塔里木马鹿(Cervus elaphus yarkandensis)遗传结构及遗传多样性分析

目的:塔里木马鹿(Cervus elaphus yarkandensis)为马鹿的新疆特有亚种,自20世纪50年代以来,由于自然和人为因素影响,种群数量急剧下降,现已隔离成3个孤立的小种群,即沙雅种群、尉犁种群和且末种群。为了更好地保护这一濒危野生动物。方法:基于塔里木马鹿线粒体控制区部分序列对3个种群的控制区结构和遗传多样性进行了研究。结果:在34个序列比对中得到342bp的片段,含变异位点12个,占分析序列长度的3.51%,由此定义了6个单倍型。显示出3个种群总的核苷酸多样性较低(0.01351±0.00063),单倍型多样性较高(0.693±0.051);就单个种群而言,且末种群的遗传多样性最低,而沙雅种群最高。从Tajima’sD和FuandLi’sD值的估算结果来看,塔里木马鹿尉犁和沙雅种群相对于中性进化的歧异度并没有明显的偏离(P>0.1),且末种群则出现了明显的偏离(分别为P<0.05和P<0.02),这预示着3个塔里木马鹿种群间可能存在一定的平衡选择。分子变异分析表明,沙雅和尉犁种群间基因流Nm大于4,说明这2个塔里木马鹿种群间存在着非常丰富的基因流,且末种群分别与沙雅、尉犁种群间基因流Nm均小于1,而且且末种群分别与沙雅和尉犁种群产生了明显的遗传分化(Fst分别为0.409;0.718,P值均小于0.001),以及3个塔里木马鹿种群单倍型间的序列差异为0.012。结论:以上数据都显示了3个塔里木马鹿种群的单倍型间已经出现了明显分化。结合系统发生关系分析,应将沙雅种群和尉犁种群联合建立管理单元进行重点保护。

新疆草兔的种群遗传结构和亚种分化

新疆草兔(Lepus capensis)的群体遗传结构至今无系统的研究报道,亚种水平的分类也长期存在争议。该文测定了形态分类上的新疆草兔3个亚种共87个个体的线粒体DNA(mtDNA)控制区(control region,D-Loop)592bp的序列,经分析发现148个多态性位点,共定义了44个单倍型。新疆草兔的单倍型多样度(h,0.977±0.005)和核苷酸多样度(π,0.064±0.031)都较高,显示了较高的遗传多样性。分子变异分析(AMOVA)结果显示,4个地理群体间的显著分化可能是由地理隔离造成的。群体遗传结构分析显示,新疆草兔包含4个进化枝,并且每个进化枝都对应特定的分布区域,显示了明显的系统地理结构。该研究的结果支持形态分类上草兔西域亚种(L.c.lehmanni)的分类地位;但中亚亚种(L.c.centrasiaticus)被分为两个独立的进化枝,提示可能存在两个亚种;帕米尔亚种(L.c.pamirensis)与其他亚种间的遗传距离在13%以上,提示其可能已达到种的分化水平。

新疆褐家鼠种群生命表及其在干旱区的生存能力分析

从2000年至今,曾于野外捕捉的褐家鼠3 837只,其中雌鼠2 685只,雄鼠1 152只,经鉴定划分为幼年组(Ⅰ)、亚成年组(Ⅱ)、成年Ⅰ组(Ⅲ)、成年Ⅱ组Ⅳ、老年组(Ⅴ)等5个年龄组,其年龄结构探讨种群数量动态,结果表明,种群中Ⅱ龄的平均生命期望值最高1.0357,其次为Ⅲ龄0.9488。该种群中1龄个体占优势地位,种群属于增长性种群,种群内禀增长率rm为0.2789/年,年周限增长率λ为1.3217,世代时间T为2.623年,种群经一世代的净增殖率R0为2.0782。

中国马鹿(Cervus elaphus)新疆三个亚种的研究现状及展望

马鹿(Cervus elaphus)是国家二级保护动物,是重要的经济动物。我国马鹿资源丰富,分布在新疆的有塔里木亚种(C.e.yarkandensis)、阿勒泰亚种(C.e.sibiricus)和天山亚种(C.e.songaricus)三个。近年来随着当地人口数量的增加,使马鹿栖息地的破碎化程度不断加剧、面积不断缩减、环境质量不断下降,严重影响了该地区的马鹿生存条件、种群结构、营养状况乃至遗传组成等,使之在生理、行为和遗传等方面发生了一系列的适应特征。根据文献资料系统的总结有关新疆马鹿各个方面的研究,提出未来的各种研究问题,为了有效的保护和利用新疆马鹿资源提供科学依据。

