【目的】研究玉米ZmCDPK22基因的功能特征,分析该基因的编码序列,分析物种间的进化关系及蛋白互作及其功能,以叶片含水量作为干旱胁迫指标,研究ZmCDPK22在干旱胁迫下的表达特性。【方法】利用生物信息学手段分析该基因的基本特征,运用...【目的】研究玉米ZmCDPK22基因的功能特征,分析该基因的编码序列,分析物种间的进化关系及蛋白互作及其功能,以叶片含水量作为干旱胁迫指标,研究ZmCDPK22在干旱胁迫下的表达特性。【方法】利用生物信息学手段分析该基因的基本特征,运用实时荧光定量(Quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)技术分析该基因在干旱胁迫下的表达特性。【结果】该基因编码一个分子式为C 2675 H 4217 N 779 O 798 S 21,分子量为60731.91,氨基酸大小为539 aa,等电点为6.44的亲水性蛋白。该蛋白无跨膜结构以及信号肽,预测结果显示该蛋白定位于细胞核且与10个蛋白存在互作,属于PK_like亚家族;该基因启动区含有大量的光响应和多种激素响应等元件。在不同含水量情况下,ZmCDPK22的表达量不同,与叶片含水量87%相比,其相对表达量随着叶片含水量的降低而逐渐降低,在叶片含水量为78%时相对表达量最高,在含水量为33%时相对表达量最低。【结论】该基因在叶片不同含水量的表达量不同,该基因响应干旱胁迫,可能在干旱应答反应中发挥一定功能。展开更多
文摘【目的】研究玉米ZmCDPK22基因的功能特征,分析该基因的编码序列,分析物种间的进化关系及蛋白互作及其功能,以叶片含水量作为干旱胁迫指标,研究ZmCDPK22在干旱胁迫下的表达特性。【方法】利用生物信息学手段分析该基因的基本特征,运用实时荧光定量(Quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)技术分析该基因在干旱胁迫下的表达特性。【结果】该基因编码一个分子式为C 2675 H 4217 N 779 O 798 S 21,分子量为60731.91,氨基酸大小为539 aa,等电点为6.44的亲水性蛋白。该蛋白无跨膜结构以及信号肽,预测结果显示该蛋白定位于细胞核且与10个蛋白存在互作,属于PK_like亚家族;该基因启动区含有大量的光响应和多种激素响应等元件。在不同含水量情况下,ZmCDPK22的表达量不同,与叶片含水量87%相比,其相对表达量随着叶片含水量的降低而逐渐降低,在叶片含水量为78%时相对表达量最高,在含水量为33%时相对表达量最低。【结论】该基因在叶片不同含水量的表达量不同,该基因响应干旱胁迫,可能在干旱应答反应中发挥一定功能。