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大豆RING/U-box蛋白Glyma.13G115900的克隆及其对非生物胁迫的应答 被引量:2
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作者 张沿政 陈龙 +1 位作者 李永光 李文滨 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期851-856,共6页
课题组前期对干旱胁迫下大豆转录组的数据分析发现大豆Glyma.13G115900基因编码一个RING/U-box蛋白,其表达水平受干旱胁迫影响显著。本研究以垦丰16大豆为试验材料,克隆Glyma.13G115900基因。氨基酸多重序列比对表明其编码的蛋白与其它... 课题组前期对干旱胁迫下大豆转录组的数据分析发现大豆Glyma.13G115900基因编码一个RING/U-box蛋白,其表达水平受干旱胁迫影响显著。本研究以垦丰16大豆为试验材料,克隆Glyma.13G115900基因。氨基酸多重序列比对表明其编码的蛋白与其它物种都具有高度保守的RING/U-box结构域。构建原核表达载体pET-29b-Glyma.13G115900转化到大肠杆菌中,Glyma.13G115900蛋白在大肠杆菌中能够表达。荧光定量PCR分析表明Glyma.13G115900基因的表达量受PEG、NaCl和ABA的影响显著,但基本不受冷胁迫的诱导。经PEG和NaCl处理后,该基因表达量与CK相比呈现出显著下降的趋势,PEG处理的表达量变化比NaCl下调的更明显;在ABA诱导下与CK相比该基因的mRNA丰度呈现出先上升后下降的趋势,在4 h表达量出现峰值,推测该基因可能通过依赖于ABA途径参与非生物胁迫应答。以上结果为进一步深入研究该基因的调控途径奠定基础。 展开更多
关键词 大豆 ring/u-box蛋白 Glyma.13G115900 基因克隆 胁迫响应
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Human RING finger protein ZNF645 is a novel testis-specific E3 ubiquitin ligase 被引量:4
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作者 Yun-Qiang Liu Gang Bai Hao Zhang Dan Su Da-Chang Tao Yuan Yang Yong-Xin Ma Si-Zhong Zhang 《Asian Journal of Andrology》 SCIE CAS CSCD 2010年第5期658-666,共9页
A large number of testis-specific genes are involved in the complex process of mammalian spermatogenesis. Identification of these genes and their roles is important for understanding the mechanisms underlying spermato... A large number of testis-specific genes are involved in the complex process of mammalian spermatogenesis. Identification of these genes and their roles is important for understanding the mechanisms underlying spermatogenesis. Here we report on a novel human RING finger protein, ZNF645, which contains a C3HC4 RING finger domain, a C2H2 zinc-finger domain, and a proline-rich region, indicating that it has a structure similar to that of the c-Cbl-like protein Hakai. ZNF645 was exclusively expressed in normal human testicular tissue. Immunohistochemical analysis confirmed that ZNF645 protein was present in spermatocytes, round and elongated spermatids, and Leydig cells. Immunofluorescence staining of mature sperms further showed that the ZNF645 protein was localized over the postacrosomal perinuclear theca region and the entire length of sperm tail. An in vitro ubiquitination assay indicated that the RING finger domain of the ZNF645 protein had E3 ubiquitin ligase activity. Therefore, we suggest that ZNF645 might act as an E3 ubiquitin-protein ligase and play a role in human sperm production and quality control. 展开更多
关键词 E3 ubiquitin ligase ring finger protein SPERMATOGENESIS ZNF645
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Synthetic lethal short hairpin RNA screening reveals that ring finger protein 183 confers resistance to trametinib in colorectal cancer cells 被引量:2
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作者 Rong Geng Xin Tan +10 位作者 Zhixiang Zuo Jiangxue Wu Zhizhong Pan Wei Shi Ranyi Liu Chen Yao Gaoyuan Wang Jiaxin Lin Lin Qiu Wenlin Huang Shuai Chen 《Chinese Journal of Cancer》 SCIE CAS CSCD 2017年第12期726-736,共11页
