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DNA存储场景下的大小喷泉码模型设计
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作者 崔竞松 蒋昌跃 郭迟 《计算机工程与科学》 CSCD 北大核心 2024年第1期72-82,共11页
在DNA存储等应用场景中,传统喷泉码算法需要占用额外信道资源将源文件分组数目K传递给解码端。在实际应用中,虽然可以将K嵌入在每一个编码数据分组中进行传递,但这种做法会严重浪费信道的带宽。针对上述问题,提出了一种大小喷泉码模型,... 在DNA存储等应用场景中,传统喷泉码算法需要占用额外信道资源将源文件分组数目K传递给解码端。在实际应用中,虽然可以将K嵌入在每一个编码数据分组中进行传递,但这种做法会严重浪费信道的带宽。针对上述问题,提出了一种大小喷泉码模型,通过增加小喷泉码这一带外信道来优化关键参数的传递。小喷泉码将每个编码分组中有关参数K所占用空间的粒度降至1 bit,有效减少了带宽资源的消耗。此外,小喷泉码还能适应由于DNA存储介质不均匀所导致的编码序列不定长的限制条件,一定条件下甚至可以完全不占用额外信道带宽。 展开更多
关键词 DNA存储 喷泉码 LT码 规避序列
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表儿茶素对大鼠脑缺血再灌注损伤的保护作用及抗氧化能力的影响 被引量:6
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作者 黄凡 胡婉湘 +2 位作者 蒋嫦月 李德丽 谢露 《天津医药》 CAS 北大核心 2021年第9期933-937,共5页
目的研究表儿茶素(EC)对大鼠脑缺血再灌注后的保护作用及抗氧化能力的影响。方法取90只雄性清洁级SD大鼠,按随机数字表法分为6组,每组15只,分别为假手术组(Sham组)、CIRI模型组(I/R组)、EC 5 mg/kg组、EC 10 mg/kg组、EC 20 mg/kg组、... 目的研究表儿茶素(EC)对大鼠脑缺血再灌注后的保护作用及抗氧化能力的影响。方法取90只雄性清洁级SD大鼠,按随机数字表法分为6组,每组15只,分别为假手术组(Sham组)、CIRI模型组(I/R组)、EC 5 mg/kg组、EC 10 mg/kg组、EC 20 mg/kg组、依达拉奉(ED)3 mg/kg组。除Sham组外,其余组采用线栓法构建大脑中动脉栓塞(MCAO)模型,缺血2 h,于再灌注后0、12、24 h给药,12、24 h进行Longa法神经功能损伤评分,36 h取脑行氯化三苯基四氮唑(TTC)染色检测缺血侧脑组织梗死面积,HE染色观察缺血侧脑组织形态学变化,比色法检测血清和缺血侧脑组织中的丙二醛(MDA)含量、超氧化物歧化酶(SOD)活力以及脑组织中谷胱甘肽过氧化物酶(GPx)的活力。结果与Sham组比较,I/R组神经功能损伤评分升高,梗死面积百分比增大(P<0.05),组织形态明显改变,血清和脑组织中MDA含量增多、SOD活力降低(P<0.05),脑组织中GPx活力降低(P<0.05)。与I/R组比较,EC 10 mg/kg、EC 20 mg/kg、ED 3 mg/kg组神经功能损伤评分降低,梗死面积百分比减少(P<0.05),组织损伤有所改善,血清和缺血侧脑组织中MDA含量减少、SOD活力升高,EC 10 mg/kg、EC 20 mg/kg、ED 3 mg/kg组脑组织中GPx活力升高(P<0.05)。结论EC能提高脑抗氧化能力,对抗大鼠脑缺血再灌注损伤,且在一定范围内呈剂量依赖性。 展开更多
关键词 儿茶素 脑缺血 再灌注损伤 丙二醛 超氧化物歧化酶 谷胱甘肽过氧化酶 抗氧化剂 表儿茶素
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表儿茶素对大鼠缺血再灌注后神经元凋亡及Caspase-3、Bcl-2、Bax蛋白的影响 被引量:6
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作者 黄凡 李德丽 +2 位作者 蒋嫦月 胡婉湘 谢露 《岭南急诊医学杂志》 2021年第2期109-112,共4页
目的:研究表儿茶素(EC)对大鼠缺血再灌注后缺血侧脑皮质神经元凋亡及Caspase-3、Bcl-2、Bax蛋白的影响。方法:将SD大鼠随机分为假手术组(Sham组)、模型组(I/R组)、EC5mg/kg组、EC10mg/kg组、EC20mg/kg组、依达拉奉(ED)3 mg/kg组,每组9... 目的:研究表儿茶素(EC)对大鼠缺血再灌注后缺血侧脑皮质神经元凋亡及Caspase-3、Bcl-2、Bax蛋白的影响。方法:将SD大鼠随机分为假手术组(Sham组)、模型组(I/R组)、EC5mg/kg组、EC10mg/kg组、EC20mg/kg组、依达拉奉(ED)3 mg/kg组,每组9只。