为实现小反刍兽疫病毒(Peste des petits ruminants virus,PPRV)的快速、准确、定量检测,以国内PPRV Clone 9疫苗株N基因为靶位点设计特异性引物及探针,建立了液滴式数字PCR(Droplet digital PCR,ddPCR)方法,并对其特异性、敏感性及重...为实现小反刍兽疫病毒(Peste des petits ruminants virus,PPRV)的快速、准确、定量检测,以国内PPRV Clone 9疫苗株N基因为靶位点设计特异性引物及探针,建立了液滴式数字PCR(Droplet digital PCR,ddPCR)方法,并对其特异性、敏感性及重复性进行评价。将所建立的ddPCR方法与实时荧光定量PCR(Fluorescence quantitative PCR,qPCR)方法的灵敏度进行比较分析并应用于PPRV(Clone 9株)核糖核酸标准物质的定量。结果显示,所建立的ddPCR方法特异性好,仅PPRV检测结果为阳性,其他羊源病毒类生物制品及毒种检测结果均为阴性;敏感性高,基因拷贝数检出限度为4.33拷贝/μL,比qPCR方法的灵敏度(57.3拷贝/μL)高10倍;重复性好,重复性试验的变异系数为1.8%;定量准确,具有一定资质的9家单位各组测量数据组间变异系数小于5%。试验建立的ddPCR方法能够有效地对PPRV核酸进行快速检测,为PPRV的诊断及绝对定量提供了有效方法。展开更多
目的分析微滴式数字PCR(ddPCR)和实时荧光定量PCR(qPCR)检测人巨细胞病毒(HCMV)核酸的结果,比较两种方法的差异性,并评估ddPCR技术的临床有效性和实用性。方法收集306例疑似HCMV感染相关疾病患者血浆标本,采用ddPCR和qPCR两种方法测定...目的分析微滴式数字PCR(ddPCR)和实时荧光定量PCR(qPCR)检测人巨细胞病毒(HCMV)核酸的结果,比较两种方法的差异性,并评估ddPCR技术的临床有效性和实用性。方法收集306例疑似HCMV感染相关疾病患者血浆标本,采用ddPCR和qPCR两种方法测定同一份标本的HCMVDNA载量。结果疑似HCMV感染人群中,基于ddPCR的检测结果,男性和女性的阳性率差异无统计学意义(χ^(2)=1.07,P>0.05);不同年龄段的病例阳性率差异无统计学意义(χ^(2)=0.03,P>0.05);不同疾病类型的样本阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=10.38,P<0.05)。采用ddPCR方法检测的阳性率为46.41%(120/306),采用qPCR方法检测的阳性率为22.86%(70/306),阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=103.80,P<0.05)。受试者工作特征曲线(ROC)分析显示,ddPCR检测的灵敏度为0.96,特异性为0.97,ROC曲线下面积(Area Under Curve,AUC)为0.98。结论采用ddPCR检测HCMVDNA比qPCR具有更好的可定量性,尤其是在低浓度样本检测中更具优势,可以进一步作为临床诊断的直接方法,对现有qPCR检测体系做出有益补充和升级。展开更多
文摘目的分析微滴式数字PCR(ddPCR)和实时荧光定量PCR(qPCR)检测人巨细胞病毒(HCMV)核酸的结果,比较两种方法的差异性,并评估ddPCR技术的临床有效性和实用性。方法收集306例疑似HCMV感染相关疾病患者血浆标本,采用ddPCR和qPCR两种方法测定同一份标本的HCMVDNA载量。结果疑似HCMV感染人群中,基于ddPCR的检测结果,男性和女性的阳性率差异无统计学意义(χ^(2)=1.07,P>0.05);不同年龄段的病例阳性率差异无统计学意义(χ^(2)=0.03,P>0.05);不同疾病类型的样本阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=10.38,P<0.05)。采用ddPCR方法检测的阳性率为46.41%(120/306),采用qPCR方法检测的阳性率为22.86%(70/306),阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=103.80,P<0.05)。受试者工作特征曲线(ROC)分析显示,ddPCR检测的灵敏度为0.96,特异性为0.97,ROC曲线下面积(Area Under Curve,AUC)为0.98。结论采用ddPCR检测HCMVDNA比qPCR具有更好的可定量性,尤其是在低浓度样本检测中更具优势,可以进一步作为临床诊断的直接方法,对现有qPCR检测体系做出有益补充和升级。