基于全基因组SNPs对太行鸡保种群保种效果的评价

本研究利用全基因组低深度重测序技术及相关分析方法对2个太行鸡保种群的保种效果进行评价。结果显示:天凯和宁晋保种群的多态性标记比例分别为83.26%和84.45%;平均期望杂合度H_(e)和平均观察杂合度H_(0)分别为0.256、0.260和0.259、0.263,表明2个群体遗传多样性较为丰富;基于连续性纯合片段值计算近交系数,2个群体分别为0.053 1和0.048 7,天凯群体显著高于宁晋群体;亲缘关系分析显示,天凯群体中存在亲缘关系为全同胞的个体。2个群体遗传相似系数为0.795,此值偏低,遗传距离为0.230,此值偏大,说明2个保种群遗传结构存在显著差异,推测可能与天凯保种场在进行禽白血病净化过程中采用了不完善的方案而导致全同胞个体进入保种群有关。遗传结构、PCA和种系发生分析等的结果与上述结果一致,表明利用低深度重测序技术可更全面地评价保种效果。根据结果,建议天凯保种场重新组建保种群,制定科学的保种方案。

川白獭兔保种选育报告

川白獭兔是国家遗传资源委员会在2015年审定通过的我国第一个獭兔新品种,经过8年来(2016—2023年)的保种选育,其繁殖性能、生长发育及毛皮品质性能稳定,主要参数指标与川白獭兔品种审定时基本保持一致,部分指标参数有所提高。

基于重测序数据评估南阳牛保种效果

旨在通过遗传多样性和群体结构分析,评估南阳牛的保种效果。本研究基于30头健康南阳牛的全基因组重测序数据,通过变异检测获得单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)信息,综合分析群体遗传多样性、群体结构、亲缘关系以及连续纯和片段(ROH)分布特征,对南阳牛保种群的保种效果进行全面评估。结果显示:1)共检测到高质量SNPs位点数目是25929389个;2)保种群遗传多样性丰富,核苷酸多样性为0.0029,多态性标记比例为0.8887,最小等位基因频率为0.1861,期望杂合度为0.2749,观测杂合度为0.2557;3)世代有效群体含量在1000代前为2834头,在20代前为149头,呈逐年下降趋势;4)主成分分析结果显示南阳牛保种群没有明显分层;5)个体间的遗传距离介于0.80~0.89,平均遗传距离为0.83±0.02;6)30头南阳牛个体共分为7个家系,公牛可分为5个家系;7)共检测到ROH片段数目是4992个,平均每头南阳牛的ROH片段长度为约74.41 Mb,总长度为2.18 Gb,基于ROH的平均近交系数为0.031,0.5 Mb以下的ROH片段占比最多为75.72%,2~4 Mb的ROH片段占比最少为0.16%。综上所述,南阳牛保种群体遗传多样性丰富,没有出现明显分层,近交水平较低,但仍有个别个体近交较高。因此,未来的保种工作应加强选种和选配管理,以促进群体的可持续发展。

不同环境条件对黑水虻虫卵保种的影响

研究旨在探究黑水虻(black soldier fly)虫卵最佳保种条件,这将有利于实现黑水虻全年养殖,提高养殖效率和经济效应。通过测定和比较虫卵孵化率,分别探究不同卵龄、冷藏温度、垫料前处理、单一垫料、复合垫料和稻草秸秆成分等因素对黑水虻虫卵保种的影响。卵裂期、胚盘胚带形成期、原肠形成期和胚体分节期的虫卵不能直接冷藏,在整个冷藏阶段破壳期的虫卵孵化率显著高于其他卵龄的虫卵孵化率(P<0.05),相较于原肠形成期其冷藏周期提高了120%;在冷藏第1~7天,12℃与16℃的虫卵孵化率差异不显著(P>0.05),在冷藏第8~10天时,16℃的虫卵孵化率显著高于4、8、12℃(P<0.05),16℃下虫卵的冷藏周期(11 d)相较于12℃(8.67 d)、30℃(4.67 d)分别提高了26.87%和135.55%,可见16℃是破壳期黑水虻虫卵最适合保种的温度;通过线性回归分析,16℃下破壳期黑水虻虫卵和稻草秸秆混合,与30℃下正常孵化的黑水虻虫卵相比,其保种周期可延长2.10 d,即在不影响虫卵正常发育的情况下又可延缓其生长。由此可见,在16℃下,使用破壳期黑水虻虫卵与未经前处理的稻草秸秆混合,可有效改良黑水虻虫卵保存期短这一特性,达到保种目的。