动物毛发石蜡切片的制作

目的:探讨哺乳动物针毛横断面的快速简易的制作方法,从毛发横断面上观察毛发微观结构。方法:取新疆部分哺乳动物(马鹿塔里木亚种Cervus elaphus yarkandensis,藏羚羊Pantholops hodgsoni,野双峰驼Camelus bactrianus,狍子Capreolus capreolus)的毛发,先将其清洗然后经浸蜡、包埋、切片、染色、封片等一系列过程的研究,得发毛横断面。结果:各动物毛发微观结构差异显著:马鹿塔里木亚种,毛皮质极薄,毛髓质占大多数;藏羚羊,由若干多边行空囊组成,内部中空;野双峰驼,毛皮质与毛髓质所占比例相当;狍子,毛皮质约占2/3,毛髓质约占1/3。结论:为利用哺乳动物毛发进行种属鉴定奠定一定科学理论基础。

塔里木马鹿车尔臣河种群栖息地现状及影响因素分析

采用地理信息系统(GIS)分析方法对车尔臣河下游马鹿塔里木亚种(Cervus elaphus Yarkandensis)栖息地现状及影响因素进行了研究。结果表明,在车尔臣河下游马鹿塔里木亚种栖息地面积为1 758.485 km2,包括湿生芦苇、旱生芦苇、水体、盐碱地、柽柳密灌丛等5种类型。根据马鹿对栖息地的利用频率,把栖息地分为适宜区、次适宜区和不适宜区等三种类型,其中不适宜区面积占总面积的50.69%,次适宜区为36.64%。同时发现该地区影响马鹿栖息地的主要因素是人类活动,特别是近年来的芦苇开发利用严重破坏其生存空间导致栖息地的破碎化,从而使马鹿种群数量不断下降。

新疆塔吉克族人群线粒体DNA序列多态性研究

目的:研究中国新疆塔吉克族人群线粒体DNA D环区序列遗传多态性,并结合文史资料,对塔吉克族的起源及迁移进行了初步探讨。方法:应用PCR扩增产物直接测序法,对34名塔吉克族无关个体线粒体DNA D一环区高变区Ⅰ进行测序分析。结果:34个个体核苷酸序列与Anderson相应序列比较共发现有47处突变位点,构成22种单倍型塔吉克族线粒体DNA D环高变一区基因差异度为0.9822,偶合概率为0.0466。结论:研究表明新疆塔吉克族与高加索人种遗传关系较近。

新疆马鹿塔里木亚种的现状与保护

新疆马鹿塔里木亚种高度适应荒漠生境,自20世纪50年代以来,由于自然和人为因素的影响,种群数量急剧下降。栖息地退缩和片段化不仅导致种群遗传多样性的丧失,而且也因遗传漂变和近亲繁殖,不断地加剧了该亚种的濒危程度。为有效的保护该物种,特提出可行的保护措施建议。

陈旧家禽血液基因组DNA的快速提取

目的:建立一种从陈旧家禽血液中快速提取基因组DNA的方法。方法:以传统蛋白酶K法为基础进行优化。以陈旧鸡血为实验材料,新鲜抗凝鸡血为对照,经过生理盐水预处理、高浓度SDS裂解液和蛋白酶K消化、酚氯仿抽提后,对产物进行凝胶电泳检测、紫外分光光度检测和PCR扩增。结果:提取时间缩短为5～6h,所得基因组DNA纯度高、产量大,可用于后续分子生物学实验。结论:快速从陈旧家禽血液中提取DNA的方法被成功建立。

塔里木马鹿(Cervus elaphus yarkandensis)且末种群栖息地动态变化分析

本文采用地理信息系统(GIS)分析方法对1972—2001年车尔臣河中下流域马鹿(Cervus elaphusyarkandensis)栖息地变化进行了研究.结果表明:车尔臣河流域马鹿栖息地从1972—2001年呈现下降趋势,1972年的栖息地总面积为2 063.585 km2,其中适宜栖息地有869.894 km2,1990年的栖息地总面积为1 916.298km2,其中适宜栖息地有466.848 km2,2001年的栖息地总面积为1 758.485 km2,其中适宜栖息地有222.786km2.车尔臣河中下流域马鹿现正遭受栖息地质量退缩和适宜栖息地面积不断减少的双重影响.

