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Molecular Characteristics of S1 Gene of Infectious Bronchitis Virus Isolated from Chicken Proventriculus
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作者 CHENG Li-qin, ZHOU Ji-yong, John Dikki, SHEN Xing-yan, CHEN Ji-gang and ZHANG De-yongInstitute of Preventive Veterinary Medicine , College of Animal Sciences , Zhejiang University , Hangzhou 310029 , P.R.China 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2003年第1期107-112,共6页
Infectious bronchitis virus was isolated from swollen proventriculi of clinically ill chicken. The suspected virus samples (2/97, 3/97, 1/98) were adapted in SPF chicken embryos for virus isolation and identification.... Infectious bronchitis virus was isolated from swollen proventriculi of clinically ill chicken. The suspected virus samples (2/97, 3/97, 1/98) were adapted in SPF chicken embryos for virus isolation and identification. All the virus isolates were able to agglutinate chicken erythrocytes after treatment with trypsin, and interfer with the reproduction of Newcastle disease virus in chicken embryos, and have low antigenic relat-edness values with reference positive IBV. The isolates 2/97, 3/97, 1/98 RNAs extracted from the allantoic fluid of inoculated embryonated eggs were converted to cDNA by reverse transcription with 3'-primer of S1 gene of (IBV). Polymerase chain reaction (PCR) was performed with two primers which span the S1 gene. Amplified product of 1. 93 kb was subjected to EcoR I and BamH I digestion and the fragments obtained were the same as expected size. The PCR product was ligated to pBlueScript-SK ( + ) vector, and its nucleotide sequence was determined by the dideoxy-mediated chain termination method. Nucleotide sequence analysis showed 73. 6 - 99. 7% homology between the isolated IBV and the IBV strains in GenBank. The homology of amino acid was 71. 4 - 99.4%. 展开更多
关键词 CHICKEN Infectious bronchitis virus s1 gene Molecular characteristics
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Prokaryotic Expression of Infectious Bronchitis Virus S1 Gene and Analysis of Biological Activity of Recombinant Protein
2
作者 WANG Chun-li WANG Hong-jun ZHAO Quan 《Animal Husbandry and Feed Science》 CAS 2010年第4期46-48,共3页
