涠洲岛海水中可培养细菌的溶藻活性初探

目的 选取3种海洋赤潮甲藻为研究对象,从广西涠洲岛海域来源细菌中筛选出高效溶藻的菌株,研究菌株的溶藻效果和初步作用机制,为开展赤潮的防治工作奠定基础。方法 采用细菌发酵液与甲藻共培养来测定菌株的溶藻活性,检测藻细胞中丙二醛和抗氧化相关酶系统的响应规律,分析甲藻胞外溶解性有机物组成,并通过KEGG和CAZy数据库预测目标菌株合成溶藻物质的能力。结果 从24株细菌中筛选到15株对至少一种甲藻表现出溶藻活性的菌株,总阳性率为62.5%,菌株M026对3种甲藻均表现出显著的溶藻效果。添加10%的M026发酵无菌滤液,共培养3 d后,3种甲藻细胞死亡率均高达95.0%。生理生化响应表明,在M026发酵无菌滤液胁迫下,甲藻细胞膜脂过氧化损伤严重,3种抗氧化相关酶(SOD、CAT和APX)活性先增加后下降,且三维荧光光谱检测到藻细胞内溶产物为类富里酸和类蛋白类物质。通过全基因组分析,菌株M026含有溶藻活性的次级代谢产物生物合成基因,及多种降解植物细胞壁的酶。结论 菌株M026可作为微生物溶藻菌剂的候选菌株。

饲料类芽孢杆菌对杉木促生机制的比较转录组学分析

【目的】从分子水平解析杉木内生饲料类芽孢杆菌(Paenibacilluspabuli)被激活后对宿主转录水平的影响,探究饲料类芽孢杆菌对杉木促生的分子机制,为饲料类芽孢杆菌开发利用提供理论依据。【方法】以杉木组培苗为试验材料,设计激活的内生饲料类芽孢杆菌SY0317共培养的杉木组培苗为实验组,未激活内生饲料类芽孢杆菌的杉木组培苗为对照组,对其进行转录组测序分析。【结果】实验组和对照组的转录组数据中共得到2358个差异基因,其中有1580个基因上调,778个基因下调。这些基因主要富集在甘油酯代谢(Glycerolipid metabolism),核黄素代谢(Riboflavin metabolism),色氨酸生物合成(Tryptophan biosynthesis),甘油磷酸酯代谢(Glycerophospholipid metabolism),嘌呤代谢(Purine metabolism)等通路中。【结论】与植物促生有关的关键基因为AGAL2、ASE1、ALDH3F1、IGPS、APS3、UGP3、NPC6、At5g35170、NPC2、ASP2、NMT3、PAP3,其中ASP2基因下调,其余11个基因上调,这些基因参与调控植物生长并起着重要作用。

产灵菌红素沙雷氏菌R18的鉴定及基因组特性

采用形态学、生理生化和分子生物学方法对菌株R18进行菌种鉴定。通过基因组测序和生物信息学比较,进一步分析其分类地位和生物学特性,并在基因组水平上探讨该菌株红色素的合成基因簇和代谢路径。结果表明:菌株R18最佳生长条件为温度30~37℃,pH值6~8,NaCl质量浓度0~10 g·L^(-1);菌株R18与粘质沙雷氏菌模式菌株ATCC 13880的16S rDNA相似度为99.86%,基因组平均核苷酸均一性和数字DNA-DNA杂交值分别为98.73%,89.5%,均高于物种界定阈值,属于同一个物种;菌株R18灵菌红素合成基因簇全长35021 bp,包含29个基因,其中,4个核心合成基因、10个补充的合成基因、1个调控基因、1个转运基因及13个其他基因,具有完整的灵菌红素合成代谢途径。