农田及生态补偿区甲虫群落结构的差异

为了调查冬麦田和不同年龄生态补偿区甲虫群落结构和物种多样性,从2003年7到10月和2004年5到6月在瑞士农业区周围不同景观中进行了实地调查,并采用对应及典范对应分析方法,对冬麦田和1～4a不同年龄阶段的野花地中的甲虫群落结构及物种多样性进行了比较系统的研究.结果,共捕甲虫6009只,分别属于150种,25科,其中,麦田共计38种445个体,1～4a不同年龄的野花地中分别计46种,2760个体,81种,1325个体,73种,668个体,75种,811个体.根据食性,植食性种类有98种(65.33%),5189个体(86.35%)、肉食性种类有40种(26.67%),240个体(3.99%)、食菌性种类有10种(6.67%),578个体(9.62%)、食腐性种类有2种(1.33%),2个体(0.03%).冬麦田中栖息的甲虫种类及其物种丰富度和多度与1～4a不同年龄阶段的野花地有明显差异.这主要由于冬麦田中植物种类多样性低和植被结构简单而导致的.在不同演替阶段野花地中甲虫群落物种的丰富度一般在1～3a型野花地之间有差异.1年型野花地具有比较典型的甲虫群落结构,不同演替阶段的野花地对甲虫群落的定居,扩散及其演替过程中具有非常重要的作用.对甲虫提供丰富的食物资源和栖息,繁殖场所.因此,人为在农业区建立生态补偿区,有利于提高无脊椎动物和昆虫多样性,对物种保护方面具有重要意义.

普氏野马与两种新疆地方品种马的ELA-DRA*exon2的多态性分析

为了解普氏野马、哈萨克马与焉耆马的ELA-DRA*exon2的多态性以及等位基因频率分布。本研究采用PCR-SSCP技术对普氏野马、哈萨克马与焉耆马的ELA-DRA*exon2进行分型,并对不同等位基因进行核苷酸与氨基酸分析。结果显示:127匹马中共出现7种基因型,3种纯合子分别记为AA、BB、CC;4种杂合子分别记为AB、AC、BC、AD。AA基因型为哈萨克马与焉耆马的优势基因型,普氏野马以CC基因型为主。经χ2检验后,3种类型马的等位基因频率和基因型频率均处于Hardy-Weinberg平衡状态。PIC值与He值分析表明,3种类型马均属于中度多态,且普氏野马的PIC值与He值比哈萨克马与焉耆马低。

用粪便形态特征初步研究新疆塔里木马鹿种群年龄和性别(英文)

塔里木马鹿分布在干旱地区,是唯一的适应干旱荒漠环境的特殊马鹿亚种之一.目前,塔里木马鹿种群面临着栖息地退缩和片段化的双重影响,这不仅导致了种群数量的锐减,而且也因物种遗传漂变和近亲繁殖的不断增加,进一步加剧其濒危程度.为了有效地保护该物种,全面了解种群结构是至关重要.对塔里木马鹿粪便的长度、宽度、长度/宽度比例和体积等参数进行了测量,并采用判别分析方法划分种群年龄.结果表明,塔里木马鹿粪便形态在不同性别之间有差异,一般雌性的粪便大于雄性(P<0.05).同时根据粪便形态对种群年龄划分为成年雄性、成年雌性和幼体等3个年龄组.

中国新疆马鹿亚种头骨形态的地理变化(英文)

新疆马鹿(Cervus elaphus)有3个亚种(塔里木亚种C. e . yarkandensis、天山亚种C. e . songaricus和阿勒泰亚种C. e . sibiricus)。本文报道新疆马鹿3个亚种头骨形态学特征描述和14项形态学指标测定。被测定的指标主要有颅全长(GLC)、颜面长(FL)、鼻骨全长(GLN)、前头长( MFL)、眼窝长(OFW)、基底全长(CBL)、口盖最大幅(GPB)、前臼齿间距离(Pm-P)、眼间最小幅(ZB)、筋突起高(CH)、关筋突起高(LH)、牙齿间隙裂高(DH)、前下颚骨高(HMP2)、后下颚骨高(HMM3) ,采用主成分分析并在这3个亚种之间进行了比较。结果表明: 1)阿勒泰亚种的头骨长度和高度值比塔里木亚种大,宽度值比塔里木亚种小; 2)天山亚种的头骨大小一般处在塔里木亚种和阿勒泰亚种的中间,但三者之间没有显著性差异; 3)阿勒泰亚种和天山亚种的头骨形态测量数据比较接近,塔里木亚种的头骨形态比较特殊(塔里木亚种的头骨短而宽,明显区别于其他两亚种的特征)。在新疆导致马鹿3个亚种头骨形态差异的主要因素有栖息地环境和气候因素的差异。阿勒泰亚种和天山亚种栖息在大陆性气候寒冷区的针叶林中,冬天气候比较寒冷;塔里木亚种栖息在大陆性气候温热区的塔里木河流域胡杨林中,气候干旱炎热。因此,阿勒泰和天山亚种在适应寒冷的气候并适应生软食物的食性过程中头骨变成长细,而塔里木亚种长期适应干旱炎热并适应生硬食物的食性使头骨变的短而宽。