[Objective] To study the prokaryotic expression and antigenicity identification of S1 gene from avian infectious bronchitis virus (IBV). [Method] The S1 gene was cloned into a pMD18-T vector to yield a recombinant p... [Objective] To study the prokaryotic expression and antigenicity identification of S1 gene from avian infectious bronchitis virus (IBV). [Method] The S1 gene was cloned into a pMD18-T vector to yield a recombinant plasmids pMD18-T-IBV-S1. Then S1 gene was inserted into the multiple cloning site of a prokaryotic expression vector pET-32a ( + ). The recombinant plasmid was transformed into E. coil BL21. The recombinant protein was induced by IPTG and measured by SDS-PAGE and western-blotting. [Result] The S1 gene was successfully expressed in E. coil BL21, the fusion proteins were about 66.0 kDa in a form of inclusion body. Western-blotting test showed that the recombinant proteins could be identified by IBV polyclonal antibody. [ Conclusion] The recombinant proteins of S1 gene have the antigenicity, which lays a good foundation for further research on new generation vaccine of IBV. 展开更多
关键词 Avian infectious bronchitis virus s1 gene Prokaryotic expression Western-blotting
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Wilm′s tumor gene1肽疫苗Galinpepimut-S在肿瘤免疫治疗中的应用
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作者 高娜 梁平 +3 位作者 单彬 高亚乾 尹金妥 冯锐 《中国药业》 2024年第3期128-128,I0001-I0004,共5页
目的为Wilm′s tumor gene1(WT1)肽疫苗Galinpepimut-S(GPS)用于肿瘤免疫治疗的后续研究提供参考。方法采用计算机检索中国知网、PubMed等数据库自建库起至2022年12月的肿瘤免疫治疗相关文献,总结GPS在肿瘤免疫治疗中的应用现状。结果GP... 目的为Wilm′s tumor gene1(WT1)肽疫苗Galinpepimut-S(GPS)用于肿瘤免疫治疗的后续研究提供参考。方法采用计算机检索中国知网、PubMed等数据库自建库起至2022年12月的肿瘤免疫治疗相关文献,总结GPS在肿瘤免疫治疗中的应用现状。结果GPS能激发自身免疫系统,对WT1抗原产生强烈免疫反应而发挥抗肿瘤作用,在卵巢癌、恶性胸膜间皮瘤、急性髓系白血病、多发性骨髓瘤的治疗中均显示出较好的疗效。结论以GPS为代表的肿瘤疫苗是未来肿瘤治疗的重要方向,需进一步进行临床研究,以获取更多数据。 展开更多
关键词 Wilm′s tumor gene1肽疫苗 Galinpepimut-S 免疫治疗 新生抗原 肿瘤疫苗
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猪流行性腹泻病毒S1基因遗传进化分析及蛋白结构预测
4
作者 孙在兴 邱文英 +3 位作者 扶海 罗皓 曹敏 李玉锋 《现代农业科技》 2024年第21期146-152,164,共8页
猪流行性腹泻病毒(PEDV)属于冠状病毒科甲型冠状病毒属,可引起血清阴性新生仔猪急性腹泻、呕吐、脱水,死亡率较高。PEDV感染引起的猪流行性腹泻(PED)给欧洲和亚洲养猪业造成了重大的经济损失。地方性PED是一个重大问题,多种PEDV潜在输... 猪流行性腹泻病毒(PEDV)属于冠状病毒科甲型冠状病毒属,可引起血清阴性新生仔猪急性腹泻、呕吐、脱水,死亡率较高。PEDV感染引起的猪流行性腹泻(PED)给欧洲和亚洲养猪业造成了重大的经济损失。地方性PED是一个重大问题,多种PEDV潜在输入或变体的出现加剧了这一问题。为了解PEDV的流行与变异情况,应用生物信息学方法对50个PEDV毒株进行了遗传进化分析。结果表明,不同基因型PEDV S1基因具有稳定突变点,同一地域主要流行毒株具有相对遗传稳定性,2020年后我国流行毒株多为G2c基因群。本研究为进一步监测和分析我国猪群腹泻的流行病学及研究PEDV的遗传变异规律提供参考,同时为PED的防控和疫苗研发提供理论依据。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 s1基因 生物信息学 遗传进化 蛋白结构 疫苗
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毛白杨PtoS1-bZIP亚家族成员的鉴定及表达分析
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作者 吴江婷 贾辰琳 +1 位作者 罗志斌 邓澍荣 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2024年第4期62-72,共11页
