我国斯里兰卡木薯花叶病毒的分子特征及致病性分析

为进一步探究我国斯里兰卡木薯花叶病毒(Sri Lankan cassava mosaic virus,SLCMV)的分子特征及致病性。以感染SLCMV的木薯叶片基因组DNA为模板,PCR扩增获得DNA-A和DNA-B基因组全长,通过生物信息软件分析比较其核酸及氨基酸序列特征;构建了强、弱致病力分离物(SLCMV-Colombo和SLCMV-DG1922)的侵染性克隆,分别将2种致病力分离物的DNA-A和DNA-B组分进行重组,接种烟草(Nicotianatabacum),比较2种分离物的致病性差异。结果显示:我国SLCMV为“旧世界”双组份菜豆花叶病毒,编码包括AV2基因在内的8个开放阅读框(ORFs);具有双生病毒典型的共同序列(CR)、重复序列、TATABox和TAATATT↓AC茎环结构,Rep蛋白羧基末端有7个氨基酸缺失;我国SLCMV的基因组、编码和非编码区与柬埔寨、泰国和越南分离物的相似性在97.0%~100.0%之间,与印度和斯里兰卡早期的分离物相似性为86.5%~98.6%,DNA-B组份与印度木薯花叶病毒株系(ICMV)编码区序列相似性为95.0%~97.6%,与其他9个非洲木薯花叶病毒株系序列之间的序列相似性均低于80.0%。侵染性克隆接种结果证实,强致病力分离物SLCMV-Col的DNA-A(Col-A)组份在烟草叶片表现典型花叶症状中起主要作用,而我国分离物的DNA-B(DG1922-B)能协同Col-A对烟草产生强致病性。本研究分析了我国SLCMV的全基因组结构,建立的侵染性克隆及其技术为进一步解析SLCMV致病性机理提供重要的研究基础。

血清HBV RNA分子特征、检测方法及临床应用研究

肝细胞内共价环状闭合DNA(cccDNA)是乙型肝炎病毒(HBV)的复制中间体,与HBV复制密切相关。同时,它是前基因组RNA(pgRNA)的转录模板,而血清中的HBV RNA多来自未逆转录的pgRNA。近年来许多研究表明HBV RNA在监测疾病进展和预测慢性HBV感染患者的预后等方面有重要作用,是慢性乙型病毒性肝炎的一种潜在的生物标志物。该文从HBV RNA的分子特征、检测方法及临床应用研究进展进行概述。

未分化/去分化子宫内膜癌分子特征及临床研究进展

未分化/去分化子宫内膜癌是临床罕见的高侵袭性肿瘤,预后差,诊断时往往处于晚期,且对常规化疗耐药。因此,新的治疗策略亟待探索。未分化/去分化子宫内膜癌具有不同于常见子宫内膜癌的特殊遗传学特征。其肿瘤发生通路具有独有的特征,如微卫星不稳定/错配修复蛋白、开关/蔗糖非发酵复合物染色质重塑复合物的基因失活。因此分子检测对未分化/去分化子宫内膜癌的临床管理、参与临床试验和靶向治疗具有重要意义。本文总结了未分化/去分化子宫内膜癌这两个罕见亚型的分子特征和临床研究,以探索当前和未来研究的潜在分子靶点。

武汉地区住院患者克罗诺杆菌感染及其临床分离株分子特征与耐药性研究

目的:研究武汉地区住院患者克罗诺杆菌感染及其临床分离株分子特征与耐药性。方法:选取2021年6月~2022年5月在武汉市第一医院就诊的克罗诺杆菌感染住院患者137例为研究对象,对患者克罗诺杆菌分离株行血清型分型鉴定、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型分析、克隆群结构特征分析与耐药性检验。结果:483例患者检出克罗诺杆菌感染137例,总检出率28.36%。男、女检出率差异无统计学意义(P>0.05),年龄分布以低龄(0~6岁)检出率最高,科室分布以儿科检出率最高,感染后易发疾病类型为脑膜炎(P<0.05);血清型分型鉴定以O 1为主要血清型分型,占比36.50%(50/137),ST型分布以ST4、ST1为主,分别占比40.15%(55/137)和31.38%(43/137),CC结构特征以CC4、CC7为主,分别占比32.85%(45/137)和40.15%(55/137);经内切酶Xba I和Spe I酶切后,分成14个PFGE图谱类型,其中BQ9、BQ11和BQ12相似系数较高(98.0%);耐药性检验结果提示,氨苄西林的耐药性较强(67.15%),对测定的其他抗生素全部敏感,未发现多重耐药菌株。结论:武汉地区住院患者克罗诺杆菌感染血清型分型以O 1型为主,PFGE分子分型具有多样性,其中氨苄西林的耐药性较强。