Background: The mitogen-activated extracellular signal-regulated kinase 1/2(MEK1/2) inhibitor trametinib has shown promising therapeutic effects on melanoma, but its efficacy on colorectal cancer(CRC) is limited. Synt... Background: The mitogen-activated extracellular signal-regulated kinase 1/2(MEK1/2) inhibitor trametinib has shown promising therapeutic effects on melanoma, but its efficacy on colorectal cancer(CRC) is limited. Synthetic lethality arises with a combination of two or more separate gene mutations that causes cell death, whereas individual mutations keep cells alive. This study aimed to identify the genes responsible for resistance to trametinib in CRC cells,using a synthetic lethal short hairpin RNA(shRNA) screening approach.Methods: We infected HT29 cells with a pooled lentiviral shRNA library and applied next-generation sequencing to identify shRNAs with reduced abundance after 8-day treatment of 20 nmol/L trametinib. HCT116 and HT29 cells were used in validation studies. Stable ring finger protein 183(RNF183)-overexpressing cell lines were generated by pcDNA4-myc/his-RNF183 transfection. Stable RNF 183-knockdown cell lines were generated by infection of lentiviruses that express RNF183 shRNA, and small interference RNA(siRNA) was used to knock down RNF183 transiently.Quantitative real-time PCR was used to determine the mRNA expression. Western blotting, immunohistochemical analysis, and enzyme-linked immunosorbent assay(ELISA) were used to evaluate the protein abundance. MTT assay,colony formation assay, and subcutaneous xenograft tumor growth model were used to evaluate cell proliferation.Results: In the primary screening, we found that the abundance of RNF183 shRNA was markedly reduced after treatment with trametinib. Trametinib induced the expression of RNF183, which conferred resistance to drug-induced cell growth repression and apoptotic and non-apoptotic cell deaths. Moreover, interleukin-8(IL-8) was a downstream gene of RNF183 and was required for the function of RNF183 in facilitating cell growth. Additionally, elevated RNF183 expression partly reduced the inhibitory effect of trametinib on IL-8 expression. Finally, xenograft tumor model showed the synergism of RNF183 knockdown and trametinib in repressing the growth of CRC cells in vivo.Conclusion: The RNF183-IL-8 axis is responsible for the resistance of CRC cells to the MEK1/2 inhibitor trametinib and may serve as a candidate target for combined therapy for CRC. 展开更多
关键词 SYNTHETIC LETHAL COLORECTAL cancer ring finger protein 183 MITOGEN-ACTIVATED EXTRACELLULAR signalregulated KINASE 1/2 Trametinib
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Droplet digital polymerase chain reaction assay for methylated ring finger protein 180 in gastric cancer 被引量:1
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作者 Guang-Hong Guo Yi-Bin Xie +1 位作者 Tao Jiang Yang An 《World Journal of Gastrointestinal Oncology》 SCIE 2022年第10期2038-2047,共10页
