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红树老鼠簕内生真菌Aspergillus terreus GXIMD 03158次级代谢产物研究
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作者 安凡 姜悦 +5 位作者 王宇 曹广萍 高程海 刘永宏 易湘茜 白猛 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期41-48,共8页
文章对红树老鼠簕(Acanthus ilicifolius L.)内生真菌Aspergillus terreus GXIMD 03158的抑菌活性次级代谢产物进行研究。采用多种色谱技术对该菌次级代谢产物进行分离纯化,结合核磁氢谱、碳谱和高分辨率质谱数据综合解析鉴定单体化合... 文章对红树老鼠簕(Acanthus ilicifolius L.)内生真菌Aspergillus terreus GXIMD 03158的抑菌活性次级代谢产物进行研究。采用多种色谱技术对该菌次级代谢产物进行分离纯化,结合核磁氢谱、碳谱和高分辨率质谱数据综合解析鉴定单体化合物结构。从A.terreus GXIMD 03158代谢产物中共分离出10个化合物,经鉴定分别为dankasterones A(1),(14α,22E)-14-hydroxyergosta-4,7,22-triene-3,6-dione(2),steresterone B(3),ergosta-4,6,8(14),22-tetraen-3-one(4),herbarulide(5),demethylincisterol A3(6),isochaetochromin B1(7),isochaetochromin B2(8),(E)-7,9-二烯-11-羰基硬脂酸(9)和aspergilfuranone A(10)。并采用微量肉汤稀释法检测所有化合物对白色葡萄球菌(Staphylococcus albus)、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(Methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)和副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)的最低抑菌浓度(minimal inhibitory concentrations,MIC),结果显示化合物6对S.albus、S.aureus和S.epidermidis的MIC分别为3.12、6.25和3.12μg·mL^(−1);化合物9对S.albus和S.aureus的MIC分别为1.56和3.12μg·mL^(−1)。 展开更多
关键词 红树老鼠簕 内生真菌 曲霉属真菌 次级代谢产物 抑菌活性
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红树林固氮微生物及其生态功能研究进展 被引量:1
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作者 董俊德 黄小芳 +3 位作者 龙爱民 王友绍 凌娟 杨清松 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期1-11,共11页
微生物固氮是红树林生态系统中氮素循环的一个关键环节,其产生的新氮源对红树林生态系统的氮素营养供给和初级生产力的提高有着重要意义。本文聚焦红树林固氮微生物的研究历史和现状,综述了红树林固氮微生物的群落结构、固氮速率及其测... 微生物固氮是红树林生态系统中氮素循环的一个关键环节,其产生的新氮源对红树林生态系统的氮素营养供给和初级生产力的提高有着重要意义。本文聚焦红树林固氮微生物的研究历史和现状,综述了红树林固氮微生物的群落结构、固氮速率及其测定方法,探讨了固氮微生物在红树林生态修复中的应用及其对红树林生境的指示作用,阐述了固氮微生物在耦合红树林碳、氮、硫元素循环的重要角色,并展望了红树林固氮微生物的研究前景和新视角。 展开更多
关键词 红树林 微生物固氮 固氮速率 生态修复 环境指示
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哈维弧菌对皱纹盘鲍不同组织内细菌群落结构的影响
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作者 张婷 王瑞旋 +4 位作者 孙敬锋 黄嘉健 林小植 周飞 马细兰 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期56-65,共10页
