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RAD51AP1基因表达在三阴性乳腺癌脑转移中的生物信息分析
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作者 欧丹 蔡钢 陈佳艺 《诊断学理论与实践》 2024年第2期146-154,共9页
目的:采用生物信息分析筛选三阴性乳腺癌脑转移相关差异性表达基因(differentially expressed genes,DEG),并探索影响预后的潜在作用机制。方法:在基因表达数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)检索获得GSE76250(三阴性乳腺癌组织与正... 目的:采用生物信息分析筛选三阴性乳腺癌脑转移相关差异性表达基因(differentially expressed genes,DEG),并探索影响预后的潜在作用机制。方法:在基因表达数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)检索获得GSE76250(三阴性乳腺癌组织与正常乳腺组织)和GSE125989(三阴性乳腺癌脑转移病灶组织与三阴性乳腺癌原发灶组织) 2个数据集,筛选DEG。采用GO(Gene Ontology)分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)分析寻找潜在的三阴性乳腺癌脑转移相关基因。通过癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库中的临床组织样本,验证相关基因表达水平与乳腺癌预后间的关系,并使用KEGG的基因集进行基因富集分析,评估DEG可能参与的信号通路。结果:在GSE125989和GSE76250数据集中共筛选出52个DEG,蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction, PPI)分析提示RAD51AP1为三阴性乳腺癌脑转移的重要相关基因。TCGA数据分析显示,相较于癌旁组织RAD51AP1在乳腺癌组织中高表达;不同分子分型中,基底样型中乳腺癌PAD51AP1高表达。以RAD51AP1在癌组织表达中位数[log2(TPM+1)=3.85],将乳腺癌患者分为高表达和低表达组,生存分析显示,高表达患者的中位生存期差于低表达者[3 873 d比3 945 d,P<0.05,HR=1.40(1.01~1.94)]。通过GO、KEGG、基因富集分析(gene set enrichment analysis, GSEA)发现,RAD51AP1在细胞周期、DNA复制、错配修复等信号通路中有富集明显。基于细胞周期和DNA损伤修复信号通路相关蛋白信息构建PPI,筛选与RAD51AP1直接相互作用的蛋白质,其中增殖细胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)与RAD51AP1的相关性较强(R=0.715,P<0.001)。结论:RAD51AP1在三阴性乳腺癌及其脑转移组织中高表达,可能作为潜在的诊断三阴性乳腺癌及预后不良的生物标志物,且其异常表达介导乳腺癌脑转移进程可能与PCNA相关。 展开更多
关键词 三阴性乳腺癌 脑转移 生物信息学分析 RAD51ap1
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墨兰CsAP1-A基因克隆及表达分析 被引量:2
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作者 周荣 刘嘉超 杨凤玺 《广东农业科学》 CAS 2023年第9期99-107,共9页
【目的】AP1基因在植物的花器官发育和开花调控中发挥重要作用,对墨兰AP1基因进行克隆与表达分析可为研究其在墨兰花发育和开花调控中的作用提供前期基础。【方法】以墨兰品种‘小香’为材料,克隆到1个AP1基因,命名为CsAP1-A。通过生物... 【目的】AP1基因在植物的花器官发育和开花调控中发挥重要作用,对墨兰AP1基因进行克隆与表达分析可为研究其在墨兰花发育和开花调控中的作用提供前期基础。【方法】以墨兰品种‘小香’为材料,克隆到1个AP1基因,命名为CsAP1-A。通过生物信息学分析其基因结构、蛋白结构域和进化关系,利用RTqPCR方法分别检测CsAP1-A在墨兰不同器官、不同花发育阶段和不同花组织部位的表达情况;通过转录组测序分析CsAP1-A在5个不同花型墨兰品种花组织部位的表达情况;通过蛋白互作预测软件分析CsAP1-A与其他蛋白的互作关系。【结果】CsAP1-A基因编码区为744 bp,编码248个氨基酸,含有高度保守的MADS-box和K-box结构域,符合MADS-box转录因子家族特征。CsAP1-A与其他兰科植物AP1蛋白相似性较高,其中与春兰AP1/FUL3(APY18447.1)和蕙兰MADS1(AGE15496.1)的同源性最高。RT-qPCR分析结果表明,CsAP1-A在墨兰不同器官中均有表达,在花中表达量最高,且集中在花芽分化初期(S1)高表达。在不同花型的墨兰品种中,CsAP1-A在WT(普通型)、MPV(重瓣花型)、LaPV(花瓣唇瓣化花型)和NLV(唇瓣萼片化花型)4种花型的合蕊柱中表达量均最高,而在萼片中表达量最低;在合蕊柱异常发育的MPV中,CsAP1-A在合蕊柱的表达量显著提高,而在花瓣蕊柱化的梅瓣花型(GPV)中整体表达量最高,且表达区域从合蕊柱扩展到花瓣。蛋白互作预测CsAP1-A蛋白可与MADS1、MADS6、MADS47、MADS8等10个蛋白存在互作关系。【结论】墨兰CsAP1-A的基因结构、进化关系、时空表达情况和蛋白互作预测可为墨兰花发育的研究提供理论依据,对进一步揭示CsAP1-A基因在墨兰成花过程中的作用奠定基础。 展开更多