[目的]鉴定毛白杨PtoS1-bZIP亚家族成员,解析PtoS1-bZIPs基因响应干旱和盐胁迫等非生物逆境的表达模式。[方法]通过生物信息学方法对PtoS1-bZIP亚家族进行系统分析,利用实时荧光定量技术检测该亚家族成员在不同组织中的基因表达特征以... [目的]鉴定毛白杨PtoS1-bZIP亚家族成员,解析PtoS1-bZIPs基因响应干旱和盐胁迫等非生物逆境的表达模式。[方法]通过生物信息学方法对PtoS1-bZIP亚家族进行系统分析,利用实时荧光定量技术检测该亚家族成员在不同组织中的基因表达特征以及对非生物胁迫的表达响应模式。[结果]从毛白杨基因组中鉴定出10个S1-bZIPs基因,分布在8条染色体上,均无内含子结构。系统进化分析表明,PtoS1-bZIP亚家族可分为3个分支,在毛白杨基因组内有12对共线性基因。顺式作用元件分析发现PtoS1-bZIP亚家族成员的启动子中含有多个光信号、激素与非生物胁迫响应元件。荧光定量结果显示,PtoS1-bZIP亚家族成员的表达具有组织特异性。第一和第二进化分支中的多数成员在ABA和干旱处理下表达量上调,在盐胁迫下表达量下调;第三进化分支中的成员在ABA、干旱和盐处理下均表达上调。[结论]从毛白杨中鉴定出10个PtoS1-bZIPs基因,聚类为3个进化分支,第一和第二分支中多数PtoS1-bZIPs成员的表达受干旱胁迫诱导,而受盐胁迫抑制;第三分支成员的表达受干旱和盐胁迫诱导。表明毛白杨PtoS1-bZIPs不同分支成员可能具有功能分化,在响应非生物胁迫过程中发挥不同作用,研究结果为后续解析PtoS1-bZIPs基因调控杨树抗逆性的分子机制提供了基础。 展开更多
关键词 毛白杨 s1-bZIP 基因家族 基因表达
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一株PEDV广东流行株S1基因遗传进化分析及其在昆虫细胞中的表达纯化
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作者 刘郁夫 林晓慧 +1 位作者 谭银娟 冯美莹 《肇庆学院学报》 2024年第2期16-21,共6页
为了解猪流行性腹泻病毒广东流行株的S1基因流行变异情况,制备相应的诊断试剂,试验采用RT-PCR从猪流行性腹泻疑似发病仔猪的肠道内容物中扩增获得S1基因,利用生物信息学软件构建S1基因的遗传进化树.将S1基因克隆至杆状病毒穿梭质粒pFast... 为了解猪流行性腹泻病毒广东流行株的S1基因流行变异情况,制备相应的诊断试剂,试验采用RT-PCR从猪流行性腹泻疑似发病仔猪的肠道内容物中扩增获得S1基因,利用生物信息学软件构建S1基因的遗传进化树.将S1基因克隆至杆状病毒穿梭质粒pFastBac1,转化至DH10Bac感受态细胞中,经抗生素筛选重组杆粒,把重组杆粒转染到昆虫细胞Sf9,盲传3代后进行间接免疫荧光试验和Western blot鉴定.结果表明:该猪流行性腹泻病毒广东流行株分布于GII-b分支,与国内猪流行性腹泻病毒分离株(HN-HB1-2018、HBHA2015)的核苷酸相似性为98.0%~98.3%,而与猪流行性腹泻病毒经典毒株CV777、DR13的核苷酸相似性仅为89.9%~90.0%.且S1重组蛋白可在昆虫细胞Sf9中以细胞培养分泌上清的形式表达.本研究可为猪流行性腹泻病毒的流行现状研究提供参考,以及后续猪流行性腹泻病毒诊断制品的研发提供前期基础. 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 s1基因 遗传进化 昆虫细胞
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2020—2021年我国部分地区猪流行性腹泻病毒S1、M和ORF3基因遗传进化分析 被引量:2
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作者 熊谋康 梁太润 +5 位作者 刘献辉 王志朋 王爽云 刘燕玲 张乐宜 宋长绪 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2023年第15期8-17,共10页
为了解2020—2021年我国部分地区猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)毒株变异及遗传进化情况,试验从多个地区的51家猪场采集340份疑似感染PEDV的猪小肠组织、粪便和肛拭子,提取病毒核酸后采用RT-PCR方法扩增S1、M... 为了解2020—2021年我国部分地区猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)毒株变异及遗传进化情况,试验从多个地区的51家猪场采集340份疑似感染PEDV的猪小肠组织、粪便和肛拭子,提取病毒核酸后采用RT-PCR方法扩增S1、M和ORF3基因并测序,与GenBank中PEDV参考毒株进行比对分析,利用生物信息学软件构建遗传进化树,分析核苷酸序列同源性及氨基酸序列。结果表明:共获得57份PEDV阳性样品,来源于14家猪场,猪场阳性率为27.5%,并对从阳性猪场获得的14株毒株进行命名。与经典毒株CV777相比,14株PEDV毒株的S1、M和ORF3基因均出现不同程度的氨基酸突变。在14株毒株的S1基因中,Heyuan2021-7毒株位于G1-2分支,其余13株位于G2分支,14株毒株与参考毒株GD-A核苷酸序列的相似性较高,为89.3%~99.9%,存在多处氨基酸的缺失和插入。在M基因中,14株毒株位于G2分支且与参考毒株FR-001核苷酸序列的相似性为98.1%~99.7%,只存在氨基酸突变。在ORF3基因中,FC2021-1、GDzq2020-12、GDmm^(2)021-1和GDjm-DG-2021-12毒株位于G1-2分支,其余10株位于G2分支,14株毒株与参考毒株VN-JFP1013核苷酸序列的相似性为95.4%~99.3%,同源性较高,只存在氨基酸突变。说明2020—2021年我国部分地区流行的PEDV毒株有G1型和G2型毒株,其S1基因较M和ORF3基因突变程度更大,PEDV的流行情况相对复杂。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒(PEDV) 检测 s1基因 M基因 ORF3基因 基因测序 遗传变异
