2020-2021年某院耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌分布特点及耐药性分析

【目的】探讨2020-2021年某院耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌(CRE)的分布特点及耐药性。【方法】收集2020年1月至2021年12月在榆林市第一医院住院患者的非重复送检标本,分离出肠杆菌科细菌1815株。培养后分离鉴定病原菌,采用K-B纸片扩散法行CRE药物敏感性检测。【结果】1815株肠杆菌科细菌中检出CRE菌株106株,检出率为5.84%,以肺炎克雷伯菌(63.21%,67/106)、大肠埃希菌(11.32%,12/106)和阴沟肠杆菌(10.38%,11/106)为主。CRE标本主要来源为痰液(62.26%,66/106)、尿液(11.32%,12/106)、血液(7.55%,8/106)。CRE菌株主要来自重症监护室(41.51%,44/106)、神经外科(16.04%,17/106)、呼吸内科(14.15%,15/106)。CRE菌株对四环素、阿米卡星耐药率较低,分别为23.58%和41.51%,对其余抗菌药物耐药率均>50%。【结论】医院CRE菌株分布以肺炎克雷伯菌、大肠埃希菌、阴沟肠杆菌为主,其对多种常用抗生素具有高耐药性,临床治疗CRE可首选四环素。

上海地区单采血小板阳性细菌筛查结果评估

目的对上海市血液中心检测的405392袋单采血小板细菌结果进行回顾性分析,评估上海地区单采血小板细菌污染发生及控制情况,为制定细菌污染检测策略和预防措施提供依据。方法2017年1月—2023年12月,上海市血液中心将采集至少间隔24 h的单采血小板从母袋中取样至留样袋,并接种于需氧培养瓶内,使用自动化微生物培养系统进行细菌筛查,统计分析阳性细菌数据。结果2017年1月—2023年12月使用3种培养系统共检测到423例初始阳性标本,通过统计分析,初始阳性率为10.43×10^(-4)、确认阳性率为1.95×10^(-4)、不确定阳性率为1.33×10^(-4)、不一致阳性率为0.12×10^(-4)、取样污染引起的假阳性率为0.32×10^(-4)、仪器误报引起的假阳性率为6.71×10^(-4),3种培养系统组间差异无统计学意义(P>0.05)。经过MALDITOF MS质谱共检测出32种,151株细菌。其中确认阳性结果中表皮葡萄球菌、头葡萄球菌、人葡萄球菌所占比例较高;在不确定结果中短芽孢杆菌、表皮葡萄球菌、头状葡萄球菌所占比例较高;在不一致阳性结果中主要是解淀粉芽孢杆菌、星座链球菌、自溶菌、坚韧类芽孢杆菌;在假阳性(取样污染)结果中短芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、莫哈维芽孢杆菌、人葡萄球菌所占比例较高。确认阳性结果中初始报阳时间在12 h内被检出的细菌主要是蜡样芽胞杆菌、加氏乳球菌、地衣芽孢杆菌;在(12~24)h内被检出的细菌主要是表皮葡萄球菌、泛血败菌属、停乳链球菌。确认阳性细菌中,皮肤条件致病菌组的数量明显高于环境条件致病菌和常见致病菌组,差异有统计学意义(P>0.05)。结论通过使用自动化微生物培养系统对单采血小板进行细菌筛查,能有效地控制细菌污染的发生,保障单采血小板制品输注安全,同时本研究也可为献血者皮肤消毒流程优化及有效性评估措施的标准或规程提供参考依据。

