成都地区犬腺病毒2型分子流行病学调查及其纤突基因的生物信息学分析

为了解成都地区犬腺病毒2型(canine Adenovirus tgpe 2,CAV-2)的流行情况及其纤突基因的遗传变异情况,试验对采集的291份样本(鼻腔样本78份、粪便样本213份)进行PCR检测,利用SPSS软件分析CAV-2感染与犬年龄、性别、免疫情况及季节之间的关系;对CAV-2阳性样本的纤突基因进行全基因扩增,并利用生物信息学软件对其遗传变异情况进行研究。结果表明:在291份样本中,CAV-2阳性率为16.49%(48/291),其中鼻腔样本中CAV-2检出率为17.95%(14/78),粪便样本中CAV-2检出率为15.96%(34/213)。6月龄以下的幼龄犬中CAV-2检出率较高,与其他年龄犬只间存在显著差异(P<0.05);免疫完全犬的感染率与未免疫和不完全免疫幼犬间存在极显著差异(P<0.01));CAV-2的感染率无性别、季节等差异(P>0.05)。获得的48条CAV-2纤突基因序列与`GenBank中收录的国内外CAV-2毒株之间有较高的核苷酸序列同源性(98.3%~99.9%)和氨基酸序列同源性(98.5%~99.6%);48例阳性样本的核苷酸序列都处于同一CAV-2分支上,CAV-2的纤突蛋白氨基酸序列的糖基化位点都发生在N-Linked糖基化的N-X-T、N-X-S这两种保守序列段中,糖基化位点的数目和位置未发生改变。说明CAV-2纤突基因的遗传性稳定,在成都地区未显示明显变异。