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高通量虚拟筛选CDK2/Cyclin A2靶点抑制剂
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作者 叶成濠 梁亨 +3 位作者 李恩民 许丽艳 李鹏 陈广慧 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2021年第10期3135-3143,共9页
CDK2/Cyclin A2复合蛋白的异常表达与乳腺癌、口腔癌、食管鳞状细胞癌的发生密切相关.CDK2/Cyclin A2复合蛋白的活性位点不同于CDK2单体.至今临床上尚无靶向此复合蛋白的药物分子.针对CDK2/Cyclin A2复合蛋白,以实验报道的10个抑制剂分... CDK2/Cyclin A2复合蛋白的异常表达与乳腺癌、口腔癌、食管鳞状细胞癌的发生密切相关.CDK2/Cyclin A2复合蛋白的活性位点不同于CDK2单体.至今临床上尚无靶向此复合蛋白的药物分子.针对CDK2/Cyclin A2复合蛋白,以实验报道的10个抑制剂分子构建药效团模型,通过药物体外药代动力学(ADME)、Docking、聚类分析、毒性预测,从DrugBank,ChEMBL和TCM@Taiwan 3个数据库约90万组数据中进行高通量虚拟筛选,进一步进行MD模拟、MM/PBSA结合自由能计算、能量分解和平均非共价作用(aNCI)分析,筛选出3个抑制效果优于阳性实验药Roscovitine的先导分子:DrugBank-2004,DrugBank-583和ChEMBL-7122.与CDK2蛋白相比,CDK2/Cyclin A2复合蛋白结合位点空间变大,先导分子与Lys33,Asp86,Lys129和Asp145残基之间的排斥作用有所降低,导致结合自由能更大. 展开更多
关键词 CDK2/Cyclin A2 分子模拟 高通量虚拟筛选 抑制剂 自由能分解
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食管癌早期发现和高危人群预警液体活检技术分析 被引量:2
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作者 徐瑞华 宋昕 +16 位作者 李恩民 魏梦霞 韩文莉 雷玲玲 赵学科 孟超龙 胡守佳 程锟 王盼盼 钟侃 胡景峰 王伟 李欣然 杨苗苗 杨媛啧 许丽艳 王立东 《肿瘤基础与临床》 2020年第5期383-387,共5页
目的探讨液体活检技术对食管癌早期筛查和高危人群预警的意义。方法采用本实验室已经建立的间接酶联免疫吸附试验方法在早期食管癌患者和健康志愿者血清样本中检测3种肿瘤关抗原自身抗体细胞角蛋白19片段(CYFRA21-1)、增殖细胞核抗原(PC... 目的探讨液体活检技术对食管癌早期筛查和高危人群预警的意义。方法采用本实验室已经建立的间接酶联免疫吸附试验方法在早期食管癌患者和健康志愿者血清样本中检测3种肿瘤关抗原自身抗体细胞角蛋白19片段(CYFRA21-1)、增殖细胞核抗原(PCNA)和转化生长因子-β1(TGF-β1)的表达水平,分析这些指标联合检测对早期食管癌筛查的特异性和敏感性;采用最优的肿瘤相关抗原自身抗体组合进行小规模验证,在高发区无症状人群进行双盲液体活检和色素内镜活检病理,比较2种方法检测结果;采用该自身抗体技术在高发区无症状人群进行大规模食管癌筛查,了解检出情况。结果CYFRA21-1、PCNA和TGF-β1在早期食管癌中的阳性率分别为27.71%、31.67%、35.83%,均高于健康志愿者(2.92%、2.92%、5.00%),差异均有统计学意义(χ^2=113.752,P<0.001;χ^2=138.708,P<0.001;χ^2=140.425,P<0.001)。CYFRA21-1、PCNA和TGF-β1联合检测的敏感性67.08%,特异性76.04%,约登指数0.43。高发区无症状人群小规模验证结果证实,532例高发区无症状人群筛查发现阳性103例(19.36%),色素内镜检查结果示48例不典型增生患者、19例早期食管癌患者、9例中晚期食管癌患者、27例食管黏膜正常者;阴性429例(80.64%),色素内镜检查结果示11例不典型增生患者、2例早期食管癌患者、0例中晚期食管癌患者、416例食管黏膜正常者。高发区无症状人群大规模推广应用结果证实,10890例无症状人群经液体活检筛查发现,高危人群(阳性)1759例(16.51%),色素内镜检查结果示812例(12.22%)不典型增生患者、215例(46.16%)早期食管癌患者、23例(1.31%)中晚期食管癌患者、709例(40.31%)食管黏膜正常者。结论CYFRA21-1、PCNA及TGF-β1联合液体活检技术对食管癌早期发现及高危人群预警有重要意义,具有显著的推广应用价值。 展开更多