2023年北京某医院呼吸道感染的流行病学分析

目的分析2023年我院呼吸道感染的流行病学特征及血清学指标变化,为呼吸道感染疾病的诊断和治疗提供依据。方法选取2023年1月至2023年12月就诊于北京佑安医院的483例呼吸道病原体IgM阳性者为研究对象,采用间接免疫荧光法检测血清中的肺炎支原体(MP)、肺炎衣原体(CP)、甲型流感病毒(INFA)、副流感病毒(PIV)、呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒(ADV)、柯萨奇病毒(COX)、嗜肺军团菌(LP)、乙型流感病毒(INFB)9种病原体免疫球蛋白(Ig)M抗体。采用卡方检验对不同性别、年龄、季节患者的血清呼吸道病原体IgM阳性率进行统计分析,采用Kru’skal-Wallis检验分析不同病原体感染者间的血清学指标。结果(1)483例呼吸道感染患者中,单一病原体IgM阳性者占比为39.3%(190/483),>2种病原体IgM阳性者占比为60.7%(293/483)。单一病原体IgM阳性患者中,位居前3位的依次为INFB(39.5%,75/190)、INFA(24.2%,46/190)及MP(20%,38/190);混合病原体IgM阳性患者中,以2种病原体混合感染为主,占比为61.7%(181/293),其中以病原体INFA+INFB为主,占比43.3%(127/293),其次为MP+INFA+INFB,占比17.4%(51/293)。(2)女性患者血清MP、ADV IgM阳性率高于男性,INFB IgM阳性率低于男性,差异均具有统计学意义(P<0.05)。(3)0~18、19~45、46~59、>60岁4个年龄段患者血清MP、COX病原体IgM阳性率比较,差异均有统计学意义(P均<0.05),其中0~18岁MP、COX阳性率分别高于19~45、46~59、>60岁(P均<0.05),19~45岁MP阳性率高于46~59、>60岁(P均<0.05)。(4)春、夏、秋、冬4个季节血清MP、INFA IgM阳性率比较,差异有统计学意义(P<0.05);其中春季MP阳性率高于秋季(P<0.05),冬季阳性率分明高于夏季、秋季(P均<0.05);INFA阳性率冬季高于夏季(P<0.05)。(5)将483例呼吸道感染者分为MP IgM阳性组、病毒IgM阳性组、混合感染组,3组间eGFR、EOS、PLT比较,差异有统计学意义(P<0.05),其中混合感染组中EOS高于MP IgM阳性组(P<0.05),eGFR、PLT高于病毒IgM阳性组(P均<0.05),肝功能指标在3组间比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论2023年全年以MP、INFA、INFB病原体感染为主,且混合感染多见;女性及年龄小的人群更易感染MP;春季和冬季更易发生MP感染,甲型流感病毒更易发生于冬季;混合感染可能更易引起机体的免疫反应。

2019~2023年某中医院6种多重耐药菌临床分布与耐药性分析

目的了解本院6种多重耐药菌的分布及耐药情况。方法对北京中医药大学东方医院2019年1月至2023年12月分离的菌株进行分析,统计6种临床常见耐药菌的检出情况。结果耐碳青霉烯类大肠埃希菌(CRECO)、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)检出率呈逐步上升趋势;耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKPN)、耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌(CRPA)呈波浪形下降趋势;耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)起伏波动较大;万古霉素耐药肠球菌(VRE)总体检出率较低,变化趋势不大。6种多重耐药菌主要分布于脑病内科、脑病外科、呼吸热病科、急诊科、重症监护、肿瘤科等科室。标本来源中CRKPN、CRPA、CRAB、MRSA均以痰标本为首,CRECO、VRE均以尿标本为首。性别方面,CRKPN、CRPA、CRAB、MRSA男性多于女性,CRECO和VRE则反之;6种耐药菌年龄分布均以60岁以上老年患者为主;季节分布上,CRKPN、CRPA、VRE以冬季占比最高,CRAB以夏季占比最高,CRECO、MRSA则是以秋季占比最高。CRECO、CRKPN、CRAB对多种抗菌药物耐药率均较高。结论应加强对多重耐药菌的监控,延缓细菌耐药发生。

DNA分子标记技术在口腔微生物研究中的应用

传统的微生物培养及鉴定方法,很难全面反映口腔微生物群落的状态及其与宿主之间的关系。近年来,随着分子生物学的发展,某些DNA分子标记技术被广泛应用于口腔微生物领域,为发现新菌种、相关口腔疾病发病机制的探讨及临床病例的快速诊断等方面开辟了新的途径。本文主要对相关DNA分子标记技术的基本原理及在口腔微生物领域的应用现状进行综述,比较各种方法的优势与不足,以期为不同的研究方向提供经验。

