针对外卖配送电动自行车换电柜布局不合理带来的部分换电柜利用率低与部分换电需求得不到及时满足的供需矛盾问题,本文通过聚类POI(Point of Interest)数据确定外卖配送起止点,并通过仿真模拟外卖骑手配送路径预测外卖配送电动自行车换...针对外卖配送电动自行车换电柜布局不合理带来的部分换电柜利用率低与部分换电需求得不到及时满足的供需矛盾问题,本文通过聚类POI(Point of Interest)数据确定外卖配送起止点,并通过仿真模拟外卖骑手配送路径预测外卖配送电动自行车换电需求时空分布,构建换电柜运营商总成本最低和用户满意度最高的多目标换电柜选址定容模型,并以新乡市主城区为例,采用NSGA-II(Non-dominated Sorting Genetic Algorithm II)算法得到换电柜选址定容方案。研究结果表明:仿真模拟得出的换电需求时间分布预测值与实际值基本吻合,换电需求在11:00,14:00,17:00和20:00左右急剧增长,且11:00和14:00左右的换电需求量显著高于17:00和20:00左右的换电需求量,外卖骑手配送路径仿真模拟方法在换电需求预测上具有较高的预测精度;换电柜选址方案不能同时满足运营商和用户利益均为最优,用户满意度的提高需以增加运营商总成本为代价;同时,兼顾运营商和用户利益的新乡市主城区外卖配送电动自行车换电柜最佳建设数量为26,其中,容量为11的换电柜11个,容量为22的换电柜8个,容量为33的换电柜7个;新乡市主城区应按照备选点编号15-7-19-17依次新增换电柜至30个,此时,用户满意度最大,若继续增加换电柜建设数量,只会增加运营商总成本。展开更多
目的:基于网络药理学探讨二仙汤“异病同治”乳腺增生和围绝经期综合征的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选二仙汤中...目的:基于网络药理学探讨二仙汤“异病同治”乳腺增生和围绝经期综合征的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选二仙汤中6味中药的活性成分并预测其潜在靶点;通过人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)及在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)平台检索乳腺增生和围绝经期综合征的疾病靶点,借助Venn在线工具构建药物与两种疾病的交集靶点。运用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络;利用STRING数据库构建PPI网络,按Dgree值大于等于平均值进一步筛选核心靶点;采用DAVID数据库进行基因本体论(gene ontology,GO)富集分析,同时实现京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果 :根据口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%和药物类药性(druglikeness,DL)≥0.18筛选得到二仙汤有效活性成分104个,预测潜在作用靶点147个;通过筛选得到乳腺增生靶点4153个,围绝经期综合征靶点155个,药物与疾病的交集靶点29个,其中IL-6、VEGFA、TNF、TP53、ESR1、CAT、IL-1β等可能是二仙汤治疗乳腺增生和围绝经期综合征的关键靶点。活性成分及靶点主要参与DNA模板转录正调控、基因表达的正调控、胞外间隙、胞外区、类固醇结合、酶结合等;靶基因主要富集在TNF、NOD样体、HIF-1、癌症、PI3K-Akt等信号通路。结论:二仙汤可能通过调控PI3K-Akt、HIF-1等信号通路达到防治乳腺增生和围绝经期综合征的目的。展开更多
目的:基于网络药理学和分子对接技术,探究虎杖治疗桥本氏甲状腺炎(Hashimoto′s thyroiditis,HT)的作用机制。方法:从传统中医药系统药理学数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database,TCMSP)筛选获...目的:基于网络药理学和分子对接技术,探究虎杖治疗桥本氏甲状腺炎(Hashimoto′s thyroiditis,HT)的作用机制。方法:从传统中医药系统药理学数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database,TCMSP)筛选获得虎杖的有效活性成分和作用靶点;从GeneCards数据库获得HT的疾病靶点,并使用Venn平台取交集,利用Cytoscape 3.7.2软件绘制“药物-成分-疾病-靶点”网络图;使用String数据库构建蛋白质相互作用网络,通过R软件筛选出核心靶点;再利用“DOSE”“clusterProfiler”“pathview”程序包(bioconductor)对其进行基因本体(gene ontology,GO)和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,绘制“成分-靶点-通路”网络图;最后通过AutoDock Vina等软件加以分子对接验证核心成分与核心靶点的相互作用。结果:筛选出药物有效活性成分10个、作用靶点164个,HT靶点587个,交集靶点61个,核心成分为槲皮素、木犀草素、囊毒碱、β-谷甾醇、大黄酸、儿茶素、鸭脚树叶碱等。蛋白-蛋白相互作用(protein-protein Interaction,PPI)网络核心靶点为蛋白激酶B1(protein kinase 1,Akt1)、半胱天冬酶3(cysteinyl aspartate specific proteinase 3,CASP3)、白细胞介素6(interleukin6,IL-6)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、肿瘤蛋白p53(tumor protein p53,TP53)、白细胞介素1β(interleukin 1β,IL-1β)、禽肉瘤病毒17癌基因同源物(v-jun avian sarcoma virus 17 oncogene homolog,JUN)、前列腺素内过氧化物合酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2)、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)、缺氧诱导因子1A(hypoxia inducible factor 1A,HIF1A)等。