三种方法对天山马鹿喀拉乌成山种群数量的比较

为了获得天山马鹿Cervuselaphus songaricus喀拉乌成山种群数量,并评估不同种群数量统计方法之间的差异。2010～2012年利用样线法、粪堆计数法以及非损伤性标记重捕法对喀拉乌成山的天山马鹿种群数量进行研究,发现样线法估计的种群数量最低,仅为1.316～1.656头/km2;而非损伤性标记重捕法获得的种群数量最高,为2.075～3.11头/km2;粪堆计数法获得的数据居中,为1.422～2.844头/km2,说明不同的方法之间很难具有可比性。

新疆维、哈、蒙古族5-HTT基因启动子区多态性的研究

采用聚合酶链反应(PCR)技术,对我国新疆维吾尔族、哈萨克族和蒙古族三个正常群体5-HTT基因启动子区(5-HTTLPR)的一个插入/缺失多态性进行了研究。结果显示:5-HTTLPR等位基因及基因型频率分布在三个民族中没有较大差异,短片段等位基因S有较高的分布频率。X2检验证明,三个民族群体的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。经分析,维吾尔族的观测杂合度(Hobs)、期望杂合度(Hexp)、多态信息量(PIC)分别为0.4167、0.4845和0.3759;哈萨克族的Hobs、Hexp和PIC分别为0.4141、0.4338和0.3396;蒙古族的Hobs、Hexp和PIC分别为0.4639、0.4386和0.3425。结果可为人类学、法医学鉴定及疾病的关联研究提供遗传学数据。

塔里木河中游塔里木马鹿种群数量及其栖息地现状的初步分析

为了查明塔里木河中游野生塔里木马鹿种群数量及栖息地资源,2006年10月1-15日,采用截线抽样法和地理信息系统相结合,对塔里木马鹿种群及其栖息地进行了研究。结果表明,现有野生种群数量大约在21-71头,集中分布在离人类干扰比较远的依明且克和托胡拉克阔坦一带。同时采用地理信息系统分析方法对研究地区的LANDSAT TM遥感影像进行了监督分类处理,把研究区影像土地覆被分成了农田、水体、高密度林地、中密度林地、低密度林地、草地、沙漠、盐碱地、荒漠等9类型。其中塔里木马鹿主要分布在中,高覆盖度胡杨林、红柳灌丛和胡杨红柳混交林带中。同时根据在不同类型栖息地中马鹿粪便、卧迹、足迹的出现频率并结合地理信息系统分析结果,把研究地区生境划分为4种适宜栖息地等级。其中不适宜区占62.6%;较差区占3.76%;适宜区占3.38%;非常适宜区占30.23%。

塔里木河中游塔里木马鹿对生境选择的初步分析

开展塔里木马鹿生境选择的研究,对分析塔里木马鹿生境丧失的原因和该物种的保护具有重要的意义。2006年7月和12月在塔里木河中游塔里木胡杨林自然保护区对塔里木马鹿夏季和冬季生境的选择进行了研究。选择5类生态因子,并设置180个10×10(m)样方。选择指数的结果表明,塔里木马鹿喜欢胡杨和芦苇、植物覆盖度较大、水源距离较近和认为干扰距离>1000 m的环境。其中夏季多选择芦苇灌丛和胡杨林,冬季选择胡杨林,芦苇和柽柳灌丛。对生境特征的主成分分析显示,前3个主成分的累计贡献率夏季达到61.683%,冬季达到60.039%,可以反映塔里木马鹿的生境特征,同时表明,影响塔里木马鹿生境选择的主要因素依次为人为干扰、植被类型和距水源距离。

保护新疆马鹿塔里木亚种的建议

马鹿塔里木亚种分布于新疆塔里木盆地各沿河地带,强度适应荒漠生境。采用分子系统学方法研究表明,世界马鹿分为东西两大系统,马鹿塔里木亚种是我国唯一属于西部系统的亚种。在中国濒危动物红皮书中被列为濒危(E)亚种,按国际自然与自然资源保护联盟(IUCN)1993年制定的世界物种红色名录濒危定级标准,属于极危级(EN)。自20世纪50年代以来,由于自然和人为因素的影响,种群数量急骤下降,现今马鹿塔里木亚种在塔河流域被隔离为莎雅、尉犁和且末3个小种群,当前该亚种正受到栖息地减小和片断化的双重影响,而且因遗传漂变和近亲繁殖的不断增加也进一步加剧它的濒危程度。为有效保护该物种特提出可行的保护建议。

马鹿线粒体DNA研究新进展

线粒体DNA作为理想的分子遗传标记被广泛应用于马鹿进化生物学、种群遗传学和保护生物学的研究。该文阐述了mtDNA在马鹿中的研究进展,重点介绍马鹿mtDNA序列的研究概况及其多态性在马鹿物种识别、起源和进化、地理分化、遗传多样性和保护管理等方面的应用情况。