关键词 食管癌 液体活检 筛查 细胞角蛋白19片段 增殖细胞核抗原 转化生长因子-Β1
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Isolation of marine benzo[a]pyrene-degrading Ochrobactrum sp. BAP5 and proteins characterization 被引量:10
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作者 WU Yirui HE Tengteng +4 位作者 ZHONG Mingqi ZHANG Yueling li enmin HUANG Tongwang HU Zhong 《Journal of Environmental Sciences》 SCIE EI CAS CSCD 2009年第10期1446-1451,共6页
A bacterial strain BAP5 with a relatively high degradation ability of benzo[a]pyrene (BaP) was isolated from marine sediments of Xiamen Western Sea, China and identified as Ochrobactrum sp. according to 16S rRNA gen... A bacterial strain BAP5 with a relatively high degradation ability of benzo[a]pyrene (BaP) was isolated from marine sediments of Xiamen Western Sea, China and identified as Ochrobactrum sp. according to 16S rRNA gene sequence as well as Biolog microbial identification system. Strain BAP5 could grow in mineral salt medium with 50 mg/L of BaP and degrade about 20% BaP after 30 d of incubation. Ochrobactrum sp. BAP5 was able to utilize other polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) (such as phenanthrene, pyrene and fluoranthene) as the sole carbon source and energy source, suggesting its potential application in PAHs bioremediation. The profile of total soluble protein from Ochrobactrum sp. BAP5 was also investigated. Some over- and special-expressed proteins of strain BAP5 when incubated with the presence of BaP were detected by two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis, and found to be related with PAHs metabolism, DNA translation, and energy production based on peptide fingerprint analysis through matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry. 展开更多
关键词 BENZO[A]PYRENE BIODEGRADATION Ochrobactrum sp. BAP5 PROTEINS
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假性紫罗兰酮的合成研究
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作者 竺少铭 覃敏 +7 位作者 查娟 潘晓军 李恩民 陈龙 章潮军 商甜波 罗艳娟 虞国棋 《绍兴文理学院学报》 2023年第2期54-58,共5页