植物乳杆菌固体发酵对复方中药中有效成分含量的影响

该研究采用植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)BLCC2-0015、BLCC2-0126和BLCC2-0410固体发酵复方中药(黄芪、甘草和益母草等),测定发酵过程中复方中药的pH、微生物数量及总酸、有机酸、粗多糖等有效成分含量的变化,评价其对复方中药有效成分含量的影响。结果表明,植物乳杆菌发酵可降低复方中药的pH值,提高乳杆菌活菌数,抑制大肠杆菌(Escherichia coli)及霉菌的生长,并提高总酸、乳酸、苹果酸、粗多糖、阿魏酸及甘草次酸的含量。其中,植物乳杆菌BLCC2-0410发酵效果最好,发酵72 h时,复方中药的pH为4.32;乳杆菌活菌数为4.53×10^(9)CFU/g,大肠杆菌及霉菌未检出;总酸、乳酸、苹果酸、粗多糖、阿魏酸和甘草次酸含量均显著升高(P<0.05),分别为27.82 g/kg、19.25 g/kg、4.06 g/kg、5.83%、42.00 mg/kg和517.9 mg/kg。

干酪乳杆菌对母婴分离诱导子代抑郁大鼠外周及中枢神经炎症的影响

目的观察干酪乳杆菌对产后进行母婴分离(maternal separation,MS)诱导子代大鼠抑郁样行为的影响,探索益生菌改善抑郁样行为潜在的中枢神经炎症的作用机制。方法采用母婴分离应激方法建立子代抑郁动物模型,并将SD子鼠采用随机数字表法分为对照组(CON组)、母婴分离组(MS组)、母婴分离+干酪乳杆菌组(MS+干酪乳杆菌组),每组8只。其中对照组雌鼠在产后与子鼠不进行母婴分离干预;母婴分离组雌鼠在正常分娩后与子鼠每天分离3 h,连续分离14 d;MS+干酪乳杆菌组的子鼠在MS组基础上给予为期4周的干酪乳杆菌干预,每天按体质量灌胃8×10^(8) CFU/(kg·d)。采用糖水偏好实验(SPT)和强迫游泳实验(FST)评估各组子代大鼠的抑郁样行为,采用ELISA法测定各组子代大鼠血清和海马组织中TNF-α、IL-6、IL-1β、IL-10的水平,采用荧光实时定量PCR法检测各组子代大鼠海马组织中IDO1及5-HT mRNA的表达水平。结果与对照组相比,母婴分离组子代大鼠的糖水偏好百分比明显降低(P<0.05),虽然自发活动实验中穿格次数的减少差异无统计学意义,但强迫游泳实验中的不动时间显著延长(P<0.05),说明母婴分离组子代大鼠产生了明显的抑郁样行为。而干酪乳杆菌显著改善了母婴分离应激引起的子代大鼠的行为学变化,明显提高了糖水偏好百分比(P<0.05),缩短了强迫游泳的不动时间(P<0.05)。与MS组相比,MS+干酪乳杆菌组子代大鼠海马和外周血中IL-6、IL-1β、TNF-α的含量显著降低(P<0.01),IL-10的含量显著增加(P<0.05);子代大鼠海马中IDO1 mRNA的表达显著降低(P<0.01),5-HT mRNA的表达显著升高(P<0.01)。结论母婴分离诱导子代大鼠产生了抑郁样行为,干酪乳杆菌通过调节外周血和海马炎性因子的表达,抑制海马中IDO1的表达、增加海马中5-HT的表达,可改善子代大鼠抑郁样行为。

