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华中樱叶绿体基因组特征与分子标记 被引量:1
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作者 阳秀玫 陈亮明 +7 位作者 禹霖 柏文富 李建挥 吴思政 李柏海 熊颖 聂东伶 严佳文 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期175-184,共10页
【目的】组装华中樱叶绿体基因组并进行序列特征分析和分子标记初步鉴定。【方法】分别应用SPAdes、prodigal v2.6.3、hmmer v3.1b2及aragorn v1.2.38软件进行华中樱叶绿体基因组组装、基因编码区注释、r RNA和t RNA预测。应用OGDRAW软... 【目的】组装华中樱叶绿体基因组并进行序列特征分析和分子标记初步鉴定。【方法】分别应用SPAdes、prodigal v2.6.3、hmmer v3.1b2及aragorn v1.2.38软件进行华中樱叶绿体基因组组装、基因编码区注释、r RNA和t RNA预测。应用OGDRAW软件进行叶绿体基因组图谱绘制。运用DNAMAN软件对26个樱亚属物种和华中樱的叶绿体基因组序列进行多重比对,人工检索华中樱特有的SNP和InDel位点。应用Codon W1.4.2和EMBOSS的cusp软件分析叶绿体基因组中基因的相对同义密码子使用度。【结果】华中樱叶绿体基因组大小为158 019 bp,其中小单拷贝区(Small single copy,SSC)、大单拷贝区(Large single copy,LSC)和反向重复区(Inverted repeat,IR)大小分别为19 247、85 910和52 862 bp,总GC含量为36.7%。华中樱叶绿体基因组共编码130个基因,包括8个核糖体RNA基因、37个转运RNA基因以及85个蛋白编码基因。序列中有SSR位点240个,其中单核苷酸重复位点153个,二核苷酸重复位点12个,三核苷酸重复位点63个,四核苷酸重复位点11个,六核苷酸重复位点1个。通过与另外26种樱亚属植物叶绿体基因组序列进行多重比对,鉴定了华中樱潜在的种特异性SNP位点29个,InDel标记8个。对密码子进行统计可知,该物种的66种密码子编码了21种氨基酸,其中RSCU> 1的密码子共有32个,有29个以A/U结尾,这些密码子结尾具有A/U偏好性。【结论】华中樱叶绿体基因组是典型的环状四分体结构,其与其他蔷薇科植物叶绿体基因组大小相近。挖掘了一批SSR、SNP和InDel标记,可为华中樱谱系地理学、群体遗传学和种间杂种鉴定等研究提供参考。 展开更多
关键词 华中樱 叶绿体基因组 SSR INDEL
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PAGE银染和条带回收方法的改进 被引量:9
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作者 陈亮明 张冬林 +3 位作者 李志辉 陈永华 肖晶晶 彭丽梅 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期163-165,共3页
为了提高聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)的银染效果和条带回收的效率,以广玉兰DNA为材料进行ISSR-PCR分析,比较了两种银染(常规银染法和快速银染法)和条带回收法(乙醇糖原法和改进的煮沸法).结果显示:两种银染方法效果一致,但常规银... 为了提高聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)的银染效果和条带回收的效率,以广玉兰DNA为材料进行ISSR-PCR分析,比较了两种银染(常规银染法和快速银染法)和条带回收法(乙醇糖原法和改进的煮沸法).结果显示:两种银染方法效果一致,但常规银染要用2-3 h,而快速银染仅用30 m in,是常规银染的1/6-1/4;改良的煮沸法回收条带比乙醇糖原法更简便、更快捷.因此,快速银染和改良的煮沸法条带回收法可以应用在以后的研究中. 展开更多
关键词 聚丙烯酰胺凝胶电泳 银染 回收 广玉兰
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两种方法对广玉兰ISSR-PCR反应体系的优化比较 被引量:8
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作者 陈亮明 相阳 +4 位作者 张冬林 李志辉 陈永华 马倩 彭婧 《种子》 CSCD 北大核心 2008年第6期10-14,共5页