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2015年~2021年我国东部地区猪流行性腹泻病毒S1蛋白关键表位的变异分析 被引量:4
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作者 程亚豪 胡灵子 +6 位作者 刘雅琦 周莹珊 杜静 周兴东 王晓杜 吴瑗 董婉玉 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期968-972,共5页
为了解2015年~2021年我国东部地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行特征和遗传变异规律,本研究利用RT-PCR扩增2015年~2017年11株分离自浙江地区PEDV流行株的S1基因序列,并与GenBank中我国东部地区(上海、江苏、山东、河南和安徽)的86株PED... 为了解2015年~2021年我国东部地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行特征和遗传变异规律,本研究利用RT-PCR扩增2015年~2017年11株分离自浙江地区PEDV流行株的S1基因序列,并与GenBank中我国东部地区(上海、江苏、山东、河南和安徽)的86株PEDV流行株的S1基因序列通过MEGA 7.0软件比较分析S1基因的遗传进化关系,采用CLC Sequence Viewer 8软件分析比对S1蛋白氨基酸序列的变异。PEDV S1基因遗传进化分析结果显示,97株PEDV中有92%的流行株属于G2型,与疫苗株CV777同源性较低(90.4%~96.1%),山东地区2017年~2018年间的部分流行株与疫苗株CV777等属于G1型;G2型中,33%的流行株属于G2a型,67%的流行株属于G2b亚型,其中2019年~2021年的流行株有15%流行株属于G2a亚型,85%的流行株属于G2b亚型。S1蛋白关键表位的变异分析结果显示,与经典株CV777相比,中和表位COE(CO-26K equivalent epitope)发生8个氨基酸位点(A^(517)S、S^(523)G、V^(527)I、T^(549)S、G^(594)S、A^(605)E/D、L^(612)F/Y、I^(635)V)的突变,SS2区域无氨基酸变异,SS6发生1个氨基酸位点(Y^(766)S)的突变,2018年后出现新的突变位点(T^(636)I和S^(749)G)。不同地区S1蛋白关键表位的变异分析结果显示,aa501变异在河南地区(L^(501)P)和江苏地区(L^(501)W)存在明显的差异;aa536突变(F^(536)L)多集中于河南、山东地区的流行株,aa542突变(D^(542)E)集中于江苏、上海地区。本研究首次系统分析了我国东部地区PEDV流行株S1基因及其氨基酸的遗传变异规律,为我国该地区PEDV变异株疫苗选择、生物安全防控方案制定提供了参考依据。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 s1基因 遗传变异 序列分析
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内蒙古地区牛冠状病毒的分离鉴定及S1基因遗传进化分析 被引量:1
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作者 梁彤 曹存 +6 位作者 于德斌 王芳 姜志刚 徐晓静 刘春东 尹鑫 常继涛 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2023年第19期82-87,141,共7页
为了对内蒙古地区患腹泻疾病的犊牛进行病原学鉴定,并进一步丰富我国牛冠状病毒(BCoV)的种质资源和流行病学数据,试验采用PCR扩增、间接免疫荧光试验、增殖动态检测、透射电镜观察等方法确定9份新生犊牛腹泻粪便样本的病原学特征,同时... 为了对内蒙古地区患腹泻疾病的犊牛进行病原学鉴定,并进一步丰富我国牛冠状病毒(BCoV)的种质资源和流行病学数据,试验采用PCR扩增、间接免疫荧光试验、增殖动态检测、透射电镜观察等方法确定9份新生犊牛腹泻粪便样本的病原学特征,同时通过序列比对分析与GenBank中具有代表性的BCoV S1基因组序列的同源性,利用MEGA 7.0.14软件构建S1基因组系统进化树。结果表明:9份样本中有2份为BCoV N基因阳性,PCR扩增得到大小约为730 bp的目的条带;用阳性样本接种HRT-18G细胞并进行3次传代培养,可见细胞出现以变圆、融合形成合胞体、融合细胞脱落为主要特征的典型细胞病变;分离株能够与兔抗BCoV N蛋白的多克隆抗体发生特异性反应,透射电镜观察可见有囊膜、表面有纤突、直径约为120 nm的病毒粒子;将分离获得的BCoV毒株命名为HM-XC,该分离株感染HRT-18G细胞的病毒含量为1×10^(5.75)TCID_(50)/0.1 mL;分离株HM-XC S1基因的核苷酸序列与我国青海省牦牛源毒株BCoV Yak/BCoV-China/QH1的相似性最高,为99.61%,与近年来辽宁省流行毒株的相似性为96.4%~99.0%,与美国经典参考毒株BCoV Mebus的相似性较低,为96.3%;与相似性最高的Yak/BCoV-China/QH1毒株相比,分离株HM-XC的S1蛋白存在7个氨基酸突变,分别是H115D、S186W、Y509H、V528A、N531D、L563S和I640T。说明内蒙古地区牛场中已有BCoV的流行,并且在犊牛腹泻粪便中分离获得BCoV内蒙古流行毒株,分离株具有我国新流行BCoV株的序列特征。 展开更多
关键词 牛冠状病毒 分离 鉴定 s1蛋白编码基因 序列分析
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2020年~2021年河北省4种猪腹泻病毒流行情况调查及PEDV分离株S1和ORF3基因序列的遗传变异分析 被引量:10
