目的:基于网络药理学、分子对接技术,并结合GEO芯片研究中药复方补中清利汤治疗IgA肾病的作用机制。方法:从TCMSP中药数据库中搜索补中清利汤各药物活性成分及靶点。借助多个疾病数据库并结合GEO基因芯片,获取IgA肾病疾病靶点。通过R语...目的:基于网络药理学、分子对接技术,并结合GEO芯片研究中药复方补中清利汤治疗IgA肾病的作用机制。方法:从TCMSP中药数据库中搜索补中清利汤各药物活性成分及靶点。借助多个疾病数据库并结合GEO基因芯片,获取IgA肾病疾病靶点。通过R语言4.2.2获取药物和疾病共同靶点后利用String数据库构建蛋白互作网络。通过Cytoscape 3.9.1(Cyto NCA插件)及Discovery Studio 2019对核心靶点进行筛选及完成分子对接。最后利用R语言4.2.2进行GO注释和KEGG富集分析。结果:补中清利汤治疗IgA肾病共筛选出70个有效活性成分,107个潜在作用靶点(核心靶点基因:JUN、MAPK1、TP53、HSP90AA1、MAPK14和HIF1A),主要涉及通路有:Lipid and atherosclerosis(脂质与动脉粥样硬化)、Fluid shear stress and atherosclerosis(流体剪切应激和动脉粥样硬化)、AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications(糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路)等。结论:补中清利汤治疗IgA肾病是多通路、多靶点、多成分的多重干预过程,本研究为补中清利汤治疗IgA肾病提供了一定理论基础。展开更多
文摘目的:基于网络药理学、分子对接技术,并结合GEO芯片研究中药复方补中清利汤治疗IgA肾病的作用机制。方法:从TCMSP中药数据库中搜索补中清利汤各药物活性成分及靶点。借助多个疾病数据库并结合GEO基因芯片,获取IgA肾病疾病靶点。通过R语言4.2.2获取药物和疾病共同靶点后利用String数据库构建蛋白互作网络。通过Cytoscape 3.9.1(Cyto NCA插件)及Discovery Studio 2019对核心靶点进行筛选及完成分子对接。最后利用R语言4.2.2进行GO注释和KEGG富集分析。结果:补中清利汤治疗IgA肾病共筛选出70个有效活性成分,107个潜在作用靶点(核心靶点基因:JUN、MAPK1、TP53、HSP90AA1、MAPK14和HIF1A),主要涉及通路有:Lipid and atherosclerosis(脂质与动脉粥样硬化)、Fluid shear stress and atherosclerosis(流体剪切应激和动脉粥样硬化)、AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications(糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路)等。结论:补中清利汤治疗IgA肾病是多通路、多靶点、多成分的多重干预过程,本研究为补中清利汤治疗IgA肾病提供了一定理论基础。