目的探讨基于免疫细胞浸润的免疫评分模型对前列腺癌(PCa)患者免疫治疗效果及预后的预测。方法从癌症基因组图谱(TCGA)选取266个PCa患者的基因表达谱和临床随访参数;通过单样本基因集富集分析(single-sample gene set enrichment analys...目的探讨基于免疫细胞浸润的免疫评分模型对前列腺癌(PCa)患者免疫治疗效果及预后的预测。方法从癌症基因组图谱(TCGA)选取266个PCa患者的基因表达谱和临床随访参数;通过单样本基因集富集分析(single-sample gene set enrichment analysis,ssGSEA)量化免疫细胞在肿瘤组织中的浸润情况,得到22个免疫细胞的浸润情况;通过“Glmnet”包的套索方法(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)分析筛选关键预测因子,以验证不同浸润免疫细胞是否与预后相关;将符合条件的细胞构建预后风险评分模型,将PCa患者分为高风险组和低风险组,并制作生存曲线(Kaplan-Meier)进行验证;基于风险模型建立列线图来预测PCa患者治疗无效和生存的概率;绘制随时间变化的受试者工作特征(ROC)曲线,以验证列线图的准确性;利用校准曲线比较基于浸润免疫细胞列线图的预测和观察结果;采用临床决策曲线分析法判断模型的预测可靠度。结果使用ssGSEA量化免疫细胞浸润数据,最后得到22个浸润免疫细胞包括:幼稚B细胞、记忆B细胞、浆细胞、CD8+T细胞、幼稚CD4+T细胞、静息记忆CD4+T细胞、激活记忆CD4+T细胞、滤泡辅助性T细胞、调节性T细胞(Treg细胞)、γδT细胞、静息NK细胞、活化NK细胞、单核细胞、M0巨噬细胞、M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、静息树突细胞、活化树突细胞、静息肥大细胞、活化的肥大细胞、嗜酸性粒细胞和嗜中性粒细胞;最终选择6个免疫细胞作为预测因子,分别为Treg细胞、M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、激活记忆CD4+T细胞、静息树突细胞和嗜中性粒细胞;根据6个浸润免疫细胞,计算样本的风险评分,随着风险评分的升高,高风险组PCa患者增多,预后不良人数增多;利用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,结果显示高风险患者总生存时间(3.8年)显著低于低风险组(6.9年)(Log-Rankχ^(2)=4.259,P<0.001);预后列线图模型总分430分,对应死亡风险为74.69%;治疗效果列线图模型总分423分,对应治疗无效的风险为73.21%,且通过模型验证结果安全可靠。结论通过评估PCa中的免疫浸润以及免疫评分模型建立了列线图,揭示免疫细胞浸润可以预测PCa患者的预后和治疗效果。展开更多
文摘目的探讨基于免疫细胞浸润的免疫评分模型对前列腺癌(PCa)患者免疫治疗效果及预后的预测。方法从癌症基因组图谱(TCGA)选取266个PCa患者的基因表达谱和临床随访参数;通过单样本基因集富集分析(single-sample gene set enrichment analysis,ssGSEA)量化免疫细胞在肿瘤组织中的浸润情况,得到22个免疫细胞的浸润情况;通过“Glmnet”包的套索方法(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)分析筛选关键预测因子,以验证不同浸润免疫细胞是否与预后相关;将符合条件的细胞构建预后风险评分模型,将PCa患者分为高风险组和低风险组,并制作生存曲线(Kaplan-Meier)进行验证;基于风险模型建立列线图来预测PCa患者治疗无效和生存的概率;绘制随时间变化的受试者工作特征(ROC)曲线,以验证列线图的准确性;利用校准曲线比较基于浸润免疫细胞列线图的预测和观察结果;采用临床决策曲线分析法判断模型的预测可靠度。结果使用ssGSEA量化免疫细胞浸润数据,最后得到22个浸润免疫细胞包括:幼稚B细胞、记忆B细胞、浆细胞、CD8+T细胞、幼稚CD4+T细胞、静息记忆CD4+T细胞、激活记忆CD4+T细胞、滤泡辅助性T细胞、调节性T细胞(Treg细胞)、γδT细胞、静息NK细胞、活化NK细胞、单核细胞、M0巨噬细胞、M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、静息树突细胞、活化树突细胞、静息肥大细胞、活化的肥大细胞、嗜酸性粒细胞和嗜中性粒细胞;最终选择6个免疫细胞作为预测因子,分别为Treg细胞、M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、激活记忆CD4+T细胞、静息树突细胞和嗜中性粒细胞;根据6个浸润免疫细胞,计算样本的风险评分,随着风险评分的升高,高风险组PCa患者增多,预后不良人数增多;利用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,结果显示高风险患者总生存时间(3.8年)显著低于低风险组(6.9年)(Log-Rankχ^(2)=4.259,P<0.001);预后列线图模型总分430分,对应死亡风险为74.69%;治疗效果列线图模型总分423分,对应治疗无效的风险为73.21%,且通过模型验证结果安全可靠。结论通过评估PCa中的免疫浸润以及免疫评分模型建立了列线图,揭示免疫细胞浸润可以预测PCa患者的预后和治疗效果。