BACKGROUND Gastric cancer(GC)is one of the most prevalent malignant tumors that endangers human health.Early diagnosis is essential for improving the prognosis and survival rate of GC patients.Ring finger protein 180(... BACKGROUND Gastric cancer(GC)is one of the most prevalent malignant tumors that endangers human health.Early diagnosis is essential for improving the prognosis and survival rate of GC patients.Ring finger protein 180(RNF180)is involved in the regulation of cell differentiation,proliferation,apoptosis,and tumorigenesis,and aberrant hypermethylation of CpG islands in the promoter is strongly associated with the occurrence and development of GC.Thus,methylated RNF180 can be used as a potential biomarker for GC diagnosis.AIM To use droplet digital polymerase chain reaction(ddPCR)to quantify the methylation level of the RN180 gene.A reproducible ddPCR assay to detect methylated RNF180 from trace DNA was designed and optimized.METHODS The primer and probe were designed and selected,the conversion time of bisulfite was optimized,the ddPCR system was adjusted by primer concentration,amplification temperature and amplification cycles,and the detection limit of ddPCR was determined.RESULTS The best conversion time for blood DNA was 2 h 10 min,and that for plasma DNA was 2 h 10 min and 2 h 30 min.The results of ddPCR were better when the amplification temperature was 56°C and the number of amplification cycles was 50.Primer concentrations showed little effect on the assay outcome.Therefore,the primer concentration could be adjusted according to the reaction system and DNA input.The assay required at least 0.1 ng of input DNA.CONCLUSION In summary,a ddPCR assay was established to detect methylated RNF180,which is expected to be a new diagnostic biomarker for GC. 展开更多
关键词 Gastric cancer ring finger protein 180 DNA methylation Droplet digital polymerase chain reaction
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lncRNA MIR17HG调节miR-214-3p/RNF38信号轴对肝癌细胞恶性生物学行为的影响
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作者 孙伟涛 石彦科 +2 位作者 封俊连 陈志飞 张存岭 《现代消化及介入诊疗》 2024年第5期565-571,共7页
目的探究长链非编码RNA(lncRNA)人类微小RNA17簇宿主基因(MIR17HG)调节微小RNA(miR)-214-3p/环指蛋白38(RNF38)信号轴对肝癌细胞恶性生物学行为的影响。方法收集2022年5月至2023年10月于本院行手术切除的46例肝癌患者的癌组织及癌旁组织... 目的探究长链非编码RNA(lncRNA)人类微小RNA17簇宿主基因(MIR17HG)调节微小RNA(miR)-214-3p/环指蛋白38(RNF38)信号轴对肝癌细胞恶性生物学行为的影响。方法收集2022年5月至2023年10月于本院行手术切除的46例肝癌患者的癌组织及癌旁组织,检测lncRNA MIR17HG、miR-214-3p和RNF38的表达。体外培养HepG2、Bel-7402、SMMC-7721、HL-7702细胞,并比较lncRNA MIR17HG、miR-214-3p和RNF38的表达,选择Bel-7402细胞继续研究,随机分为sh-NC组、sh-MIR17HG组、anti-NC组、anti-miR-214-3p组和Bel-7402组。探究各组Bel-7402细胞增殖、凋亡、侵袭和迁移情况,蛋白质印迹法分析RNF38、半胱天冬酶-3(caspase-3)、B细胞淋巴瘤-2(Bcl-2)、基质金属蛋白酶-2(MMP2)、基质金属蛋白酶-9(MMP9)蛋白表达,双荧光素酶验证lncRNA MIR17HG与miR-214-3p以及miR-214-3p与RNF38的关系。结果肝癌组织中lncRNA MIR17HG、RNF38的mRNA表达较高,miR-214-3p的mRNA表达较低,RNF38的蛋白阳性表达率较高(P<0.05)。细胞SMMC-7721、HepG2、Bel-7402中lncRNA MIR17HG mRNA、RNF38 mRNA和RNF38蛋白表达高于HL-7702细胞,miR-214-3p mRNA表达低于HL-7702细胞(P<0.05)。与Bel-7402组、sh-NC组比较,sh-MIR17HG组OD 450nm值、克隆细胞数、侵袭细胞数、迁移细胞数和RNF38、MMP2、Bcl-2、MMP9表达减少,凋亡率和caspase-3表达增加(P<0.05);与sh-MIR17HG组、anti-NC组比较,anti-miR-214-3p组OD 450nm值、克隆细胞数、侵袭细胞数、迁移细胞数和RNF38、MMP2、Bcl-2、MMP9表达增加,凋亡率和caspase-3表达减少(P<0.05)。lncRNA MIR17HG与miR-214-3p以及miR-214-3p与RNF38分别存在靶向关系。miR-214-3p+WT-MIR17HG组荧光素酶活性低于miR-NC+WT-MIR17HG组(P<0.05),miR-214-3p+WT-RNF38组荧光素酶活性低于miR-NC+WT-RNF38组(P<0.05)。结论lncRNA MIR17HG可能通过调控miR-214-3p/RNF38轴促进肝癌细胞的恶性生物学行为。 展开更多