以柠檬醛和乙酰乙酸酯类化合物为原料,以仲胺类有机碱为缩合催化剂,制得中间体2-乙酰基-5,9-二甲基-葵-2,4,8-三烯酸酯类化合物及其烯醇式衍生物;将中间体混合物在稀的碳酸氢钠水溶液中进行水解脱羧反应制得假性紫罗兰酮.本文研究了乙... 以柠檬醛和乙酰乙酸酯类化合物为原料,以仲胺类有机碱为缩合催化剂,制得中间体2-乙酰基-5,9-二甲基-葵-2,4,8-三烯酸酯类化合物及其烯醇式衍生物;将中间体混合物在稀的碳酸氢钠水溶液中进行水解脱羧反应制得假性紫罗兰酮.本文研究了乙酰乙酸酯和仲胺的种类对反应的影响,通过正交实验,优化反应条件,筛选更优异的合成工艺:以二乙胺为碱性缩合剂,柠檬醛与乙酰乙酸甲酯在20℃温度下缩合反应1.5 h,收率为98.8%,脱羧反应收率98.0%,两步总收率96.8%,产品气相含量97%.工艺具有收率高、操作简便、废水少等特点,具有工业化前景. 展开更多
关键词 柠檬醛 缩合 水解脱羧 假性紫罗兰酮
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TONSL在食管癌中的表达及其影响食管鳞癌细胞增殖的机制
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作者 郑雅琪 赵子婷 +6 位作者 潘德渊 刘禄鑫 许秀娥 廖连娣 王少洪 李恩民 许丽艳 《癌变.畸变.突变》 CAS 2023年第6期412-419,共8页
目的:探讨tonsoku样DNA修复蛋白(TONSL)在食管癌组织中的表达及其对食管鳞癌细胞增殖的影响及机制。方法:利用cBioPortal、GEPIA和PRIDE等数据库分析在食管癌组织中,TONSL基因组拷贝数及其转录和翻译水平的变化。通过免疫组织化学实验检... 目的:探讨tonsoku样DNA修复蛋白(TONSL)在食管癌组织中的表达及其对食管鳞癌细胞增殖的影响及机制。方法:利用cBioPortal、GEPIA和PRIDE等数据库分析在食管癌组织中,TONSL基因组拷贝数及其转录和翻译水平的变化。通过免疫组织化学实验检测TONSL蛋白在食管鳞癌和正常食管组织中的表达。利用siRNA干扰构建TONSL瞬时敲降食管鳞癌细胞模型,并采用集落形成实验和EdU实验检测TONSL敲降对食管鳞癌细胞增殖能力的影响。Western blot检测TONSL敲降后食管鳞癌细胞中DNA损伤修复相关标志蛋白ATM丝氨酸/苏氨酸激酶(ATM)和检查点激酶2(CHK2)及其磷酸化激活水平的变化。结果:与正常食管组织比较,食管癌基因组、转录组和蛋白质组的数据库分析结果显示,TONSL在食管癌组织中拷贝数增加表达,其mRNA和蛋白质表达水平在食管癌组织中均上调(P<0.05),且TONSL高表达与食管癌患者不良预后相关(P<0.05);免疫组织化学验证结果也表明TONSL蛋白在食管鳞癌组织中表达上调(P<0.001)。集落形成实验和EdU实验结果显示,与对照组相比,TONSL敲降后食管鳞癌细胞增殖能力减弱(P<0.05),并且在敲降TONSL后,食管鳞癌细胞DNA损伤修复相关蛋白ATM和CHK2的磷酸化水平均上调(均为P<0.05)。结论:TONSL在食管鳞癌中表达上调,并通过参与食管鳞癌细胞DNA损伤修复促进食管鳞癌细胞增殖。 展开更多
关键词 食管鳞癌 tonsoku样DNA修复蛋白 细胞增殖 DNA损伤修复
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CDC42抑制剂CASIN对食管癌细胞活力与迁移能力的抑制作用
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作者 陈婉娴 王思梦 +4 位作者 陈张瑜 王潘集 郑淳文 李恩民 许丽艳 《癌变.畸变.突变》 CAS 2021年第2期136-142,共7页
目的:研究细胞分裂周期蛋白42(CDC42)特异性抑制剂CASIN对食管癌细胞的活力、迁移能力,以及伪足形成的影响,并初步揭示其诱导细胞凋亡的分子作用机制。方法:根据CDC42蛋白表达情况将细胞分为4组,内源性CDC42高/低表达组和外源性CDC42高... 目的:研究细胞分裂周期蛋白42(CDC42)特异性抑制剂CASIN对食管癌细胞的活力、迁移能力,以及伪足形成的影响,并初步揭示其诱导细胞凋亡的分子作用机制。方法:根据CDC42蛋白表达情况将细胞分为4组,内源性CDC42高/低表达组和外源性CDC42高/低表达组。首先采用Western blot检测9种食管癌细胞系中内源性CDC42蛋白表达情况,接着选用CDC42内源性高表达和低表达食管癌细胞系各2种,采用细胞活力分析实验和划痕实验检测CDC42抑制剂CASIN对食管癌细胞活力和迁移能力的影响,Western blot检测CASIN对凋亡酶蛋白Caspase-3的表达及其底物蛋白PARP的裂解情况。然后将构建的Flag-CDC42和GFPCDC42重组表达载体转染到食管癌细胞中,分成外源性CDC42低表达和高表达组,采用细胞活力分析实验和划痕实验检测CASIN对食管癌细胞活力和迁移能力的影响;免疫荧光实验检测CASIN对食管癌细胞伪足形成的影响。