利用Illumina测序技术研究了皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)消化道、鳃和足部的菌群结构,以及受哈维弧菌(Vibrio harveyi)胁迫后皱纹盘鲍消化道、鳃和足部肌肉菌群的动态变化。在皱纹盘鲍的消化道、鳃以及足部肌肉中检测到9个门的细... 利用Illumina测序技术研究了皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)消化道、鳃和足部的菌群结构,以及受哈维弧菌(Vibrio harveyi)胁迫后皱纹盘鲍消化道、鳃和足部肌肉菌群的动态变化。在皱纹盘鲍的消化道、鳃以及足部肌肉中检测到9个门的细菌,其中变形菌门(Proteobacteria)为优势菌门,在3种组织中的占比分别为30.1%~64.4%、37.45%~70.6%和71.1%~85.9%;拟杆菌门(Bacteroidetes,5.53%~46.09%)、梭杆菌门(Fusobacteria,4.43%~36.80%)及软壁菌门(Tenericutes,0.60%~28.77%)为次优势菌门;其余为放线菌门等5个菌门和一些未知类群。在属水平上,皱纹盘鲍消化道内的优势菌属为支原体属(Mycoplasma,15.85%~34.55%);鳃组织中的优势菌属为假单胞菌属(Pseudomonas,54.81%);足部肌肉中的优势菌属为假单胞菌属(Pseudomonas,44.83%~69.76%)和Curvibacter(21.24%),此外还有Pelomonas等菌属。引入病原哈维弧菌后,随着胁迫时间的延长,皱纹盘鲍消化道内弧菌的数量由7.2×10^(5)cfu·mL^(–1)升高至10.9×10^(5)cfu·mL^(–1);血液内的弧菌数量由2×10^(3)cfu·mL^(–1)升高至4.7×10^(3)cfu·mL^(–1);在受哈维弧菌胁迫48h后足部肌肉中弧菌的数量下降,其余时间点足部肌肉中弧菌的数量均增加。除了受哈维弧菌胁迫24h后消化道的Ace、Chao指数以及受胁迫96h后消化道的Ace指数高于对照组之外,其余时间点鲍消化道、鳃及足部肌肉的Ace、Chao指数均低于对照组。除受哈维弧菌胁迫24h后的鲍消化道、足部肌肉试验组和胁迫96h后的鳃组织试验组中的Shannon指数高于对照组外,其余时间点均低于对照组。引入哈维弧菌后,消化道内拟杆菌门及梭杆菌门的丰度均增加;鳃组织的变形菌门丰度下降,梭杆菌门的丰度增加;足部肌肉的变形菌门丰度增加,拟杆菌门的丰度则下降。在属的水平上,除了个别时间点外,消化道内的假单胞菌属、拟杆菌属(Bacteroides)、中度产丙酸菌属(Propionigenium)的丰度均增加,支原体属丰度则下降;鳃组织中的拟杆菌属、Kordia、中度产丙酸菌属的丰度均增加;足部肌肉中假单胞菌属的丰度也增加。本研究从微生态角度探究常见的病原哈维弧菌对宿主体内菌群组成结构的影响,为进一步研究宿主对病原哈维弧菌的响应机制及弧菌病的防治提供了新思路。 展开更多
关键词 哈维弧菌 皱纹盘鲍 细菌多样性
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海洋假交替单胞菌SM9913中基因岛GIPspSM9913的鉴定和功能研究
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作者 王鹏霞 赵逸 +2 位作者 杜晓飞 王伟权 王晓雪 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期45-53,共9页
海洋细菌由于所处环境的复杂性和多变性,进化出独特的环境适应机制。基因岛通常携带宿主细菌环境适应性有关的基因,在推动细菌环境适应性和基因组多样化中起重要作用。假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas)在各种海洋生境中广泛分布,具有... 海洋细菌由于所处环境的复杂性和多变性,进化出独特的环境适应机制。基因岛通常携带宿主细菌环境适应性有关的基因,在推动细菌环境适应性和基因组多样化中起重要作用。假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas)在各种海洋生境中广泛分布,具有重要的工业应用价值和生态修复潜力。文章以深海沉积物中分离的假交替单胞菌SM9913为研究对象,通过与表层海水中分离的假交替单胞菌TAC125进行比较基因组学分析,发现SM9913基因组上yicC基因内部整合了一个18kb的基因岛,我们命名为GIPsp SM9913。该基因岛编码整合酶、切离酶以及多套限制修饰系统。数据库检索分析发现GIPsp SM9913同源的基因岛在假交替单胞菌、希瓦氏菌(Shewanella)、弧菌(Vibrio)和气单胞菌(Aeromonas)等细菌中广泛存在。定量PCR结果显示,当切离酶表达时,GIPsp SM9913会从基因组上大量切离,产生无基因岛的SM9913突变株。测序分析表明,GIPsp SM9913的切除不会影响整合位点侧翼基因的表达。比较切离突变株与野生菌的运动能力、电转化频率和接合转移效率等,发现GIPsp SM9913可以提高宿主细菌的泳动能力和对外源DNA入侵的抵御能力。 展开更多
