目的通过数据挖掘、网络药理学与分子对接分析中医治疗糖尿病(Diabetes Mellitus,DM)合并骨质疏松症(Osteoporosis,OP)的用药规律及作用机制。方法检索中国知网、维普期刊数据库、万方数据库、中国生物医学文献服务系统、pubmed、web of...目的通过数据挖掘、网络药理学与分子对接分析中医治疗糖尿病(Diabetes Mellitus,DM)合并骨质疏松症(Osteoporosis,OP)的用药规律及作用机制。方法检索中国知网、维普期刊数据库、万方数据库、中国生物医学文献服务系统、pubmed、web of science等数据库收录的相关文献,并利用古今医案云平台构建中医药处方数据库,通过药物频次频率、性味归经、关联规则及系统聚类分析等方式挖掘核心药物;运用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chi-nese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索高频药对化合物及治疗靶点,与Genecards和OMIM数据库筛选出糖尿病合并骨质疏松的靶点相映射并取交集;利用STRING 11.0数据库与Cytoscape软件构建可视化蛋白质相互作用网络(Protein-Protein Interaction,PPI)网络与药物成分靶点网络,并对关键靶点进行基因本体论分析(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书通路富集分析(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,最后进行分子对接。结果共纳入处方108首,涉及药物173味,归经以肝肾脾较为突出,性味以甘苦为主。关联规则分析得到药物组合10组,共7味中药,使用频次在25以上的中药有9味,其中熟地的使用频次最高;关联规则表明药对,山药-熟地,淫羊藿-黄芪支持度最高;聚类分析得到4类中药分类。将关联分析与聚类分析结果与临床应用相结合,最终得到核心组方:“熟地、山药、山茱萸、骨碎补、淫羊藿、黄芪、丹参”。核心药物组合治疗糖尿病合并骨质疏松的关键成分为豆甾醇(Stigmasterol)、亚油酸乙酯(Mandenol)、8-异戊二烯黄酮[8-(3-methylbut-2-enyl)-2-phenyl-chromone],等,核心靶点为IL-6、PPARG、IL1B、VEGFA、NR3C1等,主要通路为AMPK信号通路、cGMP-PKG信号通路等。结论中医药治疗糖尿病合并骨质疏松基本思路为补益肝脾肾三脏,活血行气。通过数据挖掘,得出中医药治疗糖尿病合并骨质疏松症核心组方为“熟地、山药、山茱萸、骨碎补、淫羊藿、黄芪、丹参”,其核心成分为豆甾醇(Stigmasterol),亚油酸乙酯(Mandenol),8-异戊二烯黄酮[8-(3-methylbut-2-enyl)-2-phenyl-chromone]等,这些成分通过AMPK信号通路、cGMP-PKG信号通路作用于NR3C1、CNR2等靶点,为中医治疗糖尿病合并骨质疏松筛选药物提供参考。展开更多
目的基于文献来源医案构建中药网络分析治疗糖尿病(diabetes mellitus,DM)合并缺血性中风(ischemic stroke,IS)的中药组方配伍规律,并基于靶点网络分析核心组方的作用机制。方法以中国知网、维普、万方数据库、中国生物医学文献服务系...目的基于文献来源医案构建中药网络分析治疗糖尿病(diabetes mellitus,DM)合并缺血性中风(ischemic stroke,IS)的中药组方配伍规律,并基于靶点网络分析核心组方的作用机制。方法以中国知网、维普、万方数据库、中国生物医学文献服务系统为文献来源,借助古今医案云平台对文献中的处方进行数据统计以及关联规则、复杂网络和聚类分析,得到核心组方,分析治疗DM合并IS的中药组方规律;从TCMSP数据库检索药物成分以及相应的靶点,从OMIM、TTD、GeneCards数据库中检索DM和IS的靶点,通过Cytoscape 3.9.1软件及MCODE插件得到核心组方有效成分及关键靶点;随后进行靶点基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析;最后通过分子对接技术进行验证。结果纳入文献144篇,处方239首,涉及中药194味,其中黄芪的使用频次最高(103次);关联规则分析得到药物组合6组;得到的核心组方由9味中药组成;核心组方有效成分有槲皮素、水蛭素A、二氢辣椒素、花生四烯酸等;关键靶点包括丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)3、转录因子JUN(transcription factor Jun,JUN)、细胞肿瘤抗原p53(tumor protein P53,TP53)、信号转导和转录激活因子(signal transducer and activator of transcription,STAT)3、SRC原癌基因(SRC proto-oncogene,SRC)、蛋白激酶B(protein kinase B,又称AKT)1、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)1、HRAS原癌基因(HRAS proto-oncogene,HRAS)、凝血酶原F2(coagulation factor Ⅱ,F2)等;GO和KEGG分析显示核心组方治疗DM合并IS与癌症通路、晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体(advanced glycation end products-receptor for advanced glycation end products,AGE-RAGE)信号通路、磷脂酰肌醇3激酶(phosphatidylinositol-3-kinase,PI3K)/AKT信号通路、环腺苷酸(cyclic adenosine monophosphate,cAMP)等信号通路有关。分子对接显示有效成分与关键靶点可形成稳定的结构。结论通过构建中药复杂网络以及靶点网络得出中药治疗DM合并IS以益气养阴、活血通络为主;也验证了核心组方有效成分通过作用于机体多靶点、多通路发挥作用,为临床治疗和进一步研究提供参考。展开更多
