,这四种鲤鱼在种内和种间均缺乏mtDNARFLP。这种现象在鱼类种间的mtDNA的RFLP研究中是罕见的。分析这一现象的原因 ,可能在于这些物种是同域形成物种 ,并且其分化时间还相当短。 展开更多
关键词 鲤属 MTDNA RFLP 同域分化 云南洱海 线粒体DNA 遗传相似性
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洱海鲤属鱼类同域分化形成的分子遗传学证据 被引量:6
3
作者 郑冰蓉 张亚平 +2 位作者 肖春杰 肖蘅 昝瑞光 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第9期976-982,共7页
对洱海的 3种鲤鱼———洱海鲤 (C .barbatus)、春鲤 (C .longipectoralis)和杞麓鲤 (C .carpiochila)线粒体DNA(mtDNA)进行了限制性片段长度多态 (RFLP)分析和mtDNA控制区 (D loop)序列测定。RFLP分析结果表明 ,16种酶在洱海鲤、春鲤... 对洱海的 3种鲤鱼———洱海鲤 (C .barbatus)、春鲤 (C .longipectoralis)和杞麓鲤 (C .carpiochila)线粒体DNA(mtDNA)进行了限制性片段长度多态 (RFLP)分析和mtDNA控制区 (D loop)序列测定。RFLP分析结果表明 ,16种酶在洱海鲤、春鲤和杞麓鲤 3个种共 14个个体上 ,仅DraⅠ在春鲤的一个个体上检出一个位点的限制性片段长度多态 ,独立为单倍型Ⅱ ,3个种的其余 13个个体共享单倍型Ⅰ ,种间遗传距离为 0 %~ 0 0 0 75 % ,此种间差异值比已报道的鱼类的种间差异甚至种内差异都低得多。D loop区的序列测定结果表明 ,长为 4 4 9bp的序列共显示有 7个变异位点 ,均为碱基替换 ,变异比例为 1 5 6 % ,在 14个鲤鱼个体中共检出 6种单倍型 ,种间的遗传距离为 0 0 82 %~ 0 171% ,与已研究的其他几种异域分布的鲤鱼相比 ,也至少小一个数量级。mtDNA的RFLP及D loop区的序列比较都揭示出洱海 3种鲤鱼之间的遗传差异远小于异域分布的鲤属鱼类物种之间及其他鱼类的同属种间的遗传差异。对洱海鲤属鱼类种间如此小的遗传差异唯一合理的解释就是 :它们确是由同域分化而形成的。 展开更多
关键词 洱海鲤属鱼类 同域分化 线粒体DNA RFLP D—loop区测序
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云南倒刺鲃mt DNA D-loop区序列的遗传多样性研究 被引量:15
4
作者 郑冰蓉 张亚平 +1 位作者 肖蘅 昝瑞光 《水利渔业》 北大核心 2002年第3期15-16,共2页
采用PCR -测序技术对采自抚仙湖的云南倒刺鱼巴 5个个体进行了mtDNAD -loop区始自 3’端共4 5 0bp碱基的序列测定。共检出 2种单倍型。 2个单倍型的差异是在第 187碱基位置处发生一个T/C颠换。种内遗传多样性指数为 0 .135 %。与鲫、银... 采用PCR -测序技术对采自抚仙湖的云南倒刺鱼巴 5个个体进行了mtDNAD -loop区始自 3’端共4 5 0bp碱基的序列测定。共检出 2种单倍型。 2个单倍型的差异是在第 187碱基位置处发生一个T/C颠换。种内遗传多样性指数为 0 .135 %。与鲫、银鲴等淡水鱼相比 ,云南倒刺鱼巴的遗传多样性程度比较丰富。在抚仙湖云南倒刺鱼巴的保护上 。 展开更多
关键词 遗传多样性 云南倒刺Ba MTDNA D-LOOP区 PCR- 序列测定
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云南倒刺鲃线粒体DNA的遗传多态性分析 被引量:2
5
作者 郑冰蓉 昝瑞光 +1 位作者 肖蘅 张亚平 《水利渔业》 北大核心 2002年第1期14-14,共1页
关键词 云南倒刺Ba 线粒体DNA 遗传多态性
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建鲤线粒体DNA的遗传多态性初步分析 被引量:8
6
作者 郑冰蓉 昝瑞光 张亚平 《水利渔业》 2000年第5期11-12,共2页