关键词 长链非编码RNA 人类微小RNA17簇宿主基因 miR-214-3p/环指蛋白38 肝癌 恶性生物学
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非肌层浸润性膀胱癌组织中OTUD5和RNF186表达与临床病理特征的关系及预后价值研究
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作者 吴楠 孙立如 +1 位作者 李亚东 刘文军 《现代检验医学杂志》 CAS 2024年第5期75-79,101,共6页
目的研究非肌层浸润膀胱癌(non-muscle invasive bladder cancer,NMIBC)癌组织中结构域蛋白去泛素化酶5(domain protein ubiquitin 5,OTUD5)、环指蛋白186(ring finger protein 186,RNF186)表达与临床病理特征的关系及预后价值研究。方... 目的研究非肌层浸润膀胱癌(non-muscle invasive bladder cancer,NMIBC)癌组织中结构域蛋白去泛素化酶5(domain protein ubiquitin 5,OTUD5)、环指蛋白186(ring finger protein 186,RNF186)表达与临床病理特征的关系及预后价值研究。方法收集2019年1月~2020年1月唐山市中医院收治的106例NMIBC患者。免疫组织化学检测NMIBC癌组织及癌旁组织OTUD5,RNF186表达。比较不同临床病理特征NMIBC癌组织OTUD5,RNF186表达差异。Kaplan-Meier曲线分析(Log-Rank检验)OTUD5,RNF186表达对NMIBC无进展生存预后的影响。COX回归模型分析影响NMIBC患者无进展生存预后的因素。结果NMIBC癌组织中OTUD5(62.26%),RNF186(66.04%)的阳性率高于癌旁组织(11.32%,8.49%),差异具有统计学意义(χ^(2)=59.146,75.079,均P<0.05)。NMIBC癌组织中OTUD5与RNF186表达呈显著正相关(r=0.659,P<0.05)。T 1期、高级别尿路上皮癌NMIBC癌组织中OTUD5(72.97%,84.21%),RNF186(77.03,86.84%)阳性率高于Ta/Tis期(37.50%,50.00%)、低级别尿路上皮癌(40.63%,54.41%),差异具有统计学意义(χ^(2)=11.964,13.199;12.143,11.431,均P<0.05)。OTUD5阳性组(40.91%)、RNF186阳性组(45.71%)三年累积无进展生存率低于OTUD5阴性组(90.00%)、RNF186阴性组(86.11%)患者(Log-Ranktestχ^(2)=24.710,14.586,均P<0.05)。OTUD5阳性(OR=1.446,95%CI:1.086~1.925)、RNF186阳性(OR=1.579,95%CI:1.132~2.024)、肿瘤TNM分期T1期(OR=1.582,95%CI:1.219~2.054)、病理分级高级别(OR=1.570,95%CI:1.188~2.074)是影响NMIBC患者无进展生存的独立危险因素(均P<0.001)。结论NMIBC患者癌组织OTUD5,RNF186表达升高,与肿瘤TNM分期、病理分级有关,是影响NMIBC患者预后的独立危险因素。 展开更多
关键词 非肌层浸润膀胱癌 结构域蛋白去泛素化酶5 环指蛋白186 临床病理特征
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硫氢化钠增加高糖高脂条件下小鼠心房肌细胞系HL-1谷胱甘肽合成
7
作者 张伟才 刘肆仁 王尚农 《基础医学与临床》 2024年第1期69-76,共8页
目的研究硫氢化钠(NaHS)是否通过调节谷胱甘肽(GSH)的合成,降低活性氧自由基(ROS)产生,改善小鼠2型糖尿病心肌病(DCM)。方法将小鼠心房肌细胞系HL-1分为对照组、高葡萄糖(HG:40 mmol/L)和棕榈酸(Pal:500μmol/L)处理组;以及硫氢化钠(NaH... 目的研究硫氢化钠(NaHS)是否通过调节谷胱甘肽(GSH)的合成,降低活性氧自由基(ROS)产生,改善小鼠2型糖尿病心肌病(DCM)。方法将小鼠心房肌细胞系HL-1分为对照组、高葡萄糖(HG:40 mmol/L)和棕榈酸(Pal:500μmol/L)处理组;以及硫氢化钠(NaHS,100μmol/L)、DL-炔丙基甘氨酸[PPG,胱硫醚γ裂解酶(CSE)抑制剂,1 mmol/L]和N-乙酰-L-半胱氨酸(NAC,ROS抑制剂,5 mmol/L)处理72 h组。Western blot检测CSE和谷胱甘肽合成酶(GSS)的表达;二氢乙锭(DHE)和二氯氟甲烷(DCFH)检测ROS含量;免疫共沉淀检测核因子红细胞系2相关因子2(Nrf2)泛素化水平及Nrf2与肌肉特异性环指蛋白1(Murf1)的相互作用。结果与对照组比高糖高脂处理HL-1细胞后CSE、溶质载体家族7成员11(SLC7A11)、谷氨酸半胱氨酸连接酶催化亚基C(GCLC)、谷氨酸半胱氨酸连接酶修饰亚基M(GCLM)、谷胱甘肽合成酶(GSS)的表达水平下降,而NaHS能恢复其表达。高糖高脂组ROS含量高于NaHS组。与NaSH组比高糖高脂条件下Murf1与Nrf2的相互作用增加,Nrf2泛素化水平明显增加。结论硫氢化钠减轻Nrf2的泛素化,增加GSH合成关键酶的表达。 展开更多
关键词 糖尿病心肌病 硫化氢 谷胱甘肽 核因子红细胞系2相关因子2(Nrf2) E3连接酶肌环指蛋白-1(Murf1)
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大肠杆菌表达高性能融合鱿鱼环齿-类弹性蛋白的发酵优化
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作者 姜正日 殷仁凯 +1 位作者 王泽建 钱江潮 《华东理工大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期71-79,共9页
为了实现重组蛋白SRT-ELP36在大肠杆菌中的高效表达,利用携带重组蛋白SRTELP36基因的pET-25b(+)表达载体,分别在摇瓶和5 L发酵罐上进行了发酵条件优化,并在50 L发酵罐中进行放大验证。经转化表达质粒后,宿主菌BL21(DE3)的菌体生长和蛋... 为了实现重组蛋白SRT-ELP36在大肠杆菌中的高效表达,利用携带重组蛋白SRTELP36基因的pET-25b(+)表达载体,分别在摇瓶和5 L发酵罐上进行了发酵条件优化,并在50 L发酵罐中进行放大验证。经转化表达质粒后,宿主菌BL21(DE3)的菌体生长和蛋白体积产量均高于BLR(DE3),可用于蛋白SRT-ELP36表达。摇瓶发酵条件优化结果表明,TB(Terrific Broth)培养基、装液比(装液量与摇瓶体积之比)为5%、诱导温度为37℃、对数生长结束期添加0.5 mmol/L的IPTG(异丙基-β-D-硫代半乳糖苷)诱导剂,菌体最高OD_(600)(波长600 nm处的吸光值)达到22.3,最高蛋白体积产量达0.60 g/L。在5 L发酵罐中进行补料分批培养条件优化,在OD_(600)为35时添加终浓度为0.5 mmol/L的IPTG启动诱导,并控制过程菌体氧消耗速率(OUR)为(180±5) mmol/(L·h),菌体的最高OD_(600)和蛋白体积产量分别达到了88、1.85 g/L,单位菌体蛋白产量为70 mg/g。在50 L发酵罐中,参照5 L工艺控制条件进行发酵过程放大,菌体最高OD_(600)达到103,重组蛋白SRT-ELP36的体积产量和单位菌体产量进一步提高到了2.22 g/L和90 mg/g,是目前文献报道SRT蛋白表达的最高水平,为高性能融合鱿鱼环齿-类弹性蛋白的工业化生产提供了基础。 展开更多
