大柴胡汤治疗结石性胆囊炎的网络药理学研究及分子对接验证

目的:基于网络药理学和分子对接的方法探讨大柴胡汤治疗胆囊炎(Cholecystitis)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索相关文献获得大柴胡汤所含中药的主要化学成分,收集其相对应的靶点;胆囊炎疾病靶点来源于GeneCards、在线人类孟德尔遗传(OMIM)、PharmGkb数据库。结合Cytoscape 3.8.0构建药物-核心靶点-有效成分网络、靶标蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。利用Bioconductor中的R包对核心靶标进行基因本体(GO)富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果:获得大柴胡汤活性成分151个,药物靶点260个;疾病靶点485个;交集基因55个;PPI网络分析发现,核心蛋白涉及TNF-α、CCK、EGFR、AKT1、VEGFA;GO富集分析得到2307个GO条目。大柴胡汤包含细胞组分92个,生物过程2126个,分子功能89个,主要有受体配体活性、细胞因子活性、细胞因子受体结合、磷酸酶结合等;KEGG通路富集分析发现大柴胡汤主要涉及AGE-RAGE信号通路、白细胞介素-17信号通路以及HIF-1信号通路等。结论:通过网络药理学分析发现,大柴胡汤多成分、多靶点调控机体,通过多途径起到治疗结石性胆囊炎的作用。

基于网络药理学的如意金黄散治疗疖肿的机制研究

目的基于网络药理学的方法探讨如意金黄散治疗疖肿的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库(TCMSP)并检索先关文献来获得如意金黄散所含中药的主要化学成分,并收集其相对应的靶点;疖肿的疾病靶点来源于GeneCards、DrugBank、Home-OMIM-NCBI数据库。结合Cytoscape3.7.1构建药物-核心靶点-有效成分网络,靶蛋白相互作用(PPI)网络。利用Bioconductor中的R包对核心靶标进行基因本体(GO)功能富集和KEGG通路分析。结果根据筛选条件获得药物活性化学成分126个,药物靶点279个;获得疾病靶点165个;获得核心靶标20个;PPI蛋白作用网络分析,核心蛋白涉及表皮生长因子受体(EGFR)、白细胞介素(IL)-6、IL-1B等;GO功能富集分析发现主要参与了白细胞-细胞黏附、蛋白质定位建立的正调控、多细胞组织内稳态等生物学过程;KEGG通路主要涉及IL-17信号通路、AGE-RAGE信号通路、以及肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等。结论如意金黄散治疗疖肿是多靶点、多途径的,本次研究为进一步研究其作用机制提供依据。

大建中汤对术后肠梗阻大鼠胃肠功能的影响

目的观察大建中汤对术后肠梗阻大鼠胃肠功能及血清血管活性肽(VIP)、分泌型免疫球蛋白(sIgA)、白细胞介素-1β(IL-1β)的影响,探讨大建中汤的可能作用机制。方法将40只雄性SD大鼠随机为正常组、假手术组、术后肠梗阻组、大建中汤组,每组10只。术后肠梗阻组和大建中汤组大鼠通过Klaff小肠干扰术建立术后肠梗阻模型。造模成功后,大建中汤组分别在术后6 h、12 h、24 h灌胃0.486 g/mL大建中汤溶液,正常组、假手术组和术后肠梗阻组灌胃等量生理盐水。在处死前60 min,各组均灌胃2%蓝色葡聚糖2000,30 min后取小肠,肉眼观察肠道形态,测定小肠推进率,HE染色观察肠组织病理表现,ELISA法测定血清中VIP、sIgA、IL-1β水平。结果术后肠梗阻组大鼠肠管表面有少量渗血点,肠壁水肿,肠腔内有气液聚积,肠蠕动稍差,部分大鼠肠管明显粘连、扩张;小肠推进率明显低于正常组及假手术组(P均<0.05);HE染色显示肠黏膜损害明显,黏膜下充血水肿,绒毛萎缩变短、部分水肿变宽,间质可见炎性细胞浸润;血清VIP、IL-1β水平均明显高于正常组及假手术组(P均<0.05),血清sIgA水平明显低于正常组及假手术组(P均<0.05)。大建中汤组大鼠肠管充血水肿情况较术后肠梗阻组明显改善,无明显出血、溃疡,肠蠕动尚可;小肠推进率明显高于术后肠梗阻组(P<0.05);HE染色显示肠黏膜上皮排列较整齐,绒毛长短稍显不齐,间质轻度充血水肿,可见少量炎性细胞浸润;血清VIP、IL-1β水平均明显低于术后肠梗阻组(P均<0.05),血清sIgA水平明显高于术后肠梗阻组(P<0.05)。结论大建中汤能够有效改善术后肠梗阻大鼠的胃肠功能,机制可能与降低血清VIP水平促进胃肠运动,升高sIgA水平和下调IL-1β水平从而调控肠道炎症反应,保护肠黏膜屏障,维持肠道免疫功能有关。