关键词 墨兰 Cs ap1-A基因 生物信息学 表达分析 花器官发育
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RAD51AP1在肿瘤进展和耐药中的研究进展
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作者 刘仁旺 李明彪 +2 位作者 胡子轩 宋作庆 陈军 《中国肺癌杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期701-708,共8页
基因组失稳可能导致多种肿瘤的发生发展。同源性重组修复(homologous recombination repair,HRR)是机体维持基因组稳态的重要机制之一。RAD51相关蛋白1(RAD51 associated protein 1,RAD51AP1)在HRR中至关重要,其主要参与D-loop的形成,... 基因组失稳可能导致多种肿瘤的发生发展。同源性重组修复(homologous recombination repair,HRR)是机体维持基因组稳态的重要机制之一。RAD51相关蛋白1(RAD51 associated protein 1,RAD51AP1)在HRR中至关重要,其主要参与D-loop的形成,是维持细胞基因组稳态的重要分子。然而,据文献报道RAD51AP1在多种癌种中显著高表达,并与预后呈负相关,提示其可能具有显著的促癌作用。其促癌作用机制尚不明确,可能与肿瘤干性密切相关。同时,RAD51AP1还在放疗和化疗的耐药中具有重要作用。探索RAD51AP1和其上下游调控机制可能能够找寻逆转肿瘤治疗耐药的新靶点。因此,我们综述了目前关于RAD51AP1在肿瘤中的研究,归纳了其在各种肿瘤中的差异表达及与预后的关系,总结了其促癌作用的潜在机制,分析了其促进耐药相关研究的现状,旨在为后续寻找抑制肿瘤进展和逆转耐药的靶点的研究提供一定的方向。 展开更多
关键词 RAD51ap1 肿瘤干细胞 耐药
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Identification of the E2F1-RAD51AP1 axis as a key factor in MGMT-methylated GBM TMZ resistance
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作者 Junhu Zhou Fei Tong +6 位作者 Jixing Zhao Xiaoteng Cui Yunfei Wang Guangxiu Wang Chunsheng Kang Xiaomin Liu Qixue Wang 《Cancer Biology & Medicine》 SCIE CAS CSCD 2023年第5期385-400,共16页
Objective:Epidermal growth factor receptor variant III(EGFRvIII)is a constitutively-activated mutation of EGFR that contributes to the malignant progression of glioblastoma multiforme(GBM).Temozolomide(TMZ)is a standa... Objective:Epidermal growth factor receptor variant III(EGFRvIII)is a constitutively-activated mutation of EGFR that contributes to the malignant progression of glioblastoma multiforme(GBM).Temozolomide(TMZ)is a standard chemotherapeutic for GBM,but TMZ treatment benefits are compromised by chemoresistance.This study aimed to elucidate the crucial mechanisms leading to EGFRvIII and TMZ resistance.Methods:CRISPR-Cas13a single-cell RNA-seq was performed to thoroughly mine EGFRvIII function in GBM.Western blot,realtime PCR,flow cytometry,and immunofluorescence were used to determine the chemoresistance role of E2F1 and RAD51-associated protein 1(RAD51AP1).Results:Bioinformatic