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作者 王挺 李风云 +1 位作者 葛生虎 刘慧芳 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期473-479,共7页
为初步调查河北省近年4种猪腹泻相关病毒的流行情况,本研究于2020年~2021年从河北省部分地区猪场采集244份腹泻猪粪便或肠组织样品,采用荧光定量PCR(qPCR)检测4种猪腹泻相关病毒[(猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪轮状病毒(PoRV)、猪传染性... 为初步调查河北省近年4种猪腹泻相关病毒的流行情况,本研究于2020年~2021年从河北省部分地区猪场采集244份腹泻猪粪便或肠组织样品,采用荧光定量PCR(qPCR)检测4种猪腹泻相关病毒[(猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪轮状病毒(PoRV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪德尔塔冠状病毒(PDCoV)];采用RT-PCR扩增部分PEDV阳性样品S1和ORF3基因并测序,利用DNAStar软件分析这两个基因及其编码氨基酸序列与PEDV相应序列的同源性;采用MEGA 7.0软件构建这两个基因的进化树,分析PEDV的基因型及其遗传进化关系。采用DNAStar比对这两个基因编码的氨基酸序列,分析其氨基酸序列的变异情况。结果显示:病料样品中PEDV、PoRV、PDCoV和TGEV检出率分别为34.02%(83/244)、18.44%(45/244)、10.66%(26/244)和2.87%(7/244)。样品中两种病原混合感染较多,其中PEDV+PoRV和PEDV+PDCoV检出率最高,分别为8.61%(21/244)和2.46%(6/244);仅2份样品为PEDV+PDCoV+PoRV三重感染,占0.81%(2/244)。8株PEDV S1和ORF3基因序列之间的同源性分别为98.2%~99.8%和97.3%~99.6%,氨基酸序列同源性分别为97.4%~100.0%和96.9%~99.2%,且二者均与国内流行变异株(如AJ1102、AH2012和CHGX株)的同源性更高(分别为97.7%~98.9%、97.2%~98.4%和98.3%~99.7%、97.4%~99.3%)。PEDV S1基因的系统进化树结果显示,5株PEDV为GII-a亚型,3株PEDV为GII-b亚型,且均与PEDV变异株亲缘关系较近;PEDV ORF3基因进化树结果显示,8株PEDV均与上述PEDV变异株所属分支亲缘关系较近。以上结果表明,本研究检测的8株PEDV均属于变异株。S1和ORF3氨基酸序列比对结果均显示,部分PEDV与其参考株相比存在独特的变异,其中HeB-QHD、HeB-HD和HeB-TS PEDV的S1存在N^(139)D、I^(289)M和A^(363)T/S变异;HeB-HD和HeB-BD的ORF3存在Q^(202)H等变异。上述结果表明,PEDV和PoRV是导致河北省仔猪腹泻的主要肠道病毒,且该省PEDV流行株主要为GII基因型,且同时存在GII-a和GII-b亚型PEDV的流行。本研究为河北省仔猪腹泻疾病的诊断与防控提供了科学依据。 展开更多
关键词 仔猪腹泻 猪腹泻病毒 流行病学 s1和ORF3基因 遗传进化
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前S1抗原检测阴性的HBV感染孕妇血清学和前S1基因特征分析
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作者 姜天琪 孙可望 +1 位作者 王皓 黄象艳 《临床输血与检验》 CAS 2023年第5期662-666,共5页
目的 分析前S1抗原(Pre-S1Ag)检测阴性的HBV感染孕妇血清学特征和前S1基因测序结果,为正确解释HBV感染孕妇中Pre-S1Ag检测无反应性和预防HBV垂直传播提供依据。方法 以2021年7月—2022年12月山东省妇幼保健院健康检查的孕妇为研究对象,... 目的 分析前S1抗原(Pre-S1Ag)检测阴性的HBV感染孕妇血清学特征和前S1基因测序结果,为正确解释HBV感染孕妇中Pre-S1Ag检测无反应性和预防HBV垂直传播提供依据。方法 以2021年7月—2022年12月山东省妇幼保健院健康检查的孕妇为研究对象,检测乙肝五项和Pre-S1Ag,选取乙肝表面抗原(HBsAg)阳性而Pre-S1Ag阴性的标本为实验组共14例,随机选取HBsAg和Pre-S1Ag均阳性的标本为对照组20例,进行HBVDNA定量检测,并扩增PreS/S基因和测序。结果 HBV感染孕妇中Pre-S1Ag阴性仅在HBsAg、抗-HBe、抗-HBc三者均阳性的乙肝五项血清学模式中发现,占比4.17%,其他HBV感染血清学检测模式中未发现;实验组和对照组HBeAg、抗-HBe阳性率均存在显著差异(P <0.001);实验组与对照组比较,HBsAg检测结果分别为(29±91)IU/mL和(2070.6±714.8)IU/mL,HBV DNA定量结果分别为:(1.63±0.05)lgIU/mL和(5.79±1.53) lgIU/mL,差异均有统计学意义(P <0.001);测序结果显示:对照组中有3例B基因型,17例C基因型;实验组14例标本均为C基因型;两组前S1蛋白变异率差异无统计学意义(P>0.05)。结论 HBV感染孕妇中Pre-S1Ag无反应性与PreS基因变异并无相关性,而是与HBV DNA载量低导致Pre-S1Ag表达水平低于检测限有关。不能忽视Pre-S1Ag检测阴性的HBV感染孕妇发生垂直传播的可能性。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 孕妇 乙肝表面抗原 s1抗原 前S/S 基因