除Sham组外,其余组采用线栓法制备大脑中动脉栓塞(MCAO)模型,缺血2 h,于再灌注后0 h、12 h、24 h三个时间点给药,第12 h、24 h进行神经功能评分,第36 h取脑称重,应用缺口末端标记法(TdT-mediated d UTP nick end labeling,TUNEL)检测缺血侧脑皮质区神经元凋亡情况,蛋白免疫印迹法(Western blot)检测凋亡相关蛋白Caspase-3、Bax、Bcl-2的表达情况。结果:与Sham组比较,I/R组神经功能评分显著升高(P<0.05),脑指数无明显差异,凋亡指数明显增大(P<0.05),Caspase-3、Bax蛋白表达显著增加(P<0.05),Bcl-2蛋白表达显著减少(P<0.05)。与I/R组比较,EC5mg/kg组、EC10mg/kg组、EC20mg/kg组、ED3mg/kg组脑指数无明显差异,凋亡指数明显减小(P<0.05),Caspase-3蛋白表达明显减少(P<0.05),Bcl-2蛋白表达显著增加(P<0.05),EC10 mg/kg组、EC20 mg/kg组、ED3mg/kg组神经功能评分显著降低(P<0.05),Bax蛋白表达明显减少(P<0.05)。结论:表儿茶素可增强大鼠脑缺血再灌注后抗凋亡能力,可能与减少Caspase-3、Bax蛋白表达,增加Bcl-2蛋白表达有关。 展开更多
关键词 表儿茶素 脑缺血再灌注 神经元凋亡 CASPASE-3
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Establishment of oxygen glucose deprivation reperfusion model of senescent SH-SY5Y cells
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作者 ZHANG Qiao-tian jiang chang-yue +3 位作者 ZHU GE Xiang-zhen LI De-li HU Wan-Xiang XIE Lu 《Journal of Hainan Medical University》 CAS 2023年第6期1-7,共7页
Obejective:To explore the establishment of an oxygen glucose deprivation/reperfusion model of senescent SH-SY5Y cells.Methods:SH-SY5Y cells were randomly divided into control(D-galactose 0 mmol/L group),D-galactose(25... Obejective:To explore the establishment of an oxygen glucose deprivation/reperfusion model of senescent SH-SY5Y cells.Methods:SH-SY5Y cells were randomly divided into control(D-galactose 0 mmol/L group),D-galactose(25 mmol/L,50 mmol/L,100 mmol/L,200 mmol/L,400 mmol/L)groups,and treated with corresponding concentrations of D-galactose for 48 h.The changes of cell morphology,β-galactosidase,the cell morphology,β-galactosidase activity by microscopic observation,cell proliferation rate by EdU kit and cell survival rate by CCK-8 assay were used to determine the decaying concentration of D-galactose and to establish the senescence model.The senescent SH-SY5Y cells were randomly divided into control group(oxygen glucose deprivation without treatment group),oxygen glucose deprivation treatment(0.5 h,1 h,1.5 h,2 h)group,followed by re-glucose reoxygenation for 24 h,and CCK-8 assay for the survival rate of senescent SH-SY5Y cells.Results:There were no significant changes in cell morphology and β-gal activity in the 25 mmol/L and 50 mmol/L groups compared with the control group(P>0.05),cytosolic hypertrophy was seen in