中国微生物资源数据库(MRDC)

中国微生物资源数据库MRDC是以中国的微生物资源为数据源的大型综合数据库,包括目前已建成的微生物性状库、微生物产品市场信息库、微生物名称库、微生物名词库、国际交流用RKC代码库及一个微生物学数值分类软件包MINTS。

性状加权编码在放线菌数值分类上的应用

本文提出了一种新的微生物形态性状的加权编码方式。使用这种加权编码方式及平均链锁法对放线菌游动放线菌属(Actinoplanes)和小瓶菌属(Ampullariella)共116株进行了聚类分析。结果表明:通过性状加权处理可以使游动放线菌属和小瓶菌属得以区分。

中国微生物资源数据库的现状与未来

本文详细介绍了中国微生物资源数据库的发展历史、现状、所起的作用以及发展方向。并对近年来建立的“中国菌种目录数据库”、“细菌名称数据库”、“微生物性状库”、“中国经济真菌多媒体数据库”、“细菌鉴定数据库”的情况进行了详细介绍。

提高甲型副伤寒患者血培养阳性率的研究

目的确定甲型副伤寒（简称：甲副）患者血内细菌数及其变化规律，分析血细菌数、采血量、培养分离方法和血培养阳性率间的关系。方法采用定量全血培养技术检测300例临床诊断甲副病例血内细菌数；用标准血培养技术对3000例疑似甲副病例进行需氧和（或）厌氧血培养；用血清甲副病原菌（简称：甲副菌）鞭毛抗原检测的细菌半定量技术分析不同病程215例甲副患者血清甲副菌鞭毛抗原的检测情况。结果131例甲副患者血细菌数的中位数是0．5CFU／ml，全距是〈0．3～6CFU／ml；血细菌数范围为〈0．3、0．3～0．49、0．5～0．9、0．9～4．9和〉5的病例构成分别是22％、28％、33％、12％和5％；长病程甲副患者血清甲副菌鞭毛抗原阳性率比短病程者高（χ^2〉4．06。P〈0．050）；疑似甲副病例5ml和10ml静脉血甲副菌血培养阳性率分别为49．8％和72．8％（χ^2=70．9，P〈0．005）；病例标准需氧瓶和厌氧瓶配对培养总阳性率为51．3％，需、厌氧瓶的血培养结果存在相关关系（χ^2=14．5。P〈0．005），厌氧培养瓶比需氧培养瓶更适合培养血内甲副菌（χ^2=5．0，P〈0．025）。结论甲副病例血内细菌数、采血量、病程、血培养方式是决定血培养阳性率的重要因素，增加采血量和采血次数并用两个以上培养瓶作配对血培养可把甲副患者血培养阳性率提高到接近99％。

我国生物种质资源保护和共享利用的现状与发展思考

生物种质资源的保护和共享利用是提升生物种质资源对科技创新支撑作用的核心内容。文章首先基于生物种质资源多样性阐述生物种质资源在科研基础研究中的重要作用,然后通过对国内外生物种质资源的保存及共享利用情况进行对比分析,最后在科技创新对生物种质资源建设发展需求分析的基础上,提出加强我国生物种质资源保护和共享利用的思考与建议。

诺卡氏菌形放线菌的化学分类

通过对28株分别代表12个属的诺卡氏菌形放线菌及有关分类单位的胞壁组分、枝菌酸、甲基萘醌、磷酸类脂等化学特性的分析,结合数值分类,在相似值(S_(?m))80%水平上将这类菌分成了两个大的化学类群,在90%水平上再分成四个小的类群。除拟诺卡氏菌属是显著的化学异源类群外,其余均与传统分类的属一致,形成独立的化学分类单位。讨论了化学分类在诺卡氏菌形放线菌分类研究中的应用及对出现的化学异源类群的认识。

浅析遗传资源数字序列信息的发展现状与建议

“遗传资源”是一个国家的战略资源。作为一种特殊的非实物性质的信息资源,遗传资源数字序列信息渗透生命科学和环境科学等领域,为生物遗传资源的保护和利用提供支持。加强对遗传资源数字序列信息的研究具有重要的现实意义。本文介绍遗传资源数字序列信息提出的背景,阐述遗传资源数字序列信息发展现状,探讨遗传资源数字序列信息与公约及其议定书的关系,并对国内外遗传资源数字序列信息数据库建设情况进行研究,对遗传资源数字序列信息的发展提出建议。