关键词 海洋细菌 假交替单胞菌 基因岛 泳动能力 环境适应性
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珠江河网典型横向汊道径潮动力时空差异性分析--以“南沙—南华”横向汊道为例 被引量:1
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作者 邱秀芳 李博 +4 位作者 王博芝 古俊豪 王辑思 苏雅楠 蔡华阳 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期77-90,共14页
横向汊道对维持珠江河网径潮动力格局的稳定发挥着重要作用,研究其径潮动力时空演变过程及规律对粤港澳大湾区的防洪、供水和通航等具有重要意义。本文基于1966—2016年“南沙—南华”横向汊道沿程潮位站的逐日高低潮位数据及马口、三... 横向汊道对维持珠江河网径潮动力格局的稳定发挥着重要作用,研究其径潮动力时空演变过程及规律对粤港澳大湾区的防洪、供水和通航等具有重要意义。本文基于1966—2016年“南沙—南华”横向汊道沿程潮位站的逐日高低潮位数据及马口、三水水文站的日均流量数据,采用双累积曲线方法及T_TIDE潮汐调和分析模型,分析了该横向汊道径潮动力的时空差异性。结果表明:(1)1993年为该横向汊道径潮动力的异变年份,1993年后横向汊道潮波振幅梯度绝对值与余水位梯度多年均值降幅分别为25%和38%;(2)强人类活动干预后该横向汊道径潮动力变化存在时空差异性,1993年后口门南沙站潮动力减弱(M2与K1分潮振幅多年平均降幅分别为0.01m和0.02m),其他站点潮动力增强,潮波衰减效应在中游略有增强,而在上游和下游减弱,且夏季比冬季变化显著;(3)上述时空差异性受自然变化与人类活动的非线性累积影响。口门附近高强度的围垦叠加航道整治工程使得口门快速延伸,导致潮波传播阻力增大,而横向汊道上游高强度的采砂活动使得地形显著下切,导致潮波传播阻力减小;受上游流量与下游海平面季节性变化的叠加影响,横向汊道径潮动力变化在夏季比冬季更为显著。上述横向汊道径潮格局的异变导致其泄洪纳潮功能发生改变,具体表现为洪季泄洪压力减小,枯季纳潮能力增强。上述研究结果可为珠江三角洲水资源的高效开发利用等实际工程问题提供理论支撑。 展开更多
关键词 流量 潮波振幅梯度 余水位梯度 径潮相互作用 强人类活动
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分子鉴定方法研究大亚湾水体弧菌种类变化 被引量:5
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作者 江晓 任春华 +3 位作者 胡超群 罗鹏 陈偿 冯敬宾 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期154-159,共6页
借助分子鉴定方法监测大亚湾水体中弧菌Vibrio种类季节性动态的变化规律。通过增菌培养、菌株分离,在224份海水中共分离出弧菌368株,并用分子生物学辅助生化鉴定方法鉴定弧菌菌株。结果表明,在大亚湾海域水体中鉴定的弧菌种类有溶藻弧菌... 借助分子鉴定方法监测大亚湾水体中弧菌Vibrio种类季节性动态的变化规律。通过增菌培养、菌株分离,在224份海水中共分离出弧菌368株,并用分子生物学辅助生化鉴定方法鉴定弧菌菌株。结果表明,在大亚湾海域水体中鉴定的弧菌种类有溶藻弧菌Vibrio alginolyticus、副溶血弧菌V.parahaemolyticus、哈氏弧菌V.harveyi和创伤弧菌V.vulnificus,没有检测到霍乱弧菌V.cholerae、拟态弧菌V.mimicus、河流弧菌V.fluvialis和霍利斯弧菌V.hollisae。溶藻弧菌和副溶血弧菌为优势菌群,分别占弧菌总数的27.99%和21.74%。 展开更多
关键词 弧菌 分子生物学鉴定 种类组成 大亚湾 季节性分布
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18株南海海洋真菌的初步鉴定及其发酵产物的细胞毒活性和抗菌活性筛选 被引量:4
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作者 张玲 张庆波 +3 位作者 陈玉婵 李浩华 王磊 章卫民 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期47-51,共5页
从南海海洋沉积物中分离得到18株真菌,经内转录间隔区(ITS)序列测定进行初步鉴定;采用3-(4,5-二甲基噻唑-2)-2,5-二苯基四氮唑溴盐(MTT)法对其发酵液及菌丝体的提取物进行体外细胞毒活性和抗菌活性筛选。结果显示,对人乳腺癌细胞株MCF-... 从南海海洋沉积物中分离得到18株真菌,经内转录间隔区(ITS)序列测定进行初步鉴定;采用3-(4,5-二甲基噻唑-2)-2,5-二苯基四氮唑溴盐(MTT)法对其发酵液及菌丝体的提取物进行体外细胞毒活性和抗菌活性筛选。结果显示,对人乳腺癌细胞株MCF-7增殖的抑制率在90%以上的菌株有5株;对金黄色葡萄球菌的抑制率在90%以上的有15株,占分离菌株总数的83.3%;对大肠杆菌和铜绿假单胞菌的抑制率在90%以上的各有2株,其中有1株对以上3种供试细菌都表现出较强的抑制活性,抑制率达90%以上。 展开更多