基于SNP芯片的沙乌头猪保种分析

为了保护和利用沙乌头猪种质资源,本研究选择现有8个家系的沙乌头猪,采用中芯一号50K SNP芯片对其进行了群体结构分析,结果表明,243头沙乌头猪个体的基因型检出率为95.66%~98.75%,平均值为98.39%;群体期望杂合度和观察杂合度分别为0.349和0.369。ROH分析结果显示,每个沙乌头猪个体含有的ROH数量为17~75个,个体的ROH总长度为110.94~581.52 Mb,其中41.56%个体的ROH总长度约300~400Mb;基于此得出沙乌头猪群体的平均近交系数为0.13。根据公猪聚类分析,将26头公猪大致划分为7个家系,并根据217头母猪与公猪间的亲缘关系,将它们划分入不同家系,其中3头母猪(个体号分别为7404、13506和13708)和检测群体中公猪亲缘关系都比较远,因此将其归类为其他。本研究基于中芯一号50K SNP芯片技术从遗传水平反映了沙乌头猪种群的群体结构,为沙乌头猪的保种、开发与利用提供了有力参考。

基于SNP芯片的固原鸡遗传结构与保种效果分析

了解固原鸡的保种效果,为更好地保护和利用固原鸡这一重要地方种质资源提供参考和帮助。从固原鸡群体中随机采集公鸡、母鸡各30只血样,采用“京芯一号”55K芯片技术对固原鸡进行保种分析。结果显示,固原鸡群体有效含量为8.9,多态标记比例为0.828,期望杂合度为0.360,观测杂合度为0.359,说明该群体遗传变异较小,整齐度较高;G矩阵表明该群体中存在近亲交配的趋势;在检测到的1431个长纯合片段(runs of homozygosity,ROH)中,ROH长度在50~100 Mb的个体数量最多,占比达36.67%,该群体平均近交系数为0.11。结合基因组亲缘关系分析和聚类分析结果,现有30只公鸡样本可以划分为10个家系,其中25只母鸡分别划入不同家系,另外5只母鸡和所检测的公鸡亲缘关系系数均小于0.1,亲缘关系都比较远,因此,将它们归入了“其他”分类中。综上所述,该保种固原鸡群体遗传变异较小,选育程度较高,为降低群体的近交增量,后期的保种过程中需考虑亲缘关系再进行配种。

室内小水体尼罗罗非鱼保种技术

随着罗非鱼养殖品种日益增多,如何经济高效地保存这些新品种的优异种质变得越来越重要。经过多年的试验和探索,初步摸索出一套完整的室内小水体尼罗罗非鱼保种技术。室内小水体循环系统由养殖缸、充气系统、控温系统、水体净化系统等组成,可严格控制水温在28℃左右,溶氧丰富,能够满足罗非鱼人工繁殖、养殖的必需条件。室内小水体尼罗罗非鱼人工养殖的主要技术流程有鱼苗的放养密度、养殖用水要求、饲养管理和疾病防治等。室内小水体尼罗罗非鱼人工繁殖技术的流程有亲鱼的培育、亲鱼配组、受精卵的口腔孵化或体外人工孵化、苗种培育等。总体上,在室内小水体就可以养殖、繁殖罗非鱼,是一种非常适合于罗非鱼保种的有效方法。

