KLOTHO的3个SNP位点分布与几种疾病相关性的研究

目的分析汉族人群Klotho基因3个单核苷酸多态性位点(G-395A,F352V,C370S)与几种疾病的相关性。方法选择无亲戚关系的病人161例及正常健康人55例,提取血白细胞基因组DNA,采用等位基因特异性引物PCR技术检测Klotho基因3个SNP位点的基因型,并用SAS统计软件对所得数据进行分析。结果3个位点存在多态性,均出现2种基因型。G-395A与糖尿病有关(P<0.002);F352V与高血压和冠状动脉硬化性心脏病有关(分别为:P=0.0120和P<0.0001);C370S与冠状动脉硬化性心脏病有关(P<0.0001)。G-395A多态性中的AA基因型可能易患高血压,GG基因型可能对患冠状动脉硬化性心脏病,糖尿病有保护性作用。F352V多态性中的VV和FF可能是高血压和冠状动脉硬化性心脏病的易患基因型,而FV基因型具有保护作用,VV基因型可能易患糖尿病。C370S基因型中,CC和SS是冠状动脉硬化性心脏病易患基因型,而CS基因型具有保护作用。结论该研究发现在中国汉族人群中,启动子区G-395A多态性中的AA基因型易患高血压,GG基因型可能对患冠状动脉硬化性心脏病,糖尿病有保护性作用。对于编码区的F-352V和C370S多态性,杂合子对患冠状动脉硬化性心脏病有保护作用。

ABCA1基因编码区SNP检测及R1587K与血脂和冠心病的关系

目的探讨三磷酸腺苷结合盒转运子A1基因ABCA1 R1587K单核苷酸多态性（SNP）在中国广东汉族人群中的发生情况及该多态性与脂代谢和冠心病易感性的关系。方法选择确诊的冠心病患者112例和同地区正常人108例，以引物引入限制性内切酶分析聚合酶链反应（PIRA-PCR）方法对ABCA1的R1587K多态性进行检测，并进行血脂水平检测。结果全部检测人群中RR型占49．1％，RK型占44．1％，KK型占6．8％。等位基因频率符合Hardy-Weinberg平衡，冠心病及正常人中R携带者HDLc水平均明显高于非携带者（P〈0．01）。在ABCA1的RR、RK和KK3种基因型中，HDI，C水平依次下降（分别1．35±0．29、1．24±0．27、0．77±0．21mmol／L，P〈0.01）。多重回归分析提示，R1587K基因型与HDL-C水平有显著相关（P=0．000）。冠心病患者与正常人等位基因频率、基因型频率差异无显著性（P〉0.05）。K基因型携带者与非携带者患冠心病的风险无显著性差异（OR=0．889，95％CI=0．49～1．61，P〉0.05）。结论ABCA1基因编码区R1587K携带情况与人群血浆HDL-C水平密切相关，K携带者血浆HDL-C水平明显下降，但与冠心病患病风险无明显相关性。

单核苷酸多态性及其检测方法

单核苷酸多态性(SNPs)是指DNA序列上的单个碱基变异,且最少一种等位基因频率在群体中不少于1%,因而不同于其它罕见变异。本文系统综述了单核苷酸多态性的概念、性质及其检测方法。

基因多态性对核因子-κB活化及TNF-α mRNA表达的影响

目的 :探讨肿瘤环死因子α(TNF α)基因组单个核苷酸多态性 (SNP)影响TNF αmRNA转录的信号转导机制。 方法 :选择前期课题已进行SNP基因型测定的脓毒症患者和正常健康人 ,每种SNP基因型各 6例 ,取静脉血分组进行全血培养 ,并用脂多糖 (LPS) (10 μg/L)进行刺激 ,提取白细胞中核蛋白和总RNA ,用EMSA方法测定核因子 κB(NF κB)活化水平 ,用RT PCR方法测定TNF αmRNA表达。 结果 :在LPS作用后具有不同SNP基因型健康人群或脓毒症患者白细胞内NF κB活化及TNF αmRNA表达水平明显不同。 - 86 3A/A可降低NF κB活化 ,并进一步抑制TNF αmRNA的表达。另两种SNP均有促进NF κB活化而随之促进细胞因子表达的作用。 结论 :TNF α基因组SNP对该细胞因子表达及其上游转录因子有一定的影响 ,个体遗传差异在全身性炎症反应综合征 (SIRS)和脓毒症发病机制中具有重要的作用。