用 1 6种限制性内切酶对建鲤mtDNA进行酶解分析 ,结果表明 :建鲤的mtDNA分子大小约为1 6 6kb ;除BglⅡ无切点 ,ClaⅠ、PstⅠ、SalⅠ和XhoⅠ有一个切点外 ,其余 1 1种酶都有 2个或 2个以上酶切位点 ,其中DraⅠ、PvuⅡ检出mtDNA多态 ,... 用 1 6种限制性内切酶对建鲤mtDNA进行酶解分析 ,结果表明 :建鲤的mtDNA分子大小约为1 6 6kb ;除BglⅡ无切点 ,ClaⅠ、PstⅠ、SalⅠ和XhoⅠ有一个切点外 ,其余 1 1种酶都有 2个或 2个以上酶切位点 ,其中DraⅠ、PvuⅡ检出mtDNA多态 ,将建鲤mtDNA分为两种不同的单倍型 ;计算建鲤种内 (群体内 )mtDNA多态值π =0 .0 0 1 6 4。建鲤在分子水平显示出的遗传多样性 ,可能是建鲤能够适应全国各地的环境条件和养殖方式 ,并得以大规模推广的重要原因之一。 展开更多
关键词 建鲤 线粒体DNA 多态性 遗传结构
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云南4个少数民族8个Y-STR位点的多态分布 被引量:9
7
作者 杨晓霞 郑冰蓉 +6 位作者 杨智丽 石宏 董永利 杨洁 曾卫民 高路 肖春杰 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第11期1065-1070,共6页
对云南蒙古族、纳西族、普米族和藏族 4个少数民族共 1 83份样本进行了 8个Y STR位点的多态性分析。结果显示 :4个民族都保留着较高的Y STR遗传多态性 ,在测出的 5 5个等位基因中共构建了 1 0 1种单倍型 ,其中蒙古族有 2 9种 ,纳西族有 ... 对云南蒙古族、纳西族、普米族和藏族 4个少数民族共 1 83份样本进行了 8个Y STR位点的多态性分析。结果显示 :4个民族都保留着较高的Y STR遗传多态性 ,在测出的 5 5个等位基因中共构建了 1 0 1种单倍型 ,其中蒙古族有 2 9种 ,纳西族有 1 7种 ,普米族有 2 6种 ,藏族有 4 5种。Rst距阵表明 ,云南蒙古族与普米族和纳西族的遗传距离最远 ,分别为 0 2 894 5和 0 2 5 86 2 ;云南藏族与普米族的遗传距离较远 ,为 0 2 0 1 0 9;云南藏族与纳西族的遗传距离最近 ,比其他民族两两之间的距离小 1个数量级 ,仅为 0 0 94 75。结合历史学和民族学对 展开更多
关键词 蒙古族 纳西族 普米族 藏族 Y—STRs多态性
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云南16个少数民族群体的线粒体DNA多态性研究 被引量:10
8
作者 高路 董永利 +6 位作者 郝肇菁 王欧 杨智丽 苏艳华 郑冰蓉 昝瑞光 肖春杰 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第2期118-123,共6页
利用PCR RFLP法对傣族、白族、蒙古族、彝族等 1 0个少数民族的 1 6个群体共 6 5 4人进行了mtDNA编码区多态性分析 ,共检测到 1 7种单倍群 ,其中 4种为未能确认的单倍群。单倍群频率分布和主成分图共同显示 ,百越系的 3个民族共 6个群... 利用PCR RFLP法对傣族、白族、蒙古族、彝族等 1 0个少数民族的 1 6个群体共 6 5 4人进行了mtDNA编码区多态性分析 ,共检测到 1 7种单倍群 ,其中 4种为未能确认的单倍群。单倍群频率分布和主成分图共同显示 ,百越系的 3个民族共 6个群体有高频的B、F单倍群 ,聚集在图的下部 ,表现出鲜明的南方群体特征 ;蒙古族的 2个群体有高频的A、D单倍群 ,聚在图的上部 ,具有典型的北方群体特征 ;氐羌系的 5个民族共 7个群体全部或绝大多数都兼有南北方高频单倍群 ,位于图的中间 ,提示他们同时具有南北方群体的一些母系遗传特征。同一民族不同群体间的单倍群频率分布存在差异 ,但差异不很大 ,一般小于不同族源民族间的差异 。 展开更多
关键词 线粒体DNA 少数民族 多态性
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白族群体间的Y染色体和线粒体DNA多态性的分析 被引量:3
9
作者 董永利 高路 +7 位作者 杨晓霞 文波 杨智丽 唐文如 程宝文 郑冰蓉 李开源 肖春杰 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第5期450-456,共7页