评价和分析云南昭通地区肺结核患者中MTB基因多样性及耐药分子特征对临床疗效的影响

目的:探讨和分析云南昭通地区肺结核患者中结核分枝杆菌(MTB)基因多样性及耐药分子特征对临床疗效的影响。方法:将2022年1月—2023年3月云南昭通地区300例初治的肺结核患者作为研究对象,以传统固体比例法对利福平、异烟肼、乙胺丁醇、链霉素、卡那霉素、氧氟沙星、卷曲霉素等临床常用抗结核药物进行药敏试验,分析所选研究对象MTB基因分型及不同MTB基因型与耐药性关系。结果:MTB分离株基因型以北京家族占比最高,构成比达52.33%,属于主要流行基因型。不同基因家族MTB菌株对乙胺丁醇、链霉素、卡那霉素及卷曲霉素的耐药性差异无统计学意义(P>0.05);不同基因家族MTB菌株对利福平、异烟肼、氧氟沙星的耐药性差异有统计学意义(P<0.05)。结论:云南昭通地区肺结核患者MTB基因存在多样性且以北京基因型为主,不同MTB基因型对抗结核药物耐药性存在较大的差异,可影响抗结核药物治疗效果,临床可根据MTB基因分型以及药敏试验结果合理选择抗结核药物。

高侵袭性特殊分子特征肾细胞癌的外科治疗决策及其价值 (“大家泌尿网”观看手术视频)

特殊分子特征肾细胞癌是2022版世界卫生组织(WHO)泌尿系统及男性生殖器官肿瘤分类中首次提出的1类具有明确驱动基因的肾癌病理亚型。其中以延胡索酸水合酶缺陷型肾细胞癌(FH-RCC)和SMARCB1基因缺陷型肾髓样癌为代表的肾癌亚型具有高侵袭性和高致死性等临床特点,极易出现早期转移,故称为高侵袭性特殊分子特征肾细胞癌。该类肾癌亚型的发病率低且缺乏相关机制研究,目前临床仍无标准治疗方案。针对原发病灶或者转移病灶的减瘤性肾切除手术均是在全身系统化药物治疗下进一步改善转移性肾癌患者生命和生活质量的重要手段。但针对高侵袭性特殊分子特征肾细胞癌,外科治疗的策略及其价值尚不明确,值得深入讨论和思考。本文就上述问题进行讨论,以期为高侵袭性特殊分子特征肾细胞癌患者的预后改善提供线索和参考。

江苏省某监测点家畜来源肠致病性大肠埃希菌分离株分子特征分析

目的分析江苏省某监测点家畜来源肠致病性大肠埃希菌分离株分子特征,进而评估其潜在的致病性,为感染性腹泻的监测与防控提供依据。方法采用全基因组测序技术对江苏省某监测点分离的家畜来源的37株肠致病性大肠埃希菌(EPEC)菌株进行特征性分析。结果本地家畜来源的EPEC均为非典型EPEC(aEPEC),其血清型多样,携带多种与腹泻相关的毒力基因,有9种ST型且具有区域性流行特征,eae基因包含有5种亚型,β1为优势亚型,其在腹泻病人中也最为常见。结论aEPEC对公众健康构成潜在威胁,应在感染性腹泻的监测工作中,加强对家畜粪便及养殖环境的监测。