利用SNP分型技术鉴别油菜FLC1与FLC3基因的A、C组基因型

甘蓝型油菜是由白菜型油菜(A组基因型)与甘蓝(C组基因型)杂交后自然加倍的异源四倍体芸薹属植物。其中含有A组与C组两种基因型的染色体,而FLC1与FLC3是A、C组中共同拥有的FLC基因。通过序列比对,分别寻找出A、C组基因中FLC1与FLC3基因的特异性SNP位点,并设计了3对SNP特异性引物对。采用特异性引物延伸法,分别对来自白菜型油菜、甘蓝以及甘蓝型油菜的不同材料进行检测。利用这3对特异性SNP引物对,成功地对油菜中A、C组的FLC1与FLC3基因进行了有效的分型,为研究甘蓝型油菜中A、C组来源的FLC1与FLC3表达奠定了基础。

单核苷酸多态性的研究进展

染色体的某个位点上存在单个碱基的变化 ,称为单核苷酸多态性 ,即SNP。SNP是继限制性片段长度多态性和微卫星多态性以后 ,近年来出现的第三代遗传标记 ,广泛用于基因定位、克隆和遗传多样性研究。本文综合介绍了单核苷酸多态性的遗传特性、功能。

96例冠心病介入治疗患者ABCA1基因启动子区-477C/T单核苷酸多态性分析

目的研究ABCA1基因启动子区-477C/T单核苷酸多态性(SNP)与血浆高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)和冠心病的关系。方法用聚合酶链反应、限制性酶切法(PCR-RFLP)检测96例冠心病患者和100例正常人的ABCA1基因启动子区-477位点基因型,比较基因型在冠心病组与正常人组间、冠心病组中不同病变亚组之间分布的差异性及3种基因型与冠心病相关临床指标的关系。结果冠心病组与正常人组比较,3种基因型CC、CT、TT分布频率差异具有显著性。TT基因型、T等位基因在冠心病组中的分布频率明显高于对照组(P<0·05、P<0·01)。冠心病组中,急性冠脉综合征组TT基因型、T等位基因明显高于稳定性心绞痛组(P<0·05、P<0·01),多支病变组TT基因型明显高于单支病变组(P<0·05),TT基因型血浆HDL-C水平明显低于CC基因型(P<0·01)。结论ABCA1基因启动子区-477C/TSNP可显著影响中国冠心病者血浆HDL-C水平,而且与冠心病严重程度相关。

基因多态性影响肿瘤化疗药物疗效或毒性作用的研究进展

所谓基因多态性即基因组序列上单核苷酸的差异,它造成对肿瘤化疗药物的疗效或毒性因人而异。临床研究发现,以化疗药物氟尿嘧啶、伊立替康、铂类药物等为基础的化疗过程中,由于单核苷酸的多态性,患者出现临床疗效或药物毒性作用不同。作者就基因多态与化疗药物的临床疗效或药物毒性作用关系的研究进展作一综述。

单核苷酸多态性及其检测方法

单核苷酸多态性( single nucleotide polymorphism s,SNP)是指一些物种正常个体的基因组DNA中单碱基对位置存在序列的变异(等位基因) ,是最新发展起来的第3代遗传标记,在遗传育种、基因作图、基因定位等方面具有广泛的作用。作者简要介绍了SNP的特点。

纳米金检测单核苷酸多态性的应用进展

单核苷酸多态性(single nucleoride polymorphism,SNP)与疾病发生的关系的重要性日益受到重视,探讨SNP与各种疾病发生的相关性研究已见于大量报道。传统的检测SNP的方法操作复杂,费时费力,假阳性高,新的SNP检测方法不断出现并应用。纳米金法是目前较为成熟的检测技术,文中介绍几种常见的SNP检测方法。

SNPs基因分型技术

介绍了SNP的概念、特点 ,集中讨论了各种技术的原理及优缺点 ,并对目前SNP在遗传图的绘制、疾病防治。

高灌蓝莓CBF基因的单核苷酸多态性分析

本研究以21个高灌蓝莓品种为试材,克隆VcCBF基因,测序后分析其单核苷酸多态性(SNP),共克隆到123个非重复序列,发现120个SNP位点,单核苷酸多态性发生频率为1/695bp,核苷酸多态性值(Pi)为0.01251。在120个SNP位点中,单态突变位点62个;简约信息位点58个,其中双突变55个,三突变3个。对其碱基替换方式进行分析发现,转换91个,颠换26个,转换与颠换的发生比率为3.5∶1。通过单倍型分析发现,21个蓝莓品种的VcCBF基因存在5种单倍型。

单核苷酸多态性作为新一代分子标记的优越性

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是可遗传的变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90%以上,为数众多且分布广泛,遗传稳定,现已成为新一代的分子标记,其相关研究方兴未艾。遂作者将SNP的优越性做了一个多方面的阐述,以期对SNP的认识及以后的深入研究有所帮助。