从父系和母系基因库水平上,研究不同分布地区白族群体之间的遗传结构的异同,并对其族源以及本民族群体之间的微进化关系进行初步的探讨。利用PCR RFLP方法对云南白族和湖南白族及云南的傣族、布依族、独龙族、怒族、阿昌族和湖南土家族... 从父系和母系基因库水平上,研究不同分布地区白族群体之间的遗传结构的异同,并对其族源以及本民族群体之间的微进化关系进行初步的探讨。利用PCR RFLP方法对云南白族和湖南白族及云南的傣族、布依族、独龙族、怒族、阿昌族和湖南土家族共8个群体进行14个线粒体多态位点和Y染色体上的13个双等位基因位点进行基因分型。统计单倍型,在SPSS软件上进行主成分分析。结果显示,两个白族群体在Y染色体双等位基因单倍型分布上差异不大,以H6、H8为主要单倍型分布;在线粒体单倍群分布上,两个白族群体则差异显著,单倍群D、B、M8在湖南白族中的分布频率比云南白族高的多,而在云南白族中M 、G、F的频率则比湖南白族高。对Y染色体单倍型分布频率进行主成分分析表明两个白族群体聚在一起,整体上和其他北方起源的群体聚成一组;而对线粒体的单倍群分布频率分析显示湖南白族接近湖南汉族和土家族,而云南白族则接近云南怒族和阿昌族。两个白族群体在父系遗传结构上相近,表明他们具有共同的父系族源;而母系遗传结构上的差异,可能与历史上迁到湖南的白族先民主要为男性军士,流寓到当地后与汉、土家等民族女子通婚所致。 展开更多
关键词 白族 Y染色体 双等位基因 线粒体
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动物模型在间充质干细胞治疗慢性肝病临床前研究的应用 被引量:4
10
作者 付旭锋 陈冰冰 +4 位作者 严亚萍 王宏 王峻峰 郑冰蓉 司维 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期102-106,共5页
慢性肝病进一步发展为肝纤维化并导致肝硬化,此时除了器官移植外没有更为有效的治疗方法。然而器官缺乏的问题迫使人们寻找更为有效的治疗策略。间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSCs)有着免疫调节、分化成肝细胞、促进原位肝细胞... 慢性肝病进一步发展为肝纤维化并导致肝硬化,此时除了器官移植外没有更为有效的治疗方法。然而器官缺乏的问题迫使人们寻找更为有效的治疗策略。间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSCs)有着免疫调节、分化成肝细胞、促进原位肝细胞再生和抑制肝星状细胞的激活等能力,所以利用MSCs开展细胞移植治疗具有非常广阔的前景。本文通过综述各类人的肝病动物模型和运用这些动物模型开展MSCs细胞移植治疗肝病的临床前研究的进展和意义,将为今后在MSCs开展临床治疗的广泛应用中提供安全性和有效性评价的科学依据。 展开更多
关键词 肝病动物模型 间充质干细胞 临床前研究
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双语教学在本科生细胞生物学课程中的应用 被引量:3
11
作者 俞海菁 董毅龙 +7 位作者 杨智丽 代瑾然 王奕 吕琦 陈穗云 肖春杰 郑冰蓉 肖蘅 《高校生物学教学研究(电子版)》 2016年第1期16-21,共6页
随着我国生命科学科研水平日益与国际接轨和社会经济文化的发展,当代生命科学的本科教育中,中英文双语教学已逐渐成为适用的教学模式。在良好的双语教学师资和正确使用英语工具的基础上,双语教学有助于大学生快速掌握生命科学包括细胞... 随着我国生命科学科研水平日益与国际接轨和社会经济文化的发展,当代生命科学的本科教育中,中英文双语教学已逐渐成为适用的教学模式。在良好的双语教学师资和正确使用英语工具的基础上,双语教学有助于大学生快速掌握生命科学包括细胞生物学的基础知识和前沿成果。本文以细胞生物学课程的教学内容为例,说明双语教学中可以通过专业英语的使用,促进学生掌握学习内容、提高专业知识的学习效率。 展开更多
关键词 双语教学 细胞生物学 专业英语
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精神分裂症与G72基因多态性的关联
12
作者 杨蜀云 邵静茹 +6 位作者 吴艳瑞 高长青 合浩 罗城 吴雪梅 郑冰蓉 肖春杰 《临床精神医学杂志》 2011年第4期217-219,共3页