1株枯草芽胞杆菌的鉴定及其产脂肪酶特性

【目的】对1株产脂肪酶细菌MY016进行鉴定并对其产脂肪酶特性进行研究,为后期规模化发酵生产脂肪酶及其在畜牧业中的实际应用奠定基础。【方法】采用形态学观察、生理生化鉴定、16S rDNA测序分析,对实验室分离保存的1株产脂肪酶细菌MY016进行鉴定;通过菌落和芽胞计数、生长曲线测定,对MY016的生长特性进行分析;通过产脂肪酶量和酶活检测、脂肪酶基因扩增和系统进化分析,对MY016菌株的产脂肪酶特性进行探讨。【结果】产脂肪酶细菌MY016经形态观察、生理生化鉴定和16S rDNA分析,被鉴定为枯草芽胞杆菌。MY016在培养2 h后进入对数生长期,生长迅速;培养10 h其菌液600 nm吸光度最高达到4.7,随后进入稳定期;12 h时活菌数约为5.3×10^(9)CFU/mL;培养22 h后开始二次生长,吸光度最高达5.2;培养46 h后进入衰退期。芽胞观察和计数结果显示,MY016菌株在接种16 h后开始形成芽胞,随着培养时间延长,芽胞形成率逐渐升高,直至72 h完全形成芽胞,芽胞数最高为1.9×10^(9)CFU/mL。产脂肪酶能力检测结果显示,MY016菌株在培养36 h时产酶量达到最大,为246.918 mg/L,然后总酶量逐步降低;48 h时总酶活达到最高,约为281.883 U/L。成功扩增了MY016菌株的脂肪酶基因,并构建系统进化树,结果显示MY016脂肪酶基因与其他芽胞杆菌的脂肪酶基因亲缘关系最近,表明其脂肪酶基因进化保守。【结论】产脂肪酶枯草芽胞杆菌MY016生长迅速、产酶量稳定,总酶活较高,适合后期规模化生产和在畜牧业中推广应用。

旱稻联合固氮菌的分离、鉴定及功能特性

【目的】通过研究旱稻内生固氮菌的生理特性,筛选出具有较强固氮和促生特性的菌株,为生物菌剂的开发提供依据。【方法】采用联合固氮固体培养基培养方法,从成熟期旱稻的根、茎、叶、谷粒中分离内生固氮菌,并进行系统进化分析、形态学鉴定、生理生化鉴定以及促生作用和拮抗禾谷镰刀菌等特性的研究。【结果】获得27株内生固氮菌,涵盖3个门,分别为芽孢杆菌门、变形菌门和放线菌门。其中,芽孢杆菌门的芽孢杆菌属为优势菌。从根中分离的URR05和URR37菌株经革兰氏染色呈紫红色,其余菌株呈紫色。所有菌株均能够利用葡萄糖,属于发酵型细菌,且为嗜温型微生物,最适温度为30~45℃,具有固氮、分泌生长素和1-氨基环丙烷羧酸脱氨酶、产铁载体、溶磷等特性。枯草芽孢杆菌URR64的固氮酶活性和吲哚-3-乙酸的质量浓度最高,分别为253.82 U·L^(-1)和19.19 mg·L^(-1);斯特氏杆菌URS02分泌的1-氨基环丙烷羧酸的质量浓度最高(1031.43 ng·mL^(-1)),且显著高于阳性对照组(褐球固氮菌)。1.03×10^(8)CFU·mL^(-1)的混合联合固氮菌对旱稻幼苗具有显著促生效果,芽孢杆菌属固氮菌对禾谷镰刀菌具有显著的拮抗作用。【结论】旱稻内生固氮菌群较为丰富,且具有多种功能。

宜宾4个品种早茶叶可培养内生细菌的比较分析

为了比较宜宾不同品种早茶叶可培养内生细菌群落结构,以种植面积较广的4个早茶品种为材料,采用传统培养方法,分别从其老叶和嫩叶中分离内生细菌,并经16S rDNA序列分析对其进行鉴定.结果表明,从4个品种早茶叶中共分离到内生细菌336株,归类于18个属23个种.从内生细菌数量和多样性来看,黄芽早>福鼎大白>中茶302>中茶108,且均为嫩叶>老叶.微杆菌属Microbacterium和黄单胞菌属Xanthomonas在4个品种早茶叶中均有分布,且都集中或仅存在于嫩叶,其中Microbacterium为绝对优势菌群.各种早茶老叶和嫩叶还有各自的优势菌属短小杆菌属Curtobacterium等或特异性菌种短小芽胞杆菌B. pumilus、磷酸镰孢菌F. phosphorivorans等.说明不同品种早茶叶内生细菌种类组成有明显的相似性,也存在一定的品种或组织专一性.这些内生细菌及其分布规律可能在较大程度上促成了宜宾早茶的高产优质以及各品种早茶的不同品质特征.