关键词 大肠杆菌 鱿鱼环齿蛋白 类弹性蛋白 力学性能 发酵优化
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泛素连接酶MuRF2通过抑制线粒体自噬减轻心肌细胞缺氧损伤
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作者 孙美琪 张瑜 +4 位作者 徐方晶 方克宝 王一帆 朱力 何军 《宁夏医科大学学报》 2024年第4期338-344,359,共8页
目的探讨泛素连接酶肌肉环指状蛋白2(muscle ring finger protein 2,MuRF2)对缺氧心肌细胞活力和自噬的调控作用。方法构建大鼠源MuRF2基因过表达和敲减慢病毒载体,分别感染大鼠心肌细胞H9C2。将H9C2细胞分为阴性对照组(NC)、阳性对照组... 目的探讨泛素连接酶肌肉环指状蛋白2(muscle ring finger protein 2,MuRF2)对缺氧心肌细胞活力和自噬的调控作用。方法构建大鼠源MuRF2基因过表达和敲减慢病毒载体,分别感染大鼠心肌细胞H9C2。将H9C2细胞分为阴性对照组(NC)、阳性对照组[MuRF2过表达空载体组(LV-Vector)、MuRF2敲减空载体组(LV-RNAi-Vector)]、Mu RF2过表达组(LV-MuRF2)和MuRF2敲减组(LV-RNAi-MuRF2),缺氧培养(5%CO_(2)、1%O_(2)、94%N_(2))后,采用CCK-8法和ELISA法检测心肌细胞损伤水平,利用透射电子显微镜检测心肌细胞超微结构和自噬水平变化,采用Western blot测定自噬相关蛋白LC3-Ⅱ和P62的表达水平。结果与对照组相比,缺氧组心肌细胞间隙增大、细胞皱缩、多见漂浮的死亡细胞和细胞碎片,心肌细胞活力下降、肌钙蛋白Ⅰ(cTnⅠ)含量增加(P均<0.05);电子显微镜下可观察到部分线粒体发生肿胀,并存在嵴断裂、嵴溶解现象,自噬小体散在胞质内;缺氧组LC3-Ⅱ蛋白表达水平升高,P62蛋白表达水平降低(P均<0.05)。缺氧培养后,与NC组和LV-Vector组相比,LV-MuRF2组细胞活力增加,偶见自噬小体,LC3-Ⅱ蛋白表达水平降低、P62蛋白表达水平增高(P均<0.05);与NC组和LV-RNAi-Vector组相比,LV-RNAi-MuRF2组细胞活力降低,可见大量自噬小体,LC3-Ⅱ蛋白表达水平升高、P62蛋白表达水平降低(P均<0.05)。结论泛素连接酶MuRF2可减轻缺氧所致的心肌细胞损伤,其机制可能与抑制心肌细胞线粒体自噬有关。 展开更多
关键词 泛素连接酶 肌肉环指状蛋白2 心肌细胞 缺氧 线粒体自噬
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环指蛋白213基因变异与血管相关疾病关系的研究进展
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作者 曹芳 刘珺宇 +1 位作者 郭雨欣 严俊霞 《中国脑血管病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期341-348,共8页
环指蛋白213(RNF213)为烟雾病的易感基因,也与颅内动脉闭塞或狭窄、缺血性卒中、颅内动脉瘤、脑动静脉畸形等多种血管相关疾病有关。作者对RNF213基因变异与血管相关疾病的关系及其可能的机制进行综述,以期为该类疾病的预防、诊断和治... 环指蛋白213(RNF213)为烟雾病的易感基因,也与颅内动脉闭塞或狭窄、缺血性卒中、颅内动脉瘤、脑动静脉畸形等多种血管相关疾病有关。作者对RNF213基因变异与血管相关疾病的关系及其可能的机制进行综述,以期为该类疾病的预防、诊断和治疗提供参考。 展开更多
关键词 环指蛋白213基因 血管疾病 综述
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RNF99通过TAK1/NF-κB信号通路参与泛素化与脓毒症性休克的潜在联系
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作者 张弛 胡赛 +3 位作者 王静 夏凤强 程晓英 甘泽英 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2024年第5期615-620,626,共7页
目的 探讨环指蛋白99(RNF99)介导的转化生长因子激酶1(TAK1)/核因子-κB(NF-κB)信号通路参与泛素化与脓毒症性急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的潜在联系。方法 进行质粒和siRNA转染以过表达或敲低小鼠肺泡上皮细胞(MLE12)中RNF99,分析磷酸p6... 目的 探讨环指蛋白99(RNF99)介导的转化生长因子激酶1(TAK1)/核因子-κB(NF-κB)信号通路参与泛素化与脓毒症性急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的潜在联系。方法 进行质粒和siRNA转染以过表达或敲低小鼠肺泡上皮细胞(MLE12)中RNF99,分析磷酸p65和p65蛋白表达。免疫沉淀分析RNF99与TRAF6和TAK1的蛋白相互作用关系。将40只小鼠随机分成WT+PBS、WT+LPS、RNF99特异性表达(TG)+PBS和TG+LPS组,每组10只。通过腹膜内注射30 mg/kg LPS诱导脓毒症。结果 与Vector组相比,RNF99组MLE12细胞中TRAF6和TAK1的蛋白表达水平显著降低(P<0.05)。泛素化TRAF6蛋白在RNF99敲低的MLE12细胞中增加。与LPS+Vector组相比,在LPS+RNF99组MLE12细胞中p65的磷酸化水平明显降低(P <0.05)。与si-NC组相比,si-RNF99组MLE12细胞中RNF99、IκBα的蛋白表达水平显著降低(P <0.05)。与LPS+si-NC组相比,在LPS+si-RNF99组MLE12细胞中p65的磷酸化水平明显增加(P <0.05)。TG+LPS组小鼠肺组织中CD68巨噬细胞染色百分比较WT+LPS组显著降低(P <0.05)。TG+LPS组小鼠肺组织中p65的磷酸化水平显著低于WT+LPS组小鼠(P <0.05)。结论 RNF99通过与NF-κB信号通路的关键调节因子(TRAF6/TAK1)相互作用来调节NF-κB信号通路,并改善小鼠腹腔注射LPS后肺损伤。 展开更多
