基于单细胞ATAC测序数据的乳腺癌上皮细胞转录因子研究

研究表明,乳腺肿瘤细胞染色质开放区域上的转录因子显著影响乳腺癌患者的临床表型和预后。然而,在单细胞层面,这些调控元件如何调控乳腺癌发生发展尚不明确。为此,本研究从GEO数据库中下载了45216个正常和肿瘤乳腺组织的单细胞染色质可及性测序(single-cell ATAC sequencing,scATAC-seq)数据,并对其进行了分析。根据标记基因在细胞群的基因活性得分进行细胞类型注释后得到7种乳腺细胞类型。皮尔逊相关性分析表明,肿瘤和正常乳腺样本的上皮细胞存在明显的染色质可及性差异,且乳腺上皮细胞存在高度样本间异质性(PCC=-0.07),暗示其是乳腺肿瘤的主要恶性细胞类型。为了探究正常和恶性乳腺上皮细胞的差异可及性区域中转录因子结合基序的富集情况,在提取上皮细胞群后对4个上皮细胞亚型的特征开放区域进行了转录因子结合基序富集分析。结果表明,恶性乳腺上皮细胞有194个转录因子显著富集(P<0.001),它们可能涉及乳腺肿瘤发展和转移等调控过程。对上皮细胞亚型中富集程度较高的转录因子进行活性分数计算及转录组数据验证,结果进一步显示这些差异调控元件可能与乳腺细胞恶性发展相关。此外,对转录因子结合基序在不同乳腺癌亚型中的可及性差异进行了分析,发现SNAI2在三阴性乳腺癌样本中具有显著高的可及性,提示SNAI2在三阴性乳腺癌中具有潜在的特异性调控作用。

新时期民族民间音乐与流行音乐的融合性研究

将民族民间音乐与流行音乐的风格结合起来,能够给公众带来一种全新的听觉和视觉体验。伴随着我国流行音乐的快速发展,多数音乐家都在不断地进行革新,将民族民间音乐与流行音乐相结合,能够创造出一批具有中国特色的音乐作品。在新时期背景下,从原生态民歌、民族调式、戏曲元素、中国风歌曲的角度出发,提出具有针对性的融合路径,为进一步推动我国民族民间音乐和流行音乐的融合发展提供借鉴。

肝癌HepG2细胞中TEAD1-增强子调控微RNA的识别与分析

转录因子、增强子和微RNA(microRNA,miRNA)组成的调控网络对癌症的转录调控和进展至关重要。TEA结构域转录因子1(TEA domain transcription factor 1,TEAD1)是TEA/ATTS结构域家族的成员,目前尚不清楚TEAD1作为一种癌症相关转录因子,是否参与了增强子-miRNA网络与肝细胞癌的发生发展。本研究首先通过整合肝细胞癌HepG2细胞系的CAGE-seq和GRO-seq数据,鉴定出14286个转录稳定与不稳定增强子RNA(enhancer RNA,eRNA)的活性增强子,并证实这些活性增强子具有先前报道的组蛋白修饰特征(高的H3K27ac信号与H3K4me1/H3K4me3信号比)。随后,通过整合从ChIP-seq数据获得的35883个TEAD1-DNA结合位点,鉴定出2550个与TEAD1结合的增强子(EnhTEAD1)。进一步分析显示,与未结合TEAD1的增强子(EnhnoTEAD1)相比,EnhTEAD1上活性增强子标记(H3K27ac、H3K4me1和H3K4me3)和eRNA的表达显著升高;TEAD1与4种转录因子(GATA4、HNF4A、YY1和CTCF)协同作用,促进EnhTEAD1区域介导的染色质可及性和空间环化。最后,为了研究EnhTEAD1与miRNA之间的调控网络,在采用干扰小RNA(small interfering RNA,siRNA)干扰TEAD1后,对HepG2肝癌细胞进行了小RNA(small RNA)测序,并通过RNA-seq和Hi-C共获得68个由EnhTEAD1调控的差异表达miRNA(EnhTEAD1-miRNA),这些EnhTEAD1-miRNA显著参与多种癌症相关的生物进程与通路。综上所述,本研究阐明了EnhTEAD1-miRNA网络在肝细胞癌中的调控机制,为肝细胞癌治疗提供了新的潜在靶点。