关键词 海洋真菌 细胞毒 抗菌
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珠江口异养细菌时空分布特征及其调控机制 被引量:6
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作者 李祥付 徐杰 +1 位作者 施震 李瑞环 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期27-36,共10页
河口是海陆相互作用的重要地带,往往呈现出独特的生物地球化学过程,是研究碳循环过程的重要场所。在春季(2015年5月)、夏季(2015年8月)和冬季(2016年1月)分别对珠江口海域异养附生细菌和游离细菌时空分布及其各自高核酸(HNA)、低核酸(L... 河口是海陆相互作用的重要地带,往往呈现出独特的生物地球化学过程,是研究碳循环过程的重要场所。在春季(2015年5月)、夏季(2015年8月)和冬季(2016年1月)分别对珠江口海域异养附生细菌和游离细菌时空分布及其各自高核酸(HNA)、低核酸(LNA)类群的相对贡献进行了调查研究,并对其调控因子进行了相应探讨。结果表明,珠江口异养细菌分布具有明显的时空差异。空间分布上,珠江口异养细菌丰度自河口上游至下游呈递减趋势,主要与上游污水输入以及珠江径流与高盐外海水在河口内的混合有关;在雨季,河口中下游盐度锋面区出现异养细菌丰度和叶绿素a质量浓度的高值区,锋面区使营养物质停留时间增加,促进浮游生物生长。垂直方向上,表层异养细菌丰度略高于底层。时间尺度上,异养细菌总丰度在春季最高(表层均值为2.94±1.23×10~9个×L^(-1),底层为2.81±1.50×10~9个×L^(-1)),夏季次之(表层均值为2.32±0.43×10~9个×L^(-1),底层为1.90±0.50×10~9个×L^(-1)),冬季最低(表层均值为1.06±0.33×10~9个×L^(-1),底层为9.76±3.44×108个×L^(-1))。珠江口海域异养细菌以附生细菌为主,占异养细菌总丰度的16.56%~96.19%,整体分布较稳定,冬季最高(平均78.65%)、夏季(70.32%)与春季相近(68.17%)。附生细菌以代谢活跃的HNA类群为主,游离细菌则主要以LNA类群为主,代谢活性整体相对较低。 展开更多
关键词 珠江口 异养细菌 附生细菌 游离细菌 相关性
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深海来源微生物乙酰酯酶的酶学性质鉴定及拆分制备D-乳酸甲酯 被引量:2
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作者 黄锦龙 张继福 +4 位作者 胡洁莹 关见留 张云 孙爱君 胡云峰 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期38-44,共7页
D-乳酸及其酯是重要的手性药物中间体和手性化工产品。从南海深海芽孢杆菌Bacillus sp.SCSIO15029克隆到一个乙酰酯酶基因bae02030,表达并鉴定该酶Bae02030的酶学性质。该酯酶的最适p H和最适温度分别为8.5和35℃,其对多种有机溶剂和表... D-乳酸及其酯是重要的手性药物中间体和手性化工产品。从南海深海芽孢杆菌Bacillus sp.SCSIO15029克隆到一个乙酰酯酶基因bae02030,表达并鉴定该酶Bae02030的酶学性质。该酯酶的最适p H和最适温度分别为8.5和35℃,其对多种有机溶剂和表面活性剂具有较好的耐受性。乙酰酯酶Bae02030能够通过水解拆分消旋乳酸甲酯来制备光学纯的D-乳酸甲酯。通过对拆分反应进行优化,添加体积分数为60%的正庚烷能够改善乙酰酯酶Bae02030的光学选择性,所制备的D-乳酸甲酯的对映体过量值(e.e.s)超过99%,转化率(c)为56%。深海微生物来源的乙酰酯酶Bae02030作为生物催化剂在工业上制备手性药物中间体具有较好的应用潜力。 展开更多
关键词 深海微生物 乙酰酯酶 生物催化 D-乳酸甲酯 手性拆分
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南海软珊瑚共附生真菌Aspergillus sp.EGF15-0-3苯甲醛类化合物研究 被引量:4
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作者 刘炳新 韦霞 +2 位作者 肖细姬 张琪 张翠仙 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期63-69,共7页