采用单因子和正交设计2种方法,对影响广玉兰ISSR-PCR反应体系的5个因素(Taq酶、Mg2+、dNTP、引模板DNA)进行优化。结果表明:正交设计采用直观分析法获得影响因素最佳反应水平与单因子试验找出影响因素最佳反应水平有一定差异,通过综合... 采用单因子和正交设计2种方法,对影响广玉兰ISSR-PCR反应体系的5个因素(Taq酶、Mg2+、dNTP、引模板DNA)进行优化。结果表明:正交设计采用直观分析法获得影响因素最佳反应水平与单因子试验找出影响因素最佳反应水平有一定差异,通过综合比较分析,最终建立了广玉兰ISSR-PCR的最佳反应体系:在20μl的反应体系中,TaqDNA聚合酶1.0U、Mg2+1.2~1.5mmol/L、dNTP1.80mmol/L、引物0.5~0.6μmol/L、30ng模板DNA、10×PCRbuffer。同时,通过PCR比较,确定延伸时间为2min,循环次数为35个较为合适,确定了引物最佳退火温度,得到了广玉兰ISSR-PCR反应的最佳扩增程序。 展开更多
关键词 广玉兰 ISSR—PCR 单因子试验 正交设计
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广西天峨红水河龙滩库区植物生物多样性 被引量:7
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作者 陈亮明 文仕知 +1 位作者 李科林 肖育檀 《中南林学院学报》 CSCD 北大核心 2006年第3期55-58,81,共5页
在对广西天峨红水河龙滩库区植被调查研究的基础上,论述了该地区植物多样性.结果表明:该地区计有土著维管束植物182科、665属、1 230种,其中裸子植物4科、5属、9种,被子植物155科、603属、1 145种;地带性植被为含季雨林成分的季风常绿... 在对广西天峨红水河龙滩库区植被调查研究的基础上,论述了该地区植物多样性.结果表明:该地区计有土著维管束植物182科、665属、1 230种,其中裸子植物4科、5属、9种,被子植物155科、603属、1 145种;地带性植被为含季雨林成分的季风常绿阔叶林;库区植物区系具有丰富性、古老性、复杂性和过渡性等特点,且有相当多的中国特有分布的类群,其中有20个特有属、693个特有种(占该区种子植物总数的60.02%),珍稀保护植物13种集中于此,是中国植物生物多样性最关键的地区之一. 展开更多
关键词 植物学 红水河 龙滩库区 广西天峨 植物生物多样性
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城郊工业废弃地旅游开发SWOT分析及其景观规划 被引量:5
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作者 陈亮明 张毅川 +1 位作者 冯磊 乔丽芳 《水土保持研究》 CSCD 北大核心 2008年第6期215-217,221,共4页
城郊工业废弃地具有较高的旅游开发潜力,进行工业废弃地旅游开发是一种新型的治理方法,具有较为广阔的应用前景。采用SWOT分析法,以新乡市凤泉区一处工业废弃地为实证案例,全面分析城郊工业废弃地旅游开发的优势和劣势,面临的机遇和挑... 城郊工业废弃地具有较高的旅游开发潜力,进行工业废弃地旅游开发是一种新型的治理方法,具有较为广阔的应用前景。采用SWOT分析法,以新乡市凤泉区一处工业废弃地为实证案例,全面分析城郊工业废弃地旅游开发的优势和劣势,面临的机遇和挑战。根据SWOT矩阵(细分为SO矩阵、WO矩阵、ST矩阵、WT矩阵)确定了城郊工业废弃地旅游开发的基本策略。以SWOT分析结果为依据指导了凤泉区一处废弃地的旅游景观规划,将其改造为集经济生产、生态保护、文化教育、科学研究、避灾防灾为一体的旅游地。 展开更多
关键词 工业废弃地 旅游开发 SWOT分析 城郊
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高校园区绿地景观规划设计——以河南科技学院为例 被引量:7
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作者 陈亮明 张毅川 +1 位作者 乔丽芳 齐安国 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2005年第6期1016-1017,共2页
以河南科技学院的景观规划设计为例,探索了现代高校园区绿地景观规划设计的构思、原则及方法。
关键词 高校园区 绿地 景观设计
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基于虚拟仪器的电机测试平台设计 被引量:4
7
作者 陈亮明 于军 +1 位作者 章红 何圆球 《长江科学院院报》 CSCD 北大核心 2014年第1期72-76,共5页
基于虚拟仪器和LabVIEW软件开发平台,完成电机测试平台的软硬件设计。测试平台主要对电机的电压、三相电流、功率因数、温度、转速、扭矩等信号进行采集,然后经过融合处理,对电机的综合性能进行评价。硬件设计主要包括信号采集、信号调... 基于虚拟仪器和LabVIEW软件开发平台,完成电机测试平台的软硬件设计。测试平台主要对电机的电压、三相电流、功率因数、温度、转速、扭矩等信号进行采集,然后经过融合处理,对电机的综合性能进行评价。硬件设计主要包括信号采集、信号调理、信号处理等模块。其中信号调理电路主要包括电流转电压模块、电压放大模块、电流源模块和频压转换模块;信号处理主要利用NI-PCI6221数据采集和处理卡实现。软件设计主要是基于LabVIEW,利用信号选择控件、动态数据转换控件以及显示控件分别完成信号的采集与选择、信号的处理与显示,并利用PID控制算法完成电机转速和扭矩控制等。经过测试,测试平台可以达到预期的测试效果,研究工作是电机性能测试控制技术领域中的一次创新性尝试。 展开更多