新型鹅源星状病毒广西流行株GoAstV-GXHZ01-2022基因组分子特征分析

为研究新型鹅源星状病毒(GoAstV)广西流行株基因组的分子特征,本研究采集广西3只疑似GoAstV感染发病雏鹅的3份组织病料样品(每份样品包括肾脏、肝脏和脾脏),采用荧光定量RT-PCR(RT-qPCR)检测GoAstV,以GoAstV阳性样品的核酸为模板,经RT-PCR分段扩增、测序及拼接获得GoAstV广西株的全基因组序列,采用BioEdit软件分析上述获得的GoAstV全基因组序列与该病毒参考株各功能基因(ORF1a、ORF1b及ORF2)的相似性,采用Bepipred及NetNGlyc软件预测该病毒Cap蛋白的抗原表位与N-糖基化位点,通过Mega 7.0软件绘制各功能基因的进化树,通过RDP 5软件分析ORF基因序列的重组事件。结果显示,RT-qPCR检出3份GoAstV阳性样品,并经测序获得1条GoAstV广西流行株GoAstV-GXHZ01-2022全基因组序列,该基因组全长为7 149 bp,其中5'非编码区(5'UTR)长143 bp,ORF全长6 929 bp,3'UTR长77 bp;GoAstV-GXHZ01-2022株与经典GoAstV代表株的ORF1a、ORF1b及ORF2基因序列的相似性分别为53.0%~53.4%、63.2%~63.5%及48.2%~48.4%,与新型GoAstV参考株相应基因序列的相似性分别为97.0%~99.6%、98.1%~99.8%及97.5%~99.8%;Cap蛋白抗原表位预测结果为aa6~aa16、aa20~aa66及aa80~aa86等共29个区域存在抗原表位,N-糖基化位点预测结果为^(81)NSTD^(84)、^(401)NTTG^(404)、^(464)NITF^(467)及^(531)NTST^(534);功能基因的进化树结果显示,GoAstV-GXHZ01-2022株与新型GoAstV参考株均处于同一进化分支,与禽星状病毒3型(AAstV-3)流行株遗传距离较近,与AAstV-1次之,与AAstV-2最远;基因重组分析结果显示,GoAstV-GXHZ01-2022株的ORF1a和ORF2检测到重组信号,主要亲本株为新型GoAstV安徽株AstV/AH01/Goose/0512/18,二者相似性为98.6%,次要亲本株为新型GoAstV河南株AstV/HB02/Goose/0310/19,二者相似性为99.1%。表明GoAstV-GXHZ01-2022株与新型GoAstV参考株相似性最高,进化趋势也一致,并检测到重组现象。本研究为丰富GoAstV基因库中广西流行株全基因组序列信息提供基础数据。

牛科物种THRSP基因的分子特征及功能比较分析

【目的】探究牛科物种THRSP基因的序列特征、功能差异及系统发育关系。【方法】从NCBI和Ensembl数据库下载常见牛科物种和非牛科物种的THRSP基因及其编码产物的氨基酸序列,进一步利用比较基因组学和生物信息学方法对所得数据进行比较分析。【结果】牛科物种THRSP基因转录区的结构相似,编码序列一致性高(93.2%~96.9%),但非翻译区和内含子差异较大。牛科THRSP蛋白均为亲水性核蛋白,无跨膜区和信号肽,都包含1个Spot_14或Spot_14超家族保守结构域,其参与的生物学路径主要与脂类的生物合成有关,分子功能主要与脂肪酸合酶活性和蛋白同源二聚化活性相关。与牛科THRSP互作的蛋白质主要与脂肪酸的合成和β-氧化、蛋白质代谢和转运、跨细胞膜或细胞器的物质转运、溶酶体与吞噬体的融合等生物学过程有关。牛科THRSP蛋白的氨基酸组成、理化特性、基序组成模式、保守结构域、功能修饰位点和高级结构高度相似,但表现出属间差异。系统发育分析表明:牛科物种同属动物间THRSP蛋白的亲缘关系更近。【结论】牛科物种THRSP序列和结构一致性高、功能相似,是一种在细胞核中发挥功能作用的亲水蛋白,推测其参与牛科物种脂合成的调节。