analysis identified E2F1 as the key transcription factor in EGFRvIII-positive living cells.Bulk RNA-seq analysis revealed that E2F1 is a crucial transcription factor under TMZ treatment.Western blot suggested enhanced expression of E2F1 in EGFRvIII-positive and TMZ-treated glioma cells.Knockdown of E2F1 increased sensitivity to TMZ.Venn diagram profiling showed that RAD51AP1 is positively correlated with E2F1,mediates TMZ resistance,and has a potential E2F1 binding site on the promoter.Knockdown of RAD51AP1 enhanced the sensitivity of TMZ;however,overexpression of RAD51AP1 was not sufficient to cause chemotherapy resistance in glioma cells.Furthermore,RAD51AP1 did not impact TMZ sensitivity in GBM cells with high O6-methylguanine-DNA methyltransferase(MGMT)expression.The level of RAD51AP1 expression correlated with the survival rate in MGMT-methylated,but not MGMT-unmethylated TMZ-treated GBM patients.Conclusions:Our results suggest that E2F1 is a key transcription factor in EGFRvIII-positive glioma cells and quickly responds to TMZ treatment.RAD51AP1 was shown to be upregulated by E2F1 for DNA double strand break repair.Targeting RAD51AP1 could facilitate achieving an ideal therapeutic effect in MGMT-methylated GBM cells. 展开更多
关键词 TMZ EGFRVIII E2F1 RAD51ap1 MGMT
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“求同存异”彰显“双新”核心素养——评析“高考”和“AP1”二道情境化试题
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作者 张东升 《中学物理》 2023年第11期49-52,共4页
“双新”的目的是将学生培养成问题的解决者,提高他们运用知识与技能的能力,关注学生在真问题情境中解决真问题的本领.通过评析2021年全国高考理科综合甲卷第24题和2016年美国大学先修课程物理AP1卷2问答题第3题,题目高度相似都是巧设... “双新”的目的是将学生培养成问题的解决者,提高他们运用知识与技能的能力,关注学生在真问题情境中解决真问题的本领.通过评析2021年全国高考理科综合甲卷第24题和2016年美国大学先修课程物理AP1卷2问答题第3题,题目高度相似都是巧设物理情境,解决真实问题,但是问题的角度不一样,通过分析这两题的异同,体会不同的课程标准,在教学内容、育人方式、评价方式上的异同. 展开更多
关键词 高考试题 ap1 定量分析 育人方式 评价方式
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AP1基因转化地被菊品种‘玉人面’的研究 被引量:20
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作者 吕晋慧 吴月亮 +1 位作者 孙磊 张启翔 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第9期128-132,共5页