p53直接调控microRNA及其靶基因的高通量筛选

通过对676条人microRNA进行筛选,共得到了53条新的具有p53-DNA结合位点且调控p53上游转录因子和下游靶基因的microRNA.结合已有蛋白质互作关系与microRNA调控信息,构建了p53-microRNA相互作用网络图,其中FAS受多条microRNA调控,FAS是介导细胞凋亡的关键因子,因此,FAS-microRNA的相互作用可能在细胞凋亡途径中起着关键的作用.随后,提出了microRNA参与p53调控的假设机制,认为p53调控靶基因与microRNA的同时也受上游转录因子与microRNA的调控,从而形成了以p53为中心的一种平衡,当这种调控平衡一旦被打破则会引起信号通路的紊乱,从而可能引发相应的疾病.对这53条microRNA进行靶基因预测,共得到15500个靶基因,对这些基因的出现频率进行聚类分析共得到27个簇,将出现频率大于10的基因进行功能注释分析,发现多数基因功能属于近来发现的p53靶基因新的功能分类——细胞粘连和细胞运动,目前研究认为,p53通过与这些具有细胞粘连和运动功能的靶基因结合来抑制肿瘤的迁移.通过对15500个基因进行功能注释分析,得到了30条感兴趣的参与细胞周期调控、细胞凋亡和细胞增殖的microRNA,其中有9条microRNA于3种生物学进程均有参与,这9条microRNA分别是:hsa-mir-181a-1、hsa-mir-181b-1、hsa-mir-181c、hsa-mir-181d、hsa-mir-195、hsa-mir-497、hsa-mir-495、hsa-mir-543和hsa-mir-548c.这暗示着这9条microRNA在p53信号通路的调节中可能起着关键的作用,它们互相作用共同调节着多个p53信号环路.最后在36个物种的基因组中对这30条microRNA进行了同源性搜索与保守性分析,结果发现有10条高度保守的且为目前数据库所未收录的microRNA.这10条microRNA分别是:hsa-mir-497、hsa-mir-495、hsa-mir-543、hsa-mir-19a、hsa-mir-19b-1、hsa-mir-200b、hsa-mir-448、hsa-mir-28、hsa-mir-455和hsa-mir-590.

生物胺受体配基结合区域及其位点的预测

生物胺受体被认为是一类重要的药物靶标,用生物信息学手段寻找它的配基结合位点并分析其功能,对于药物设计具有重要的指导意义。从整体上结合可变性、疏水性和保守性构建了受体的2D螺旋横切面模型,预测出其可能的配基结合区Ⅰ、Ⅱ,其中TM3、TM4以及TM7在配基结合中起关键作用,E-Ⅱ环也参与了配基结合这一过程,这是对以往普遍认为只有TM参与配基结合的延伸。从局部上寻找了生物胺受体及其子受体的motif,提出了父家族可变子家族保守motif概念,即父家族可变区中出现的子家族保守的motif。最后结合整体与局部分析结果分析了各motif的功能,预测了行使配基结合功能的motif及其相应位点,结果证明与突变实验结果有很好的吻合度。

G蛋白偶联受体的结构与功能

G蛋白偶联受体 (Gprotein coupledreceptor,GPCR)是具有 7个跨膜螺旋的蛋白质受体 ,根据其序列的相似性以及与配基的结合情况 ,共分为 5个亚家族 ,是人体内最大的蛋白质家族 ,也是重要的药物靶标。二聚体或寡聚体的形成 ,以及G蛋白偶联受体多元素参与的信号网络传递模式的研究 ,打破了传统的配基→G蛋白偶联受体→G蛋白→效应器的这种单一的线性信号传递模式 ,它的结构与功能的研究对于新药的开发、研制以及推动医药领域的发展起着举足轻重的作用。

