基于Antares2的金黄色葡萄球菌生物发光示踪系统的构建

目的构建融合型荧光素酶标记的金黄色葡萄球菌示踪菌株,建立金葡菌示踪系统。方法采用同源重组技术将融合型荧光素酶Antares2编码基因敲入到金葡菌USA300基因组中,与金葡菌烯醇酶编码基因eno融合,构建稳定表达的示踪菌株。将示踪菌株与不同的底物混合,检测生物发光强度差异,筛选合适的菌株/底物示踪系统,并探究其在体外和体内的敏感性。结果通过构建基因敲入质粒pBT2-eno-antares2,转化金葡菌USA300菌株中进行基因敲入菌株筛选,经DNA测序和Western blot鉴定示踪菌株USA300/Eno-Antares2构建成功。细菌生长曲线和溶血实验表明所构建的示踪菌株与野生型USA300无明显差异。将示踪菌与DTZ、FUR和HFZ底物混合,肉眼均可观察到发光。不同浓度不同底物分析显示,USA300/Eno-Antares2/HFZ组成的系统发光性能最优,体外发光示踪的敏感性为50 CFU(菌落形成单位),小鼠体内示踪敏感性为100 CFU。结论金葡菌USA300/Eno-Antares2/HFZ示踪系统性能佳,可用于金葡菌感染、定植、播散等研究。

WalK(S221P)突变促进金黄色葡萄球菌荚膜产生的作用研究

目的探究WalK(S221P)突变促进金葡菌荚膜产生的作用及可能机制。方法采用转录组测序(RNA-seq)分析WalK(S221P)突变对金葡菌基因表达的影响,采用RT-qPCR检测荚膜合成基因的表达变化。利用荚膜染色和透射电镜观察确认WalK(S221P)突变促进金葡菌荚膜产生的作用,再用RT-qPCR筛选参与介导WalK(S221P)促进荚膜合成的调控分子,通过结合位点分析和凝胶迁移阻滞实验(EMSA)证实WalKR对目标分子的调控作用。结果RNA-seq分析显示WalK(S221P)突变对196个金葡菌基因的表达水平影响显著,其中16个荚膜合成操纵子基因在XN108中的表达均显著上调。RT-qPCR检测显示荚膜合成相关capA,capH和capK在含有WalK(S221P)突变的XN108及K-Newman菌株中分别较回复株XN108-R和野生型Newman菌株显著上调。荚膜染色和透射电镜观察显示XN108的荚膜合成相比于回复株XN108-R明显增多,增厚。RT-qPCR筛选提示WalK(S221P)促进金葡菌荚膜合成可能是通过上调MgrA表达水平实现的,结合位点检索分析及EMSA实验证实WalK激活的WalR具有直接结合mgrA基因调控区的功能。结论金葡菌WalK(S221P)突变具有促进金葡菌荚膜产生的作用,该作用的发挥可能通过上调MgrA的表达而实现。

一个承载分子的设计与肽抗生素hPAB-β的高效表达

目的 通过设计一个承载蛋白分子高效表达肽抗生素hPAB β ,为大量制备hPAB β奠定基础。 方法 根据肽抗生素的特性 ,确立 4条设计原则 ,并据此设计一 489bp的承载蛋白编码序列 ,用化学合成法获得该序列并将之克隆到pQE 3 2中构建成表达载体 ,进一步将肽抗生素hPAB β基因插入上述表达载体 ,肽抗生素基因位于承载蛋白编码序列 3’ 端 ,两者构成融合基因。将含融合基因的表达载体转化大肠杆菌JM10 9,筛选阳性重组子 ,并用阳性重组子表达融合蛋白。结果 设计的承载蛋白为 163个氨基酸 ,分子量 17668.80 ,等电点 5 .62 1。用承载分子与肽抗生素hPAB β构建的融合蛋白表达载体转化细菌后 ,筛选到 4个阳性重组子 ,均能高效表达肽抗生素融合蛋白 ,融合蛋白的产量占细菌总蛋白的 40 %～ 45 %。结论 设计的承载蛋白分子能够实现肽抗生素的高效表达。

肽抗生素hPAB-β的化学合成及其杀菌活性的初步证实

目的 化学合成、纯化并初步测定肽抗生素hPAB β的活性 ,为后续研究奠定基础。 方法 采用固相合成法合成肽抗生素hPAB β ,经RP HPLC纯化 ,用质谱进行分子量鉴定 ,谷胱甘肽氧化 还原法复性合成产物 ,进一步用阳离子交换柱纯化复性产物 ,收集主峰 ,药敏法初步测定合成肽的抗菌活性。结果 合成肽抗生素hPAB β的纯度为 86 5 2 % ,经质谱分析 ,合成肽的分子量测定值与理论值相符。用谷胱甘肽氧化 还原法复性合成肽取得了较好的效果。复性产物对大肠埃希菌、铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌具有杀灭作用。结论 化学合成的肽抗生素hPAB β具有良好的杀菌活性。