浙江中蜂保种现状及保护开发建议

“浙江中蜂”是具有浙江地域特征的蜜蜂保护品种,是在长期进化适应的过理中形成的特别适应浙江省气候、蜜源条件的蜂种,早在2013年被列入浙江省畜禽遗传资源保护品种,2022年“江山中蜂养殖系统”入选浙江省首批重要农业文化遗产资源。

湖羊保护区保种场母羊多羔性能的调查研究

湖羊是我国特有白色羔皮用绵羊品种,也是世界著名多羔羊绵羊品种,中心产区为太湖流域的浙江省湖州市的吴兴、南浔,嘉兴市的桐乡、海宁和江苏省的吴中、太仓等县区。湖州怡辉生态农业有限公司湖羊场为吴兴区湖羊国家保护区内核心保种场之一,承担着湖羊种质资源保护任务,目前保种场湖羊存栏7500只,基础母羊2550只。为了进一步探明现代湖羊的繁殖性能,对该场2022年8月至2023年9月期间湖羊产羔情况进行了一次调查研究,现将调查分析报告如下。

做好保种选育 做强特色产业 遗传资源保护开发并重,“石禽食美”太行鸡一鸣惊人

太行鸡是河北省珍贵的地方品种,是国家不可多得的家禽遗传资源和战略性资源,是高品质的家禽品种。太行鸡遗传资源是蛋肉鸡育种事业和养殖业持续发展的宝贵的种质基础之一,也是生物遗传资源的重要组成部分。近年来,在专家和企业家的共同努力下,坚持保种与开发并重,以保促用、以用促保战略,太行鸡成功纳入国家畜禽品种名录,太行鸡产业不断发展壮大。

边鸡的保种历史、现状和未来

20世纪80年代以后,养殖环境的变化,外来品种的进入、规模养殖的普及致使边鸡数量急剧下滑,曾濒临灭绝。该文概述了边鸡的产区情况,包括地理位置、气候条件、品种形成历史等,对比分析有书面记载以来边鸡的外貌特征和生产性能变化,介绍了边鸡保种的历史和现状,提出了未来发展目标,根据原产地乌兰察布的情况,并针对保种和利用中存在的问题提出了一些切实可行的建议和对策,以期为边鸡的种质资源保护与开发利用提供参考。

分子标记在畜禽保种中应用的研究进展

畜禽种质资源是农业科技创新的重要基础,对于打赢种业翻身仗具有重要意义。相较于利用传统系谱等信息对保种效果进行评价,基于分子标记手段的评价方法更为科学、直接,目前已广泛应用于畜禽保种中。该文主要围绕当前我国畜禽遗传资源的现状以及危机、分子标记常见的检测方法以及基于不同分子标记在猪、鸡、牛等畜禽遗传资源保种中应用的研究进展展开阐述,以期为我国畜禽遗传资源基于分子手段科学评价保种效果提供参考及帮助。

沂蒙山区中华蜜蜂“沟峪型”保种配套技术

沂蒙山区中华蜜蜂属我国中华蜜蜂北方型,是我国国家级畜禽遗传资源保护品种,主要生存于临沂市蒙山周围的山区和丘陵地带,包括蒙阴、平邑、费县、沂水、沂南等地区[1]。为促进中华蜜蜂的保种工作,蒙阴县结合南蒙山、北岱崮山区地理优势,在沂蒙山中华蜜蜂(北方型)保护区隔离区内构建中华蜜蜂沟峪型保种架构,突出沟峪型地理特点形成阻断西蜂转地入侵的天然屏障,推广沂蒙山中华蜜蜂沟峪型保护模式[2]。