本文研究了具有克服肿瘤耐药活性的软珊瑚共附生真菌Aspergillus sp.EGF 15-0-3苯甲醛类化学成分。采用硅胶柱层析、十八烷基硅烷键合硅胶层析、Sephadex LH-20层析、高效液相色谱(high performance liquid chromatography,HPLC)等多种... 本文研究了具有克服肿瘤耐药活性的软珊瑚共附生真菌Aspergillus sp.EGF 15-0-3苯甲醛类化学成分。采用硅胶柱层析、十八烷基硅烷键合硅胶层析、Sephadex LH-20层析、高效液相色谱(high performance liquid chromatography,HPLC)等多种方法进行分离纯化;通过核磁共振波谱(nuclear magnetic resonance,NMR)、质谱(mass spectrometry,MS)等现代波谱分析及物理常数对照等方法进行结构鉴定;采用MTT法对苯甲醛部位和单体化合物进行克服肿瘤耐药活性研究。从EGF15-0-3的苯甲醛部位共得到9个苯甲醛类化合物,结构依次为flavoglaucin(1)、tetrahydroauroglaucin(2)、isoaspergin(3)、isotetrahydroauro-glaucin(4)、dihydroauroglaucin(5)、isodihydroauroglaucin(6)、2-(1',5'-heptadienyl)-3,6-dihydroxy-5-(3''-methyl-2''-butenyl)benzaldehyde(7)、auro-glaucin(8)和2-(2',3-epoxy-1'-heptenyl)-6-hydroxy-5-(3''methyl-2''-butenyl)benzaldehyde(9)。体外克服肿瘤耐药活性研究表明,苯甲醛类化合物9具有较强的克服肿瘤耐药活性,可能是由于其结构2位烷基侧链与3羟基形成吡喃环所致。 展开更多
关键词 软珊瑚共附生真菌 Aspergillus sp.EGF15-0-3 苯甲醛 克服肿瘤耐药活性
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一株群体感应抑制活性海洋放线菌的筛选与鉴定 被引量:4
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作者 李艳群 陈柔雯 +2 位作者 林宗豪 田新朋 尹浩 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期75-81,共7页
群体感应抑制剂(Quorum Sensing Inhibitors,QSIs)可以通过干扰群体感应(Quorum Sensing,QS)而有效降低病菌的感染性和毒力,并且不会胁迫致病菌使其产生耐药性,是具有前景的抗生素替代品。海洋微生物是新型QSIs的潜在来源。本研究利用... 群体感应抑制剂(Quorum Sensing Inhibitors,QSIs)可以通过干扰群体感应(Quorum Sensing,QS)而有效降低病菌的感染性和毒力,并且不会胁迫致病菌使其产生耐药性,是具有前景的抗生素替代品。海洋微生物是新型QSIs的潜在来源。本研究利用紫色杆菌(Chromobacterium violaceum 026,CV026)模型评价QS抑制活性,在来源于南海中西部和印度洋深海沉积物样品的放线菌中筛选QS抑制活性菌株,并且根据形态学特征和16S rRNA基因序列鉴定活性菌株。通过筛选获得了菌株SCSIO 53717,其提取物在CV026模型中能够显著降低指示菌株的紫色菌素产量,并且在0~1000mg·mL^-1的有效浓度范围内不影响紫色杆菌的生长。菌株SCSIO 53717被鉴定为Kocuria属,是首次报道的具有QS抑制活性的Kocuria属菌株,因而具有进一步深入研究的价值。 展开更多
关键词 群体感应 海洋放线菌 群体感应抑制活性 紫色杆菌CV026 16S rRNA Kocuria属
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Khai 岛和Pathiu 岛珊瑚礁沉积物细菌多样性及细菌粗提物延缓秀丽隐杆线虫衰老活性研究 被引量:4
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作者 韩敏敏 李蜜 +5 位作者 刘昕明 刘永宏 龙超 钟振国 易湘茜 高程海 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期19-29,共11页