5株H6N3亚型禽流感病毒的分子特征及遗传演化分析

为了解H6N3亚型禽流感病毒(AIV)的遗传演化特点,试验对2023年采集自广东、湖北两地的活禽交易市场禽类咽喉拭子及泄殖腔拭子进行病原分离鉴定,并对分离的H6N3亚型AIV进行全基因组序列测定,进一步分析其遗传演化情况和特殊分子标记。结果显示:共分离到5株H6N3亚型AIV,且均为新型重配病毒,可分为2种基因型,其中4株湖北分离株属于基因1型,NA基因进化支相对独立,其余基因片段与分离于我国家禽的H3N2、H3N3、H3N8、H6N6亚型AIV有着较近的亲缘关系;1株广东分离株属于基因2型,与多种不同亚型野鸟源病毒高度同源;5株分离株HA蛋白的裂解位点序列仅有一个碱性氨基酸,符合低致病性禽流感病毒(LPAIV)的特征;4株湖北分离株的NA基因全长仅有1365bp,其编码的NA蛋白出现茎部缺失;部分分离株HA蛋白获得A138S突变,一株病毒的PB2蛋白获得I292V突变。综上所述,分离的5株H6N3亚型AIV为新型重配病毒,部分分离株获得哺乳动物适应性突变,应加强对H6亚型AIV的流行病学监测。

非洲猪瘟病毒O174L蛋白的真核表达载体构建及分子特征分析

为分析非洲猪瘟病毒O174L基因,通过同源重组方式将O174L基因连接至p RK5M-C-2×Strep载体,构建重组质粒,经PCR扩增和测序鉴定正确后,将重组质粒转染至猪小肠上皮细胞系(porcine intestinal columnar epithelial cells,IPEC-J2)中,通过免疫荧光和Western blot检测O174L蛋白的表达情况。PCR及测序结果显示,p RK5M-C-2×Strep-O174L重组质粒构建成功。免疫荧光和Western blot检测结果显示,O174L蛋白能够在IPEC-J2细胞中稳定表达。生物信息学分析结果显示,基于O174L基因和B646L(p72)基因序列构建各分离毒株的2个系统发育树间排列高度相似。来自中国的16株分离株中,O174L基因序列的相似性高达96.76%~100.00%。其中,与中国爆发的其他Ⅱ型分离株相比,China/2018/Anhui XCGQ在O174L蛋白的第67、75及110位氨基酸存在差异,GZ201801在第110位氨基酸存在差异。Ⅰ型分离株SD/DY-I/2021和HeN/ZZ-P1/2021的O174L蛋白的氨基酸序列分别在第13、73、93、95、113和114位上与其他中国Ⅱ型分离株存在差异。O174L蛋白为稳定的亲水蛋白,没有信号肽和跨膜区;其二级结构由α螺旋、β折叠和无规则卷曲组成,三级结构预测结果与二级结构预测相符。以上结果为深入研究ASFV O174L蛋白与宿主间的相互作用和遗传进化提供了基础。

绵羊肺源大肠杆菌cyaA基因的分子特征及抗原性分析

为研究绵羊肺源大肠杆菌cyaA基因的分子特征、抗原性及其遗传进化关系,采用PCR技术对绵羊肺源大肠杆菌XJ10菌株的cyaA基因进行扩增、克隆并测序,应用定量PCR检测cyaA基因在不同培养阶段的mRNA表达量,利用在线软件对其进行编码蛋白分子特征、抗原性及其遗传进化分析。结果显示,cyaA基因全长2547 bp,编码848个氨基酸;cyaA基因在细菌对数期的mRNA表达量最高,其次是稳定期及迟缓期,在衰亡期的mRNA表达量最低;氨基酸序列分析发现,分子式为C_(4389)H_(6759)N_(1193)O_(1273)S_(30),理论分子质量为97.57 ku,理论等电点为5.82,为酸性亲水性蛋白,稳定性较低;二级结构中α-螺旋、无规则卷曲、延伸链和β-折叠所占比例分别为42.81%、39.03%、14.27%和3.89%。AC蛋白无信号肽与跨膜区,保守结构域位于1~848位氨基酸,属于腺苷酸环化酶超家族,具有14个开放阅读框,存在81个磷酸化位点。AC蛋白B细胞优势表位共16个,分别位于第44~51、61~65、248~250、259~267、296~304、355~366、436~439、456~456、476~481、489~490、540~559、589~597、634~640、717~722、766~773、806~806区段;遗传进化分析发现大肠杆菌XJ10菌株AC蛋白与志贺氏菌AC蛋白相似性最高。本试验结果为进一步研究大肠杆菌AC蛋白的功能及其作为大肠杆菌疫苗候选抗原奠定了基础。

