【目的】“三系”法是选育杂交大豆的主要途径,但恢复系中仅有少数大豆恢复基因被克隆,为挖掘更多新恢复基因,从而促进多基因聚合的强恢复系选育,提高杂种F1的育性稳定性。【方法】以大豆细胞质雄性不育系JLCMS5A和其恢复系JLR2为材料,...【目的】“三系”法是选育杂交大豆的主要途径,但恢复系中仅有少数大豆恢复基因被克隆,为挖掘更多新恢复基因,从而促进多基因聚合的强恢复系选育,提高杂种F1的育性稳定性。【方法】以大豆细胞质雄性不育系JLCMS5A和其恢复系JLR2为材料,采用转录组测序技术分析JLCMS5A和JLR2花蕾不同时期的转录水平变化,挖掘调控育性恢复和花蕾发育进程的相关基因和通路。进一步对具有恢复基因特征编码PPR(pentatricopeptide repeat)蛋白的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)进行基因注释、序列差异分析、RT-qPCR验证、系统进化分析及蛋白结构预测,挖掘育性恢复相关基因。【结果】转录组测序鉴定到17181个DEGs,其中有3856个DEGs与发育时期相关,2808个DEGs与育性相关。GO(geneontology)功能注释表明,与育性相关的DEGs主要富集在ADP结合、核酸结合转录因子活性和蛋白激酶活性等功能类别,与发育时期相关的DEGs主要富集在蛋白质异源二聚化活性、DNA复制和DNA结合等功能类别。KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)富集分析表明,育性相关DEGs主要参与内质网蛋白质加工、葡萄糖苷酸生物合成和植物激素信号转导等与蛋白质、糖类和信号转导密切相关的代谢通路,发育时期相关DEGs主要参与DNA复制、错配修复、淀粉和蔗糖代谢等与细胞分裂和能量物质降解密切相关的代谢通路。育性恢复候选基因分析发现,JLR2中的Glyma.09G176400可能在调控大豆细胞质雄性不育育性恢复过程中起到一定作用。【结论】共鉴定到3856个与发育时期相关的DEGs,2808个与育性相关的DEGs;鉴定出具有恢复基因特征编码PPR蛋白的DEGs15个;挖掘了1个育性恢复相关基因Glyma.09G176400。展开更多
产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens)是一种致病性细菌,也是一种重要的人畜共患病病原菌,能够引起动物坏死性肠炎、动物和人类食物中毒和牛的“猝死症”(Cattle Sudden Death Syndrome,CSDS)。2023年3-12月,黑龙江省某万头奶牛场母...产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens)是一种致病性细菌,也是一种重要的人畜共患病病原菌,能够引起动物坏死性肠炎、动物和人类食物中毒和牛的“猝死症”(Cattle Sudden Death Syndrome,CSDS)。2023年3-12月,黑龙江省某万头奶牛场母牛发生CSDS,为了明确其病原特征和耐药情况,本研究进行了产气荚膜梭菌分离鉴定,测定了其毒素基因以及抗菌药物敏感性。经鉴定后,从样本中分离出了14株产气荚膜梭菌,其中,有6株属于A型菌株,8株属于C型菌株。通过对这些菌株进行cpa、cpb、etx、iap、cpe、netB基因的检测,结果显示所有菌株的cpa毒素基因呈阳性,占比为100%,而cpb毒素基因的阳性占比为51.14%。药敏试验结果显示,这些产气荚膜梭菌菌株表现出较高的耐药性,其中87.5%的菌株对至少5类常用抗生素具有耐药性。特别是对磺胺甲唑、四环素和新霉素的耐药率均为100%。这些结果表明,产气荚膜梭菌在黑龙江地区某奶牛场A型和C型均流行,以C型为主,这些产气荚膜梭菌在抗生素治疗方面具有较高的耐药性,且都具有广谱耐药的特点。展开更多
文摘【目的】“三系”法是选育杂交大豆的主要途径,但恢复系中仅有少数大豆恢复基因被克隆,为挖掘更多新恢复基因,从而促进多基因聚合的强恢复系选育,提高杂种F1的育性稳定性。【方法】以大豆细胞质雄性不育系JLCMS5A和其恢复系JLR2为材料,采用转录组测序技术分析JLCMS5A和JLR2花蕾不同时期的转录水平变化,挖掘调控育性恢复和花蕾发育进程的相关基因和通路。进一步对具有恢复基因特征编码PPR(pentatricopeptide repeat)蛋白的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)进行基因注释、序列差异分析、RT-qPCR验证、系统进化分析及蛋白结构预测,挖掘育性恢复相关基因。【结果】转录组测序鉴定到17181个DEGs,其中有3856个DEGs与发育时期相关,2808个DEGs与育性相关。GO(geneontology)功能注释表明,与育性相关的DEGs主要富集在ADP结合、核酸结合转录因子活性和蛋白激酶活性等功能类别,与发育时期相关的DEGs主要富集在蛋白质异源二聚化活性、DNA复制和DNA结合等功能类别。KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)富集分析表明,育性相关DEGs主要参与内质网蛋白质加工、葡萄糖苷酸生物合成和植物激素信号转导等与蛋白质、糖类和信号转导密切相关的代谢通路,发育时期相关DEGs主要参与DNA复制、错配修复、淀粉和蔗糖代谢等与细胞分裂和能量物质降解密切相关的代谢通路。育性恢复候选基因分析发现,JLR2中的Glyma.09G176400可能在调控大豆细胞质雄性不育育性恢复过程中起到一定作用。【结论】共鉴定到3856个与发育时期相关的DEGs,2808个与育性相关的DEGs;鉴定出具有恢复基因特征编码PPR蛋白的DEGs15个;挖掘了1个育性恢复相关基因Glyma.09G176400。
文摘产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens)是一种致病性细菌,也是一种重要的人畜共患病病原菌,能够引起动物坏死性肠炎、动物和人类食物中毒和牛的“猝死症”(Cattle Sudden Death Syndrome,CSDS)。2023年3-12月,黑龙江省某万头奶牛场母牛发生CSDS,为了明确其病原特征和耐药情况,本研究进行了产气荚膜梭菌分离鉴定,测定了其毒素基因以及抗菌药物敏感性。经鉴定后,从样本中分离出了14株产气荚膜梭菌,其中,有6株属于A型菌株,8株属于C型菌株。通过对这些菌株进行cpa、cpb、etx、iap、cpe、netB基因的检测,结果显示所有菌株的cpa毒素基因呈阳性,占比为100%,而cpb毒素基因的阳性占比为51.14%。药敏试验结果显示,这些产气荚膜梭菌菌株表现出较高的耐药性,其中87.5%的菌株对至少5类常用抗生素具有耐药性。特别是对磺胺甲唑、四环素和新霉素的耐药率均为100%。这些结果表明,产气荚膜梭菌在黑龙江地区某奶牛场A型和C型均流行,以C型为主,这些产气荚膜梭菌在抗生素治疗方面具有较高的耐药性,且都具有广谱耐药的特点。