The flower’s meristematic characteristic gene AP1 was introduced into Chrysanthemum morifolium cv. ‘Yu Ren Mian’ mediated by Agrobacterium tumefaciens.The factors influencing genetic transformation protocol were st... The flower’s meristematic characteristic gene AP1 was introduced into Chrysanthemum morifolium cv. ‘Yu Ren Mian’ mediated by Agrobacterium tumefaciens.The factors influencing genetic transformation protocol were studied.The results showed that the leaf explants precultured for 2~8 hours or not precultured were best for transformation by A. tumefaciens. The suitable concentration of bacterial and the time for infecting was OD_ 600 0.5 for 10 minutes. Leaves were cocultivated with bacterial at 23~25 ℃ for 2 days,then delayed selection for 3 days. Kan^r plant were selected by increased selective press from 5 mg·L ~ -1 G418 to 7.5 mg5L~ -1 G418 followed by 10 mg5L~ -1 G418. The integration of AP1 gene into C. morifolium ‘Yu Ren Mian’ was confirmed by PCR and Southern blotting.Two of transgenic plants bloomed 15 days earlier than untransformed plants. 展开更多
关键词 地被菊 ap1基因 根癌农杆菌 遗传转化
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无抗性选择标记转AP1基因抗病水稻新品系的选育 被引量:9
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作者 于恒秀 刘巧泉 +6 位作者 王玲 赵志鹏 徐丽 黄奔立 龚志云 汤述翥 顾铭洪 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第12期2373-2379,共7页
为获得无任何抗生素抗性基因的抗病转基因水稻新品系,将克隆自甜椒的两亲性蛋白AP1基因与潮霉素抗性选择标记基因(HPT)分别构建位于同一农杆菌双元载体上的两个独立的T-DNA区中,并经农杆菌介导,将其导入江苏省推广的两个粳稻品种广陵香... 为获得无任何抗生素抗性基因的抗病转基因水稻新品系,将克隆自甜椒的两亲性蛋白AP1基因与潮霉素抗性选择标记基因(HPT)分别构建位于同一农杆菌双元载体上的两个独立的T-DNA区中,并经农杆菌介导,将其导入江苏省推广的两个粳稻品种广陵香粳和武香粳9号中,获得了一批转基因水稻植株。PCR和Southern杂交分析表明,AP1基因和HPT基因已同时导入受体基因组中,并从共转化植株的自交后代中筛选到了无HPT基因的转AP1基因水稻植株。结合田间农艺性状考察,选育了多个无抗性选择标记基因的纯合转AP1基因水稻新品系;抗病性鉴定结果表明,转AP1基因水稻对稻白叶枯病的抗性与未转化对照相比有显著提高,部分转基因水稻对纹枯病的抗性与未转化对照相比也有一定程度的提高。 展开更多
关键词 水稻 抗病 ap1基因 无抗性选择标记 白叶枯病 纹枯病
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草莓AP1同源基因的克隆、表达及启动子分析 被引量:10
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作者 邹冬梅 刘月学 +3 位作者 张志宏 李贺 马跃 代红艳 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期1972-1981,共10页
【目的】从草莓(Fragaria×ananassa)中克隆APETALA1(AP1)同源基因,并分析其在不同组织、器官及不同花发育阶段的表达水平,探讨其在草莓植株成花进程中的作用。【方法】根据其它物种AP1同源基因的保守序列设计简并引物,以草莓幼叶... 【目的】从草莓(Fragaria×ananassa)中克隆APETALA1(AP1)同源基因,并分析其在不同组织、器官及不同花发育阶段的表达水平,探讨其在草莓植株成花进程中的作用。【方法】根据其它物种AP1同源基因的保守序列设计简并引物,以草莓幼叶和花芽为试材,克隆得到AP1的基因片段,在此基础上利用RACE的方法分离获得其cDNA全长。利用实时定量RT-PCR分析草莓不同组织、器官及不同花发育阶段中AP1同源基因的表达水平。利用染色体步移的方法分离启动子序列。【结果】从草莓品种‘花姬’中克隆出AP1同源基因的cDNA全长序列,命名为FaAP1;其CDS长度为735 bp,编码245个氨基酸,与玫瑰AP1-1的氨基酸序列同源性最高,达到92%,与拟南芥AtAP1的氨基酸序列同源性为64.00%。FaAP1编码的氨基酸全长序列符合MADS-box基因家族特征,包含MADS-box、I-间插域、K-box域和C-末端几个结构域,是MIKC类型的MADS-box基因家族的成员。实时定量RT-PCR结果表明,在不同组织、不同花器官及不同花发育阶段中FaAP1的表达量存在差异。其启动子除了具有TATA/CAAT-box外还包含一些特异作用元件。【结论】从草莓中分离出的FaAP1基因,在花分生组织形成和花器官发育中有一定的调控作用。 展开更多