关键词 环指蛋白99 转化生长因子激酶1 核因子-ΚB 脂多糖 肺泡上皮细胞
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环指蛋白调控天然免疫反应的研究进展
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作者 林小嫚 潘倩瑜 孟君 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期844-848,共5页
环指蛋白是最大的E3泛素连接酶家族之一,可通过其E3泛素连接酶的特性调控蛋白的泛素化修饰。天然免疫是机体抵御病原体入侵的第一道防线。天然免疫反应中,多种关键蛋白均受泛素化修饰调控,在抑制和清除病原体的同时,维持适宜的炎症反应... 环指蛋白是最大的E3泛素连接酶家族之一,可通过其E3泛素连接酶的特性调控蛋白的泛素化修饰。天然免疫是机体抵御病原体入侵的第一道防线。天然免疫反应中,多种关键蛋白均受泛素化修饰调控,在抑制和清除病原体的同时,维持适宜的炎症反应。文章围绕环指蛋白在Toll样受体(TLR)信号通路、维甲酸诱导基因I样受体(RLR)信号通路和环鸟嘌呤-腺嘌呤合成酶-环腺嘌呤-干扰素基因刺激物(cGAS-cGAMP-STING)信号通路调控中的作用进行总结,以期为环指蛋白和抗感染天然免疫相关研究提供新思路。 展开更多
关键词 环指蛋白 天然免疫 信号通路 泛素化修饰 综述
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食管癌组织中FOXM1和RNF2表达与临床病理参数及预后的相关性分析
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作者 贾亚松 彭小乐 +1 位作者 姚文杰 葛广林 《标记免疫分析与临床》 CAS 2024年第6期1068-1073,1124,共7页
目的探讨食管癌组织中叉头盒蛋白M1(FOXM1)和环指蛋白2(RNF2)表达与临床病理参数及预后的相关性。方法选取我院2018年1月至2019年12月期间收治的120例食管癌患者作为研究对象,收集术中切除的食管癌组织标本及癌旁组织标本。另选取45例... 目的探讨食管癌组织中叉头盒蛋白M1(FOXM1)和环指蛋白2(RNF2)表达与临床病理参数及预后的相关性。方法选取我院2018年1月至2019年12月期间收治的120例食管癌患者作为研究对象,收集术中切除的食管癌组织标本及癌旁组织标本。另选取45例食管癌患者并收集术中切除的食管癌组织标本作为验证组。检测食管癌组织及癌旁组织中FOXM1和RNF2的表达水平,分析二者相关性及其与患者预后状态的关系,并探讨影响食管癌患者预后状态的影响因素。结果食管癌组织中FOXM1和RNF2表达水平均高于癌旁组织(P<0.05);食管癌组织FOXM1和RNF2表达水平呈正相关(r=0.625,P<0.05);FOXM1高表达组及RNF2高表达组TNM分期为Ⅲ+Ⅳ期、发生淋巴结转移、浸润深度为深层的食管癌患者所占比例高于FOXM1低表达组及RNF2低表达组(P<0.05);癌组织中呈现出FOXM1低表达及RNF2低表达的食管癌患者其3年生存率(47.45%、48.33%)明显高于FOXM1高表达和RNF2高表达者(27.87%、26.67%)( χ^(2)=4.302、6.009,P=0.038、0.014);TNM分期、淋巴结转移、浸润深度、FOXM1及RNF2是食管癌患者死亡的危险因素(P<0.05);验证组中,FOXM1高表达组和RNF2高表达组发生淋巴结转移、TNM分期为Ⅲ+Ⅳ期、浸润深度为深层的患者所占比例分别高于FOXM1低表达组和RNF2低表达组(P<0.05),而3年生存率则分别低于FOXM1低表达组和RNF2低表达组(P<0.05)。结论FOXM1和RNF2在食管癌患者癌组织中的表达水平与其临床病理特征及3年生存率有关。 展开更多
关键词 食管癌 叉头盒蛋白M1 环指蛋白2 临床病理特征 预后
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MuRF1在低氧性肺动脉高压中的作用及机制
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作者 张婧 文新元 +4 位作者 韦红梅 薛茜茜 金玲 杨自更 吴宾 《心脏杂志》 CAS 2024年第1期1-6,共6页
目的 探讨肌肉环指蛋白1(MuRF1)在低氧性肺动脉高压(HPH)中的作用及可能机制。方法 将MuRF1转基因敲除小鼠(MuRF1 KO)及其同窝野生型(WT)小鼠随机分到对照(nWT)组、对照+HPH(hWT)组、MuRF1 KO(nMuRF1-KO)组、MuRF1 KO+HPH(hMuRF1-KO)组... 目的 探讨肌肉环指蛋白1(MuRF1)在低氧性肺动脉高压(HPH)中的作用及可能机制。方法 将MuRF1转基因敲除小鼠(MuRF1 KO)及其同窝野生型(WT)小鼠随机分到对照(nWT)组、对照+HPH(hWT)组、MuRF1 KO(nMuRF1-KO)组、MuRF1 KO+HPH(hMuRF1-KO)组。其中,hWT组和hMuRF1-KO组置于低压低氧人工实验舱内,nWT组和nMuRF1-KO组置于常压常氧SPF环境中,维持28 d。检测小鼠右心功能及右心室重塑水平、远端肺小动脉血管重塑水平、肺泡灌洗液炎症因子表达、MuRF1和大电导钙激活钾通道β1亚基(BK-β1)蛋白表达。结果 与nWT组相比,hWT组右室内径(RVID)显著降低(P<0.01),右室前壁厚度(RVAW)、右心室收缩压(RVSP)、右心室肥厚指数(RVHI)、胶原容积分数(CVF)显著增加(P<0.01),远端肺动脉壁厚度比(WT%)、肺动脉壁面积比(WA%)、肺动脉肌化水平、相对肺重量显著增加(P<0.01),肺泡灌洗液中炎症因子IL-1β、IL-6、TNF-α显著增加(P<0.01),MuRF1表达显著增加(P<0.05),BK-β1表达降低(P<0.05)。与hWT组相比,hMuRF1-KO组RVID显著增加(P<0.05),RVAW、RVSP、RVHI、CVF显著降低(P<0.05),WT%、WA%、肺动脉肌化水平、相对肺重量显著降低(P<0.05,P<0.01),肺泡灌洗液中炎症因子IL-1β、IL-6、TNF-α也显著减少(P<0.05,P<0.01),BK-β1表达显著增加(P<0.05)。结论 敲除MuRF1可改善HPH小鼠右心功能障碍和右室重塑,减轻肺血管重塑和肺血管炎性环境,其机制可能与敲除MuRF1抑制BK-β1降解有关。 展开更多
关键词 肌肉环指蛋白1 低氧性肺动脉高压 大电导钙激活钾通道 炎症
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食管鳞癌组织中BARD1的表达及与淋巴结转移的关系
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作者 潘艺 庞雅青 吴献忠 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2024年第4期259-262,共4页