the cells of the 100 mmol/L group,chromatin fixation in the cells of the 200 mmol/L group,and massive vacuolization in the cells of the 400 mmol/L group;the positive rate ofβ-galactosidase staining in the cells of the(100-400 mmol/L)group was significantly higher compared with the control group(P<0.05),with little difference between the 100 mmol/L and 200 mmol/L groups(P>0.05);the cell proliferation ability of the(100-400 mmol/L)group was significantly decreased in a concentration-dependent manner(P<0.05);the cell survival rate was decreased in a concentration-dependent manner(P<0.05),with IC_(50) between 100 mmol/L and 200 mmol/L.The survival of senescent SH-SY5Y cells showed a time-dependent decrease in oxygen-glucose deprivation(P<0.05),with an IC_(50) close to 1 h.Conclusion:D-gal concentration of 100 mmoL/L and 48 h of cell action could establish a survival rate of about 50%of senescent SH-SY5Y cells,and oxygen glucose deprivation of senescent SH-SY5Y cells for 1 h and reperfusion for 24 h could establish an oxygen glucose deprivation/reperfusion model of senescent SH-SY5Y cells with a survival rate close to 50%. 展开更多
关键词 Cerebral ischemia-reperfusion injury Oxygen glucose deprivation reperfusion AGING D-GALACTOSE SH-SY5Y cell
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ERK抑制剂U0126对氧糖剥夺再灌注致神经母细胞瘤细胞损伤的影响
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作者 李德丽 胡婉湘 +1 位作者 蒋嫦月 谢露 《岭南急诊医学杂志》 2022年第1期6-9,共4页
目的:探究ERK抑制剂U0126对氧糖剥夺再灌注致神经母细胞瘤(SH-SY5Y)细胞损伤的影响。方法:将生长状态良好的SH-SY5Y细胞随机分为正常对照组(Control组)、模型组(OGD/R组)、溶剂组(DMSO组)、U0126 10μmol/L组(U0126-L组)、U0126 20μmo... 目的:探究ERK抑制剂U0126对氧糖剥夺再灌注致神经母细胞瘤(SH-SY5Y)细胞损伤的影响。方法:将生长状态良好的SH-SY5Y细胞随机分为正常对照组(Control组)、模型组(OGD/R组)、溶剂组(DMSO组)、U0126 10μmol/L组(U0126-L组)、U0126 20μmol/L组(U0126-M组)和U0126 30μmol/L组(U0126-H组)。U0126作用24 h后,除Control组更换正常完全培养基外,其余组采用DMEM无糖培养基和氮气缺氧法制备SHSY5Y细胞缺糖缺氧2 h后复糖复氧,继续放入37℃、5%CO2培养箱中培养24 h。采用CCK-8法测定细胞存活率;酶标法检测细胞培养液乳酸脱氢酶(LDH)活性和细胞超氧化物歧化酶(SOD)活性;流式细胞术测定细胞凋亡率。结果:与OGD/R组比较,Control组、U0126三个剂量组的LDH活性和细胞凋亡率均明显降低,而细胞中SOD活性显著升高(P<0.05);U0126作用显示出剂量效应关系,U0126-H组与U0126-L组有显著性差异(P<0.05)。结论:U0126对SY-SY5Y细胞缺糖缺氧再灌注损伤有一定的保护作用,可提高细胞存活率、增强细胞的抗氧化能力和降低细胞凋亡率。 展开更多
关键词 ERK抑制剂 氧糖剥夺再灌注 超氧化物歧化酶 细胞凋亡
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