Computational Simulation of Aptamer-target Binding Mechanisms

Aptamers are a type of single-chain oligonucleotide that can combine with a specific target.Due to their simple preparation,easy modification,stable structure and reusability,aptamers have been widely applied as biochemical sensors for medicine,food safety and environmental monitoring.However,there is little research on aptamer-target binding mechanisms,which limits their application and development.Computational simulation has gained much attention for revealing aptamer-target binding mechanisms at the atomic level.This work summarizes the main simulation methods used in the mechanistic analysis of aptamer-target complexes,the characteristics of binding between aptamers and different targets(metal ions,small organic molecules,biomacromolecules,cells,bacteria and viruses),the types of aptamer-target interactions and the factors influencing their strength.It provides a reference for further use of simulations in understanding aptamer-target binding mechanisms.

山西省200所二级及以上医院医院感染专职人员人力资源配置现状调查

目的了解山西省二级及以上医疗机构医院感染专职人员人力资源配置现状,为山西省医院感染管理专职人员人才队伍建设提供参考依据。方法2023年1月17日—2月4日采用便利抽样法对山西省二级及以上医院医院感染专职人员进行问卷调查。结果共调查200所医院284名医院感染专职人员,包括三级医院45所,二级医院155所,其中56所(28.0%)医院医院感染专职人员配置充足。不同等级、床位数医院医院感染专职人员配置充足率比较,差异有统计学意义(P<0.05),三级医院配置充足率优于二级医院,床位数为100~500张者配置充足率最低。医院感染专职人员以46~66岁(占50.4%)、女性(占94.4%)居多,专业背景以护理专业为主(占80.0%),学历硕士者仅占7.0%,高级职称占44.8%。虽医疗工作年限>20年者占61.6%,但医院感染工作年限<5年者却高达43.3%,已取得医院感染专职人员证书者占91.9%。结论山西省二级及以上医院医院感染专职人员配置不足、人员结构不合理,医疗机构应进一步加强医院感染专职人员人才队伍建设。

政和白茶不同泡法对其茶汤香气、糖类组分影响研究

【目的】白茶以其毫香蜜韵、滋味鲜醇的品质特征深受消费者喜爱。探明政和白茶不同泡法对其茶汤品质的影响,为丰富白茶泡饮方式和参数提供理论基础。【方法】以政和白茶寿眉小饼为研究对象,设置泡茶(PC)、煮茶(ZC)和煮茶后焖茶汤(ZCM)3种不同泡法,采用顶空固相微萃取(HS-SPME)结合气相色谱质谱联用技术(GC-MS)对不同泡法茶汤香气组分进行测定,应用衍生化法结合GC-MS对不同泡法茶汤可溶性糖类组分进行测定。【结果】结果表明,PC汤色橙黄,滋味醇厚欠润,陈香显;ZC汤色金黄,滋味醇和,枣香;ZCM汤色金黄,滋味甘醇甜润,转为枣香明显,带糯香。ZC与ZCM之间香气组分整体差异较小,但与PC差异明显。与PC相比,ZC与ZCM在吲哚、环氧-β-紫罗兰酮、水杨酸甲酯和β-罗勒烯相对含量均明显降低,而(E)-3-己烯醇、香叶醇、α-法呢烯和芳樟醇相对含量均显著提高。ZCM中的环氧-β-紫罗兰酮、水杨酸甲酯、α-法呢烯相对含量在煮茶基础上进一步提高。可溶性糖总量在ZCM中最高,达153.7μg·mL^(−1),ZC与PC处理次之。与PC相比,ZC与ZCM在果糖、葡萄糖、蔗糖和麦芽糖含量显著增加,ZCM中果糖与蔗糖含量均在ZC基础上进一步提高。【结论】与PC相比,ZC和ZCM在吲哚、环氧-β-紫罗兰酮、水杨酸甲酯和β-罗勒烯降低,(E)-3-己烯醇、香叶醇、α-法呢烯和芳樟醇提高,果糖、葡萄糖、蔗糖、麦芽糖和总可溶性糖含量提高,共同构成了ZC和ZCM醇厚、枣香的品质特征。ZCM在ZC基础上进一步强化了上述品质。