在Khai岛和Pathiu岛珊瑚礁生长海域采集2份珊瑚礁沉积物样品,将样品预处理后采用6种分离培养基进行分离培养,获得活性海洋细菌菌株,通过PCR扩增和16s rRNA基因序列测定,分析物种多样性,并构建系统发育树。以模式生物秀丽隐杆线虫为模型... 在Khai岛和Pathiu岛珊瑚礁生长海域采集2份珊瑚礁沉积物样品,将样品预处理后采用6种分离培养基进行分离培养,获得活性海洋细菌菌株,通过PCR扩增和16s rRNA基因序列测定,分析物种多样性,并构建系统发育树。以模式生物秀丽隐杆线虫为模型考察菌株发酵提取物延缓衰老的作用。实验结果表明,从4种样品中分离鉴定出22株细菌,分别属于11目13科14属。16S rRNA基因序列相似性低于98.65%的细菌有2株,疑似为潜在新种。GXIMD014(Vibrio galatheae)和GXIMD112(Kocuria kristinae)的500μg·mL–1细菌粗提物具有延缓线虫衰老的活性,能不同程度的延长线虫寿命,提高线虫产卵量、运动能力、热激损伤能力、抗氧化损伤能力、体内酶活性以及改善虫体表皮形态。Khai岛和Pathiu岛珊瑚礁沉积物细菌具有较高的物种多样性,蕴藏着丰富的微生物资源,且部分细菌菌株具有延缓衰老的生物活性。 展开更多
关键词 珊瑚礁 海洋细菌 物种多样性 延缓衰老活性
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三份南海岛礁珊瑚砂样品中可培养细菌多样性 被引量:1
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作者 李存 崔林青 +2 位作者 杨红强 龙丽娟 田新朋 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期149-158,共10页
岛礁珊瑚砂环境中存在着大量未被培养和利用的微生物资源,微生物多样性研究是了解微生物生态功能、开发和利用微生物资源的基础。文章采用多种寡营养培养基选择性分离南海岛礁珊瑚砂中的可培养细菌,共获得纯培养细菌菌株349株,通过16Sr... 岛礁珊瑚砂环境中存在着大量未被培养和利用的微生物资源,微生物多样性研究是了解微生物生态功能、开发和利用微生物资源的基础。文章采用多种寡营养培养基选择性分离南海岛礁珊瑚砂中的可培养细菌,共获得纯培养细菌菌株349株,通过16SrRNA基因序列分析,发现它们隶属于4门(Actinobacteria、Proteobacteria、Firmicutes和Bacteroidetes)、6纲、26目、43科、73属、134种,可培养细菌的优势类群为放线菌门,占所有分离菌株数量的60%;而且还发现18个16S rRNA基因序列相似性低于97%的潜在新种。本研究使用改良优化的寡营养培养基进行分离,较好地显示出样品中微生物的群落组成,且获得了大量潜在的稀有新物种资源。研究结果表明,岛礁珊瑚砂样品的可培养细菌资源十分丰富、细菌群落所涉及的生态功能完整、潜在新种比例较高,为后期岛礁微生物资源挖掘打下了良好的基础,也为后期开发应用积累了丰富且稀有的菌种资源。 展开更多
关键词 南海岛礁 寡营养培养基 可培养细菌多样性 微生物资源
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广西涠洲岛柳珊瑚共附生真菌多样性及其抑菌活性 被引量:3
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作者 陆春菊 陆玫霖 +3 位作者 刘昕明 刘永宏 高程海 徐新亚 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期45-52,共8页
文章使用4种分离培养基,从10个广西涠洲岛柳珊瑚样本中分离可培养真菌,通过菌落形态观察和内转录间隔区序列系统发育分析,得到涠洲岛柳珊瑚共附生真菌多样性信息,并采用96孔板法测定了真菌发酵液乙酸乙酯提取物的抑菌活性和抗生物被膜... 文章使用4种分离培养基,从10个广西涠洲岛柳珊瑚样本中分离可培养真菌,通过菌落形态观察和内转录间隔区序列系统发育分析,得到涠洲岛柳珊瑚共附生真菌多样性信息,并采用96孔板法测定了真菌发酵液乙酸乙酯提取物的抑菌活性和抗生物被膜形成活性。试验结果表明,从涠洲岛柳珊瑚样本中分离得到191株共附生真菌,鉴定为26个种。这些真菌均属于子囊菌门,分布于6个属:曲霉属(Aspergillus)、青霉属(Penicillium)、链格孢属(Alternaria)、枝孢菌属(Cladosporium)、黑孢霉属(Nigrospora)和Parengyodontium属。曲霉属(Aspergillus)为优势种属,占总菌株种类的69.23%;次优属为枝孢菌属(Cladosporium)。抑菌活性筛选发现有11种真菌至少对一种指示菌有抑制活性,占菌种总数的42.31%;有7种真菌对表皮葡萄球菌生物被膜形成具有抑制活性,半数有效浓度(EC_(50))范围为40.3~155μg·mL^(-1),菌株Penicillium cinnamopurpureum GXIMD00518、Aspergillus carneus GXIMD00519具有抗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌生物被膜形成活性,EC_(50)分别为105.4μg·mL^(-1)和117.4μg·mL^(-1)。 展开更多