引起典型PDNS的PCV-2病原分子特征分析

为了了解引起贵州省贵定县某猪场育肥猪群出现的典型猪皮炎肾病综合征(PDNS)的PCV-2的分子特征,试验首先对采自该猪场患病猪血清进行PCR扩增和克隆测序,然后采用多种分子生物学软件及网站对PCV-2的基因型、基因结构、推导蛋白等进行研究。结果表明:PCR扩增得到大小为1767 bp的条带,与GenBank中CZ246毒株序列(登录号为MZ995482)的相似性最高,将获得的毒株命名为PCV-2 GZGD2022。PCV-2 GZGD2022株为PCV-2d基因型,与PCV-2d参考株NLControl4(登录号为AY484410)相比,含10个开放阅读框(ORF),缺失ORF8,其ORF5终止密码子提前,大小仅为21 bp。该毒株在基因组第1042位有1个碱基T的缺失,但导致Cap蛋白C末端延伸的是脯氨酸(P)而非赖氨酸(K)。与疫苗株(LG株、DBN-SX07-2株、ZJ株、SH株)相比,在Cap蛋白的抗原表位区有7个特异性突变点(F53I、R59K、A68N、T134N、A190T、A68N、T134N)。上述疫苗株之间磷酸化位点的差异主要集中在Cap蛋白上,在88 aa处多了1个丝氨酸磷酸化位点,在47 aa、134 aa、149 aa处少了1个苏氨酸磷酸化位点,在55 aa和218 aa处少了1个酪氨酸磷酸化位点。Rep蛋白有3个N糖基化位点(23NPS25、256NQT258和286NAT288),Cap蛋白有1个N糖基化位点(143NYS145)。Rep、Cap蛋白为混合型蛋白。此外,Rep、Cap蛋白有一些特殊功能结构域,如前者的PH-LIKE、NACHT等结构域和后者的乙酰化修饰位点(1MTYPR6)与核定位信号(NLS)。说明引起贵州省贵定县某猪场猪群出现典型PDNS的致病株为PCV-2d基因型,该毒株缺失ORF8,编码蛋白的氨基酸、抗原表位和磷酸化位点的改变可能是导致其毒力较强、引起典型PDNS的原因。

鳙IGFBP1分子特征及基因表达模式研究

从鳙(Hypophthalmichthys nobilis)基因组中获得胰岛素样生长因子结合蛋白1(IGFBP1,insulin-like growth factor binding protein 1)基因序列,并对其蛋白质理化和进化特征以及基因表达模式进行分析。鳙IGFBP1开放阅读框(ORF)为789 bp,编码262个氨基酸,蛋白分子量为28139.23 u,等电点(pI)为7.42,具有1个信号肽但不具有跨膜结构,推测其为亲水性分泌蛋白。鳙IGFBP1蛋白具有两个保守的IB和TY结构域,与鲤形目鱼类IGFBP1有较高的序列同源性。鳙IGFBP1的基因时空表达分析结果显示:体节期表达量显著上调,出膜后表达水平迅速下降;成鱼肝脏中的表达量最高,皮肤、肠、性腺等组织也有一定的表达,其余组织的表达量较低。对群体中具有显著生长差异的个体进行IGFBP1表达分析,结果显示在极大个体与极小个体的肝脏组织中具有极显著性差异(P<0.01),提示该基因在鳙快速生长中发挥了正调控作用。研究结果对鳙生长调控分子机制研究及遗传改良研究具体理论和潜在应用价值。