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山东部分地区禽传染性支气管炎流行病学调查
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作者 张春阳 兰邹然 +5 位作者 李宏梅 刘坤 孔祥华 王贵升 姜子昕 王苗利 《中国家禽》 北大核心 2024年第6期86-92,共7页
为了解近年来山东省流行的禽传染性支气管炎病毒(Infectious bronchitis virus,IBV)S1基因遗传特性,试验于2020-2023年从山东14个地市的肉鸡养殖场及蛋鸡养殖场共收集462份病料(包含组织器官、泄殖腔拭子和咽拭子),采用RT-qPCR和RT-PCR... 为了解近年来山东省流行的禽传染性支气管炎病毒(Infectious bronchitis virus,IBV)S1基因遗传特性,试验于2020-2023年从山东14个地市的肉鸡养殖场及蛋鸡养殖场共收集462份病料(包含组织器官、泄殖腔拭子和咽拭子),采用RT-qPCR和RT-PCR对病料进行IBV检测。结果显示:山东省2020-2023年肉鸡和蛋鸡养殖场IBV阳性检出率为27%(125/462),并在3年试验期间IBV感染率呈现逐年上升趋势,在初春、秋末及冬季感染率较高,以济南(49%)、泰安(33%)和东营(28.9%)地区IBV阳性检出率最高,肉鸡的IBV感染率略高于蛋鸡。试验成功分离37株IBV分离株,其S1基因核苷酸同源性为74.8%~99.8%,分属GⅠ-22、GⅠ-13、GⅠ-7、GⅠ-1、GⅠ-28(LZ05型)和GⅠ-19(QX型)6种基因型,其中QX型为分离株优势基因型(83.7%,31/37)。31株QX型IBV分离株S1基因在第68、116、208、261、333和369位的碱基突变、替换最为频繁。研究提示:山东部分地区IBV感染率呈现逐年上升趋势,多发于寒冷季节且肉鸡发病较为严重,流行毒株仍以QX基因型为主,并且LZ05型首次在鲁中地区被检出。 展开更多
关键词 IBV s1基因 肉鸡 蛋鸡 QX型
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番鸭呼肠孤病毒MW9710株S1基因片段的克隆及序列分析 被引量:22
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作者 胡奇林 林锋强 +7 位作者 陈少莺 林天龙 陈仕龙 程晓霞 朱小丽 江斌 李怡英 程由铨 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期22-25,共4页
参考GenBank番鸭呼肠孤病毒(muscovyduckreovirus,MDRV)S1基因序列设计合成一对引物,对番鸭呼肠孤病毒MW9710株S1基因进行RT_PCR扩增,并对PCR产物进行了克隆和测序。结果显示扩增产物为300bp,与预期的目的片段大小一致,经PCR、酶切反... 参考GenBank番鸭呼肠孤病毒(muscovyduckreovirus,MDRV)S1基因序列设计合成一对引物,对番鸭呼肠孤病毒MW9710株S1基因进行RT_PCR扩增,并对PCR产物进行了克隆和测序。结果显示扩增产物为300bp,与预期的目的片段大小一致,经PCR、酶切反应鉴定后克隆到pGEM_Teasy载体中,核苷酸序列经BLAST软件分析表明:番鸭呼肠孤病毒MW9170株S1基因的目的片段与番鸭呼肠孤病毒法国89026株同源性为91 7%,与鸡关节炎病毒S2基因同源性为68 7%,结果提示番鸭呼肠孤病毒MW9710株与鸡关节炎病毒亲缘距离较远。 展开更多
关键词 番鸭呼肠孤病毒 s1基因 基因克隆 序列分析 双链RNA
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中国禽(番鸭)呼肠孤病毒分离株S1基因全序列分析 被引量:16
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作者 王劭 邓国华 +2 位作者 吴异健 吴宝成 陈化兰 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期105-111,共7页
采用RT_PCR技术 ,分别以DRV_YH、DRV_YJL两株中国禽 (番鸭 )呼肠孤病毒RNA为模板 ,扩增了S1全基因的cDNA片段。将S1cDNA克隆到T载体后进行序列测定 ,测序结果表明所扩增的cDNA片段长 16 4 3个核苷酸 ,包含了完整的S1基因的三个开放阅读... 采用RT_PCR技术 ,分别以DRV_YH、DRV_YJL两株中国禽 (番鸭 )呼肠孤病毒RNA为模板 ,扩增了S1全基因的cDNA片段。将S1cDNA克隆到T载体后进行序列测定 ,测序结果表明所扩增的cDNA片段长 16 4 3个核苷酸 ,包含了完整的S1基因的三个开放阅读框架 (ORF1,ORF2和ORF3)和基因两端的非编码区。核苷酸序列比较分析结果表明 :DRV_YH与ARV_S1133,176分别有 6个 ,10个核苷酸的差异 ,DRV_YJL与ARV_S1133,176分别有 8个 ,12个核苷酸的差异 ,DRV_YH与DRV_YJL有 展开更多
关键词 番鸭 呼肠孤病毒 s1基因
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广西不同时期IBV分离株S1基因高变区Ⅰ的遗传变异分析 被引量:22
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作者 韦正吉 韦平 +3 位作者 磨美兰 李孟 韦天超 李康然 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期126-132,共7页