胎盘多肽治疗小儿EB病毒感染合并继发性中性粒细胞减少症的疗效及对患儿免疫功能的影响探索

目的探索与分析胎盘多肽治疗小儿EB病毒(Epstein Barr Virus,EBV)感染合并继发性中性粒细胞减少症的疗效及对患儿免疫功能的影响。方法选取2022年4月—2023年7月在贵州省人民医院诊治的81例EB病毒感染合并继发性中性粒细胞减少症患儿作为研究对象,根据随机数表法将所有患儿分为胎盘多肽组(n=41)与对照组(n=40)。对照组给予常规药物治疗,胎盘多肽组在对照组治疗的基础上给予胎盘多肽治疗,两组都治疗观察14 d,判定患儿的治疗效果与免疫功能变化情况。结果胎盘多肽组治疗14 d后的总有效率高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。胎盘多肽组的肝脾增大、发热、咽峡炎、淋巴结肿大等临床症状消失时间短于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。两组治疗14 d后的CD4^(+)T淋巴细胞、CD8^(+)T淋巴细胞相对比例都显著高于治疗前,且胎盘多肽组高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。两组胎盘多肽组治疗14 d期间的恶心、呕吐、腹泻不良反应发生率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论胎盘多肽治疗小儿EB病毒感染合并继发性中性粒细胞减少症能提高治疗效果,促进缓解患儿的临床症状,改善患儿的免疫功能,并不会增加不良反应的发生率。

呼吸道病原体检测方法研究进展

呼吸道感染是严重威胁人类健康的一类重要疾病,严重的感染可导致患者病死率增加,病原学检测结果影响呼吸道感染治疗策略的制定,明确病原体可进行目标治疗,能够提高患者的生存率。快速、简单、灵敏、特异的检测方法对于早期发现病原体、控制病原体传播及有效控制患者感染、改善患者结局至关重要。传统的检测方法主要通过病原体分离培养、抗原或抗体检测来确定病原体,然而这些方法具有复杂耗时或灵敏度低等缺点。

新医科背景下生物安全融入医学微生物学本科实验课程路径研究——以湖南师范大学为例

近年来,生物安全问题尤其是病原微生物的安全问题被社会广泛关注。由于医疗工作面临不同层级的生物安全风险,因此相关工作者必须具备相应的生物安全知识及应急处理能力。医学微生物学是检验专业学生的必修基础课程,实验课程内容以病原微生物为主,由于病原微生物具有一定的不可控性,所以相关操作必须在生物安全实验室内进行。实践中,以往课程以符号知识为教学途径,无法培养学生的安全实验意识及具身体验。因此,湖南师范大学依据相关法律法规条例建设本科教学的生物安全二级(biosafety level 2,BSL-2)实验室,并通过将培养学生生物安全意识、完善实验室生物安全制度、加强实验室生物安全管理以及生物安全考核等融入实验教学的日常工作,提高学生生物安全意识,确保医学微生物学本科实验教学活动安全,实现课程育人的新图景。