CNTF基因单核苷酸多态性与运动能力的关联性及与一些生化指标的关系

目的研究睫状神经营养因子基因rs2515362位点在杰出运动员和非运动员中的单核苷酸多态性,并测定运动员的临床生化指标,看它们在rs2515362位点的不同基因型运动员之间有无统计学差异。方法设计针对rs2515362位点的引物合成,然后将它与其它基因的SNP位点一起用Bakeman的GenomeLab SNPstream基因分型系统进行高通量检测。结果得到了121个运动员和232个非运动员rs2515362位点的多态性,经过统计学分析发现rs2515362位点在运动员和非运动员组中的AA、AG和GG三种基因型频率有统计学差异(χ2=13.9805,P=0.0009),A和G两种等位基因频率也有统计学差异(χ2=12.0080,P=0.0005),且AA、AG和GG三种不同基因型的运动员的生化指标Alp、Cr、Ca、TP、GGT、Cl、CO2和Alb也存在统计学差异。结论睫状神经营养因子基因rs2515362位点的单核苷酸多态性与运动能力有关,且不同基因型运动员之间其生化指标Alp、Cr、Ca、TP、GGT、Cl、CO2和Alb也存在统计学差异。

海南黑山羊生长激素(GH)基因单核苷酸多态性分析

利用PCR-SSCP与测序相结合,分析海南黑山羊GH基因第2外显子exon2的多态性,SSCP结果出现3种基因型,分别定义为AA、AB、BB;3种基因型频率分别为28.3%、63.0%、8.7%,A、B等位基因频率分别为59.8%和40.2%,以A等位基因为优势基因,经Hardy-Weinberg平衡卡方适合性检验结果表明,exon2在此群体中处于Hardy-Weinberg不平衡状态(X2=0.000,P<0.01),该位点群体遗传结构及多态指标分析结果显示,该位点表现为中度多态。AA和BB基因型进行测序结果发现,exon2第11位点发生G→C突变,将核苷酸序列翻译成氨基酸序列进行同源性比较,结果exon2第11位G→C突变位点引起编码的氨基酸改变,所编码的氨基酸由原来的精氨酸变为脯氨酸。

单核苷酸多态性的研究进展及其应用

本文系统地介绍了单核苷酸多态性的理论基础、相关研究和最新进展 。

常用单核苷酸多态性数据库简介

对人类最常见遗传变异—单核苷酸多态性的研究对阐明疾病的发病机制,筛选对外界致病因素易感的易感人群等都具有重要意义,而SNP数据库是研究者开展研究时必不可少的重要工具。该文就常用单核苷酸多态性数据库做一简要介绍。

生物质谱作为SNP分型检测方法的研究

利用改良的 Miller法从人血中提取人类基因组 DNA。采用聚合酶链式反应 ( Polymerase chain reac-tion,PCR) ,对含有单核苷酸多态性 ( SNP)点的 DNA片段进行扩增 ,然后用 CIP和 Eox I去除掉 PCR体系中剩余的脱氧核糖核苷三磷酸 ( d NTP)和引物 ,最后用单碱基延伸反应获得 SNP位点处碱基类型。用基质辅助激光解吸电离 -飞行时间质谱 ( MALDI-TOFMS)或电喷雾电离 -四极杆飞行时间质谱 ( ESI-Qq TOFMS)检测延伸产物与未延伸引物间的分子量差异 ,确定该点处碱基。

三磷酸腺苷的电喷雾质谱裂解规律研究

采用电喷雾离子阱质谱仪对正负离子模式下5′-三磷酸腺苷(adenosine 5′-triphosphate,ATP)的各种离子[ATP+H]+、[ATP-nH+(n+1)Na]+(n=0～4)、[ATP-H]-的裂解规律进行了系统研究,并提出可能的裂解过程。实验发现在裂解过程中,ATP脱去γ-磷酸时,不仅是P—O键断裂,还存在三磷酸链上β-P‖O中O先夺去碱基上的氨基或核糖环上的羟基中H、N或O再亲核进攻磷引发结构重排,脱去γ-磷酸得到一系列碎片离子。利用理论计算解释了2种重排途径的可能性与碎片离子的丰度差异。

寡核苷酸-DNA嵌入剂偶联物的合成

对寡核苷酸 - DNA嵌入剂偶联物的化学合成途径进行了归纳总结 ,并对有关的分离、纯化与鉴定方法作简单介绍。 DNA嵌入剂可先引入到用于寡核苷酸合成的核苷酸单体 ,然后再通过 DNA自动合成仪引入到寡核苷酸的预定位点。也可在寡核苷酸合成后解保护之前或之后 ,通过特异的化学反应直接共价偶联到寡核苷酸的预定位点。通过以上两种途径 ,可将 DNA嵌入剂共价偶联到寡核苷酸的 3′末端、5′末端、两端或中间位点。