关键词 柳珊瑚 海洋来源真菌 生物多样性 抑菌活性 生物被膜
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别样玫瑰变色杆菌(Aliiroseovarius sp.)Z3基因组测序及比较基因组分析 被引量:2
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作者 刘巍 郭海朋 +2 位作者 董鹏生 燕孟琛 张德民 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期52-61,共10页
菌株Z3是一株从凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)肠道样品中分离出的细菌。本研究利用Illumina HiSeq测序平台对其进行了测序,用SOAPdenovo等软件进行基因组组装、系统发育分析、基因预测和功能注释,并与别样玫瑰变色杆菌属(Aliiroseov... 菌株Z3是一株从凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)肠道样品中分离出的细菌。本研究利用Illumina HiSeq测序平台对其进行了测序,用SOAPdenovo等软件进行基因组组装、系统发育分析、基因预测和功能注释,并与别样玫瑰变色杆菌属(Aliiroseovarius)已知的5个种的模式株进行了比较基因组分析。基因组注释结果显示,Z3基因组大小为3525503bp,GC(guanylate and cytidylic acid)含量为59.4%,预测包含3509个编码蛋白基因。通过16S rRNA基因全长序列比对、平均核苷酸一致性(ANI)、DNA-DNA杂交(DDH)和共线性分析发现,菌株Z3与Aliiroseovarius crassostreae CV919-312T的16S rRNA基因全长序列相似度最高,为98.20%,与Aliiroseovarius sediminilitoris DSM 29439T的DDH和ANI值最高,分别为26.80%和84.95%,属于Alliroseovarius属的新种,将其命名为Aliiroseovarius sp.Z3。经比较基因组分析发现,Aliiroseovarius sp.Z3与5个近缘的模式株细菌共享2005个直系同源核心基因簇;Z3拥有的413个独立基因经注释,主要与碳水化合物转运与代谢、氨基酸转运与代谢、复制、重组及修复等功能相关。功能注释发现Z3具有进行完整的反硝化途径的相关基因,其利用的可能是环境中的硝酸盐、亚硝酸盐等。本研究对Z3全基因序列的注释、功能和比较基因组的分析,不仅丰富了Aliiroseovarius属细菌基因组资源,还为深入研究其反硝化特性等提供了基础。 展开更多
关键词 对虾肠道 Aliiroseovarius sp.Z3 系统发育分析 反硝化 比较基因组
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线纹海马肠道菌群结构与功能对迟钝爱德华氏菌(Edwardsiella tarda)感染的响应特征研究
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作者 张乐乐 邹强 +6 位作者 田雅楠 吕春晖 郑诗怡 姜广峻 高龙坤 侯玉平 王凯 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期177-188,共12页
细菌性肠炎对海马养殖业影响巨大,但病原对海马肠道菌群的具体影响尚不清楚。文章利用已分离的病原细菌Edwardsiella tarda YT1和海马细菌性肠炎模型,结合16S rDNA高通量测序技术,探究病原细菌侵染对海马肠道菌群的影响。结果发现,E.ta... 细菌性肠炎对海马养殖业影响巨大,但病原对海马肠道菌群的具体影响尚不清楚。文章利用已分离的病原细菌Edwardsiella tarda YT1和海马细菌性肠炎模型,结合16S rDNA高通量测序技术,探究病原细菌侵染对海马肠道菌群的影响。结果发现,E.tarda侵染改变了海马肠道菌群的结构组成、多样性和丰度,并显著降低了其多样性(p<0.05);显著增加了海马肠道变形菌门(Proteobacteria)的相对丰度(p<0.05),减少了放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)的相对丰度(p<0.05);导致致病菌爱德华氏菌属(Edwardsiella)在属水平的相对丰度极显著增加(p<0.01),而肠道固有菌群嗜冷杆菌属(Psychrobacter)和罗氏菌属(Rothia)极显著减少(p<0.01),以及球菌属(Macrococcus)与动球菌属(Planococcus)显著减少(p<0.05)。研究结果表明,E.tarda能通过改变海马肠道固有优势菌群的相对丰度导致菌群失调。菌群功能变化及其相关性分析表明,E.tarda可能通过显著提高细菌趋化性、鞭毛组装、ABC转运蛋白、磷酸转运酶系统以及脂多糖生物合成途径的活性(p<0.05),抑制肠道核心菌群如嗜冷杆菌属、动球菌属和谷氨酸杆菌属的丰度及其核糖体、RNA降解、核苷酸剪切修复与脂肪酸生物合成途径的活性(p<0.05),导致肠道菌群功能失调,并诱发肠炎。 展开更多