喀斯特洞穴沉积物中可培养固碳和固氮细菌多样性分析

微生物固碳和固氮作用在生物地球化学循环和能量流动中具有重要作用.洞穴黑暗和寡营养极端环境中蕴藏丰富独特的微生物资源.为了解喀斯特洞穴固碳细菌和固氮细菌群落结构组成和多样性,利用9种分离培养基,分离筛选喀斯特洞穴沉积物固碳细菌和固氮细菌,并基于16S rDNA序列测定,分析分离菌株的系统发育和多样性.共分离获得230株固碳细菌,隶属于3门、16属和64种,优势属为假单胞菌属(Pseudomonas)和不动杆菌属(Acinetobacter).固碳细菌Shannon-Wiener多样性指数为3.65,Margalef丰富度指数为11.58,Pielou均匀度指数为0.88.共分离获得425株固氮细菌,分别属于3门、14属和68种,优势属为假单胞菌属、不动杆菌属和贪铜菌属(Cupriavidus).固氮细菌Shannon-Wiener多样性指数为3.43,Margalef丰富度指数为11.07,Pielou均匀度指数为0.81.此外,无碳培养基CFMD和无氮培养基NFb分离获得的菌株多样性最高.以上结果表明,荔波喀斯特洞穴沉积物中存在丰富的固碳和固氮细菌类群,这些结果为进一步研究固碳和固氮微生物在喀斯特洞穴生态系统中的功能以及农业应用提供了菌种资源.

基于深度网络投票的抗血管生成肽识别

血管生成在各种疾病中,尤其是癌症的发病机制中起着关键作用,因此开发更加快速高效的抗血管生成肽(AAPs)智能识别工具尤为重要.基于多种特征工程、深度学习和集成学习构建了一个深度网络投票的识别模型iAAPs-DNV.采用AAindex编码、分组权重编码(EBGW)、K-间隔氨基酸对(KSAAP)、基于物理化学性质的二阶移动平均(SOMA)和BLOSUM62编码提取氨基酸序列的特征信息.利用软投票策略集成加入了注意力机制(attention)的双向长短期记忆网络(BiLSTM)和卷积神经网络(CNN),并通过全连接层输出识别结果.iAAPs-DNV模型在Main数据集和NT15数据集上的识别精度明显优于已有的识别模型,表明该模型能够高效准确地识别抗血管生成肽.

基于孟德尔随机化探讨肠道菌群与过敏性鼻炎的因果关联

目的通过孟德尔随机化分析肠道菌群和过敏性鼻炎之间的因果关联。方法从MiBioGen数据库下载人类肠道菌群数据集,保留196个已知菌群(9个门、16个纲、20个目、32个科和119个属)作为暴露因素,筛选出与暴露因素强相关且相互独立的单核苷酸多态性作为有效工具变量。从全基因组关联研究数据库下载包含5527例患者和212387例对照的过敏性鼻炎数据集(finn-b-ALLERG_RHINITIS)作为结局变量。分别使用逆方差加权、加权中位数、MR-Egger、加权模式和简单模式进行两样本孟德尔随机化分析,以优势比(OR)评估肠道菌群与过敏性鼻炎的因果关联。同时利用留一法进行敏感性分析,以MR-Egger截距测试和MR-PRESSO全局检验检测水平多效性,Cochran's Q检测异质性。结果逆方差加权分析结果显示食物谷菌科(OR=1.111,95%CI:[1.004,1.230],P=0.042)和瘤胃球菌属gauvreauii群(OR=1.263,95%CI:[1.044,1.528],P=0.016)与过敏性鼻炎存在显著正相关关系;瘤胃球菌属UCG-010(OR=0.775,95%CI:[0.605,0.993],P=0.044)、罕见小球菌属(OR=0.735,95%CI:[0.595,0.909],P=0.004)、伯克氏菌目(OR=0.764,95%CI:[0.606,0.963],P=0.023)和放线菌门(OR=0.798,95%CI:[0.657,0.970],P=0.024)与过敏性鼻炎存在显著负相关关系。此外,留一法敏感性分析结果稳定,MR-Egger截距测试和MR-PRESSO全局检验无水平多效性,Cochran's Q检验显示不存在异质性。结论肠道菌群和过敏性鼻炎之间存在因果关系,食物谷菌科和瘤胃球菌属gauvreauii群可增加过敏性鼻炎发病风险,瘤胃球菌属UCG-010、罕见小球菌属、伯克氏菌目和放线菌门能降低过敏性鼻炎发病风险。