关键词 草莓 ap1同源基因 分离 表达 启动子
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花分生组织决定基因AP1转化矮牵牛的研究 被引量:37
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作者 安利忻 刘荣维 +1 位作者 陈章良 李毅 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2001年第1期63-66,共4页
利用RT_PCR方法从拟南芥 (Arabidopsisthaliana (L .)Heynh .)中克隆了花分生组织决定基因 (flower_meristem_identitygene)AP1,进行了全序列测定。测序结果显示 ,所得到的基因与发表的序列仅有一个碱基的差异 ,但并不影响蛋白质的一级... 利用RT_PCR方法从拟南芥 (Arabidopsisthaliana (L .)Heynh .)中克隆了花分生组织决定基因 (flower_meristem_identitygene)AP1,进行了全序列测定。测序结果显示 ,所得到的基因与发表的序列仅有一个碱基的差异 ,但并不影响蛋白质的一级结构。将AP1基因克隆入植物中间载体p2 0 8,通过根癌土壤杆菌 (Agrobacteriumtumefaciens (SmithetTownsend)Conn)介导的方法转化矮牵牛 (PetuniahybridaVilm .)。对转基因植株进行了PCR和Southern检测 ,所得到的两个株系的转基因矮牵牛在R0 代即表现出提前且持续不断地开花的特性 。 展开更多
关键词 拟南芥 花分生组织决定基因 ap1 矮牵牛 基因转化
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芒果AP1同源基因的克隆及其生物信息学分析 被引量:17
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作者 罗聪 何新华 +3 位作者 陈虎 蒋雅琴 高美萍 李杨瑞 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期851-858,共8页
我们采用RT-PCR方法克隆了2个A州同源基因全长cDNA,分别命名为MAPl—1(GenBankac—cession No.FJ529206)和MAPl—2(GenBankaccession No.FJ529207)。MAPl—1编码247个氨基酸,开放阅读框长度为741bp,蛋白质分子量为28.54kD,... 我们采用RT-PCR方法克隆了2个A州同源基因全长cDNA,分别命名为MAPl—1(GenBankac—cession No.FJ529206)和MAPl—2(GenBankaccession No.FJ529207)。MAPl—1编码247个氨基酸,开放阅读框长度为741bp,蛋白质分子量为28.54kD,等电点为8.31;MAPl—2编码248个氨基酸,开放阅读框长度为744bp,蛋白质分子量为28.78kD,等电点为8.70。同源性分析表明,它们的核苷酸序列与其它木本植物A纠同源基因的一致性为72%~81%。实验分析表明,MAPl—1和MAPl—2第1至第61个氨基酸含有一个MADS盒结构域,第88至第178个为K盒结构域;两个基因均定位于细胞核,且功能位点分布存在着不同,推测这两个基因在花器官发育过程中的功能存在差异。蛋白二级结构预测显示,MAPl—1蛋白有12个α-螺旋,4个8折叠区,14个β-转角;而MAP1—2蛋白有11个α-螺旋,5个B折叠区,15个β-转角;其大多数氨基酸具有亲水性。本研究有助于进一步了解芒果的开花分子机理及成花的生物学发育阶段。 展开更多
关键词 芒果 ap1(APETALA1)基因 克隆 生物信息学分析
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Y系山定子AP1同源基因的克隆及序列分析 被引量:6
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作者 王娟 田建保 +4 位作者 杜俊杰 杨廷桢 王骞 孙俊杰 弓桂花 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2014年第5期66-70,共5页
以Y系山定子为试材研究AP1基因,试图为缩短果树童期提供理论依据。根据已登录的苹果AP1基因保守序列设计引物,以Y系山定子的基因组DNA为模板进行PCR扩增,获得1 010 bp的基因片段;PCR产物纯化后,将其连接到pMD18-T载体上,连接产物转化大... 以Y系山定子为试材研究AP1基因,试图为缩短果树童期提供理论依据。根据已登录的苹果AP1基因保守序列设计引物,以Y系山定子的基因组DNA为模板进行PCR扩增,获得1 010 bp的基因片段;PCR产物纯化后,将其连接到pMD18-T载体上,连接产物转化大肠杆菌DH5α菌株感受态细胞,通过蓝白斑筛选、质粒长度和酶切鉴定,获得重组质粒并测序。测序结果表明,该序列有2个外显子、1个内含子及2个内含子的一部分,编码区共编码81个氨基酸;对氨基酸序列保守性分析发现,第13-81个氨基酸为MADS-box基因家族特有的K区域;其氨基酸序列在GenBank中同源性检索表明,Y系山定子与其他植物AP1同源基因的氨基酸序列同源性为67.9%-100%。研究结果为揭示Y系山定子早花现象的分子机制奠定了基础,对果树育种具有重要的理论价值和实际意义。 展开更多