牛环曲病毒云南株纤突蛋白基因分子特征及进化分析

【目的】了解牛环曲病毒(Bovine torovirus,BToV)在云南部分地区牛群中的流行及其S基因遗传进化情况。【方法】采集云南省内13个地区15个牛场不同年龄牛的粪便样品655份,利用RT-PCR方法检测BToV,并对其中6株BToV阳性样品进行S基因扩增、克隆、测序及遗传进化分析。【结果】RT-PCR检测结果显示,655份牛粪便样品检出71份BToV阳性,总阳性率为10.8%;其中腹泻样品阳性率为21.2%(59/278),非腹泻样品阳性率为3.2%(12/377);1周龄、1周龄~1月龄、1~6月龄和1岁及上样品的阳性率分别为15.0%(3/20)、17.7%(20/113)、14.0%(45/321)和1.5%(3/201)。相似性分析结果显示,6条BToV S基因序列相似性为96.0%~99.8%,且与原始毒株Breda1的相似性为94.7%~96.0%,与国内流行毒株的相似性为95.2%~99.7%。遗传进化分析结果显示,6条S基因均与原始毒株Breda1不在同一大分支,与国内四川、河南毒株及土耳其毒株形成一个大分支,表明云南省BToV毒株与目前国内流行毒株一致,亲缘关系近。氨基酸突变位点分析结果显示,S基因存在少量独特的氨基酸突变位点。重组分析结果显示,BTOV-China/YN03-2021、BTOV-China/YN01-2021和BTOV-China/YN06-2022为重组序列,其中重组序列BTOV-China/YN06-2022得分最高,重组区域为1438~1609 bp区间,主要亲本为BTOV-China/YN05-2021;重组序列BTOV-China/YN03-2021,重组区域位于1668~3569 bp区域,主要亲本为土耳其毒株BToV-HT2-TUR(MG957146.1);重组序列BTOV-China/YN01-2021,重组区域位于261~2552 bp,主要亲本为土耳其毒株BToV-HT2-TUR(MG957146.1)。基因选择压力分析结果显示,BToV S基因的进化方式主要以中性选择为主,但同时也存在净化选择和正向选择的压力影响。【结论】本研究揭示了BToV已存在于云南省部分地区牛群体中且防控形势较严峻,可为中国研究BToV流行病学和BToV S基因遗传进化关系提供参考,同时也为云南地区制定BToV感染的防控措施提供理论依据。

Claudin18.2分子特征概述及其作为治疗靶点在胃癌中的研究进展

作为紧密连接蛋白(Claudin,CLDN)家族成员之一,Claudin18.2(CLDN18.2)在正常情况下仅在正常胃黏膜上皮细胞中表达,以维持细胞正常功能。但在异常情况下,CLDN18.2在包括胃癌在内的多种恶性肿瘤中呈高表达状态,使其成为治疗前景非常高的新靶点。目前,靶向CLDN18.2的抗肿瘤新药研发如火如荼,药物类型和治疗策略呈现多样化。本文旨在概述CLDN18.2的分子特征,并对胃癌中靶向CLDN18.2的新药/新技术研发现状进行梳理,包括单克隆抗体、双特异性抗体、抗体药物偶联物、嵌合抗原受体T细胞免疫疗法、纳米抗体等。

猪萨佩罗病毒HNHB-01株VP1基因的表达与分子特征

猪萨佩罗病毒(PSV)VP1蛋白是位于病毒粒子表面的结构蛋白,发挥主要的抗原效应。为了弄清PSV HNHB-01株VP1基因的表达与分子特征,本研究设计针对VP1基因的特异性引物,通过RT-PCR扩增获得VP1基因,并重组到真核表达载体pCAGGS上,经Western blot、间接免疫荧光鉴定,成功表达VP1蛋白。随后基于PSV HNHB-01株全基因序列以及VP1基因序列与其他参考毒株的基因序列构建遗传进化树,分析遗传进化关系。结果表明:实验室分离的HNHB-01株与2017年分离的HNXX-01株亲缘关系最近,与日本株JPSV-1315关系接近;HNHB-01 VP1基因与国内2016-2017年流行的毒株HNXX-01、PSV-A2、JXXY-a2的VP1基因高度同源,与国外2009年流行的日本毒株JPSV1315的VP1基因亲缘关系较近;HNHB-01株VP1氨基酸与HNXX-01株VP1氨基酸同源性最高,同源性为99.32%。三级结构分析表明,VP1蛋白存在3条位于蛋白结构外侧的抗原表位区,对应的氨基酸序列分别为20~30 aa、90~100 aa和265~275 aa。本研究为PSV感染的诊断与预防提供依据,并为今后研究VP1基因的功能和开发疫苗奠定基础。