大柴胡汤对结石性胆囊炎豚鼠胆囊动力的影响及其机制

目的观察大柴胡汤对结石性胆囊炎豚鼠血清炎症因子水平和胆囊动力的影响,探讨大柴胡汤治疗结石性胆囊炎的作用机制。方法将40只雌性豚鼠随机分为正常组、模型组、消炎利胆片组、大柴胡汤组,每组10只。模型组、消炎利胆片组、大柴胡汤组连续喂以高胆固醇致石饲料4周建立结石性胆囊炎模型。造模成功后,大柴胡汤组给予大柴胡汤颗粒剂灌胃,消炎利胆片组给予消炎利胆片灌胃,正常组和模型组给予等量生理盐水灌胃,均连续灌胃4周。灌胃结束后,腹主动脉取血测定血清肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素-1β(IL-1β)、胆囊收缩素(CCK)、小窝蛋白-3(Cav-3)水平,测量胆汁量,取胆囊检测胆囊肌条收缩活性。结果与正常组比较,模型组豚鼠血清TNF-α、IL-1β、Cav-3水平均明显升高(P均<0.05),血清CCK水平明显降低(P<0.05),胆汁量明显减少(P<0.05),胆囊收缩频率明显减慢(P<0.05),胆囊收缩振幅无明显变化(P>0.05)。与模型组比较,消炎利胆片组和大柴胡汤组豚鼠血清TNF-α、IL-1β、Cav-3水平均明显降低(P均<0.05),血清CCK水平均明显升高(P均<0.05),胆汁量均明显增加(P均<0.05),胆囊收缩频率均明显变快(P均<0.05),胆囊收缩振幅均无明显变化(P均>0.05)。与消炎利胆片组比较,大柴胡汤组豚鼠胆汁量更多,血清TNF-α、IL-1β、CCK水平更高,血清Cav-3水平更低,胆囊肌条收缩频率更快,差异均有统计学意义(P均<0.05)。结论大柴胡汤可以明显减轻结石性胆囊炎豚鼠的炎症反应,增加胆汁量,促进胆囊运动,其作用机制可能与下调血清TNF-α、IL-1β水平发挥抗炎作用,上调血清CCK水平并下调血清Cav-3水平发挥利胆作用相关。

