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基于InDels标记的大白菜育种材料的亲缘关系鉴定 被引量:9
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作者 刘栓桃 张志刚 +7 位作者 司立英 王荣花 李巧云 王立华 赵智中 梁水美 张全芳 步迅 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期657-667,共11页
采用86对InDels引物对105份大白菜育种材料进行了鉴定,共得到189个多态性位点。每对引物所能检测到的等位基因为2~4个,其中82.6%的引物仅能检测到2个等位基因位点;杂合度指数0~0.1880,平均为0.0511;主要等位基因频率为0.3277~0.9664,平... 采用86对InDels引物对105份大白菜育种材料进行了鉴定,共得到189个多态性位点。每对引物所能检测到的等位基因为2~4个,其中82.6%的引物仅能检测到2个等位基因位点;杂合度指数0~0.1880,平均为0.0511;主要等位基因频率为0.3277~0.9664,平均为0.6638;每对引物的多态性信息含量为0.0629~0.6654,平均为0.3444。94.2%的引物杂合度低于0.1,表明所选材料纯合度较高。采用NTSYS软件对供试材料进行UPGMA聚类分析,当相似系数为0.60时所有试材料分为合抱型(类群Ⅰ)与叠抱型(类群Ⅱ)明显的两个类群。叠抱型所在的类群Ⅱ在相似系数0.63时又进一步分为4个亚群。4个杂种优势非常明显的叠抱型品种的亲本材料分别处于不同的亚群或同一亚群中的不同分支。对双亲标记检测结果的进一步分析后挖掘了一批适宜4个杂交种纯度鉴定的引物,从中筛选了3对适宜4个杂交种纯度鉴定的通用引物。研究结果不仅提供了大白菜杂种优势育种的分子证据,同时也为育种实践中杂交组合的高效选配提供了帮助。 展开更多
关键词 大白菜 育种材料 亲缘关系 杂种优势 插入/缺失标记
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北柴胡成花基因的克隆及时空表达分析 被引量:3
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作者 李敏 张全芳 +4 位作者 蒲高斌 刘艳艳 刘谦 步迅 张永清 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期1188-1196,共9页
开花是植物生长发育的关键环节,本研究从北柴胡植株中克隆得到4个与成花相关的基因,分别命名为BcSVP、BcPAF1、BcCO、BcFT,并进行了同源性比对;以actin和EF-1α作为双内参,对4个基因在北柴胡植株不同器官和不同发育阶段的时空表达差异... 开花是植物生长发育的关键环节,本研究从北柴胡植株中克隆得到4个与成花相关的基因,分别命名为BcSVP、BcPAF1、BcCO、BcFT,并进行了同源性比对;以actin和EF-1α作为双内参,对4个基因在北柴胡植株不同器官和不同发育阶段的时空表达差异进行分析。结果表明,BcSVP主要在根中表达,相对表达量较低;BcPAF1和BcCO在不同部位均有较高表达,二者相对表达量伴随花期进程均呈先上升后缓慢下降趋势;BcFT基因主要在茎中表达,相对表达量在盛花期急剧上升。本文首次克隆并分析了与北柴胡植株成花相关4个基因的相对表达量,为解析柴胡植株成花分子调控机制奠定了基础。 展开更多
关键词 北柴胡 成花基因 克隆 时空表达模式
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药用贝母属系统发育关系分析及多重实时荧光PCR检测方法的建立 被引量:7
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作者 刘艳艳 张全芳 +7 位作者 范阳阳 谭晴晴 姜欣欣 汪冰 葛付存 林永强 步迅 张永清 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期2172-2180,共9页
目的探讨多重实时荧光PCR检测方法对川贝母及伪品鉴别的可行性。方法通过对常见贝母属植物的ITS、psb Atrn H、rbc L和matK基因序列种间变异、遗传距离及系统发育关系分析,选择进化速率快、种间变异大、种内变异小的基因作为靶基因,设... 目的探讨多重实时荧光PCR检测方法对川贝母及伪品鉴别的可行性。方法通过对常见贝母属植物的ITS、psb Atrn H、rbc L和matK基因序列种间变异、遗传距离及系统发育关系分析,选择进化速率快、种间变异大、种内变异小的基因作为靶基因,设计川贝母及伪品贝母的特异性引物和Taqman探针,建立一种多重实时荧光PCR检测方法。通过特异性、灵敏度及混合样本检测与测序方法比较进行方法评估。结果贝母属ITS和psb A-trn H变异位点高于rbc L和mat K,通过遗传距离分析rbc L和mat K基因显著低于ITS和psb A-trn H基因,以ITS作为靶基因,建立多重实时荧光PCR检测方法特异性强,灵敏度达0.01ng,对18份样本抽查检出4份伪品贝母,检测结果与构建的NJ树聚类分析结果完全一致。结论基于ITS区域序列为靶基因建立多重实时荧光PCR检测方法能够成功鉴定川贝母及其混伪品,为川贝母真伪鉴别提供依据。 展开更多
关键词 ITS PSBA-TRNH RBCL MATK 多重实时荧光PCR 川贝母 混伪品
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一种鉴定西红花和红花源性成分的实时荧光PCR方法 被引量:4
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作者 张全芳 刘艳艳 +5 位作者 谭晴晴 姜欣欣 陈雪燕 葛付存 步迅 张永清 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第23期4575-4581,共7页