对广西1985-2007年间分离到的22株传染性支气管炎病毒(IBV)的S1基因高变区I(HVRI)进行序列测定,并与发表的其他IBV参考株及鸽子分离的冠状病毒株的基因序列进行比较和分析。系统进化关系显示毒株可分为5个基因群,其中有16个广西... 对广西1985-2007年间分离到的22株传染性支气管炎病毒(IBV)的S1基因高变区I(HVRI)进行序列测定,并与发表的其他IBV参考株及鸽子分离的冠状病毒株的基因序列进行比较和分析。系统进化关系显示毒株可分为5个基因群,其中有16个广西分离株属第1群,它们与鸽子冠状病毒分离株的氨基酸序列同源性较高,与Massachusetts(Mass)型疫苗株的同源性较低。有15个分离株在33-34位和34~35之间分别有4个和3个氨基酸残基的插入,GX-NN6在33~34位和34~35位之间则均有4个氨基酸残基的插入;GX-YL1、GX-NN2与常用的Mass型疫苗株的亲缘关系最近,同属于第Ⅱ群;GX-G、GX-XD与日本同一时期分离的毒株JP Miyazaki 89亲缘关系最近,属于第Ⅲ群;GX-YL6、GX-NN7与欧洲毒株4/91亲缘关系较近,属于第V群。结果表明广西存在着多种类型IBV毒株的流行,毒株S1基因HVRI碱基的突变或插入比较普遍,可导致其氨基酸序列的变化,绝大部分毒株与目前常用的Mass型疫苗株的亲缘关系较低。同一时期的分离株同源性较高,但无明显的地域性差异。 展开更多
关键词 传染性支气管炎病毒 分离株 s1基因高变区I 序列测定 遗传变异 基因型
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禽呼肠孤病毒S1基因的扩增克隆与鉴定 被引量:17
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作者 谢芝勋 廖敏 +4 位作者 庞耀珊 谢志勤 邓显文 刘加波 李康然 《中国兽医科技》 CAS CSCD 2000年第8期3-5,共3页
利用反转录 聚合酶链 (RT PCR)技术 ,扩增出禽呼肠孤病毒 (ARV )S113 3、173 3长为 5 40bp的S1基因片段。将扩增到的这 2个毒株的S1基因通过粘端连接分别克隆到pBluescriptⅡKS +质粒中 ,用PCR和限制性内切酶分析鉴定 ,表明获得 2种重... 利用反转录 聚合酶链 (RT PCR)技术 ,扩增出禽呼肠孤病毒 (ARV )S113 3、173 3长为 5 40bp的S1基因片段。将扩增到的这 2个毒株的S1基因通过粘端连接分别克隆到pBluescriptⅡKS +质粒中 ,用PCR和限制性内切酶分析鉴定 ,表明获得 2种重组质粒ARVS113 3S1 pBluescript、ARV 173 3S1 pBluescript。 展开更多
关键词 禽呼肠孤病毒 RT-PCR s1基因 克隆
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鸡传染性支气管炎病毒S1基因免疫对鸡的保护作用 被引量:12
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作者 陈洪岩 江国托 +4 位作者 杨奇伟 陈奖励 张宝山 刘胜旺 卢景良 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 1999年第4期250-253,共4页
将鸡传染性支气管炎病毒肾型 T 株 S1 基因c D N A 连接于pc D N A3 的 Hind I I I与 Ba m H I位点之间构建含有 C M V 启动子及 B G Hpoly A 信号序列的鸡传染性支气管炎病毒 S1 蛋白真核表... 将鸡传染性支气管炎病毒肾型 T 株 S1 基因c D N A 连接于pc D N A3 的 Hind I I I与 Ba m H I位点之间构建含有 C M V 启动子及 B G Hpoly A 信号序列的鸡传染性支气管炎病毒 S1 蛋白真核表达质粒。实验证明, S P F 鸡肌注免疫后血清 Ig G 抗体逐渐升高,至第35 日龄左右达到高峰,攻毒后血清 Ig G 抗体先下降而后升高,血清 Ig G 抗体升高幅度不及 I B 油苗免疫组。质粒 D N A 免疫鸡攻毒后有40 % 的鸡可耐过强毒的攻击,说明 S1 基因在体内获得了表达并使鸡产生了一定的免疫力。 展开更多
关键词 s1基因 基因免疫 传染性支气管炎 IBV
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肾型禽传染性支气管炎病毒(IBV)Z株S1基因的结构与变异 被引量:10
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作者 常维山 蔡宝祥 +3 位作者 陈溥言 张绍学 姜平 杨奎 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期332-333,共2页
利用 1对 p UC质粒通用测序引物和 3条合成引物 ,通过步移法完成了肾型 IBV Z株 S1基因全部序列测定。所测序列已被 GENBANK收录 ,收入号为 AF1 4 0 352。该片段全长 1 74 7bp,含有 1个无终止子的阅读框架 ,编码 558个氨基酸。与 IBV-Be... 利用 1对 p UC质粒通用测序引物和 3条合成引物 ,通过步移法完成了肾型 IBV Z株 S1基因全部序列测定。所测序列已被 GENBANK收录 ,收入号为 AF1 4 0 352。该片段全长 1 74 7bp,含有 1个无终止子的阅读框架 ,编码 558个氨基酸。与 IBV-Beaudette株 S1基因序列比较 ,同源性为 77% ,并出现部分碱基的缺失与重组。无 Bam H 、Eco R 酶切位点 ,Pst 位点也未出现 ;氨基酸同源性为 74 %。 展开更多
关键词 禽传染性支气管炎病毒 肾型地方株 s1基因 序列分析 变异