关键词 虚拟仪器 LABVIEW 电机测试平台 PID控制
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湖南森林公园森林文化的量化研究 被引量:4
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作者 陈亮明 朱松 周围 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期102-105,共4页
通过建立通用的科学系统的森林公园森林文化评价体系和评价模型,计算出不同区域的森林文化水平,定义了量化评价指标;用改进的层次分析法(IAHP)计算出了各指标的权重系数,并按此确定了各项指标评价标准分值,建立了评价体系。采用计算出... 通过建立通用的科学系统的森林公园森林文化评价体系和评价模型,计算出不同区域的森林文化水平,定义了量化评价指标;用改进的层次分析法(IAHP)计算出了各指标的权重系数,并按此确定了各项指标评价标准分值,建立了评价体系。采用计算出的相关数据对湖南森林公园森林文化进行评价计分:湖南省得分为67.3分(满分100分),水平为III级(中等)水平。 展开更多
关键词 森林公园 森林文化 水平评价 层次分析法(IAHP) 湖南
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城市绿地防灾减灾功能探讨——以北京元大都遗址公园防灾绿地建设为例 被引量:21
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作者 陈亮明 章美玲 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2006年第3期452-453,共2页
防灾与减灾是城市绿地的重要功能之一,在整个城市的防灾与减灾中起着重要的作用。首先分析了城市绿地的各种防灾与减灾功能。并以北京元大都遗址公园防灾绿地建设为例说明了绿地防灾与减灾功能的具体应用。
关键词 绿地 防灾 减灾
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大学城景观环境设计的生态对策——以广州大学城为例 被引量:6
10
作者 陈亮明 朱凯 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2006年第7期1357-1359,1363,共4页
在对我国大学城建设中面临的景观环境问题进行分析的基础上,提出了大学城景观环境设计的生态对策,并对广州大学城景观环境设计与建设的生态对策进行了探讨。
关键词 大学城 景观环境设计 生态-环境敏感地 生态对策
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翅荚木引种栽培耐寒力的调查研究 被引量:19
11
作者 陈亮明 陈永密 张巧琴 《林业科技开发》 1997年第3期37-38,共2页
关键词 翅荚木 引种 栽培 耐寒性
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乙醛脱氢酶2基因G1510A多态位点等位基因的克隆及应用 被引量:1
12
作者 陈亮明 王瑢 +2 位作者 黄丽玲 杨泽民 何震宇 《广东药学院学报》 CAS 2014年第5期647-650,共4页
目的克隆乙醛脱氢酶2(ALDH2)基因G1510A多态位点(rs671位点)的野生型和突变型等位基因,为该位点的基因分型提供参照品。方法分别以经测序证实的rs671位点野生型纯合子和突变型纯合子样品为模板,PCR扩增跨越该位点的DNA片断,采用胶回收... 目的克隆乙醛脱氢酶2(ALDH2)基因G1510A多态位点(rs671位点)的野生型和突变型等位基因,为该位点的基因分型提供参照品。方法分别以经测序证实的rs671位点野生型纯合子和突变型纯合子样品为模板,PCR扩增跨越该位点的DNA片断,采用胶回收试剂盒纯化PCR产物,T-A克隆构建重组质粒,PCR和测序验证重组质粒是否构建成功,PCR-RFLP法检验其应用效果。结果 PCR和测序均证实目的基因被成功克隆,将重组质粒用于PCR-RFLP法基因分型之中,能正确区分样品的基因型。结论成功构建了rs671位点的野生型和突变型等位基因重组质粒,可用作该位点基因分型的参照品。 展开更多
关键词 乙醛脱氢酶2基因 多态性 基因分型 参照品
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广州大学城湿地公园营建技术探讨 被引量:5