亚洲分枝杆菌肺病一例并文献复习

目的:报道1例亚洲分枝杆菌肺病患者临床诊治过程,并结合文献分析该病临床特征、影像特点及预后。方法:以1971年1月至2019年9月为检索时间,分别从PubMed数据库中以“Mycobacterium asiaticum”为检索词检索到27篇相关文献,其中仅有7例为亚洲分枝杆菌肺病患者报道;而以“亚洲分枝杆菌,肺病”为检索词在万方数据库和中国知网数据库中均未检索到相关文献。总结本例患者特征并进行入选患者文献复习。结果:本例亚洲分枝杆菌肺病患者为中老年女性,且合并结构性肺病,以咳嗽、咳痰为主诉,以支气管扩张、空洞为主要影像表现,痰液及肺泡灌洗液抗酸杆菌涂片及快速分枝杆菌培养均为阳性,DNA微阵列芯片法菌种鉴定均为结核分枝杆菌复合群,药物敏感性试验(液体法)提示对利福平、异烟肼、左氧氟沙星、贝达喹啉均耐药,血γ-干扰素释放试验、痰液及肺泡灌洗液TB-RNA和TB-DNA、探针熔解曲线法检测结核分枝杆菌对利福平和异烟肼耐药均为阴性,经肺泡灌洗液多种病原体靶向测序(tNGS)提示为亚洲分枝杆菌而临床确诊。抗非结核分枝杆菌药物治疗8个月后,患者呼吸道症状缓解、病灶好转,痰液及肺泡灌洗液分枝杆菌培养阴转,治疗有效。另7例报道患者中,合并结构性肺病4例,合并肿瘤1例(未启动治疗),5例肺部病灶以结节和空洞形成为主;治疗方案存在差异,其中3例接受1年以上治疗后实现临床治愈,2例临床症状及影像学有好转(包括1例实现细菌学阴转),1例复发。结论:亚洲分枝杆菌肺病相关报道较少,临床表现不典型,易误诊,对抗酸杆菌涂片及分枝杆菌培养阳性且菌种鉴定提示为结核分枝杆菌复合群但TB-RNA和TB-DNA阴性的患者,应注意排除非结核分枝杆菌肺病,tNGS检测有助于临床诊断,值得临床医生重视。

广州市非结核分枝杆菌病流行病学特征分析

目的:分析广州市非结核分枝杆菌(non-tuberculous mycobacteria,NTM)病的一般情况及流行病学特点,为制定和实施有效的预防和管理NTM病提供参考信息。方法:回顾性分析2018年1月1日至2023年12月31日广州市新发NTM病患者2714例,并对各年度NTM病的检出率趋势,以及性别、年龄、菌种/群分布特点进行分析。使用9个连续的年龄段分析了年龄对NTM病的影响,并重点对比青年组(21~40岁)和中老年组(51~70岁)的检出差异;根据感染部位的不同,分成肺内组、肺外组、播散组三组进行分析。结果:广州市6年新发NTM病的检出率呈波动趋势,由2018年的男性构成比41.10%(194例)下降至2023年的38.10%(205例),2018年的女性构成比由58.90%(278例)上升至2023年61.90%(333例),男性所占比例逐年降低,女性所占比例逐年升高。好发年龄段为51~70岁,占总病例的51.62%(1401/2714),青年组(21~40岁)构成比呈下降趋势,由2018年的23.09%(109/472)下降至2023年的16.36%(88/538);中老年组(51~70岁)构成比呈上升趋势,由2018年的48.31%(228/472)上升至2023年的55.76%(300/538)。6年广州市新发NTM病患者2714例,其中肺内组(97.09%,2635/2714)NTM分离菌种前4位分别是:鸟-胞内分枝杆菌复合群(M.avium complex,MAC)(43.42%,1144/2635)、龟-脓肿分枝杆菌复合群(Turtle-M.abscessus complex,MABC)(36.39%,959/2635)、堪萨斯分枝杆菌(8.50%,224/2635)、偶发分枝杆菌(4.10%,108/2635);肺外组(1.69%,46/2714)NTM分离菌种前4位分别是:MABC(34.78%,16/46)、偶发分枝杆菌(21.74%,10/46)、MAC(19.57%,9/46)、海分枝杆菌(15.22%,7/46);播散组(1.22%,33/2714)NTM分离菌种前4位分别是:MAC(42.42%,14/33)、MABC(27.27%,9/33)、堪萨斯分枝杆菌(15.15%,5/33)、偶发分枝杆菌(6.06%,2/33);MAC肺病构成比略上升,由2018年的39.19%(185/472)升至2022年的48.48%(176/363)和2023年的44.61%(240/538);MABC肺病构成比呈下降趋势,由2018年的38.98%(184/472)下降至2023年的30.30%(163/538)。结论:广州市中老年患者对NTM易感,女性多于男性,青年组(21~40岁)构成比呈下降趋势,中老年组(51~70岁)构成比呈上升趋势;NTM肺病菌种以MAC、MABC为主,MABC肺病构成比呈下降趋势。