目的:探讨在云南省汉族人群中D-氨基酸氧化酶激活基因(G72)多态性与精神分裂症的关联性。方法:采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态(PCR-RFLP)方法,在云南汉族276例精神分裂症患者和312例健康对照者中进行G72基因3个多态位点(rs95585... 目的:探讨在云南省汉族人群中D-氨基酸氧化酶激活基因(G72)多态性与精神分裂症的关联性。方法:采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态(PCR-RFLP)方法,在云南汉族276例精神分裂症患者和312例健康对照者中进行G72基因3个多态位点(rs9558562,rs45476401,rs3918341)的分型。结果:各位点在病例组和对照组中基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡。无论在男女混合样本,还是分别在男性、女性样本中,rs9558562,rs45476401,rs3918341在病例组和对照组间的等位基因频率分布差异均无显著性(P均>0.05)。结论:G72基因rs9558562,rs45476401和rs3918341多态与云南汉族精神分裂症发病无显著相关。 展开更多
关键词 精神分裂症 G72基因 单核苷酸多态 云南汉族
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一个Sierpinski垫片的Hausdorff测度的准确值的计算
13
作者 郑冰蓉 李楚玲 许绍元 《韩山师范学院学报》 2016年第6期12-14,共3页
研究了一个Sierpinski垫片的Hausdorff测度,利用自相似集Hausdorff测度的上限估计的有效方法,得到Sierpinski垫片的Hausdorff测度的一个上界,然后应用垂直射影的方法得到Hausdorff测度的一个下界,从而得到该Sierpinski垫片的Hausdorff... 研究了一个Sierpinski垫片的Hausdorff测度,利用自相似集Hausdorff测度的上限估计的有效方法,得到Sierpinski垫片的Hausdorff测度的一个上界,然后应用垂直射影的方法得到Hausdorff测度的一个下界,从而得到该Sierpinski垫片的Hausdorff测度的准确值. 展开更多
关键词 SIERPINSKI垫片 垂直映射 HAUSDORFF测度
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TLR4在炎性癌症中的研究现状 被引量:7
14
作者 罗晓曦 陈国栋 +2 位作者 焦扬 桑雄波 郑冰蓉 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期1735-1740,共6页
炎性癌症是指由炎症引发的癌症。大多数癌症的发生往往与炎症有着密不可分的联系,例如:长期的宫颈炎提高了宫颈癌变的可能性;幽门螺旋杆菌所致的胃炎被普遍认为是胃癌的始发原因;严重的溃疡性结肠炎可能会导致结肠癌的发生;慢性肝炎则... 炎性癌症是指由炎症引发的癌症。大多数癌症的发生往往与炎症有着密不可分的联系,例如:长期的宫颈炎提高了宫颈癌变的可能性;幽门螺旋杆菌所致的胃炎被普遍认为是胃癌的始发原因;严重的溃疡性结肠炎可能会导致结肠癌的发生;慢性肝炎则是造成肝纤维化、肝硬化、最终形成肝癌的罪魁祸首之一。 展开更多
关键词 炎性癌 TLR4 宫颈癌变 肝癌细胞系 结肠癌 幽门螺旋杆菌 肝纤维化 肝硬化 胃癌 慢性肝炎
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间充质干细胞冻存方法的研究进展 被引量:6
15
作者 付旭锋 刘平 +3 位作者 陈冰冰 焦扬 司维 郑冰蓉 《云南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期652-660,共9页
间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSCs)是具有自我复制能力和多向分化潜能的成体干细胞,它能够发育成硬骨、软骨、脂肪和其他类型的细胞,因此已成为细胞治疗的重要候选种子细胞,特别在各种退行性疾病和自身免疫性疾病的组织修复和... 间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSCs)是具有自我复制能力和多向分化潜能的成体干细胞,它能够发育成硬骨、软骨、脂肪和其他类型的细胞,因此已成为细胞治疗的重要候选种子细胞,特别在各种退行性疾病和自身免疫性疾病的组织修复和免疫调节方面有良好的应用前景.有效的应用须建立在有生物学特性保持良好的充足MSCs的前提下.由于临床上细胞移植的供体和受体往往存在不同时性,很难保证即离即用,且充足的数量需求保证也会是一个问题.因此,能保证良好生物学特性稳定保持的MSCs冻存方法就显得尤为重要.本文即对MSCs冻存技术的研究进展进行综述. 展开更多