柴胡消石自拟方对结石性胆囊炎豚鼠胆囊病理及脂多糖、微囊蛋白-3的影响

目的 观察柴胡消石自拟方对结石性胆囊炎豚鼠胆囊组织病理形态及血清脂多糖(LPS)、微囊蛋白-3(CAV-3)水平的影响。方法 将30只雌性豚鼠随机分为空白组、模型组、柴胡消石自拟方组,每组10只。模型组和柴胡消石自拟方组连续喂以高胆固醇致石饲料4周建立结石性胆囊炎模型。造模成功后,柴胡消石自拟方组给予柴胡消石自拟方颗粒剂灌胃,空白组和模型组给予等量生理盐水灌胃,均连续灌胃4周。灌胃结束后,肉眼及镜下观察各组豚鼠胆囊病理形态,腹主动脉取血测定血清LPS、CAV-3水平。结果 肉眼观察:空白组胆囊颜色红润,形态大小正常,血运良好,胆汁透亮,胆囊壁无增厚;模型组胆囊颜色较深,体积增大,血运不佳,出现明显的炎症,胆汁浑浊,胆囊壁增厚,胆囊内见灰色泥沙样颗粒;柴胡消石自拟方组胆囊颜色较模型组浅,胆汁清澈,胆囊壁厚度较模型组薄,炎症明显减轻,胆囊内少量灰色泥沙样颗粒沉淀。镜下观察:空白组胆囊黏膜上皮细胞呈单层柱状排列,黏膜皱壁完整,囊襞无充血、水肿及炎性细胞浸润;模型组胆囊部分腺上皮脱落或增生,黏膜间质水肿、充血、炎性细胞浸润;柴胡消石自拟方组上述病变较模型组轻。模型组豚鼠血清LPS、CAV-3水平均明显高于空白组(P均<0.05),柴胡消石自拟方组豚鼠血清LPS、CAV-3水平均明显低于模型组(P均<0.05)。结论 柴胡消石自拟方可逆转结石性胆囊炎的病理改变,机制可能与调控血清LPS和CAV-3水平减轻结石性胆囊炎豚鼠胆囊的炎症和改善胆囊动力有关。

麻子仁丸治疗术后肠梗阻的网络药理研究

目的:通过网络药理学预测麻子仁丸治疗术后肠梗阻(POI)作用靶点,探讨其多成分-多靶点-多通路的潜在作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)收集麻子仁丸中药化学成分,经口服生物利用度(OB)、类药性(DL)筛选得到药物的有效成分,并进行有效成分靶点预测;同时从GeneCards、OMIM、DisGeNet数据库检索POI相关靶点;取交集靶点后,使用Cytoscape 3.7.2软件构建成分-靶点互作网络;利用String数据库绘制靶点蛋白-靶点蛋白相互作用网络;并对核心靶点和核心成分分子对接;最后利用Metascape数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:本研究共收集到POI相关靶点405个,麻子仁丸活性成分140个,涉及治疗POI靶点75个;GO生物过程分析显示,涉及对无机物的反应、对有害物质的反应、药物细胞应答、细胞因子介导的信号传导途径、对脂多糖的反应、对氧化应激的反应、对细菌源分子的反应、激酶活性的正调控、转移酶活性的正调控等。KEGG分析结果显示,涉及PI3K-AKT信号通路、TNF通路、HIF-1通路、IL-17通路、ErbB通路等信号通路。结论:麻子仁丸可通过潜在的多途径、多靶点、多通路改善术后肠梗阻炎症反应、调节肠黏膜免疫及肠道微循环等。

基于TCGA数据库分析三阴性乳腺癌预后与铁死亡相关lncRNA的关系

目的基于美国癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库分析影响三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)预后的铁死亡相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),并建立TNBC预后预测模型。方法从TCGA下载TNBC样本的转录组数据及临床信息数据。用R语言limma包筛选乳腺癌差异表达基因,survival包筛选TNBC生存时间相关基因,并与搜集到的382个铁死亡基因取交集,获得与TNBC预后相关的铁死亡基因。采用Pearson法进行共表达分析以确定与铁死亡相关的lncRNA。采用Cox回归分析来确定生存相关的lncRNA和预后因素。LASSO回归分析构建TNBC预后回归模型,受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析该模型对预后的预测价值。结果单因素Cox回归分析显示,17个差异表达的lncRNA与TNBC患者生存时间相关(均P<0.05)。采用LASSO回归分析成功构建由6个铁死亡相关lncRNA(SGMS1-AS1、AC015908.2、LINC01014、AC083967.1、TTC39A-AS1和AL353708.3)构成的TNBC风险预测模型。计算每个样本的风险评分。Kaplan-Meier法分析显示,风险评分可以有效区分低风险患者和高风险患者(P<0.05)。该模型预测TNBC患者1、2和3年总生存率的ROC曲线下面积分别为0.808、0.840和0.807。结论基于TCGA数据库共筛选出17个铁死亡相关lncRNA与TNBC预后相关。基于SGMS1-AS1、AC015908.2、LINC01014、AC083967.1、TTC39A-AS1和AL353708.3这6个铁死亡相关lncRNA构建的模型可较好地预测TNBC患者预后,提示铁死亡相关lncRNA与患者预后具有一定的相关性。