滁州地区医院感染细菌监测与药敏试验结果分析

目的 分析滁州地区医院感染病原菌分布与耐药特点。方法 通过滁州市第一人民医院、滁州市儿童医院医院感染实时监控系统智能识别并实时上报2022年住院患者医院感染病例1152例次,进行细菌鉴定及药敏试验。结果 1152例次医院感染主要感染类型为下呼吸道感染(44.10%)、泌尿系统感染(18.75%)、血流感染(13.72%);共分离出病原菌1116株,其中革兰阴性菌占52.15%,检出率较高的是鲍曼不动杆菌(6.63%)、肺炎克雷伯菌(6.81%)、大肠埃希菌(7.71%)和铜绿假单胞菌(6.27%);革兰阳性菌占22.22%,检出率较高的是金黄色葡萄球菌(2.51%);真菌占25.63%,主要为假丝酵母(15.59%)。特殊耐药菌产超广谱β-内酰胺酶(ESBL)大肠埃希菌检出率51.16%、ESBL肺炎克雷伯菌检出率21.05%,耐甲氧西林金黄色葡萄球菌检出率28.57%。鲍曼不动杆菌对各种抗菌药物耐药率均超过50%;肺炎克雷伯菌对氨苄西林耐药率最高(100%),对氨苄西林/舒巴坦、头孢唑林、头孢呋辛耐药率均超过60%,对亚胺培南(34.21%)、妥布霉素(31.58%)、左氧氟沙星(10.53%)耐药率降低。大肠埃希菌对氨苄西林耐药率最高(90.70%),对呋喃妥因(4.65%)、亚胺培南(2.33%)、头孢替坦(2.33%)耐药率较低。铜绿假单胞菌对环丙沙星(2.86%)、庆大霉素(2.86%)、妥布霉素(2.86%)和左氧氟沙星(2.86%)耐药率最低。结论滁州地区医院感染细菌构成比主要以鲍曼不动杆菌、大肠埃希菌等为主,细菌耐药率较高。

阿尔茨海默病合并深部感染患者的病原菌分布规律及耐药性特点

目的探讨阿尔茨海默病(AD)合并深部感染住院患者的病原菌分布规律及耐药性特点。方法选取AD合并深部感染患者350例为研究对象,收集患者的痰液(n=244)、尿液(n=83)、血液(n=20)及其它分泌物(n=3)标本350份分离培养得纯菌落,采用全自动微生物鉴定系统对纯菌落进行菌种鉴定;收集164例临床体征表现典型的AD合并肺部感染患者的痰标本进行分离培养得纯菌落,采用全自动微生物鉴定系统对纯菌落进行菌种鉴定,并对该164例患者的基础疾病和死亡情况进行统计;选取AD合并肺部感染排名前5的155株主要菌株进行药物敏感试验;同时收集上述菌株来源患者的肺部影像学资料。结果350份AD合并深部感染患者的标本中培养出病原菌397株,数量最多的细菌是铜绿假单胞菌(23.93%),数量最多的真菌是白念珠菌(5.04%);AD合并肺部感染的患者常常伴有多种基础疾病,伴有糖尿病的患者占比居首位(53.66%),其次是伴有高血压病的患者占比(47.56%);药敏检测结果显示,鲍曼不动杆菌对哌拉西林/他唑巴坦耐药率最高(47.36%),大肠埃希菌对环丙沙星耐药率最高(44.44%),铜绿假单胞菌对庆大霉素耐药率最高(59.25%),金黄色葡萄球菌对头孢吡肟耐药率最高(70.58%),肺炎克雷伯菌对头孢吡肟耐药率最高(38.29%);对AD合并肺部感染患者的常见影像学表现以小叶性肺炎居多,间质性肺炎及肺脓肿情况少见。结论AD合并深部感染患者的病原菌以革兰阴性菌居多,感染部位以肺部感染最高,菌株对环丙沙星、左氧氟沙星、头孢他啶、头孢吡肟及庆大霉素耐药率较高。