关键词 间充质干细胞 细胞冻存 冷冻保护剂
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线粒体DNA多态性揭示丝绸之路上游地区少数民族的基因融合 被引量:5
16
作者 杨留启 谭思杰 +5 位作者 俞海菁 郑冰蓉 乔恩发 董永利 昝瑞光 肖春杰 《中国科学(C辑)》 CSCD 北大核心 2008年第4期368-376,共9页
河西走廊位于中国古丝绸之路的上游地区,是连接东亚和中亚地区的主要通道.为了在遗传背景上评价该地区的基因融合,研究了该地区5个少数民族人群的线粒体DNA多态性.采用测序和PCR-限制性内切酶片段长度多态分析方法对采自河西走廊地区的... 河西走廊位于中国古丝绸之路的上游地区,是连接东亚和中亚地区的主要通道.为了在遗传背景上评价该地区的基因融合,研究了该地区5个少数民族人群的线粒体DNA多态性.采用测序和PCR-限制性内切酶片段长度多态分析方法对采自河西走廊地区的三个人群和邻近的新疆两个人群总共242个无关个体进行单倍型分型,并且把得到的数据同以前报道的东亚、中亚、西亚以及欧洲人群数据进行比较.结果发现欧洲特异单倍型和东亚特异单倍型同时存在于河西走廊地区人群中,从而揭示了从欧洲经中亚向河西走廊的基因流动.河西走廊地区人群在遗传上分布于中亚和东亚人群之间,这意味着中亚和东亚人群对该地区的母系遗传结构做出了重要贡献.本研究更加完整地展示了沿着丝绸之路地区从欧洲经中亚到丝绸之路上游的河西走廊的基因流动和基因融合事件。 展开更多
关键词 多态性 线粒体DNA 基因融合 河西走廊
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D-氨基酸氧化酶激活剂基因多态性与精神分裂症的关联研究 被引量:2
17
作者 杨丽 邵静茹 +6 位作者 阮冶 吴艳瑞 周利国 张勇辉 伍星 郑冰蓉 肖春杰 《中华精神科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期70-74,共5页
目的探讨D-氨基酸氧化酶激活剂(D—aminoacid oxidaseactivator,DAOA)基因rs2391191、rs947267、rs778294多态性与云南汉族人群精神分裂症发病的相关性。方法采用聚合酶链式反应一限制性片段长度多态(PCR—RFLP)方法,对276例精神... 目的探讨D-氨基酸氧化酶激活剂(D—aminoacid oxidaseactivator,DAOA)基因rs2391191、rs947267、rs778294多态性与云南汉族人群精神分裂症发病的相关性。方法采用聚合酶链式反应一限制性片段长度多态(PCR—RFLP)方法,对276例精神分裂症患者(患者组)和312名健康对照(对照组)DAOA基因rs2391191、rs947267和rs7782943个位点的多态进行检测,在混合群体和性别分层群体中进行多态性与精神分裂症关联分析。结果(1)患者组和对照组rs2391191、rs947267、rs7782943个位点等位基因频率分布的差异无统计学意义(P〉0.05)。(2)患者组男性和对照组男性rs2391191等位基因的频率分布差异无统计学意义(P〉0.05);患者组男性rs947267C和rs778294A等位基因的频率分别为0.406,0.184,对照组男性分别为0.327,0103,患者组高于对照组[校正相对风险度(OR)=1.41,95%可信区间(CI)=1.00~1.99,P=0.049;OR:1.91,95%CI=1.21~3.20,P=0.006]。(3)对照组男性单倍型GAA的频率显著高于患者组男性(P=0.008)。结论DAOA基因的rs947267、rs778294位点可能与男性精神分裂症发病存在相关性,rs947267C等位基因和rs778294A等位基因可能是男性精神分裂症发病的危险因子;单倍型GAA可能是男性精神分裂症的保护性单倍型。 展开更多
关键词 精神分裂症 多态性 单核苷酸 D-氨基酸氧化酶激活剂基因
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哺乳动物中不同表达丰度外显子的进化特征
18
作者 李洁 方林 +6 位作者 李昕 张晓妍 叶葭 胡卫红 郑冰蓉 俞海菁 肖春杰 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第1期31-39,共9页