人源肽抗生素hPABβ突变体及其重组杆状病毒的构建

确定人工合成的人肽抗生素hPAB β的抗菌活性。利用已知肽抗生素hBD 2的晶体结构坐标进行hPAB β的同源模建 ;设计hPAB β突变体 ;用PCR法生成hPAB β突变体基因 ,分别构建转移载体和重组杆状病毒。结果表明 ,合成肽hPAB β在正确复性后具有较好的杀菌活性 ,将 4种突变体基因插入转移载体pFASTHTa ,筛选阳性重组子pFAST hPAB β并转化DH10Bac大肠杆菌 ,获得了重组杆状病毒 ,为筛选活性强而结构更为简单的hPAB

基因串联体的构建策略及其表达模式

为了获取足够的DNA片段或得到基因的表达产物,常需要构建基因串联体,将目的基因按头尾相连随机串联起来,克隆入克隆载体以制备需要的目的基因片段或克隆入表达载体进行高效表达。串联的策略包括定向串联法、PCR扩增串联法、化学拼接法、同尾酶法等,不同方法构建的串联体基因表达模式也有一定差异。

人源肽抗生素hBD-2表达质粒的构建及其在大肠杆菌中的表达

为了构建人源肽抗生素hBD 2的表达质粒并在大肠杆菌中表达 ,将化学合成的hBD 2全基因插入原核融合蛋白表达质粒 pinpointXa 3的多克隆位点构建成表达质粒 ,按常规方法转化大肠杆菌JM10 9,筛选阳性重组子并诱导融合蛋白的表达。结果经酶切鉴定获得 7个阳性克隆 ,序列分析表明其中 4个克隆的插入序列与hBD 2基因完全一致 ,另 3个克隆插入序列的 39位由C突变为T ,89位多了一个G。正确的阳性克隆子在大肠杆菌中产生了约 18kD的特异性诱导蛋白。hBD 2的成功表达为进一步研究hBD 2的抗菌活性、抗菌机理打下了一定的基础。

一对检测肺炎衣原体的新引物

为建立一种更敏感的肺炎衣原体PCR检测方法 ,根据肺炎衣原体种特异性 5 3kDa蛋白基因序列设计一对引物5 3A、5 3B ,用PCR进行肺炎衣原体的检测研究。结果该引物仅能扩增肺炎衣原体DNA ,而与沙眼衣原体 ,鹦鹉热衣原体不反应 ,且对呼吸道常见病原菌之DNA的扩增亦为阴性 ,它能扩增出少至 10fg的肺炎衣原体DNA ,比我们以前合成的一对肺炎衣原体 16srRNA基因检测引物Cpnl、Cpn2更敏感 ,分别用这两对引物检测 30例有呼吸道疾患病人的鼻咽拭子标本 ,PCR的阳性符合率为 86 7%。表明 5 3A、5 3B是一对有效、实用。

埃博拉病毒病之病原学

埃博拉病毒病(Ebola virus disease,EVD),以往称埃博拉出血热(Ebola haemorrhagic fever,EHF),是迄今发现的凶猛烈性传染病之一。自1976年发现于非洲的扎伊尔和苏丹后,至今已有8次较大规模的人群流行,均发生在非洲,平均病死率高达67.98%。EVD的病原体埃博拉病毒(Ebola virus,EBOV)是一种人兽共患病原体,虽然其自然储存宿主尚不完全清楚,但EBOV能造成非人灵长类动物(如黑猩猩、猴等)感染,并具有致死性。EBOV在分类上属于丝状病毒科(Filoviridae)的埃博拉病毒属(Ebolavirus),属内有5个种。各种间的毒力存在差异,以扎伊尔埃博拉病毒(Zaire-EBOV)致病性最强,也是引起2014年西非大规模流行的元凶。EBOV呈丝状,形态多样,以长丝分枝状为常见;病毒体由核心、核衣壳和包膜3部分构成,病毒基因组为单股负链RNA,可编码7种结构蛋白,在病毒复制、感染和致病中发挥重要作用。EBOV主要通过接触传播,目前对其致病机制尚不完全清楚。EBOV为生物危害度最高的4级病原体,与活病毒相关的检验和实验必须在生物安全4级(BSL-4)实验室中进行,其感染的临床诊断以检测血清中抗体、抗原和核酸为主,实时荧光定量反转录PCR检测阳性可作出诊断。EVD尚无特效治疗方法,疫苗尚在研制之中,临床上以辅助性支持疗法为主。

课堂知识,课后延伸——记本科生《医学微生物学》第二课堂活动

第一课堂知识的传授是目前高校培养人才的主要阵地,而第二课堂教学则是第一课堂的拓展和延伸,对于拓宽学生学习的深度和广度,提升学生的创新思维能力有重要作用。《医学微生物学》是一门形态学学科,也是一门重要的基础与临床的桥梁课。近年来,我教研室针对医学微生物学教学特点,精心组织并开展了以学生为中心的第二课堂教学活动。实践效果证明第二课堂教学以其内容上的新颖性和形式上的灵活性,激发了学生对医学微生物学的学习兴趣,使学生的课堂知识在课后得到有效延伸,有助于学生思维能力、实践能力和创新能力的培养,提高了学生的综合素质。

肺炎衣原体研究进展

肺炎衣原体研究进展第三军医大学微生物学教研室饶贤才综述俞树荣审校肺炎衣原体（Ｃｈｌａｍｙｄｉａｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）是新近命名的一种以引起人肺炎为主的病原体，临床表现多样，严重地危害人类的健康。本文对近年来肺炎衣原体的生物学特性，特别是分子生物学的研...