PPI网络核心靶点为Akt1、CASP3、IL-6、TNF、TP53、IL-1β、JUN、PTGS2、EGFR、HIF1A等;KEGG通路富集分析共有157个条目,主要涉及脂质和动脉粥样硬化、晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体(advanced glycation end products-receptor for advanced glycation end products,AGE-RAGE)、IL-17、TNF、AGE-RAGE、IL-17等信号通路及利什曼病、乙型肝炎等,分子对接显示活性成分与核心靶点之间有较好的结合力。结论:虎杖治疗HT具有多成分、多靶点、多通路的特点,可以为今后的临床应用提供一定的理论参考和支持。展开更多
文摘目的:基于网络药理学探讨二仙汤“异病同治”乳腺增生和围绝经期综合征的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选二仙汤中6味中药的活性成分并预测其潜在靶点;通过人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)及在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)平台检索乳腺增生和围绝经期综合征的疾病靶点,借助Venn在线工具构建药物与两种疾病的交集靶点。运用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络;利用STRING数据库构建PPI网络,按Dgree值大于等于平均值进一步筛选核心靶点;采用DAVID数据库进行基因本体论(gene ontology,GO)富集分析,同时实现京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果 :根据口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%和药物类药性(druglikeness,DL)≥0.18筛选得到二仙汤有效活性成分104个,预测潜在作用靶点147个;通过筛选得到乳腺增生靶点4153个,围绝经期综合征靶点155个,药物与疾病的交集靶点29个,其中IL-6、VEGFA、TNF、TP53、ESR1、CAT、IL-1β等可能是二仙汤治疗乳腺增生和围绝经期综合征的关键靶点。活性成分及靶点主要参与DNA模板转录正调控、基因表达的正调控、胞外间隙、胞外区、类固醇结合、酶结合等;靶基因主要富集在TNF、NOD样体、HIF-1、癌症、PI3K-Akt等信号通路。结论:二仙汤可能通过调控PI3K-Akt、HIF-1等信号通路达到防治乳腺增生和围绝经期综合征的目的。
文摘目的:基于网络药理学和分子对接技术,探究虎杖治疗桥本氏甲状腺炎(Hashimoto′s thyroiditis,HT)的作用机制。方法:从传统中医药系统药理学数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database,TCMSP)筛选获得虎杖的有效活性成分和作用靶点;从GeneCards数据库获得HT的疾病靶点,并使用Venn平台取交集,利用Cytoscape 3.7.2软件绘制“药物-成分-疾病-靶点”网络图;使用String数据库构建蛋白质相互作用网络,通过R软件筛选出核心靶点;再利用“DOSE”“clusterProfiler”“pathview”程序包(bioconductor)对其进行基因本体(gene ontology,GO)和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,绘制“成分-靶点-通路”网络图;最后通过AutoDock Vina等软件加以分子对接验证核心成分与核心靶点的相互作用。结果:筛选出药物有效活性成分10个、作用靶点164个,HT靶点587个,交集靶点61个,核心成分为槲皮素、木犀草素、囊毒碱、β-谷甾醇、大黄酸、儿茶素、鸭脚树叶碱等。蛋白-蛋白相互作用(protein-protein Interaction,PPI)网络核心靶点为蛋白激酶B1(protein kinase 1,Akt1)、半胱天冬酶3(cysteinyl aspartate specific proteinase 3,CASP3)、白细胞介素6(interleukin6,IL-6)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、肿瘤蛋白p53(tumor protein p53,TP53)、白细胞介素1β(interleukin 1β,IL-1β)、禽肉瘤病毒17癌基因同源物(v-jun avian sarcoma virus 17 oncogene homolog,JUN)、前列腺素内过氧化物合酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2)、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)、缺氧诱导因子1A(hypoxia inducible factor 1A,HIF1A)等。PPI网络核心靶点为Akt1、CASP3、IL-6、TNF、TP53、IL-1β、JUN、PTGS2、EGFR、HIF1A等;KEGG通路富集分析共有157个条目,主要涉及脂质和动脉粥样硬化、晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体(advanced glycation end products-receptor for advanced glycation end products,AGE-RAGE)、IL-17、TNF、AGE-RAGE、IL-17等信号通路及利什曼病、乙型肝炎等,分子对接显示活性成分与核心靶点之间有较好的结合力。结论:虎杖治疗HT具有多成分、多靶点、多通路的特点,可以为今后的临床应用提供一定的理论参考和支持。