6株H9N2亚型禽流感病毒分子特征及遗传演化分析

为了解H9N2亚型禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)的分子变化特征及其跨物种传播的可能性,对实验室保存的6株H9N2亚型AIV的8个基因片段进行了序列测定及遗传演化分析,并且对6株病毒与选取的代表毒株进行了HA和NA同源性及关键氨基酸位点分析。结果显示,分离的6株病毒均为欧亚系,其中3株为G57基因型;4株病毒的HA蛋白发生了Q226L突变,2株病毒的HA发生了A190V突变。HA和NA均有增加或缺失的潜在糖基化位点。6株病毒的NA茎部均有62~64位的缺失,红细胞结合位点431~433较为保守,而368和369位变化较大。综上,6株病毒为低致病性AIV,HA和NA均含有哺乳动物适应性突变,增大了其跨宿主传播的风险。研究结果为我国H9N2亚型AIV的进化提供了参考依据,为其综合防控提供了理论指导。

基于肿瘤分子特征胶质母细胞瘤患者对肿瘤电场治疗敏感性预测价值探讨

目的 探究肿瘤电场治疗(TTFields)的抗肿瘤效用及可预测患者对TTFields治疗响应的肿瘤分子特征。方法 回顾性分析华山医院2018年8月—2023年6月收治的100例接受过TTFields治疗的新诊断的胶质母细胞瘤(ndGBM)患者的临床资料和基因检测数据,另选择195例未接受电场治疗的ndGBM作为对照组。采用Kaplan-Meier法分析TTFields治疗组和对照组患者生存差异;组间比较采用Log-rank检验。采用多因素Cox回归分析探讨TTFields治疗效果的影响因素。结果 TTFields治疗组中位总生存期(OS)23.0个月(95%CI:17-NA),对照组中位OS为15.1个月(95%CI:13~18)。TTFields治疗组中位无进展生存期(PFS)17个月(95%CI:12-NA),相比对照组中位PFS为12个月(95%CI:9~12)。多因素Cox回归分析结果显示,PTEN突变、EGFR扩增对TTFields治疗组的PFS(PTEN突变,HR=0.15,95%CI=0.034~0.63;EGFR扩增,HR=5.67,95%CI=1.455~22.05)的影响有统计学意义(均P<0.05)。TERT突变对TTFields治疗组OS(TERT突变,HR=3.96,95%CI=1.308~12.0)的影响有统计学意义(P<0.05)。结论 TTFields治疗可以显著延长患者的生存期。PTEN突变,EGFR扩增是独立预测患者对TTFields PFS的潜在分子标志物,TERT启动子突变是预测TTFields患者OS的潜在标志物。

泸宁鸡MYOZ2基因的分子特征及其在不同日龄腿肌中的表达

旨在研究雄性泸宁鸡MYOZ2基因的分子特性及其在不同组织的表达谱和不同日龄腿肌中的表达水平,探讨该基因对泸宁鸡生长发育的影响.通过RT⁃PCR技术获得MYOZ2基因的CDS序列并进行生物信息学分析,利用qPCR技术检测MYOZ2基因在泸宁鸡的心、肝、脾、肺、肾、胸肌与腿肌组织中的表达差异情况,以及在不同日龄腿肌中的表达差异情况.结果表明,泸宁鸡MYOZ2基因开放阅读框(ORF)长度为792 bp,可以编码263个氨基酸;泸宁鸡MYOZ2蛋白质主要存在于细胞核内,其二级结构中无规卷曲所占比例最高;与其他物种如原鸡、火鸡、珍珠鸡、蜂鸟、雨燕、麻雀、中国仓鼠、牛、羊、猪及人的核苷酸序列进行对比,与原鸡同源性最高,为100%;与人、中国仓鼠、牛、羊、猪等物种的亲缘性较低,说明MYOZ2基因在同种属间进化较为保守;经组织表达谱的分析,MYOZ2在心脏中的表达量显著高于除脾以外的组织(P<0.05);在20、36、51、94 d日龄腿肌组织中都有表达,其中MYOZ2基因在20 d中的表达量最高,显著高于51 d和94 d日龄腿肌(P<0.05).此研究为进一步了解MYOZ2基因在泸宁鸡公鸡生长发育等生理功能调控中的作用提供理论依据.