光合细菌代谢与其在医药领域的应用

光合细菌代谢途径多样,能够产生多种生理活性物质,具有固碳、固氮、产氢等功能,目前已广泛应用于能源、环境、食品和养殖等领域。近些年,有关光合细菌代谢产物免疫调节功能的研究逐渐增多,其在医药领域应用已成为业内热点。本文概述了光合细菌的主要代谢能力,总结了光合细菌代谢产生具有营养药用价值的多元产物类型,并对光合细菌在制药领域进行的基础理论研究和实际应用进展进行了综述,以期为光合细菌在医药领域的进一步应用提供参考。

石板菜内生固氮菌分离鉴定及促生特性

[目的]本研究旨在从石板菜(Sedum emarginatum)中分离和鉴定内生固氮菌,并探究其促生特性,以期为生物肥料和绿色生态农业的开发提供新的资源。[方法]以石板菜内生细菌为材料,通过乙炔还原法测定固氮酶活性,利用IS-PCR指纹图谱聚类、16S rRNA基因系统发育分析和理化性质鉴定等方法,对内生固氮菌进行分离和鉴定。此外,通过盆栽测试,评估了分离得到的菌株对玉米幼苗生长的影响。[结果]从石板菜中成功分离出20株内生固氮菌株,这些菌株分属于5个类群,包括Klebsiella pneumoniae subsp.ozaenae、Proteus mirabilis、Providencia rettgeri、Klebsiella quasipneumoniae subsp.quasipneumoniae和Phytobacter diazotrophicus。其中,K.pneumoniae subsp.ozaenae和P.diazotrophicus不仅具有固氮能力,还具备溶磷解钾、产铁载体和产生长素等多种促生特性。盆栽测试显示,JSR1、JSR21能显著促进玉米幼苗生长。JSR21处理的玉米幼苗最长根长较对照提高48.4%,JSR1对玉米幼苗地上部生长的促进作用较对照提高27.2%。[结论]石板菜内生固氮菌种类丰富,还具备多种促生特性。这些菌株在绿色生态农业和生物肥料开发方面具有潜在的应用价值。

异养硝化-好氧反硝化菌ZH7的分离鉴定及脱氮特性研究

从养殖塘底泥中分离筛选出一株具有异养硝化-好氧反硝化功能的菌株ZH7,通过形态观察、生理生化测定和16S rDNA序列将菌株鉴定为不动杆菌属(Acinetbacter sp.)。研究不同环境因素(碳源、碳氮比、温度、pH、摇床转速、NaCl浓度)对菌株生长及脱氮性能的影响,并在最佳条件下,探究菌株在单一氮源和混合氮源中的异养硝化-好氧反硝化性能。结果表明:ZH7可以乙酸钠为碳源,在C/N为12~16、温度30℃、摇床转速180 r/min、pH 7~9的条件下对氨氮(NH_(4)^(+)-N)和硝酸盐氮(NO_(3)^(-)-N)的去除率均可达到95%以上。混合氮源条件下(氨氮和硝酸盐氮),菌株会优先利用氨氮。氮源去除过程符合Compertz模型,菌株对氨氮的最大去除速率明显高于硝酸盐氮和亚硝酸盐氮,R_(m)分别为12.61、7.17和7.23 mg/(L·h)。菌株ZH7具有高效的脱氮能力,可作为生物脱氮候选菌株。