关键词 海马 肠道菌群 肠炎 失调 迟钝爱德华氏菌
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比较基因组学分析弧菌属群体感应通路的分布与进化
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作者 毛颖津 高贝乐 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期28-41,共14页
群体感应是一种细菌细胞间的通讯过程,细菌通过测量细胞外自诱导剂浓度从而感知群体细胞密度变化。群体感应使细菌能够在两种基因表达模式下转换:在低细胞密度时有利于个体发展,而在高细胞密度时则有利于群体发展。目前主要有7种群体感... 群体感应是一种细菌细胞间的通讯过程,细菌通过测量细胞外自诱导剂浓度从而感知群体细胞密度变化。群体感应使细菌能够在两种基因表达模式下转换:在低细胞密度时有利于个体发展,而在高细胞密度时则有利于群体发展。目前主要有7种群体感应通路,分别以oligopeptides、AHL(Acylated Homoserine Lactones)、AI-2(Autoinducer-2)、CAI-1(Cholera Autoinducer-1)、PQS(Pseudomonas Quinolone Signal)、AI-3(Autoinducer-3)以及DSF(Diffusible Signal Factor)作为各群体感应通路的信号分子;其中oligopeptides存在于革兰氏阳性细菌中,其余6种信号分子存在于革兰氏阴性细菌中。弧菌是导致人类感染和水产品污染的主要病原菌,传统的抗生素治疗弧菌感染具有很强的选择压力,导致越来越多耐药弧菌出现。面对愈发严峻的弧菌耐药性问题,目前群体感应淬灭被认为是治疗弧菌感染的重要替代手段之一,因而有必要调查弧菌属细菌不同群体感应通路的分布情况,为针对弧菌的群体感应淬灭剂研发提供重要参考信息。通过比较基因组学分析,发现全基因组测序的46株弧菌存在AHL、AI-2以及CAI-1这3种信号分子通路,其中5株弧菌均含有上述3种信号分子通路,共有30株弧菌只含有AI-2和CAI-1两种信号分子通路;而46株弧菌都不存在PQS、AI-3以及DSF群体感应通路。此外,弧菌群体感应通路的分布与物种进化有关,含有同种群体感应信号分子通路的弧菌,其亲缘关系较近,说明该通路的基因进化自它们的共同祖先。本研究表明开发针对弧菌的群体感应淬灭剂应以AI-2和CAI-1两种信号分子介导的通路作为靶点。 展开更多
关键词 比较基因组学 弧菌 群体感应 信号分子 物种进化 群体感应淬灭剂
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海洋弧菌HN897β-琼脂糖酶基因vas1-1339异源表达及活性分析
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作者 喻飞 金兴坤 +5 位作者 雷天影 曹海航 陈锵辉 阳耀帆 李佳航 赵哲 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期170-176,共7页
海洋弧菌HN897株是一株高产琼脂糖酶的Vibrio astriarenae菌,前期功能缺失实验证明其β-琼脂糖酶基因vas1-1339的缺失可显著降低弧菌HN897株的琼脂水解活性。文章在大肠杆菌中异源表达Vas1-1339基因编码蛋白,分析该基因的表达及蛋白功... 海洋弧菌HN897株是一株高产琼脂糖酶的Vibrio astriarenae菌,前期功能缺失实验证明其β-琼脂糖酶基因vas1-1339的缺失可显著降低弧菌HN897株的琼脂水解活性。文章在大肠杆菌中异源表达Vas1-1339基因编码蛋白,分析该基因的表达及蛋白功能活性。首先,构建含vas1-1339基因开放阅读框全长的表达载体pET28a-1339,利用原核表达技术在大肠杆菌中成功地异源表达了Vas1-1339琼脂糖酶;然后,利用卢戈氏碘液染色分析发现异源表达Vas1-1339琼脂糖酶的大肠杆菌能够高效水解琼脂,且异丙基硫代半乳糖苷(IPTG)最优诱导浓度为10μmol·L^(-1);免疫印迹分析发现胞内基因表达产物羧基端可能存在切割现象,推测Vas1-1339琼脂糖酶存在复杂的成熟过程。对纯化的琼脂糖酶活性分析发现海洋弧菌HN897株β-琼脂糖酶Vas1-1339能够独立发挥琼脂糖降解功能。 展开更多
关键词 β-琼脂糖酶 海洋弧菌 琼脂糖酶解 异源蛋白表达
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