结果:与对照组(0μmol/L的CASIN)比较,在内源性CDC42高/低表达的细胞组中,细胞活力分析和划痕实验发现,15~30μmol/L的CASIN能明显抑制食管癌细胞的活力和迁移能力(P<0.05);Western blot结果显示,CASIN能引起Caspase-3表达增加,裂解PARP增多,提示可能诱导了细胞凋亡的发生。与低表达CDC42的食管癌细胞对照组相比,外源性高表达CDC42的食管癌细胞在20μmol/L CASIN作用时抑制程度显著增强(P<0.05);免疫荧光实验结果显示CASIN对CDC42促进细胞的伪足形成具有抑制作用。结论:CASIN能使食管癌细胞活力和迁移能力明显下降,抑制细胞伪足形成,同时还可能诱导细胞发生凋亡。因此,CASIN有望被开发为一种新型的抗食管癌分子靶向药物。 展开更多
关键词 细胞分裂周期蛋白42 CASIN 食管癌 抑制作用
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基于光纤Bragg光栅的悬臂梁式力检测系统
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作者 茶映鹏 李恩旻 +1 位作者 彭星玲 张华 《南昌工程学院学报》 CAS 2019年第3期101-104,共4页
采用毛细金属管对光纤光栅进行了封装,设计了一种悬臂梁式光纤布拉格光栅力检测装置,对光纤光栅的温度和力传感性能进行了实验研究,分析了基于悬臂梁的双光纤Bragg光栅的力灵敏度。结果表明:毛细金属管能够对光纤光栅提供较好的保护,封... 采用毛细金属管对光纤光栅进行了封装,设计了一种悬臂梁式光纤布拉格光栅力检测装置,对光纤光栅的温度和力传感性能进行了实验研究,分析了基于悬臂梁的双光纤Bragg光栅的力灵敏度。结果表明:毛细金属管能够对光纤光栅提供较好的保护,封装后其温度和力传感性能稳定,温度灵敏度为11. 1pm/℃,力灵敏度为0. 891pm/N,而在悬臂梁上正反面粘贴两个相同的FBG能够进行温度补偿的同时,使力灵敏度提高两倍。 展开更多
关键词 光纤布拉格光栅 毛细管封装 温度传感 力传感
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全血核黄素水平与食管鳞癌发生发展的关联研究 被引量:4
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作者 李珊珊 谭华珍 +8 位作者 许镒洧 吴志勇 吴健谊 赵学科 王立东 龙琳 李恩民 许丽艳 张建军 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1124-1129,共6页
目的 探讨全血核黄素水平与食管鳞癌(ESCC)发生发展的关联.方法 采用病例对照的研究方法,于2014年3月至2018年9月,选取在南方潮汕地区的汕头大学医学院附属医院、汕头市中心医院和北方太行山地区的郑州大学第一附属医院就诊的ESCC患者... 目的 探讨全血核黄素水平与食管鳞癌(ESCC)发生发展的关联.方法 采用病例对照的研究方法,于2014年3月至2018年9月,选取在南方潮汕地区的汕头大学医学院附属医院、汕头市中心医院和北方太行山地区的郑州大学第一附属医院就诊的ESCC患者为病例组;以在该医院体检的非ESCC患者为对照组,对照组按照年龄(±5岁)、性别进行1∶1匹配.最终共纳入1 528例研究对象,病例组和对照组各764例.采集研究对象的静脉血3~5 ml,检测红细胞谷胱甘肽还原酶活性系数(GRAC)代表血核黄素水平.采用多因素条件logistics回归模型分析GRAC与ESCC患病风险的关联;以生存资料完整的288例患者为研究对象,根据总生存期、生存结局与GRAC的关联最强点(GRAC=7.87)将研究对象分为两组:高谷胱甘肽还原酶组(GRAC≥7.87)和低GRAC组(GRAC<7.87),采用Cox比例风险回归模型分析GRAC与ESCC预后的关联.结果 1 528例研究对象中,南方潮汕地区958例,病例组和对照组分别有479例,年龄分别为(59.90±9.34)、(59.55±8.77)岁;北方太行山地区共570例,病例组和对照组分别有285例,年龄分别为(58.39±5.19)、(58.74±4.57)岁.多因素条件logistic回归模型分析结果显示,GRAC与ESCC患病风险OR(95%CI)值为1.009(0.998~1.019);Cox比例风险回归模型分析结果显示,50~70岁年龄组中,与低GARC组相比,高GARC组的死亡风险HR(95%CI)值为1.712(1.034~2.824).结论 全血核黄素水平与ESCC的发生可能没有关联;高全血核黄素水平利于50~70岁ESCC患者的预后. 展开更多
关键词 食管肿瘤 核黄素 病例对照研究
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