目的分析食管鳞癌(ESCC)中乳腺癌易感基因1相关环指结构域蛋白1(BARD1)的表达及与淋巴结转移的关系。方法纳入2018年1月至2021年12月本院收治且经组织病理学检查确诊的114例ESCC患者,免疫组化EnVision两步法检测癌组织与癌旁组织中BARD... 目的分析食管鳞癌(ESCC)中乳腺癌易感基因1相关环指结构域蛋白1(BARD1)的表达及与淋巴结转移的关系。方法纳入2018年1月至2021年12月本院收治且经组织病理学检查确诊的114例ESCC患者,免疫组化EnVision两步法检测癌组织与癌旁组织中BARD1的表达情况并比较BARD1阳性率,分析BARD1表达与ESCC临床病理特征的关系,建立Logistic回归模型分析BARD1表达对ESCC淋巴结转移的影响,绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析BARD1表达对ES⁃CC淋巴结转移的预测价值。结果114例ESCC组织中BARD1阳性78例、阴性36例,对应癌旁组织中BARD1阳性23例、阴性91例,ESCC组织的BARD1阳性率为68.42%,高于癌旁组织的20.18%(χ^(2)=53.769,P<0.001)。BARD1表达与ESCC患者的T分期、分化程度和淋巴结转移有关(P<0.05),其中淋巴结转移组织的BARD1阳性率为80.36%(45/56),高于未转移组织的56.90%(33/58)。经Phi系数分析发现,BARD1表达与ESCC淋巴结转移呈正相关(r=0.276,P=0.003)。BARD1阳性是ESCC患者淋巴结转移的独立危险因素(OR=3.099,95%CI:1.339~7.175,P=0.008),且BARD1表达对ESCC患者淋巴结转移具有一定预测价值(AUC=0.636,P=0.020)。结论BARD1在ESCC中高表达,其与ESCC淋巴结转移密切相关,BARD1阳性会增加淋巴结转移风险,在评估ESCC淋巴结转移上有一定价值。 展开更多
关键词 食管鳞癌 乳腺癌易感基因1相关环指结构域蛋白1 淋巴结转移 临床意义
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RNF26 up-regulates PD-L1 to regulate the cancer immune response in ccRCC
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作者 WEIGANG REN JING LI +1 位作者 RUIJIANG ZENG LIANG ZHU 《BIOCELL》 SCIE 2024年第9期1323-1330,共8页
Background:Clear cell renal cell carcinoma(ccRCC)stands as the most prevalent form of kidney cancer,accounting for a significant proportion of malignancies affecting the kidneys.ccRCC is well known as a type of tumour... Background:Clear cell renal cell carcinoma(ccRCC)stands as the most prevalent form of kidney cancer,accounting for a significant proportion of malignancies affecting the kidneys.ccRCC is well known as a type of tumour with immunogenicity.Immune checkpoint inhibitors(ICIs)aim to enhance the anticancer immune response in ccRCC by blocking programmed cell death 1 ligand 1/programmed death 1(PD-L1/PD-1)pathways.In a previous study,we showed that RING finger protein 26(RNF26)degrades chromobox 7(CBX7)to activate the tumor necrosis factor(TNF)in ccRCC.Methods:We analyzed The Cancer Genome Atlas(TCGA)database using the R package ESTIMATE and found that RNF26 was significantly associated with ccRCC immune infiltration.The relationship between RNF26 and the PD1 checkpoint signaling pathway was detected by enrichment analysis.In addition,the molecular mechanism of RNF26 up-regulation of PD-L1 was detected by transcriptome sequencing,RT-qPCR,and Western Blot in ccRCC cell lineages 786-O and A498 cells.The transplantation tumor experiments in C57BL/6 mice were used to test the efficacy of anti-PD1 and knockdown of RNF26 in vivo.Results:We showed that RNF26 suppressed the immune response to ccRCC.Next,we revealed that RNF26 activated the PD-1 checkpoint pathway to suppress the immune response to ccRCC,possibly via the CBX7/PD-L1 axis.Conclusion:The suggestion derived from our results is that targeting RNF26 holds the potential to amplify the efficacy of anticancer immunotherapies in the treatment of ccRCC. 展开更多
关键词 Clear cell renal cell carcinoma ring finger protein 26 chromobox 7 PD-L1
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沙田柚RING-H2 finger基因的生物信息学分析 被引量:1
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作者 李惠敏 罗琼 +3 位作者 肖君 李少梅 刘华英 秦新民 《生物信息学》 2017年第3期149-155,共7页