生物信息数据库通用数据字典标准化研究

本文首先描述了生物信息学数据库的基本概念,详细分析了生物信息学数据库的产生背景、国内外现状、发展趋势和特点以及标准化的需求,阐述了生物信息数据库通用数据字典的一般内容、结构、功能和编制方法。并且通过对生物信息学的代表性数据库进行详细分析,提出了生物信息学数据库通用数据字典标准化研究的建议和方向。

IA:一种科学数据云分析服务管理引擎

【目的】随着科学大数据技术的发展,问题导向的数据端分析成为常态。科学数据处理以云计算的形式跑在数据端,并提供安全的用户访问方式、可选的算法资源库、高效的数据存取接口、便捷的用户交互工具、有效扩展的计算和存储资源,将有力提升科学家的数据分析探索效率。【方法】本文提出一种基于容器技术的科学数据端云分析服务管理引擎设计方案:资源节点以自动注册的方式进行横向扩展,资源节点可以是物理主机或虚拟主机;当在用资源达到阈值,管理节点通过接口启动资源节点的注册,同时资源入池;可选的算法资源库、高效的数据和计算访问接口均以容器镜像的方式进行版本控制,在构造资源池时选用。容器实例池的健康度在节点内部进行维护,根据用户的最长使用时间、静默时间等进行实例生命周期管理;内部资源池的容器实例有准备中、准备好、使用中、消亡中几种状态,并始终维护资源池的固定大小。用户认证访问时,根据用户的领域算法库的选择和资源池的使用率进行新用户资源的接入,并通过代理配置提供唯一的标识入口以供用户访问;用户以安全加密的网络访问方式访问交互编程组件或交互应用组件,即可使用数据端的数据资源和计算资源。每个交互组件均在独立的容器实例中,可以进行有效的资源隔离。【结果】基于以上科学数据端云分析服务管理引擎构建的交互分析云服务系统IA(Interactive Analysis Cloud Service System)V1.0,实现了科学数据端云分析资源的统一管理服务,可以通过服务门户直接面向终端科学家使用,也可以通过API接口以docker容器交付的方式给其它现有数据系统调用。已逐步构建生命健康、生态环境、气象水文等领域的科学数据端云分析服务,已应用于中国科学院战略先导专项A、中国科学院战略先导专项B、国家烟草专卖局重大专项等重大项目;已应用于国家微生物科学数据中心、国家空间科学数据中心等国家科学数据中心;已应用于地理空间数据云、DarwinTree分子数据与应用环境等领域公共平台。并提供面向R、TensorFlow、Data Science、All Spark等的常用工具服务,用户可以https的方式访问交互编程组件(iJupyter)或交互应用组件(iWorkflow),即可使用数据端的数据资源和计算资源。

低合金高强度钢的发展与对策

文章分析了我国低合金钢的发展，结合近年来济钢在品种钢开发生产方面的成绩与经验，指出济钢今后应加强配套设施建设，强化质量保证措施，把低合金钢科研成果尽快转化为生产力，加快济钢微合金化低合金高强度钢的开发．

物种和植被资源信息系统的建设及展望

着重阐述了生物物种和植被资源信息系统的基本组成和基础数据库 ,并简要介绍了生境评价系统的研究成果和植被资源 -气候环境的空间模拟结果。

提高用户满意率的服务器主动调度算法

在集群环境中,为了实现多台计算机协同工作,充分利用服务器的计算能力,需要选用恰当的负载均衡策略.目前常用的服务器调度策略只是从服务器角度出发,实现硬件负载的均衡,而忽略了服务质量.本文算法定义了用户满意率(即"用户期望的任务完成时间"与"任务实际完成时间"的比值)指标来评价服务质量.算法综合用户权值,任务所属类别历史平均计算时间,用户期望计算时间,任务添加时间等四个因子,计算任务权值,然后由服务器主动按照任务权值高低进行调度.试验结果表明,该算法能够有效提高用户的满意率,充分利用服务器的计算资源.