应用16S rDNA高通量测序分析孤独症谱系障碍患儿肠道菌群的变化

目的 基于16S rDNA高通量测序分析孤独症谱系障碍(ASD)患儿肠道菌群的变化。方法 收集25例ASD患儿(ASD组)和22例健康儿童(对照组)的新鲜粪便样本,提取两组样本DNA,通过16S rDNA高通量测序和生物信息分析评估两组研究对象肠道菌群的变化情况。结果 在门水平上,两组的优势菌门均为厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、放线菌门、脱硫菌门;在属水平上,ASD组的优势菌属为拟杆菌属、双歧杆菌属、志贺-大肠杆菌属、普氏菌属、链球菌属、克雷伯氏菌属、副拟杆菌属、肠杆菌属、小杆菌属、考拉杆菌属。两组研究对象肠道菌群的α多样性及β多样性无明显差异。ASD组中疣微菌门、疣微菌纲、疣微菌目、阿克曼菌科、阿克曼菌属显著富集。ASD组的婴儿双歧杆菌、长双歧杆菌的相对丰度低于对照组(P<0.05)。结论 与正常儿童相比,ASD患儿存在肠道菌群失调,疣微菌门、阿克曼菌属相对丰度增加,婴儿双歧杆菌、长双歧杆菌相对丰度减少,但目前对于ASD患儿肠道菌群的改变未有统一结论,仍需进一步深入研究。

北京某医院周边地区6种呼吸道病原体流行病学分析

目的了解航天中心医院周边地区疑诊呼吸道感染患者6种常见呼吸道病原体:呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒(ADV)、甲型流感病毒(IFA)、乙型流感病毒(IFB)、鼻病毒(HRV)、肺炎支原体(MP)的流行病学特点,为医院周边地区患者的临床诊治及防控提供依据。方法回顾2023年3月至2023年11月在航天中心就诊的4412例疑诊呼吸道感染患者作为研究对象,运用实时荧光PCR核酸检测技术对鼻咽部标本进行6种常见呼吸道病原体检测,采用SPSS 25.0统计软件进行数据分析。结果4412例疑诊呼吸道感染患者中共检出阳性结果1298例,阳性检出率为29.42%,其中HRV(9.09%)检出率最高,其次是MP(7.16%)。男性与女性检出率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。未成年人(<18岁)疑诊呼吸道感染患者以HRV(20.81%)与MP(16.75%)为主;成年人(≥18岁)的疑诊呼吸道感染患者以IFA(5.71%)、HRV(4.02%)为主。4412例患者中春季以IFA(9.86%)为主,夏季以HRV(8.78%)为主,秋季以MP(20.49%)为主。结论该地区疑诊呼吸道感染患者以HRV和MP感染为主,未成年人以HRV、MP感染为主,成人以IFA和HRV为主。不同季节呼吸道感染的主要病原体不同。

北京某三甲中医院发热门诊患者病原体感染变化趋势分析

目的分析发热门诊患者就诊人数及呼吸道病原体变化趋势,为合理安排发热门诊医疗资源分配提供依据。方法收集并分析北京某三甲中医院2023年1月至2023年12月发热门诊患者相关信息。对就诊人数、年龄分布及感染情况进行描述性分析。结果2023年1月至2023年12月北京某三甲中医院发热门诊共就诊16707人次。其中男性7498人次,女性9209人次。女性患者高于男性患者。20岁以下患者1156人次,21~40岁区间患者8495人次,41~60岁区间患者3801人次,61岁以上患者3255人次。21~40岁患者为主要感染人群。就诊高峰季节为3月;次高峰为11月、12月。甲型流感病毒抗原检测阳性率11%,乙型流感病毒抗原检测阳性率9%。甲型流感病毒核酸检测阳性率24.4%,乙型流感病毒核酸检测阳性率7.8%。肺炎支原体IgM检测阳性率11%。结论北京某三甲中医院发热门诊患者就诊高峰阶段为春季3月、冬季11月、12月。以甲型流感病毒,乙型流感病毒及肺炎支原体为主要感染源,21~40岁患者为主要易感人群。因此应在此时段增加医疗资源分配比重,保护易感人群。