通过比较基因组学方法,利用哺乳动物基因组数据对不同表达丰度外显子的进化特征进行了研究.以非编码区和假基因为对照,对外显子进行序列相似度、phastCons和Ka/Ks分析,结果显示,高表达外显子十分保守而低表达和低表达的外显子也在物种... 通过比较基因组学方法,利用哺乳动物基因组数据对不同表达丰度外显子的进化特征进行了研究.以非编码区和假基因为对照,对外显子进行序列相似度、phastCons和Ka/Ks分析,结果显示,高表达外显子十分保守而低表达和低表达的外显子也在物种间表现出保守的进化特征.低表达丰度的外显子构成了物种转录组中大多数的转录本种类,结果显示它们的进化都受到功能限制,暗示它们可能在生物进化过程中为增加生物复杂度做出贡献. 展开更多
关键词 外显子 进化 序列相似度 phastCons Ka/Ks
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EXO1基因单核苷酸多态性与云南汉族人群胃癌的相关性研究 被引量:1
19
作者 张洁莹 寿涛 +7 位作者 杨红菊 罗丽琳 杨文娟 李琴 李苏华 李雪萍 卢春燕 郑冰蓉 《云南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期120-127,共8页
胃癌是一种由基因和环境因素相互作用、在世界范围内最常见的恶性肿瘤之一.该研究用PCRRFLP的方法,在270名健康对照个体和239名胃癌患者共509人的云南汉族人群中,对核酸外切酶1(exonuclease 1,EXO1)基因rs1635517、rs1776177、rs851797... 胃癌是一种由基因和环境因素相互作用、在世界范围内最常见的恶性肿瘤之一.该研究用PCRRFLP的方法,在270名健康对照个体和239名胃癌患者共509人的云南汉族人群中,对核酸外切酶1(exonuclease 1,EXO1)基因rs1635517、rs1776177、rs851797、rs1635498和rs1776148五个单核苷酸多态(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点进行多态检测.结果采用SPSS16.0、PHASE、HaploView4.2软件进行数据统计分析,用Logistic模型在95%置信区间内进行相关性风险度测算.结果显示,位于EXO1基因5’UTR的位点rs1635517的CC基因型携带者和C等位基因携带者患胃癌的相对风险度显著升高(p<0.05),提示该多态位点可能与胃癌发生相关.其余4个位点虽检测到多态,但它们的基因型和等位基因频率在病例和对照中无显著差异,提示这4个位点可能与云南汉族人群的胃癌发生不相关. 展开更多
关键词 核酸外切酶1基因 单核苷酸多态性 胃癌 云南汉族
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TLR4基因Asp299Gly、Thr399Ile错义突变与强直性脊柱炎的相关性研究 被引量:1
20
作者 秦姣 邵静茹 +8 位作者 周若宇 魏传钰 寿涛 梁德全 寸益贤 方文昆 刘荣华 李琛 郑冰蓉 《云南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第S2期499-503,540,共6页
强直性脊柱炎是一种以中轴关节受累为主要病变的自身免疫性疾病.新近的研究显示,TLR4基因多态与强直性脊柱炎的发生和病情发展有关,但迄今尚未见对中国人群的研究报道.该研究以病例-对照研究策略,采用PCR-RFLP和直接测序的方法,在107名... 强直性脊柱炎是一种以中轴关节受累为主要病变的自身免疫性疾病.新近的研究显示,TLR4基因多态与强直性脊柱炎的发生和病情发展有关,但迄今尚未见对中国人群的研究报道.该研究以病例-对照研究策略,采用PCR-RFLP和直接测序的方法,在107名强直性脊柱炎病例和112名健康对照个体中,对TLR4基因位于第3外显子编码区的rs4986790和rs4986791位点,即Asp299Gly和Thr399Ile错义突变进行多态检测.结果显示,在病例和正常对照样本中,均未检测到这2个位点的多态性,提示这2个位点多态与强直性脊柱炎的发生无关.这是首次在中国云南汉族人群中进行的TLR4基因多态与强直性脊柱炎的关联研究. 展开更多
关键词 TLR4基因Asp299Gly和Thr399Ile多态 强直性脊柱炎 云南汉族
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