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广西1985年~2008年IBV分离株S1基因高变区Ⅰ和N基因的序列和系统进化分析 被引量:16
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作者 磨美兰 李孟 +6 位作者 韦正吉 陈秋英 范文胜 郎亚辉 黄柏成 韦平 韦天超 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期761-765,799,共6页
为了解广西传染性支气管炎病毒(IBV)的纤突蛋白S1基因高变区Ⅰ(HVRⅠ)和核(N)蛋白基因变异情况及S1和N基因变异的相关性,本研究应用RT-PCR方法扩增了广西1985年~2008年的21株IBV的S1基因HVRⅠ和N基因,并进行了克隆、序列测定及分析。... 为了解广西传染性支气管炎病毒(IBV)的纤突蛋白S1基因高变区Ⅰ(HVRⅠ)和核(N)蛋白基因变异情况及S1和N基因变异的相关性,本研究应用RT-PCR方法扩增了广西1985年~2008年的21株IBV的S1基因HVRⅠ和N基因,并进行了克隆、序列测定及分析。结果发现:广西存在着多种基因型IBV流行;广西IBV分离株S1基因存在广泛的点突变和插入现象;N基因序列存在氨基酸替代现象。21株IBV中12株在S1基因HVRⅠ和N基因遗传进化树中均归属相同群,其余毒株却归属不同的群。2005年分离的GX-NN5存在基因重组现象。以上结果表明了广西IBV毒株存在基因突变和基因重组现象,S1和N基因的变异不完全平行,有些毒株间的S1和N基因差异很大。 展开更多
关键词 鸡传染性支气管炎病毒 s1基因高变区Ⅰ N基因 系统进化分析 基因突变 基因重组
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表达鸡传染性支气管炎病毒JS/95/03株S1蛋白的重组杆状病毒构建 被引量:7
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作者 戴亚斌 陈德胜 +6 位作者 丁铲 潘杰彦 刘兴友 芦银华 刘梅 陈溥言 蔡宝祥 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期86-90,共5页
The recombinant baculovirus expressing S1 glycoprotein of nephropathogenic strain JS/95/03 of infectious bronchitis virus was generated by using the Bac-to-Bac baculovirus expression system.The BamH I-Sal Ⅰ fragment ... The recombinant baculovirus expressing S1 glycoprotein of nephropathogenic strain JS/95/03 of infectious bronchitis virus was generated by using the Bac-to-Bac baculovirus expression system.The BamH I-Sal Ⅰ fragment containing S1 gene from the recombinant plasmid pMDJS9503S1 was purified and cloned in frame into the baculovirus transposing vector pFASTBAC HTa under the polyhedrin gene promoter.The recombinant transposing plasmid pFASTJS9503S1 was screened and then transformed into Escherichia coli DH10BAC.The resulting recombinant bacmid rBacmidJS9503S1 was transfected into cells of the insect Spodoptera frugiperda(Sf9)and the recombinant baculoviruse rAcJS9503S1 was obtained.The lysates of cells infected with rAcJS9503S1 were analyzed by SDS-PAGE and the expressed product of S1 gene was detected by Western bloting and immunofluorescence assay(IFA).The results showed the recombinant baculovirus was fully capable of expressing S1 glycoprotein of JS/95/03.Maybe owing to the incomplete glycosylation in insect cells,the S1 gene product had a Mr of only 61000.In immunofluorescence test and Western blotting,the expressed product could react with polycolonal antibody against IBV M41 strain,indicating it possessed the antigenic properties specific for native S1 glycoprotein. 展开更多
关键词 传染性支气管炎病毒(IBV) s1基因 s1蛋白 杆状病毒表达载体 表达
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