关键词 Y系山定子 ap1(APETALA1)基因 PCR 克隆 序列分析
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牛乳腺炎无乳链球菌PI-2a菌毛岛屿辅助蛋白AP1、BP、AP2三基因的串联表达及其免疫原性研究 被引量:4
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作者 布日额 王金良 +5 位作者 吴金花 锡林高娃 陈金龙 孙立杰 王华 朝洛蒙 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期138-141,共4页
为探究无乳链球菌菌毛岛屿3个亚基AP1、AP2、BP融合蛋白的抗原性,本研究根据该3个亚基基因的主要抗原结构域序列设计并合成引物,通过重叠延伸PCR技术获得上述3个亚基的串联核苷酸片段,并插入pET-30a(+)载体,转化至BL21(DE3)感受态细胞... 为探究无乳链球菌菌毛岛屿3个亚基AP1、AP2、BP融合蛋白的抗原性,本研究根据该3个亚基基因的主要抗原结构域序列设计并合成引物,通过重叠延伸PCR技术获得上述3个亚基的串联核苷酸片段,并插入pET-30a(+)载体,转化至BL21(DE3)感受态细胞后诱导表达,表达蛋白经亲和层析纯化后进行western blot鉴定和小鼠免疫实验。结果表明,AP1-AP2-BP融合抗原具有良好的反应原性和免疫原性。本研究为进一步研究无乳链球菌基于AP1-BP-AP2融合蛋白的致病机制、检测制剂及亚单位疫苗研制提供了实验依据。 展开更多
关键词 无乳链球菌 菌毛岛屿 ap1 BP AP2 串联表达
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芥菜AP1基因体外表达及其与FLC相互作用的验证 被引量:3
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作者 汤青林 许俊强 +1 位作者 宋明 王志敏 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期1328-1333,共6页
芥菜花分生组织决定因子AP1与开花路径核心调节子FLC可能存在直接的相互作用,从而调节开花时间。为进一步检测该相互作用,从芥菜"QJ"材料中同源克隆了790bp的AP1cDNA序列,该基因编码256个氨基酸。生物信息学分析表明,AP1属MIK... 芥菜花分生组织决定因子AP1与开花路径核心调节子FLC可能存在直接的相互作用,从而调节开花时间。为进一步检测该相互作用,从芥菜"QJ"材料中同源克隆了790bp的AP1cDNA序列,该基因编码256个氨基酸。生物信息学分析表明,AP1属MIKC型蛋白,其MADS域含有2个螺旋和2个折叠,第1个螺旋内含有1个不保守氨基酸位点;而K域含有3个螺旋,第1、2个螺旋内各有1个不保守位点,第3个螺旋内具有4个不保守位点。同时构建了原核表达质粒pET43.1a-AP1,转化宿主菌大肠杆菌BL21,以IPTG诱导该融合蛋白体外表达。利用pET43.1a-AP1融合蛋白序列中6×His标签与Ni+结合的特点,结合SDS-PAGE分析,证实了体外表达蛋白AP1能与FLC相互作用并形成复合体,该结果为深入研究AP1与FLC互作机制及花分生组织的分子调控奠定了基础。 展开更多
关键词 芥菜 ap1基因 FLC 蛋白互作
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萼脊兰SeAP1-like基因的克隆与表达载体构建 被引量:4
14
作者 蒋素华 袁秀云 +3 位作者 王洁琼 武振江 张国付 崔波 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2015年第1期105-109,共5页
根据NCBI网站上萼脊兰AP1-like全长基因序列设计引物,采用RT-PCR法从萼脊兰花瓣中扩增Se AP1-like基因,对扩增产物进行克隆和测序。结果表明,获得的萼脊兰Se AP1-like基因为743 bp,编码247个氨基酸。将Se AP1-like基因插入p CAMBIA1304... 根据NCBI网站上萼脊兰AP1-like全长基因序列设计引物,采用RT-PCR法从萼脊兰花瓣中扩增Se AP1-like基因,对扩增产物进行克隆和测序。结果表明,获得的萼脊兰Se AP1-like基因为743 bp,编码247个氨基酸。将Se AP1-like基因插入p CAMBIA1304载体中,经PCR、双酶切鉴定,证实重组表达质粒中含有目的片段,表明成功构建了高效植物表达载体p CAMBIA1304-Se AP1。对Se AP1-like基因的结构域和所表达蛋白质的亲水性进行了分析,并预测了该基因所表达蛋白的二维结构。结果显示,该基因包含MADS-box和K-box保守域,属于MADS-box基因家族,该蛋白分子属于亲水性蛋白。二级结构分析表明,其包含57.49%的α螺旋、6.07%的延伸链、36.44%的不规则折叠。 展开更多