尤溪县戴云山羊保种存在的问题与对策

通过对戴云山羊保种情况进行调查,简述戴云山羊品种资源基本情况、存在的主要问题及保护与开发对策。

乌兰察布细毛羊保种选育及开发利用

乌兰察布细毛羊是20世纪90年代乌兰察布市唯一的一个家畜培育品种,被列入国家畜禽品种遗传目录。近年,由于市场原因,乌兰察布细毛羊养殖数量急剧下滑,目前乌兰察布市细毛羊基础母羊数量仅存600余只,该优良品种已到濒临灭绝的边缘。为不使该优良培育品种遗传基因灭绝消失,内蒙古自治区向乌兰察布市下达乌兰察布细毛羊遗传材料保存项目。项目选择具有乌兰察布细毛羊特性、特征、健康无疾病的公母羊,制作冷冻精液3000剂和冷冻胚胎200枚,保存到国家基因库。本项目的实施,使乌兰察布市畜牧业中唯一一个细毛羊培育品种遗传基因得以保存,为振兴乌兰察布市畜禽种业和丰富内蒙古自治区品种资源做出贡献。

大河猪保种现状分析及建议

大河猪是乌金猪的代表猪种,在乌金猪中起源相对较早,具有独特的遗传结构。大河猪除具备乌金猪的共性特点外,最大的特点是后腿比例较高,肌内脂肪和不饱和脂肪酸含量丰富,是“云腿”的优质原料猪种,具有重要的保护和开发利用价值。本文主要总结和分析大河猪的保种现状及存在的问题,并提出后期保种工作的建议。

岷县黑裘皮羊一场七群保种繁育体系模式运行效果观察

岷县黑裘皮羊是甘肃省特有的绵羊品种,生长在高海拔、空气稀薄、气候多变、枯草期长的自然条件下,由于生长环境和羊群特点,存在着群体规模小、饲养分散、经营效益低下,种群的家系血统来源单一,造成品种退化严重,种质资源存在灭绝的风险。岷县黑裘皮羊保种扩繁关键技术研究项目通过构建“一场七群保种繁育体系模式”进行品种选育扩繁提高,经过3年运行,在种群数量,品种质量等方面取得了明显的成效。本文详述了项目实施的体系构架、运行情况、运行成果、项目措施,并提出了保种建议。希望能进一步推动岷县黑裘皮羊的保护与利用工作。

织金白鹅种群现状及保种选育开发利用探讨

织金白鹅是毕节市地方品种鹅,是贵州省优良的遗传资源,具有抗逆性强、食性广、肉美汤鲜等特点。该文就织金白鹅种群现状、产地环境及养殖方式、品种特征、存在问题、保种选育措施、开发利用措施6个方面展开论述,为下一步织金白鹅保种选育及开发利用工作的开展提供一定的理论依据。

沂蒙山区中华蜜蜂“沟峪型”保种配套技术

沂蒙山区中华蜜蜂属我国中华蜜蜂北方型,是我国国家级畜禽遗传资源保护品种,主要生存于临沂市蒙山周围的山区和丘陵地带,包括蒙阴、平邑、费县、沂水、沂南等地区。为促进中华蜜蜂的保种工作,蒙阴县结合南蒙山、北岱固山区地理优势,在沂蒙山中华蜜蜂择(北方型)保护区隔离区内构建中华蜜蜂沟峪型保种架构,突出沟峪型地理特点形成阻断西蜂转地入侵的天然屏障.

地方品种圭山山羊保种工作思考

圭山山羊是一个优良的肉乳兼用型地方山羊品种,据石林彝族撒尼历史典籍中记载彝族撒尼人饲养圭山山羊历史已有2800多年,石林乳饼的制作可追溯到2200多年前。圭山山羊具有适应性强,耐粗饲,抗病性能强的特点,是一个优良的地方品种。随着高产品种的不断冲击,兼用品种主产性状不明显,生产性能提高缓慢,经济效益难以提高,近年来各级政府部门不断提出种质资源保护的重要性,圭山山羊的保种工作刻不容缓。