13
作者 陈亮明 朱凯 《福建林业科技》 北大核心 2006年第3期261-264,共4页
运用现代园林设计学、景观生态学、生物学、地质学、气候学等理论与相关科学研究成果,对广州大学城中湿地公园的营建技术进行了探讨,并对其将来如何进行保护管理与合理利用进行了策划。
关键词 湿地公园 营建技术 管理利用 广州大学城
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武功山国家森林公园的自然生态化规划设计实践 被引量:6
14
作者 陈亮明 乔丽芳 张毅川 《江苏林业科技》 2004年第5期18-21,共4页
森林是重要的自然资源,在开发方式上应十分慎重。以自然生态化规划设计思想作为指导思想,进行了武功山国家森林公园的规划和设计,进行了森林公园可持续规划设计的探索。
关键词 国家森林公园 自然生态化 规划设计
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慢生活理念下乡村景观规划设计评价体系的构建及分析
15
作者 张诗琪 陈亮明 《绿色科技》 2024年第9期45-51,60,共8页
以长沙县鹿芝岭村为研究对象,运用层次分析法建立慢生活理念下乡村景观规划设计评价体系,探究慢生活理念下乡村景观规划设计中各项影响要素之间的关系。通过分析鹿芝岭村现状,从构建品质型乡村空间、生态环境、地域文化、特色经济产业... 以长沙县鹿芝岭村为研究对象,运用层次分析法建立慢生活理念下乡村景观规划设计评价体系,探究慢生活理念下乡村景观规划设计中各项影响要素之间的关系。通过分析鹿芝岭村现状,从构建品质型乡村空间、生态环境、地域文化、特色经济产业、民主性慢意识5个方面,选取景观营造程度、绿化覆盖率、生态自然环境风貌、人居环境等17个评价指标。结果表明:构建品质型乡村空间(0.3802)最为重要,其次为生态环境(0.1927)、地域文化(0.1885)以及特色经济产业(0.1667),民主性慢意识(0.0719)作为最后考虑的因素。研究结果可以为慢生活理念下同类型乡村景观规划设计提供科学依据与参考。 展开更多
关键词 慢生活理念 乡村景观规划设计 层次分析法 长沙县鹿芝岭村
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思蒙湿地公园生态旅游开发对策论 被引量:1
16
作者 陈亮明 蒋梦烟 欧阳心怡 《中南林业科技大学学报(社会科学版)》 2016年第4期59-64,共6页
正在建设中的湖南溆浦思蒙国家湿地公园有着让人赏心悦目的丹霞地貌,有着具有地方特色的风俗文化,是旅游的绝佳去处。思蒙湿地公园将建设成为集湿地保育、科普宣教、生态旅游等功能于一体的具有较高管理水平的国家湿地。虽然思蒙公园已... 正在建设中的湖南溆浦思蒙国家湿地公园有着让人赏心悦目的丹霞地貌,有着具有地方特色的风俗文化,是旅游的绝佳去处。思蒙湿地公园将建设成为集湿地保育、科普宣教、生态旅游等功能于一体的具有较高管理水平的国家湿地。虽然思蒙公园已经逐渐完成建设,但是在建设中仍然有许多不足之处。 展开更多
关键词 湿地公园 生态旅游 开发对策
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水稻品种直链淀粉含量、糊化温度和蛋白质含量的稳定性分析 被引量:51
17
作者 万向元 胡培松 +6 位作者 王海莲 孔令娜 毕京翠 陈亮明 张坚勇 翟虎渠 万建民 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期1-6,共6页
利用AMMI模型对18个水稻品种的直链淀粉含量(AC)、糊化温度(GT)和蛋白质含量(PC)进行两年三点的稳定性分析,并以AC、GT和PC的表型值及相应的稳定性参数(Di)为性状指标,对供试品种进行聚类分析和评价。结果表明,稻米AC、GT和PC在不同品... 利用AMMI模型对18个水稻品种的直链淀粉含量(AC)、糊化温度(GT)和蛋白质含量(PC)进行两年三点的稳定性分析,并以AC、GT和PC的表型值及相应的稳定性参数(Di)为性状指标,对供试品种进行聚类分析和评价。结果表明,稻米AC、GT和PC在不同品种和环境间的差异以及G×E互作效应都达到极显著水平(P<0.01);3项品质性状的稳定性随品种不同而变化较大(0.15≤Di≤2.68),AC、GT和PC稳定性都高的品种仅有W002;综合考虑AC、GT和PC等3项品质性状的表现、稳定性、产量水平等因素,W002、广陵香粳、早丰九号和南京16号等品种可作为育种亲本,以改良水稻品种食味品质及其稳定性。 展开更多
关键词 水稻品种 蛋白质含量 直链淀粉含量 品质性状 AMMI模型 供试品种 广陵香粳 糊化温度 稳定性 食味品质
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水稻种子低温萌发生理机制的初步研究 被引量:29
18
作者 江玲 侯名语 +4 位作者 刘世家 陈亮明 刘喜 翟虎渠 万建民 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期480-485,共6页