石榴皮提取物对副溶血弧菌的抑制效应与机制研究

研究了二次煎煮的石榴皮提取物(Pomegranate peel aqueous extract,PPAE)对副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)的抑制活性作用及其机理,为防治水产养殖弧菌病提供理论依据。采用二倍稀释法测定石榴皮提取物对副溶血弧菌的最小抑菌浓度(MIC)和最小杀菌浓度(MBC)、电导率仪检测弧菌的相对电导率、分光光度法测定弧菌的核酸泄露及生物膜抑制率、蛋白质电泳检测弧菌的蛋白质合成、扫描电子显微镜观察弧菌的亚显微结构及碘化丙啶(PI)染色分析弧菌细胞膜完整性。结果表明:PPAE对副溶血弧菌具有明显的抑制作用,MIC和MBC分别为1.563 mg·m L^(-1)和3.125 mg·m L^(-1);PPAE能够显著抑制副溶血弧菌生物膜形成(P<0.05);显著增加副溶血弧菌的核酸泄露和电导率(P<0.01),明显抑制副溶血弧菌蛋白合成;明显改变副溶血弧菌亚显微形态,破坏副溶血弧菌细胞膜的完整性。

东帕米尔高原产纤维素酶菌株的分离鉴定

为筛选出具有产纤维素酶能力的菌株,以东帕米尔高原金草滩植物根际土壤为样本,采用刚果红水解圈法初步筛选到了5株菌株,分别命名为:XY-14、XY-38、XY-39、XY-49和XY-65。这5株菌株在CMC-Na培养基上长势良好,菌落均呈现圆形、并产生白色菌丝,最适生长温度为25℃。通过水解圈和滤纸崩解试验,确定XY-38、XY-39、XY-49这3株菌的酶活力较强。经分子鉴定,确定XY-38、XY-39为睾酮丛毛单孢菌(Comamonas testosteroni strain),XY-49为假单孢菌(Pseudomonas sp.strain)。菌株的生长曲线和产酶特性表明,XY-39在第6天时酶活力最大,为9.33 U/mL,XY-49在第5天时酶活力最大,为10.49 U/mL。

不同施磷水平下外生菌根真菌对薄壳山核桃幼苗生长和磷吸收的影响

采用盆栽实验,比较了低磷(0.05 mmol·L^(-1))和正常施磷(0.50 mmol·L^(-1))下接种土生空团菌(Cenococcum geophilum Fries)和豆马勃属菌(Pisolithus sp.)以及未接菌的薄壳山核桃〔Carya illinoinensis(Wangenh.)K.Koch〕幼苗在净光合速率、干质量、营养元素吸收以及土壤酶活性的差异。结果显示:低磷条件下,土生空团菌和豆马勃属菌的幼苗菌根侵染率分别为39.9%和35.5%;正常施磷条件下,这2种真菌的幼苗菌根侵染率分别为41.4%和31.9%。总体上看,缺磷会抑制幼苗光合作用,减少干质量以及叶中全氮、全磷和全钾含量;接菌处理促进了幼苗光合作用,增加了干质量以及根、茎、叶中全氮、全磷和全钾含量。低磷条件下,接种豆马勃属菌对幼苗光合作用和干质量增加的提升效果显著优于接种土生空团菌,接种土生空团菌对幼苗营养元素吸收的提升效果总体优于接种豆马勃属菌。低磷条件下,接菌处理提高了土壤中β-葡萄糖苷酶、N-乙酰-β-葡萄糖苷酶和碱性磷酸酶活性,降低了亮氨酸氨基肽酶活性,且接种豆马勃属菌对土壤酶活性的提升效果优于接种土生空团菌。综合分析认为,外生菌根真菌对薄壳山核桃幼苗在低磷条件下的磷吸收和生长具有明显促进作用,不同菌种对薄壳山核桃幼苗生长和土壤酶活性的影响存在差异,在提高磷利用效率和宿主植株干质量方面表现出不同的优势。