人β-型肽抗生素研究进展

肽抗生素是生物体免疫防御系统的一个重要组成部分 ,有的为组成型表达 ,有的则只因微生物等因素的侵染而产生。肽抗生素带正电荷、对热稳定、具有广谱的抗菌活性 ,在迫切需要解决细菌对传统抗生素产生耐药性问题的今天 ,肽抗生素的研究为人类寻找新型的抗菌药物开辟了一条全新的道路。

肺炎衣原体与动脉粥样硬化

肺炎衣原体是新认识的人类呼吸系统重要病原菌,可引起急、慢性感染,尤其是近年来发现其慢性感染与动脉粥样硬化有密切的关系。本文从血清流行病学、分子形态学、分子生物学等方面综述这种关系,并简要阐明肺炎衣原体慢性感染诱发动脉粥样硬化的可能机制。

重组人肽抗生素hPAB-β及其突变体的活性测定与筛选

目的 测定重组人肽抗生素 h PAB- β及其突变体的抗菌活性 ,筛选理想的活性分子。方法 应用平板法和 MIC测定法检测重组表达的 h PAB- β及突变体 h PAB- β38、h PAB- β34对 8株实验室保存菌株及 10株临床分离菌株的杀菌能力 ,并以化学合成的肽抗生素 h PAB- β作对照 ;根据各目的分子抗菌能力的强弱 ,筛选理想的目标分子 ,并分析突变体结构的变化对其功能的影响。结果 重组 h PAB- β及突变体 h PAB- β38与化学合成的天然分子抗菌活性相当 ,对革兰氏阳性菌的 MIC在 12 5～ 2 5 0 μg/ml之间 ,对革兰氏阴性菌的MIC在 31～ 12 5 μg/ml范围内 ;突变体 h PAB- β34活性下降 4倍左右 ;结构分析表明 h PAB- β38与 h PAB- β参与二级结构中 α螺旋和 β片层构成的氨基酸残基完全相同 ,而 h PAB- β34则有显著不同 ,α螺旋少了 2个残基 ,3个 β片层中除 β2与 h PAB- β相同外 ,β1和 β3的构成均多 2个残基 ,推测 h PAB- β34二级结构的改变是其活性降低的主要原因。结论 重组肽抗生素 h PAB- β具有抗菌活性 ,删除 3个端残基的突变体 h PAB- β38活性不变 ,可作为 h PAB- β走向临床应用的一个新侯选者。

人肽抗生素hPAB-β分子的同源模建及其突变体设计

目的 :获得肽抗生素hPAB β的分子结构 ,设计其突变体。 方法 :在序列比较的基础上 ,利用同源分子对hPAB β进行同源模建 ,并以此为基础设计其突变体 ,通过PCR引入突变法获得突变体基因序列 ,将其克隆到原核融合蛋白表达质粒 pQE CP4中 ,转化JM 10 9大肠杆菌进行表达。 结果 :模建结果表明 ,hPAB β由一个α螺旋和3个 β片层构成 ,二级结构保守 ,具有两亲性结构 ;其α螺旋推测与活性寡聚体形成有关 ;Asp4带负电 ,可能通过削弱寡聚体中央微孔口处阳电荷富集区而降低目的分子的生物学活性。利用PCR成功克隆了所设计的突变体基因 ,通过构建融合蛋白表达质粒 ,实现了突变体融合蛋白在大肠杆菌中的表达。 结论 :基于分子同源模建的肽抗生素hPAB β突变体的设计、克隆和成功表达 ,为筛选肽链更短。

用DNA探针检测肺炎衣原体

目的建立一种敏感而特异的肺炎衣原体分子生物学检测方法。方法用ＰＣＲ扩增约４６０ｂｐ的肺炎衣原体种特异性基因片段并标记成探针，建立ＤＮＡ探针杂交检测肺炎衣原体的方法。结果：探针只与肺炎衣原体ＡＲ－３９、ＶＲ１３１０株ＤＮＡ呈阳性杂交斑点，与肺炎衣原体ＡＲ－３９株全ＤＮＡＰｓｔＩ酶切片段在２．５ｋｂ处有一阳性杂交带，与其它两种衣原体、Ｑ热立克次体、嗜肺军团菌、大肠杆菌、绿脓杆菌、金黄色葡萄球菌ＤＮＡ斑点膜无阳性杂交信号。从１５２例有呼吸道疾患的住院病人鼻咽拭子和肺泡灌洗液中检出阳性１８例，阳性率１２％。结论本文建立的ＤＮＡ探针检测肺炎衣原体方法具有较高的敏感性和特异性，可用于批量临床标本的检测。