生物信息学技术进展

生物信息学是一门对生物信息进行采集、储存、传递、检索、分析和解读的学科,它已经渗透于现代生物学、数学、信息学、计算科学、统计学、物理、化学各个方面。本文概述和分析了生物信息学研究中的一些方法。

计算识别microRNA及其靶基因(英文)

小RNA的发现为基因调控系统研究提供了新的方向。在多数物种中已经发现了大量的小RNA。这一领域已经成为了近来研究的热点,在研究起始阶段,计算学方法已经成为实验研究中不可或缺的工具,许多发现是由生物学实验与计算学方法共同合作来完成的。总结了前人关于小RNA及其靶基因识别的理论知识,讨论了关于预测小RNA及其靶基因的计算学方法和相关软件。

输尿管镜手术并发症的防治

目的总结输尿管镜手术并发症及其防治措施。方法对600例应用输尿管镜手术患者临床资料进行回顾性分析,统计术中、术后发生的各种并发症。结果术中输尿管穿孔6例(1.0%),5例术中发现,均成功留置双J管;1例术后发现,重新留置双J管成功。1例(0.16%)术中输尿管下段完全断裂改开放手术行输尿管膀胱再植术治愈;1例(0.16%)术中发现下段黏膜撕脱约1cm,经抗感染、留置双J管2个月等治疗后恢复;结石残留40例(6.6%),予保留双J管行ESWL治疗后治愈。术后肾绞痛6例(1.0%),针对引起腰痛不同原因进行相应处理。感染12例(2.0%),经抗感染及拔除双J管等治疗后恢复。结论应用输尿管镜手术成功率高,严重并发症较少见,且绝大多数行保守治疗可得到解决;熟练的手术操作是减少输尿管镜手术并发症的关键。

骨脊柱创伤患者陪检转运护理

目的保证骨脊柱创伤患者的陪检转运安全,提高陪检转运工作的护理服务质量。方法合理安排陪检路线,密切观察病情变化,采取相应的护理措施。结果应用骨脊柱创伤患者陪检服务流程,缩短了检查等候时间,减少了检查纠纷,增加了患者及家属对陪检转运工作的满意度。结论在骨脊柱创伤患者陪检转运过程中,运用科学、规范的陪检工作流程,采取安全、高效的陪检护理措施,保证了骨脊柱创伤患者的陪检转运安全,提高了陪检转运服务质量。

腹腔镜胆囊切除患者围手术期的护理

目的:充分探讨行腹腔镜胆囊切除术(LC)患者的有效地围手术期护理。方法:总结具体有效的LC围手术期的护理措施。结果:我院临床LC术患者恢复良好。结论:高质量的LC围手术期护理是促进手术成功的基础。

论社会主义核心价值观与闽南文化

作为马克思主义中国化的最新成果,社会主义核心价值观离不开中华传统文化的有效滋养。闽南文化是中华优秀传统文化的重要组成部分,能够为社会主义核心价值观提供良好的养分。依托闽南历史文化资源、闽商资源、闽南民俗文化资源能够形成培育和践行社会主义核心价值观的良好氛围,提升社会主义核心价值观的实践张力,真正实现内化于心、外化于行。

“一带一路”建设与统一战线拓展研究

"一带一路"建设视域下,统一战线应该发挥优势和特色,统筹国内国际两个大局,积极构建大统战工作格局。性质构成逐步拓展,团结对象日益广泛,目标任务日趋多元是统一战线在"一带一路"建设中必须直面的新情况新问题。统一战线应明确定位,认清形势,依托自身线长面广的独特优势,理清工作思路、拓宽发展渠道,在政治、经济和文化等领域不断激发自身潜能,进一步凝聚人心、汇聚力量,从而服务于"一带一路"建设和中华民族伟大复兴的中国梦。