关键词 萼脊兰 SE ap1-like基因 克隆 载体构建
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内含子源性miRNA通过转录因子AP1调节内皮型一氧化氮合酶表达及血管内皮细胞增殖作用 被引量:3
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作者 李玉媚 王辉 +3 位作者 张文宇 陈伟 胡楠 欧和生 《中国动脉硬化杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第7期649-654,共6页
目的前期工作发现,内皮型一氧化氮合酶(eNOS)第4内含子的27碱基重复子产生相应27-nt miRNA,并对eNOS的转录和表达有负反馈调节作用。进一步探讨该内含子源性27-nt miRNA对内皮型一氧化氮合酶基因调节的分子机制及血管内皮细胞增殖相关... 目的前期工作发现,内皮型一氧化氮合酶(eNOS)第4内含子的27碱基重复子产生相应27-nt miRNA,并对eNOS的转录和表达有负反馈调节作用。进一步探讨该内含子源性27-nt miRNA对内皮型一氧化氮合酶基因调节的分子机制及血管内皮细胞增殖相关转录因子AP1的作用机制。方法应用MTT法检测人脐静脉内皮细胞(HUVEC)的增殖抑制率;细胞划痕实验检测HUVEC迁移能力;免疫组织化学方法检测内皮细胞中eNOS和AP1蛋白表达水平;进一步用Western Blot检测27-nt miRNA表达相关情况及细胞核转录因子eNOS表达情况。结果27-nt miRNA对HUVEC增殖具有强烈抑制作用(P<0.05);27-nt miRNA对HUVEC迁移具有显著抑制作用(P<0.05);27-nt miRNA显著降低eNOS和AP1蛋白表达(P<0.05);27-nt miRNA通过负调控AP1降低eNOS蛋白表达(P<0.05)。结论 27-nt miRNA显著抑制eNOS和AP1蛋白表达,AP1在27-nt miRNA对eNOS表达调节中起重要作用。 展开更多
关键词 MIRNA 内皮型一氧化氮合酶 内皮细胞 ap1
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microRNA-21对膀胱癌T24细胞增殖的影响及对VEGF和AP1蛋白的调节 被引量:6
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作者 杨国胜 刘百川 尹智峰 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期365-370,共6页
【目的】研究microRNA-21(miR-21)对膀胱癌T24细胞系中血管内皮生长因子(vascularendothelialgrowthfactor,VEGF)和活化因子蛋白-1(activatorprotein-1,AP1)及mRNA表达的调节作用,探讨miR-21对膀胱癌T24细胞增殖的影响。【方法】用人工... 【目的】研究microRNA-21(miR-21)对膀胱癌T24细胞系中血管内皮生长因子(vascularendothelialgrowthfactor,VEGF)和活化因子蛋白-1(activatorprotein-1,AP1)及mRNA表达的调节作用,探讨miR-21对膀胱癌T24细胞增殖的影响。【方法】用人工合成的miR-21相应的双链互补DNA片段,插入pSilencerTM3.1-H1neo载体表达载体,经测序鉴定后作为microRNA的表达质粒;用脂质体将miR-21高表达质粒转染进T24膀胱癌细胞,经G418筛选获得阳性克隆。用RT-PCR技术和Westernblot方法分别检测该细胞系中VEGF和AP1的mRNA和蛋白表达情况。四甲基偶氮唑蓝(MTT)法检测膀胱癌T24细胞增殖的变化情况。【结果】Westernblot结果显示miR-21能够增加VEGF和AP1蛋白的表达,RT-PCR方法分析显示VEGF和AP1mRNA水平升高。MTT显示转染后细胞的生长速率比未转染的细胞明显加快。【结论】miR-21促进T24膀胱癌细胞增殖,提示可能与VEGF和AP1的低表达有关。 展开更多
关键词 MICRORNA-21 VEGF ap1 T24细胞 膀胱肿瘤
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芍药AP1(APETALA1)基因密码子使用的偏好性分析 被引量:4
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作者 吴彦庆 葛金涛 陶俊 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期610-615,共6页