基于16sRNA测序分析亚油酸对小鼠肠道菌群的影响

目的探究亚油酸(LA)对小鼠肠道菌群多样性和结构的影响。方法将7周12只SPF级雄性C57BL/6J小鼠随机分为对照组(CTRL组)和亚油酸组(LA组)。在补充LA饮食前1 d,对LA组撤去正常粮食,禁食一晚,以便LA组小鼠更易接受LA饮食,且于实验记录当天给予LA,随时保持饲料更新,保证小鼠能自由饮食到造模结束。于造模12周后收集小鼠粪便,每2只小鼠粪便进行混合采样,后续进行16sRNA高通量测序分析肠道菌群结构、Alpha多样性、Beta多样性等分析。结果通过16sRNA高通量测序发现,LA干预后肠道菌群的丰富度及多样性受损;主成分分析结果表明,CTRL组与LA组菌群组成相差较多。在门水平中,LA组放线菌门相对丰富度增加(P<0.01);在属水平中,LA组杜氏乳杆菌属相对丰富度下降(P<0.05),双歧杆菌、粪杆菌属和丹毒丝菌属相对丰富度升高(均P<0.01)。结论LA干预后降低小鼠肠道菌群的丰富度与多样性,且调整肠道菌群的结构。LA干预后的肠道菌群中有益菌及致病菌存在差异,为LA的生物活性化合物的疗法和以肠道微生物为靶点的治疗调整提供一定的依据。

基于CRISPR-Cas12a系统的鼠伤寒沙门氏菌可视化检测方法的建立

为了建立一种特异性强、灵敏度高的鼠伤寒沙门氏菌可视化检测方法,试验将聚合酶链式反应(PCR)与成簇的有规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白(clustered regularly interspaced short palindromic repeats-CRISPR-associated, CRISPR-Cas)系统相结合,首先根据鼠伤寒沙门氏菌的spy基因序列3′末端的保守区设计crRNA及靶标序列扩增引物,根据可视化检测原理设计单链DNA(single-stranded DNA, ssDNA)荧光报告探针;然后对靶标序列进行PCR扩增,将扩增产物加入CRISPR-Cas12a系统,在蓝光下通过肉眼观察是否产生绿色荧光实现对靶标的检测;最后进行特异性试验和灵敏度试验。结果表明:建立的方法仅能检测到鼠伤寒沙门氏菌,检测不到除鼠伤寒沙门氏菌外其他血清型的沙门氏菌及大肠杆菌、巴氏杆菌、鸭疫里默氏杆菌,能检测到循环数为14个的PCR产物和0.53 copies/μL的重组质粒,灵敏度优于常规PCR方法和实时荧光定量PCR方法。说明本试验建立的方法可以实现鼠伤寒沙门氏菌的可视化检测,具有特异性强、灵敏度高的特点。

肠道菌群在酒精性肝病中的作用及机制研究进展

酒精性肝病(ALD)是过量饮酒引起的一系列肝脏病变,发病率和病死率位居全球肝病之首。多项研究证明ALD伴随肠道菌群紊乱,肠道菌群及其代谢物如何影响ALD发生、发展逐渐成为研究热点,且新的研究表明肠道微生态制剂对ALD的治疗有积极作用。该文主要总结了酒精对肠道菌群多样性及组成的影响,重点讨论了肠道菌群代谢相关产物胆汁酸、短链脂肪酸和色氨酸以及肠源性细菌相关成分在ALD发病中的分子机制及研究进展,发现了以益生菌为代表的微生物制剂针对ALD有积极作用。这为临床治疗ALD提供新思路,肠道菌群有望成为ALD的诊疗靶点,但肠道菌群复杂且影响因素众多,目前临床研究进展缓慢,研究规模小,需要学者们后续扩大生物学样本量、加强质量控制进一步探索,并明确与ALD有关的特异肠道微生物及相关标志物。