论全面从严治党视阈下的统一战线建设

作为"四个全面"战略布局的根本保证,全面从严治党已经成为中国共产党党内生活的新常态。作为党执政兴国的重要法宝,统一战线要深刻认识、主动适应全面从严治党的新常态,同时要树立求同存异、依法治国、网络统战三大理念,增强政治、大局、服务三大意识,提升学习、创新、合作三大能力,积极服务全面从严治党新常态。

门急诊电子病历监管在医院病历信息管理中的应用研究

门急诊电子病历系统是现代医院信息管理系统建立与发展中的一项重要内容,能够有效为患者在就医时从挂号到治疗结束中省去繁杂的手工程序,极大地提高就医效率,能够有效解决医院医护人员对患者病历的后期整理、查询等难题,不仅提高了医院的治疗效率,同时也少了医护人员的工作量。该文主要介绍了门急诊电子病历特点,以及门急诊电子病历帮助门急诊医生解决的模板病历书写等一些实际问题。

论《包身工》的报告文学特征

以传统社会历史批评解读《包身工》无法深度透视其文体特性,非虚构叙述下的文体特征被研究者有意无意地忽略了。以叙事学为凭借,作为报告文学文本经典的《包身工》在叙事上所折射出的文学性与批判性渐次浮出历史地表。

论统一战线与“一带一路”的关系

"一带一路"是一项有利于促进区域经贸合作、增进区域政治互信、推动区域文明互鉴的伟大方略。统一战线作为服务"四个全面"战略布局的重要力量支持,可以而且应当在服务"一带一路"战略中发挥重要作用。"一带一路"战略离不开统一战线的大力支持。"一带一路"是"四个全面"战略布局的重要延伸。统一战线是"四个全面"战略布局的力量支持。"一带一路"是统一战线围绕中心、服务大局的重要内容。统一战线要发挥人才优势,为"一带一路"战略提供智力支持;发挥法宝作用,为"一带一路"战略提供力量支持。要打造国际统一战线,为"一带一路"战略提供国际环境。

统战新时代 社院新使命——学习十九大精神心得体会

习近平总书记在党的十九大报告中多次提到了统一战线工作,并对新形势下的统战工作提出了一系列的新定位、新部署和新要求.社会主义学院作为统一战线人才教育培养主阵地和统一战线高端智库,应当在认真学习领会大会精神实质基础上,进一步统一思想、提高认识,切实做到以党的十九大精神为引领,扎实推进社院正规化建设.

学贯新思想 开创新辉煌——关于民营经济学习贯彻新思想的几点思考

2018年9—10月,由福建省社会主义学院牵头,联合泉州市委组织部、市委统战部、市工商联和市社会主义学院联合开展的“爱学会赢闯天下——全面推动习近平新时代中国特色社会主义思想进泉商全国行”大型宣讲活动在神州大地掀起了一波新思想大学习的高潮。从刺桐出发,辗转经过首都、杭州、银川,最后在改革开放的前沿阵地深圳收官,宣讲活动实现了对257家泉籍商会非公企业代表人士的全覆盖宣讲。本着锻炼新人、打造教师队伍的目标,我有幸被学院选中组成宣讲团第二梯队,并在“塞上江南”银川站为泉州的企业家精英们讲授习近平新时代中国特色社会主义思想。个中滋味,过后思量更难忘。结合参与活动的具体感受和个人学习习近平新时代中国特色社会主义思想与党的十九大精神的心得体会,针对民营经济如何学习贯彻党的十九大精神方面,笔者谈几点思考:一、新思想是中华民族伟大复兴的指导思想与行动指南新的时代必然会产生新的思想,因为新的时代需要新的思想进行引领。

论统一战线与“四个全面”的关系

统一战线与"四个全面"之间存在辩证关系。统一战线是全面建成小康社会的直接受益者,全面建成小康社会需要统一战线提供力量支撑。统一战线要服务全面深化改革,要在全面深化改革中把统一战线事业推向前进。统一战线是全面依法治国的重要力量,要在全面依法治国中推进统战工作的法治化。统一战线有助于实现全面从严治党,要以全面从严治党的精神巩固和发展统一战线。