面向食品科学专业的计算化学课程思政教学案例设计

为充分发挥课程育人功能,全面提升食品专业学生的爱国主义情怀、科学素养以及创新能力等,我们对面向食品学科的计算化学课程中的思政元素进行了深度挖掘。本文主要介绍了相关课程思政的设计理念和几个具体案例,为其他相关课程思政元素的设计提供了有价值的参考和借鉴。

液态金属原子自扩散的Enskog理论研究

为研究液态金属的自扩散行为,把液态金属看成硬球流体.考虑液态金属原子间碰撞深度随温度的升高而加大的问题,得到了硬球模型原子有效直径与温度的关系.进而对Enskog理论做出修正,得到能更准确地计算液态金属原子自扩散系数的公式.利用分子动力学软件LAMMPS模拟了液态金属铝、镁、铁的原子自扩散,得到了这些金属原子的自扩散系数,并与修正的Enskog理论计算结果进行了比较.结果表明:修正的Enskog理论更适用于硬度大的液态金属;温度比密度对液态金属原子的有效直径的影响小;密度的改变比有效直径的改变对液态金属原子的自扩散系数的贡献更大.

水稻中类受体蛋白激酶FERONIA-like Receptor 1的表达纯化及抗体制备

类受体蛋白激酶参与调控植物的器官发育和抗逆性,是一种重要的蛋白激酶。通过对水稻中类受体蛋白激酶家族成员FERONIA-like receptor 1 (FLR1)进行蛋白质结构预测分析,发现FLR1蛋白具有跨膜结构,其N端在细胞膜外(FLR1-BW, 1~450 aa), C端在细胞膜内(FLR1-BN, 474~892 aa)。为了得到FLR1抗体用于其功能分析,将FLR1的N端和C端分别构建到原核表达载体pET-32a、pGEX-4T-1、pET-22b、pTriEx-4上,比较FLR1-BW和FLR1-BN在不同载体和不同条件下的表达效果。结果显示:FLR1-BW在pET-32a及pGEX-4T-1中能够有效表达,最优条件为16℃/16 h、0.5 mmol/L IPTG;而FLR1-BN蛋白表达后会对大肠杆菌产生细胞毒性,但在293细胞中能够表达。进一步利用纯化的FLR1-BW蛋白制备FLR1多克隆抗体,结果显示该抗体特异识别FLR1蛋白。本研究为类受体蛋白激酶的抗体制备提供了良好的思路并为研究FLR1功能奠定了基础。

早期乳腺癌患者调强放射治疗射野边界外放方法的探讨及其影响

目的探讨早期乳腺癌调强放射治疗(IMRT)计划设计环节中添加补偿膜实现射野边界外放的方法并评估其效果。方法选取2018-08-08-2019-02-13中山大学孙逸仙纪念医院接受放射治疗的早期乳腺癌行保留乳房手术患者20例(左侧10例,右侧10例)。针对每个病例设计优化环节添加补偿膜,计算环节去掉补偿膜的调强计划IMRT_b,并与系统自带通量刷Skin flash Tool往外拷贝通量实现射野边界外放的调强计划IMRT_sf进行比较。为模拟呼吸运动、皮肤肿胀和摆位等误差因素,将射野等中心往呼吸方向移动约1.4cm,与常规调强计划IMRT_o进行比较。对于符合正态分布的数据采用单因素方差分析,否则采用非参数Friedman检验。结果射野方向观上观察到IMRT_b计划实现了多叶光栅在胸廓方向外放2cm;将射野等中心往呼吸方向移动后,IMRT_b和IMRT_sf计划靶区覆盖V95%分别是94.67%和94.00%,与常规IMRT_o计划的62.50%相比分别高47%(F=29.762,P<0.001)和50%(F=29.762,P<0.001)。IMRT_b和IMRT_sf计划的V105%均高于常规IMRT_o计划,但都满足临床剂量限值,差异无统计学意义。IMRT_b计划靶区均匀性指数高于常规IMRT_o计划(F=1.066,P<0.001),IMRT_sf计划和IMRT_o计划比较,差异无统计学意义,F=1.066,P=0.051.结论本研究提出的优化环节添加补偿膜的方法不依赖于计划系统,能有效地实现调强计划射野在胸廓方向外放的效果,可避免由呼吸运动、皮肤肿胀和摆位误差等因素引起的靶区漏照射问题。