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题名基于CT扫描的多枝柽柳年轮生长参数测量及验证
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作者
刘志洋
韩忠玲
程勇翔
董合干
吴玲
黄敬峰
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机构
石河子大学生命科学学院(绿洲城镇与山盆系统生态兵团重点实验室)
石河子大学机械电气工程学院
浙江大学农业遥感与信息技术应用研究所
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出处
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第20期9401-9411,共11页
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基金
国家自然科学基金(32360369)
欧盟Erasmus+项目(598838-EPP-1-2018-EL-EPPKA2-CBHE-JP)。
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文摘
利用多枝柽柳(Tamarix ramosissima Ledeb.)茎秆CT扫描图像,构建年轮三维解剖模型,获取年轮生长速率(TRGR)和年木材材积量(ATV)等生长参数。结果对树木长势评估、干旱区年轮水文响应和气候响应、林业碳汇计量等研究领域具有参考价值。研究通过对多枝柽柳茎秆CT扫描和平板扫描,分别获得其茎秆CT和平板二维横切扫描图。使用Python深度学习方法,获得CT年轮U-net语义分割模型。结合前期研究已构建的平板扫描年轮图像U-net语义分割模型,研究分别获取两种轮盘扫描图像年轮早材区域。轮盘扫描及语义分割后的结果经图像处理、GIS配准赋坐标后,借助GIS编辑和测量工具,完成多枝柽柳年轮周长、基部断面积生长增量、TRGR及ATV指标的计算。利用CT图像提取的年轮线状CAD图,根据CT切片顺序和间隔,在Sketchup 3D软件中重构多枝柽柳年轮三维解剖图,立体刻画年轮结构特征。研究测量结果通过成对样本t检验,Pearson相关系数检验和Bland-Altman定量一致性分析,评价多枝柽柳CT和平板扫描图年轮测量结果的一致性,检验CT扫描图年轮参数的提取准确性。研究结果表明基于CT图像测量的TRGR指标和平板扫描测量结果一致。成对样本t检验TRGR序列定量均值比较的P值均大于0.05,表明两种来源所得测量结果间无统计学差异。Pearson相关系数为0.9984(P<0.0001),表明两种测量结果间具有强相关性。Bland-Altman定量一致性分析,两种测量途径中有95.625%的样本差异位于一致性界限内,表明两种方法测量的结果具有一致性。基于CT图像通过GIS测量所得的多枝柽柳年轮生长参数经验证,结果准确。研究构建的CT图像年轮生长参数测量方法,可推广到农业和林业各类树木年轮参数的测量。研究结果对树木年轮无损测量技术的发展,未来树木年木材材积量的测算,以及利用年轮研究水文响应和气候响应具有参考价值。
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关键词
年轮
CT扫描
生长速率
年木材材积量
三维解剖图
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Keywords
tree-ring
CT scanning
tree-ring growth rate
annual timber volume
three-dimensional anatomical map
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分类号
S793.5
[农业科学—林木遗传育种]
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