为探讨沙田柚自交不亲和性的机理,利用高通量测序技术对沙田柚自交和异交花柱进行转录组测序,通过差异分析得到了沙田柚RING-H2 finger基因序列。采用生物信息学方法,对其编码的蛋白质从序列特征、理化性质、跨膜结构域、高级结构以及... 为探讨沙田柚自交不亲和性的机理,利用高通量测序技术对沙田柚自交和异交花柱进行转录组测序,通过差异分析得到了沙田柚RING-H2 finger基因序列。采用生物信息学方法,对其编码的蛋白质从序列特征、理化性质、跨膜结构域、高级结构以及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明:该基因全长为845 bp,开放阅读框(ORF)全长为387 bp,编码128个氨基酸,编码蛋白质的分子量为13.61 KDa,理论等电点为4.26;该蛋白质含有一个植物RING-H2 finger蛋白家族的保守结构域,为疏水性不稳定蛋白。氨基酸序列分析表明,其编码的氨基酸与甜橙(Cs4g15340.1)RING-H2 finger蛋白的相似度为98%。这些分析结果可为今后深入研究该蛋白的结构特征和功能提供参考。 展开更多
关键词 沙田柚 ring-H2 finger蛋白基因 生物信息学 环指结构域
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细胞有丝分裂前期检查点和结肠癌转移相关蛋白1表达与直肠癌新辅助同步放化疗敏感性关系的研究
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作者 张馨元 付永峰 +2 位作者 白立立 杨森 董立新 《中国医学装备》 2024年第2期98-103,共6页
目的:探讨细胞有丝分裂前期检查点(CHFR)和结肠癌转移相关蛋白1(MACC1)表达与直肠癌新辅助同步放化疗(nCRT)敏感性关系。方法:收集2017年3月至2022年2月秦皇岛市第一医院住院治疗的166例直肠癌患者病案资料,所有患者术前仅接受nCRT,其... 目的:探讨细胞有丝分裂前期检查点(CHFR)和结肠癌转移相关蛋白1(MACC1)表达与直肠癌新辅助同步放化疗(nCRT)敏感性关系。方法:收集2017年3月至2022年2月秦皇岛市第一医院住院治疗的166例直肠癌患者病案资料,所有患者术前仅接受nCRT,其中放疗采用三维适形调强放疗,化疗采用Capeox方案,nCRT治疗4~6周后均顺利完成腹腔镜下全直肠系膜切除术。免疫组织化学SP染色法检测直肠癌及其癌旁组织CHFR和MACC1蛋白表达。根据美国癌症分期联合委员会肿瘤退化分级(TRG)标准,将nCRT后肿瘤退化分级(TRG)0~2级的75例患者纳入nCRT不敏感组,TRG为3~4级的91例患者纳入nCRT敏感组,比较两组患者治疗前后癌组织CHFR和MACC1蛋白表达水平,分析患者临床病理特征与nCRT敏感性关系,以及nCRT敏感性的影响因素。采用受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)分析CHFR和MACC1对直肠癌nCRT敏感性的预测价值。结果:直肠癌组织CHFR阳性表达率显著低于癌旁组织,MACC1阳性表达率显著高于癌旁组织(x^(2)=81.373、87.150,P<0.05)。166例患者nCRT治疗结束后,TRG为0级6例,1级8例,2级61例,3级59例,4级32例,nCRT敏感率为54.82%(91/166)。nCRT敏感组CHFR阳性表达率显著高于nCRT不敏感组,MACC1阳性表达率显著低于nCRT不敏感组(x^(2)=4.613、37.509,P<0.05)。nCRT敏感组T4分期占比高于nCRT不敏感组,N+分期占比高于nCRT不敏感组,差异有统计学意义(x^(2)=54.432、28.912,P<0.05)。CHFR和MACC1表达是影响直肠癌患者对nCRT敏感性的独立危险因素[OR=2.456(95%CI:1.294~4.563),OR=3.281(95%CI:1.472~6.479),P<0.05]。CHFR和MACC1联合检测预测直肠癌nCRT敏感性的灵敏度、特异度分别为65.89%和69.46%,联合检测预测、CHFR和MACC1单项检测的AUC分别为0.713,0.564和0.589,P<0.05。结论:CHFR和MACC1与直肠癌nCRT敏感性有关,即CHFR高表达和MACC1低表达患者对nCRT敏感性更高,故两者有可能成为预测直肠癌nCRT敏感性的指标。 展开更多
关键词 直肠癌 新辅助同步放化疗 细胞有丝分裂前期检查点 结肠癌转移相关蛋白1 敏感性
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人类RING型锌指蛋白DTX2的全长cDNA克隆与序列分析
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作者 易正芳 李永青 +5 位作者 袁婺洲 王跃群 朱传炳 刘芳 吴自荣 吴秀山 《华东师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期123-126,133,共5页
鉴定了一个人类WWE与RING型锌指基因DTX2,位于人染色体7q11.23.通过RACE获得的全长cDNA显示,DTX2编码包含两个WWE区域与一个RING锌指区域的蛋白.
关键词 DTX2 WWE区域 ring-锌指蛋白cDNA 序列分析
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小白菜RING锌指蛋白基因的克隆及其表达分析
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作者 赵瑞丽 钟凤林 +4 位作者 林俊芳 高世超 胡海非 杨碧云 林义章 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2014年第1期90-97,共8页
锌指蛋白在调控植物防御和抗性方面具有重要作用。根据从小白菜中获得的与铜胁迫相关的RING锌指蛋白基因TDF片段设计引物,应用RACE技术克隆出具有完整阅读框的小白菜RING锌指蛋白基因,该基因全长855 bp,开放阅读框606 bp,编码202个氨基... 锌指蛋白在调控植物防御和抗性方面具有重要作用。根据从小白菜中获得的与铜胁迫相关的RING锌指蛋白基因TDF片段设计引物,应用RACE技术克隆出具有完整阅读框的小白菜RING锌指蛋白基因,该基因全长855 bp,开放阅读框606 bp,编码202个氨基酸,分子量为21.32 ku,理论等电点为6.87,属于中性蛋白。结构分析结果表明,该蛋白C-端含有1个保守的C3HC4型RING锌指结构域。进化树分析结果显示,小白菜RING锌指蛋白与芜菁RING锌指蛋白的相似度高达98%,属于C3HC4型RING锌指亚家族。RT-PCR分析结果表明,在铜胁迫下该基因下调表达,推测其可能参与对铜胁迫的应答反应。此结果为进一步研究该基因在小白菜逆境应答中的作用机制奠定基础。 展开更多
关键词 小白菜 ring锌指蛋白基因 RACE RT—PCR
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