文摘目的通过数据挖掘、网络药理学与分子对接分析中医治疗糖尿病(Diabetes Mellitus,DM)合并骨质疏松症(Osteoporosis,OP)的用药规律及作用机制。方法检索中国知网、维普期刊数据库、万方数据库、中国生物医学文献服务系统、pubmed、web of science等数据库收录的相关文献,并利用古今医案云平台构建中医药处方数据库,通过药物频次频率、性味归经、关联规则及系统聚类分析等方式挖掘核心药物;运用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chi-nese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索高频药对化合物及治疗靶点,与Genecards和OMIM数据库筛选出糖尿病合并骨质疏松的靶点相映射并取交集;利用STRING 11.0数据库与Cytoscape软件构建可视化蛋白质相互作用网络(Protein-Protein Interaction,PPI)网络与药物成分靶点网络,并对关键靶点进行基因本体论分析(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书通路富集分析(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,最后进行分子对接。结果共纳入处方108首,涉及药物173味,归经以肝肾脾较为突出,性味以甘苦为主。关联规则分析得到药物组合10组,共7味中药,使用频次在25以上的中药有9味,其中熟地的使用频次最高;关联规则表明药对,山药-熟地,淫羊藿-黄芪支持度最高;聚类分析得到4类中药分类。将关联分析与聚类分析结果与临床应用相结合,最终得到核心组方:“熟地、山药、山茱萸、骨碎补、淫羊藿、黄芪、丹参”。核心药物组合治疗糖尿病合并骨质疏松的关键成分为豆甾醇(Stigmasterol)、亚油酸乙酯(Mandenol)、8-异戊二烯黄酮[8-(3-methylbut-2-enyl)-2-phenyl-chromone],等,核心靶点为IL-6、PPARG、IL1B、VEGFA、NR3C1等,主要通路为AMPK信号通路、cGMP-PKG信号通路等。结论中医药治疗糖尿病合并骨质疏松基本思路为补益肝脾肾三脏,活血行气。通过数据挖掘,得出中医药治疗糖尿病合并骨质疏松症核心组方为“熟地、山药、山茱萸、骨碎补、淫羊藿、黄芪、丹参”,其核心成分为豆甾醇(Stigmasterol),亚油酸乙酯(Mandenol),8-异戊二烯黄酮[8-(3-methylbut-2-enyl)-2-phenyl-chromone]等,这些成分通过AMPK信号通路、cGMP-PKG信号通路作用于NR3C1、CNR2等靶点,为中医治疗糖尿病合并骨质疏松筛选药物提供参考。
文摘目的基于文献来源医案构建中药网络分析治疗糖尿病(diabetes mellitus,DM)合并缺血性中风(ischemic stroke,IS)的中药组方配伍规律,并基于靶点网络分析核心组方的作用机制。方法以中国知网、维普、万方数据库、中国生物医学文献服务系统为文献来源,借助古今医案云平台对文献中的处方进行数据统计以及关联规则、复杂网络和聚类分析,得到核心组方,分析治疗DM合并IS的中药组方规律;从TCMSP数据库检索药物成分以及相应的靶点,从OMIM、TTD、GeneCards数据库中检索DM和IS的靶点,通过Cytoscape 3.9.1软件及MCODE插件得到核心组方有效成分及关键靶点;随后进行靶点基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析;最后通过分子对接技术进行验证。结果纳入文献144篇,处方239首,涉及中药194味,其中黄芪的使用频次最高(103次);关联规则分析得到药物组合6组;得到的核心组方由9味中药组成;核心组方有效成分有槲皮素、水蛭素A、二氢辣椒素、花生四烯酸等;关键靶点包括丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)3、转录因子JUN(transcription factor Jun,JUN)、细胞肿瘤抗原p53(tumor protein P53,TP53)、信号转导和转录激活因子(signal transducer and activator of transcription,STAT)3、SRC原癌基因(SRC proto-oncogene,SRC)、蛋白激酶B(protein kinase B,又称AKT)1、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)1、HRAS原癌基因(HRAS proto-oncogene,HRAS)、凝血酶原F2(coagulation factor Ⅱ,F2)等;GO和KEGG分析显示核心组方治疗DM合并IS与癌症通路、晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体(advanced glycation end products-receptor for advanced glycation end products,AGE-RAGE)信号通路、磷脂酰肌醇3激酶(phosphatidylinositol-3-kinase,PI3K)/AKT信号通路、环腺苷酸(cyclic adenosine monophosphate,cAMP)等信号通路有关。分子对接显示有效成分与关键靶点可形成稳定的结构。结论通过构建中药复杂网络以及靶点网络得出中药治疗DM合并IS以益气养阴、活血通络为主;也验证了核心组方有效成分通过作用于机体多靶点、多通路发挥作用,为临床治疗和进一步研究提供参考。