该研究根据GenBank中的ITS2序列设计引物,基于SYBRGreen荧光PCR技术建立了一种能快速、灵敏和特异的鉴别西红花和红花源性的实时荧光定量PCR检测体系。与中草药DNA条形码技术相比,该方法检测时间短、特异性强、灵敏度高。利用该方法检... 该研究根据GenBank中的ITS2序列设计引物,基于SYBRGreen荧光PCR技术建立了一种能快速、灵敏和特异的鉴别西红花和红花源性的实时荧光定量PCR检测体系。与中草药DNA条形码技术相比,该方法检测时间短、特异性强、灵敏度高。利用该方法检测15份样品,其中4份为红花,8份样品为西红花,3份为其他源性,与中草药DNA条形码检测结果一致。该方法为药材中西红花与红花源性的快速鉴定奠定了基础。 展开更多
关键词 sYBRGreen实时荧光定量PCR 西红花 红花 源性鉴定
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Cellular Tolerance, Accumulation and Distribution of Cadmium in Leaves of Hyperaccumulator Picris divaricata 被引量:2
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作者 HU Peng-Jie GAN Yuan-Yuan +4 位作者 TANG Ye-Tao zhang quan-fang JIANG Dan YAO Nan QIU Rong-Liang 《Pedosphere》 SCIE CAS CSCD 2012年第4期497-507,共11页
Knowledge of cellular metal homeostasis will provide a better understanding of the mechanisms involved in metal tolerance and hyperaccumulation in metal-hyperaccumulating plants. Energy dispersive X-ray spectrometry ... Knowledge of cellular metal homeostasis will provide a better understanding of the mechanisms involved in metal tolerance and hyperaccumulation in metal-hyperaccumulating plants. Energy dispersive X-ray spectrometry (EDS) was used to determine the localization of cadmium (Cd) in leaves of the Zn/Cd hyperaccumulator Picris divaricata which had a shoot Cd concentration of 565 mg kg-1 after 2 weeks of growth in solution culture supplying 10μ tmol L^-1 CdCl2. The results indicated that Cd was distributed mainly in the trichomes, upper and lower epidermis and bundle sheath cells, with a relatively low level of Cd in mesophyll cells. Mesophyll protoplasts isolated from leaves remained viable after 24 h exposure to CdCl2 at a concentration up to 1 mmol L^-1, indicating their high tolerance to Cd. The intracellular Cd was visualized by staining with Leadmium Green dye, a cellular permeable Cd fluorescence probe. The results showed that the majority of protoplasts (〉 82%) did not accumulate Cd, with only a minority (〈 18%) showing Cd accumulation. In the Cd-accumulating protoplasts, Cd accumulation was depressed by the addition of Fe^2+, Mn^2+ and the metabolic inhibitor carbonyl cyanide m-chlorophenylhydrazone (CCCP), but not by Ca^2+ or Zn^2+. Furthermore, the entire process of Cd uptake from external solution into the cytoplasm and subsequent sequestration into vacuoles was successfully recorded by confocal images. These results suggested that reduced cellular Cd accumulation and efficient Cd vacuolar sequestration in mesophyll cells might be responsible for cellular Cd tolerance and distribution in the leaves of P. divaricata. 展开更多
关键词 confocal images fluorescence probe MESOPHYLL PROTOPLAST VACUOLAR
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