人工阅读DL-Bt64血培养系统不典型生长曲线在筛选血培养假阴性标本中的价值

目的探讨人工阅读DL-Bt64血培养系统不典型生长曲线在鉴别血培养假阴性标本中的临床应用价值。方法将常见的生长曲线分为Ⅰ~Ⅷ型,并以盲种培养法作为判定真阴性和假阴性的“金标准”。选取2180瓶经全自动血培养仪判读为阴性的静脉血培养物标本,通过分析采血量和患者的抗生素应用史,探讨不典型生长曲线及假阴性的形成原因。进一步采用A(抽取培养物,涂片并革兰染色)和B(人工阅读并分析各种不典型生长曲线)两种方法筛查假阴性标本,通过比较两种方法的敏感性、特异性、准确率和阳性预测值,评估方法B的临床应用价值。结果2180瓶培养物中,用“金标准”方法共检出110瓶假阴性标本,其余2070瓶为真阴性标本。99.09%(109/110)的假阴性标本的生长曲线不典型,且97.27%(107/110)的不典型生长曲线与采血量不符合要求或滥用抗生素有关。79.09%的假阴性标本生长曲线延迟抬头,符合Ⅲ型。方法A与“金标准”方法结果完全一致。方法B筛选出140瓶疑似假阴性标本,经“金标准”方法确认,109瓶为假阴性,31瓶为真阴性;其余2040瓶标本经“金标准”方法确认,1瓶为假阴性,2039瓶为真阴性。方法B的敏感性(99.09%)和特异性(99.95%)与方法A相比差异无统计学意义(χ2值分别为0.90和2.01,P>0.05)。方法B的准确率(98.53%)和阳性预测值(77.86%)显著低于方法A(χ2值分别为32.13和54.23,P<0.01)。结论绝大多数假阴性标本的生长曲线不典型,与采样量不符合要求或抗生素滥用有关。通过人工阅读细菌生长曲线,能够高效筛选假阴性标本。

前列腺增生患者手术前后尿液菌群特征与功能

为了阐明前列腺增生患者术前和术后尿液菌群特征,探究差异微生物类群发挥作用的机理,采用宏基因组鸟枪法对健康人群(对照)、前列腺增生患者术前和术后尿液样品进行测序,并利用相关软件进行生物信息学分析.结果表明:尿液微生物多样性呈现出术前组明显低于对照组和术后组;在门水平上,厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)的丰度在对照组和术后组之间无明显差异,但均显著高于术前组;在属水平上,大肠杆菌属(Escherichia)、假单胞菌属(Pseudomonas)、不动杆菌属(Acinetobacter)、志贺氏杆菌属(Shigella)的丰度在对照组和术后组之间无明显差异,但均低于术前组,而链球菌属(Streptococcus)、普氏菌属(Prevotella)的丰度在对照组和术后组之间无明显差异,但均高于术前组.PHI-base数据库功能注释发现,差异菌群的一些弱毒力因子、非影响致病因子、增毒因子、致死因子等丰度呈现出术前组明显高于对照组和术后组,术后这些互作因子的丰度基本恢复到对照组水平;VFBD数据库功能注释发现,毒力因子IV型菌毛、荚膜I、鞭毛、III型分泌系统、大肠杆菌素、肠杆菌素等丰度也呈现出术前组明显高于对照组和术后组,术后这些毒力因子的丰度也能基本恢复到健康水平.以上结果暗示尿路微生物多样性降低、特异微生物类群丰度显著变化可能与患者前列腺增生呈正相关关系,患者尿路差异菌群中一些互作因子和毒力因子的丰度升高可能诱发前列腺增生.