高产苯乳酸菌株选育及发酵豆粕工艺优化

该研究以泡菜为原料,以金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)与大肠杆菌(Escherichia coli)为指示菌,通过溶钙圈法及牛津杯法初筛,苯乳酸产量检测复筛,从泡菜中分离筛选具有抑菌性能的高产苯乳酸菌株,将其应用于发酵豆粕以评估其产苯乳酸性能,并对其进行形态学观察、生理生化实验及分子生物学鉴定。结果表明,共获得8株具有抑菌效果的菌株,其中,菌株R69苯乳酸产量最高,为1.25 mg/mL,添加苯丙酮酸时,该菌株固态发酵豆粕的苯乳酸产量为425.70 mg/kg,该菌株被鉴定为植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)。菌株R69固态发酵豆粕时,添加0.2%蛋白酶、3%糖蜜和0.15%苯丙酮酸可提高苯乳酸含量,苯乳酸含量达到624.49 mg/kg,且可有效抑制大肠杆菌和霉菌的生长。

一株异养硝化菌(Alcaligenessp.XN-1)的筛选分离及降解特性

为提高含盐废水的生物脱氮效率,从工业废水污泥中分离筛选出1株异养硝化细菌。对所分离的菌株进行形态学观察、革兰氏染色和分子生物学鉴定,16S rRNA基因测序结果在Blast数据库中进行同源性分析并构建系统发育树,同时研究菌株在不同碳源、C/N、pH、温度和盐含量条件下的脱氮特性。结果表明:筛选得到的菌株鉴定为产碱杆菌属(Alcaligenes sp.),命名为XN-1;菌株XN-1在碳源为乙酸钠时具有最大的NH_(4)^(+)-N去除率和细胞生长量,其氨氮去除率和细胞生长量分别为100%和0.42;在C/N 15~20、pH 7~10、温度30~35℃、盐含量0~4%条件下异养硝化效果最佳,氨氮去除率均为100%。菌株XN-1具有较高的异养硝化能力,在含盐废水脱氮处理中具有很大的应用潜力。

新根瘤菌属模式菌株全基因组序列比较分析

新根瘤菌属(Neorhizobium)隶属于根瘤菌科(Rhizobiaceae),目前有效发布了8个种。为了探究该属下不同模式菌株的全基因组分子机理和遗传特征,本文采用Prodigal等软件对这8个模式菌株的全基因组序列进行基因预测、功能注释和系统发育分析,并在此基础上进行了基因组比较分析。基因组预测结果显示,这8个模式菌株的CDS(Coding Sequences)数量为4471~6669个,GC含量在60.0%至61.6%之间,rRNA数量为3至9个,tRNA数量为43至51个。通过比较基因组分析发现,所有菌株共享的直系同源基因簇有2563个,独立拥有的基因簇数量少。通过平均核苷酸一致性(ANI)、数字DNA-DNA杂交(dDDH)和系统发育树的分析,发现菌株CCBAU 05176^(T)和菌株T17_20^(T)具有最高的同源性,而菌株T786^(T)和NTR19^(T)的遗传距离最远。COG(Cluster of Orthologous Groups of Proteins)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)分类的比较分析显示,注释的基因功能整体差异较小,但在SL-1T中,异种生物的生物降解和代谢的注释比例和数量明显高于其他模式菌株。本研究为新根瘤菌属的系统分类以及在生态系统中的应用奠定了理论基础。