在前期克隆芍药AP1基因(登录号为KC354376)的基础上,运用CHIPS、CUSP和Codon W在线程序,分析芍药AP1基因的密码子偏好性,并与其他物种的AP1基因以及模式生物的基因组进行比较。结果表明,芍药AP1基因大部分偏好使用以A/T结尾的密码子,29... 在前期克隆芍药AP1基因(登录号为KC354376)的基础上,运用CHIPS、CUSP和Codon W在线程序,分析芍药AP1基因的密码子偏好性,并与其他物种的AP1基因以及模式生物的基因组进行比较。结果表明,芍药AP1基因大部分偏好使用以A/T结尾的密码子,29种偏好密码子(RSCU值>1)中,偏好性较强的有CCA、AGG、TCA、GTT(RSCU值≥2);通过比较12种植物的AP1基因密码子偏好性,发现AP1基因在芒果和梨中的表达水平相对较高,而在芍药和牡丹等植物中的表达水平一般,并且大多偏好以A/T结尾的密码子,这可能与该基因的特殊功能有关;聚类分析结果表明,芍药科中芍药与牡丹聚为一类,梨和碧桃聚为一类;在密码子的使用频率上,芍药AP1基因与酵母基因组的差异小于与大肠杆菌和拟南芥基因组的差异,酵母真核表达更适合作为芍药AP1基因的外源表达系统。本研究结果可为芍药AP1基因在遗传改良中选择合适的受体植物、选择较佳的外源表达系统以及提高该基因的表达水平提供参考依据。 展开更多
关键词 芍药 ap1基因 密码子偏好性
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小黑杨PsnAP1基因转化烟草的研究 被引量:4
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作者 李爽 郑唐春 +1 位作者 臧丽娜 曲冠证 《安徽农业科学》 CAS 2014年第8期2278-2281,2308,共5页
[目的]研究杨树APETALA1基因的功能,为缩短林木育种周期及杨树成花机理的研究提供参考。[方法]以杨树为研究对象,构建植物表达载体,利用农杆菌介导法转化烟草叶盘,并对转基因烟草进行分子水平鉴定。[结果]杨树APETALA1基因已经整合入烟... [目的]研究杨树APETALA1基因的功能,为缩短林木育种周期及杨树成花机理的研究提供参考。[方法]以杨树为研究对象,构建植物表达载体,利用农杆菌介导法转化烟草叶盘,并对转基因烟草进行分子水平鉴定。[结果]杨树APETALA1基因已经整合入烟草基因组中,且转基因烟草比野生型提早开花。[结论]杨树APETALA1基因能促进转基因植株开花,为研究杨树成花机理奠定了基础。 展开更多
关键词 杨树 ap1 烟草 早花
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莲瓣兰大雪素AP1 MADS-box基因的克隆和系统发育分析 被引量:5
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作者 刘涛 普卫琼 +1 位作者 赵银河 于仲艳 《种子》 北大核心 2016年第7期14-17,共4页
随着植物中越来越多的MADS-box基因被克隆出来,人们对经典的ABC模型进行了改进和完善,提出花发育的ABCDE模型,通过RT-PCR和RACE技术从莲瓣兰大雪素花器官中克隆得到AP1同源基因AP1a和AP1b的cDNA全长:AP1a基因全长为1 054bp,其开放阅读框... 随着植物中越来越多的MADS-box基因被克隆出来,人们对经典的ABC模型进行了改进和完善,提出花发育的ABCDE模型,通过RT-PCR和RACE技术从莲瓣兰大雪素花器官中克隆得到AP1同源基因AP1a和AP1b的cDNA全长:AP1a基因全长为1 054bp,其开放阅读框为744bp;AP1b基因全长为944bp,其开放阅读框为516bp。从莲瓣兰大雪素中得到2个AP1同源基因,说明在大雪素中AP1出现基因松弛,所以出现多个拷贝。通过序列比对以及系统发育分析表明,莲瓣兰AP1a基因与春兰具有很高的相似度,达到99.1%,莲瓣兰AP1b基因与萼脊兰具有中等程度的相似度,达75.8%,但从大雪素花器官提取的同源基因AP1a和AP1b的相似度很低,仅为65.4%。这表明AP1基因在不同品种植物间具有保守性,而在同一个物种中又存在着功能的分化。 展开更多
关键词 莲瓣兰大雪素 ap1基因 克隆 系统发育分析
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超声提取对鸡腿菇多糖AP1结构的影响 被引量:1
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作者 李连启 刘娜女 +2 位作者 杜柯 张勤勤 孙润广 《陕西师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期32-36,共5页
对传统热水浸提取和超声辅助提取得到的鸡腿菇多糖AP1和CAP1的结构进行分析比较,研究了超声辅助提取对鸡腿菇多糖AP1结构的影响.结果表明:AP1由甘露糖、葡萄糖和半乳糖组成,CAP1由木糖、甘露糖、葡萄糖和半乳糖组成.红外光谱表明多糖AP... 对传统热水浸提取和超声辅助提取得到的鸡腿菇多糖AP1和CAP1的结构进行分析比较,研究了超声辅助提取对鸡腿菇多糖AP1结构的影响.结果表明:AP1由甘露糖、葡萄糖和半乳糖组成,CAP1由木糖、甘露糖、葡萄糖和半乳糖组成.红外光谱表明多糖AP1和CAP1在4 000~650 cm-1具有多糖类物质的特征吸收峰;不同的是,AP1的红外光谱中在865、764 cm-1处有吸收峰,而CAP1在903、8267、56 cm-1处有吸收峰.原子力显微图中均显示多糖线形并具有分支结构.超声对其影响可能是引起了单糖之间连接的方式变化,进而更易散开形成较均匀的网状. 展开更多
关键词 鸡腿菇多糖 超声提取 ap1结构 原子力显微镜
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