以粳稻品种 USSR5、Hatanishiki 和籼稻品种密阳 23、N22 为材料,研究了水稻品种间种子低温发芽力的差异,并进一步从内源植物激素含量、种子对激素的敏感性及淀粉酶等方面对耐低温发芽的机理进行探讨。结果表明,来自前苏联的 USSR5 和... 以粳稻品种 USSR5、Hatanishiki 和籼稻品种密阳 23、N22 为材料,研究了水稻品种间种子低温发芽力的差异,并进一步从内源植物激素含量、种子对激素的敏感性及淀粉酶等方面对耐低温发芽的机理进行探讨。结果表明,来自前苏联的 USSR5 和来自日本的 Hatanishiki 低温发芽力高,而籼稻品种 N22、密阳 23 低温发芽力弱,这可能与种子对赤霉素(gibberellin, GA)、脱落酸(abscisic acid, ABA)敏感性更强有关,且低温增加了这种敏感性;低温和外源激素处理可能主要通过影响淀粉酶酶带 3 的活性而起作用;在整个低温萌发过程中,USSR5 种子中内源激素 ABA 含量在相当长的时间内保持较高水平,其 GA1/ABA 值始终低于 N22,这也可能是其低温发芽率高的原因之一。 展开更多
关键词 低温发芽 水稻种子 ABA 籼稻品种 萌发过程 间种 生理机制 敏感性 含量 初步研究
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水稻种子休眠性QTL定位及其对干热处理的响应 被引量:28
19
作者 唐九友 江玲 +5 位作者 王春明 刘世家 陈亮明 翟虎渠 吉村醇 万建民 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第12期1791-1796,共6页
利用Kinmaze(粳稻)/DV85(籼稻)杂交组合衍生的重组自交F11家系 (Recombinant Inbred Lines, RILs)进行了种子休眠性QTL的检测和遗传效应分析。以抽穗后35 d的种子发芽率作为种子休眠性的表型值,分析亲本和81个家系的休眠性表现,利用Wind... 利用Kinmaze(粳稻)/DV85(籼稻)杂交组合衍生的重组自交F11家系 (Recombinant Inbred Lines, RILs)进行了种子休眠性QTL的检测和遗传效应分析。以抽穗后35 d的种子发芽率作为种子休眠性的表型值,分析亲本和81个家系的休眠性表现,利用Windows QTL Cartographer 1.13a软件共检测到4个种子休眠性QTL,分别位于第2、5、11染色体上,其中第2染色体存在2个QTL,各QTL的贡献率变幅8.37%~17.40%。进一步研究了这些休眠性基因位点对干热破除休眠处理的响应,结果表明,来自DV85增强休眠性的QTL位点qDOR-2-1和qDOR-5,以及来自Kinmaze增强休眠性的QTL位点qDOR-11,易被干热处理破除休眠,这3个QTL效应较强,可在种子休眠性状的遗传改良中加以利用;而位于第2染色体上标记XNpb227-XNpb132之间的QTL位点qDOR-2-2却不易被干热处理破除休眠,该位点增强休眠性的基因来自DV85。 展开更多
关键词 QTL定位 种子休眠性 位点 破除休眠 水稻种子 干热处理 抽穗 家系 染色体 基因
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水稻品种外观品质性状稳定性分析 被引量:44
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作者 张坚勇 肖应辉 +6 位作者 万向元 刘世家 王春明 陈亮明 孔令娜 翟虎渠 万建民 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期548-554,共7页
基于AMMI模型 ,研究了 18个水稻品种外观品质性状与环境的交互作用 ,并对参试品种的品质性状稳定性进行了分析。以 6个外观品质性状表型值及相应的品种稳定性参数为指标 ,进行系统聚类分析 ,据此对供试品种外观品质性状进行了评价。结... 基于AMMI模型 ,研究了 18个水稻品种外观品质性状与环境的交互作用 ,并对参试品种的品质性状稳定性进行了分析。以 6个外观品质性状表型值及相应的品种稳定性参数为指标 ,进行系统聚类分析 ,据此对供试品种外观品质性状进行了评价。结果表明 ,品种与环境互作效应在 1%水平显著 ,外观品质性状的稳定性随品种而变化较大 ;随水稻品种的稻米粒长、长宽比值变大 ,相应品质性状的稳定性下降 ;相反 ,垩白率、垩白度越小的水稻品种 ,相应性状的品种稳定性越高。汕优 6 3的 6个外观品质性状均居参试品种平均水平 ,但其品种稳定性极高 ;932 72、南京 16、W0 0 2、苏香粳 2号等水稻品种垩白率低 ,垩白面积小 ,稳定性高 ,可作为水稻外观品质改良的育种亲本。 展开更多
关键词 水稻 品种 外观品质性状 稳定性 AMMI模型
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