深圳地区育龄人群G6PD基因突变谱特征分析

目的:分析深圳地区育龄人群葡萄糖-6磷酸脱氢酶(G6PD)缺乏症的发生率及基因突变特征。方法:采集深圳地区体检育龄夫妇外周血样本,采用葡萄糖-6磷酸脱氢酶/6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶(G6PD/6GPD)比值法、突变阻滞聚合酶链扩增系统(ARMS-PCR)结合二代测序(NGS)全序列分析方法,对样本进行G6PD基因突变检测和分析。结果:5640例样本G6PD酶活性异常比例为6.4%(360/5640),G6PD基因突变比率为7.8%(442/5640)。酶活性正常的5280例样本中(男性1331例、女性3949例)基因突变占1.8%(96/5280),男女性样本漏诊率分别为0.3%(3/1331)和2.4%(93/3949),而在1109例G6PD酶活性异常样本(包括之前收集的749例阳性样本)中,有25例样本未发现基因变异,误诊率2.2%(25/1109)。本研究共检出23种基因突变类型,发现c.460A>G、c.226A>C、c.-6T>C、c.452C>G 4种未见报道的基因突变类型。结论:深圳地区常见G6PD缺乏症致病基因突变类型主要为c.1376 G>T、c.1388 G>A、c.95 A>G、c.871 G>A、c.392 G>T、c.1024C>T 6种,与中国人G6PD缺乏症常见基因突变类型基本一致。本研究发现4例尚未见报道的可能致病性突变,其与酶活性缺乏的具体关系尚需进一步深入研究。

二代测序平台(NGS)在眼皮肤白化病I型诊断应用一例

目的借助Ion Torrent PGMTM测序平台对1例眼皮肤白化病(oculocutaneous albinism,OCA)患者的家系进行基因诊断分型。方法采用PCR扩增的方法对OCA常见的四个致病基因TYR、P、TYRP1和SLC45A2进行全长扩增(包括内含子和外显子),PCR产物二代测序,在确定致病突变的基础上对家系成员进行综合分析。结果先证者携带TYR基因的双重杂合突变:c.929ins C和c.1199G>T,尽管先证者在P和SLC45A2基因上也发现了纯合突变,但是相应纯合突变在父母基因组中也被发现,而父母均未有临床症状表现,因此确定先证者为OCA1型患者。结论我们在一个白化病核心家系鉴定了1例由TYR基因双重杂合子突变引起的OCA1型白化病,应用二代测序方法可高效准确地为具有高遗传异质性的遗传病开展全面的基因筛查工作。