2023年11月29日,浙江大学医学院基础医学院杜艺岭研究员和中国科学院深圳先进技术研究院周佳海研究员合作在《美国化学会志》(Journal of the American Chemical Society)上发表了最新研究成果论文“Conserved enzymatic cascade for ba...2023年11月29日,浙江大学医学院基础医学院杜艺岭研究员和中国科学院深圳先进技术研究院周佳海研究员合作在《美国化学会志》(Journal of the American Chemical Society)上发表了最新研究成果论文“Conserved enzymatic cascade for bacterial azoxy biosynthesis”(DOI:10.1021/jacs.3c12018)。该研究以微生物来源的多种氧化偶氮类(azoxy)药源分子为研究对象,揭示了生物合成代谢产物中氧化偶氮基这种重要的功能基团形成的生物化学机制。研究人员发现,细菌来源的VlmO蛋白是一类新型的膜结合氮-氮键合酶,而VlmB是一类具有双铁中心的氧化偶氮合酶。VlmO和VlmB共同催化了一个由从肼到偶氮、再到氧化偶氮(hydrazine-azo-azoxy)的酶促反应序列从而得到氧化偶氮产物。进一步的基因组大数据挖掘和酶学表征实验表明,该合成代谢途径在细菌基因组上广泛存在。该研究成果不仅揭示了长期以来氧化偶氮类天然分子合成代谢的生化基础之谜,而且也为通过基因组挖掘方法精准发现该家族的新活性化合物提供了基因标记。展开更多
为了研究酶活性中心功能基团的性质,从槐猪精液中提取N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶(EC3.2.1.52,简称NAGase)的电泳单一纯酶制剂,试验采用动力学和化学修饰的方法进行研究。结果表明:在37℃条件下,酶活性中心解离常数p Ke值为5.29,解离热...为了研究酶活性中心功能基团的性质,从槐猪精液中提取N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶(EC3.2.1.52,简称NAGase)的电泳单一纯酶制剂,试验采用动力学和化学修饰的方法进行研究。结果表明:在37℃条件下,酶活性中心解离常数p Ke值为5.29,解离热焓ΔHo值为30.46 k J/mol,酶活性相关的可解离基团是咪唑基;在特定条件下,通过对酶分子基团的特异性修饰可知,对酶分子链内二硫键、巯基及吲哚基的修饰会使酶的活性显著下降。说明这些氨基酸残基也是该酶的功能基团,而ε-氨基可能与维系酶分子构象有关,胍基则被修饰后对酶活性没有影响,不是此酶的功能基团。展开更多
经Tris-HC l缓冲液(pH 8.6)抽提,正丁醇脱脂,硫酸铵分级沉淀分离,DEAE-Sepharose Fast F low和Sephacryl S-200柱层析,从黄鳝内脏中提取出电泳纯的碱性磷酸酶。用PCMB,NBS,PMSF,TNBS,SUAN,DTT及IAA在一定条件下选择性修饰该酶的各种氨...经Tris-HC l缓冲液(pH 8.6)抽提,正丁醇脱脂,硫酸铵分级沉淀分离,DEAE-Sepharose Fast F low和Sephacryl S-200柱层析,从黄鳝内脏中提取出电泳纯的碱性磷酸酶。用PCMB,NBS,PMSF,TNBS,SUAN,DTT及IAA在一定条件下选择性修饰该酶的各种氨基酸残基,并对酶活力的变化作出测定。结果表明,PMSF,NBS,TNBS,SUAN和DTT的修饰能显著抑制酶的活性,且酶活力降低程度与修饰剂的浓度相关;IAA和PCMB的修饰不表现对酶的抑制作用。初步认为,Ser,Lys和Trp残基为黄鳝碱性磷酸酶的必需功能基团,部分二硫键对保护酶的催化能力是必需的。展开更多
文摘2023年11月29日,浙江大学医学院基础医学院杜艺岭研究员和中国科学院深圳先进技术研究院周佳海研究员合作在《美国化学会志》(Journal of the American Chemical Society)上发表了最新研究成果论文“Conserved enzymatic cascade for bacterial azoxy biosynthesis”(DOI:10.1021/jacs.3c12018)。该研究以微生物来源的多种氧化偶氮类(azoxy)药源分子为研究对象,揭示了生物合成代谢产物中氧化偶氮基这种重要的功能基团形成的生物化学机制。研究人员发现,细菌来源的VlmO蛋白是一类新型的膜结合氮-氮键合酶,而VlmB是一类具有双铁中心的氧化偶氮合酶。VlmO和VlmB共同催化了一个由从肼到偶氮、再到氧化偶氮(hydrazine-azo-azoxy)的酶促反应序列从而得到氧化偶氮产物。进一步的基因组大数据挖掘和酶学表征实验表明,该合成代谢途径在细菌基因组上广泛存在。该研究成果不仅揭示了长期以来氧化偶氮类天然分子合成代谢的生化基础之谜,而且也为通过基因组挖掘方法精准发现该家族的新活性化合物提供了基因标记。
文摘为了研究酶活性中心功能基团的性质,从槐猪精液中提取N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶(EC3.2.1.52,简称NAGase)的电泳单一纯酶制剂,试验采用动力学和化学修饰的方法进行研究。结果表明:在37℃条件下,酶活性中心解离常数p Ke值为5.29,解离热焓ΔHo值为30.46 k J/mol,酶活性相关的可解离基团是咪唑基;在特定条件下,通过对酶分子基团的特异性修饰可知,对酶分子链内二硫键、巯基及吲哚基的修饰会使酶的活性显著下降。说明这些氨基酸残基也是该酶的功能基团,而ε-氨基可能与维系酶分子构象有关,胍基则被修饰后对酶活性没有影响,不是此酶的功能基团。
文摘经Tris-HC l缓冲液(pH 8.6)抽提,正丁醇脱脂,硫酸铵分级沉淀分离,DEAE-Sepharose Fast F low和Sephacryl S-200柱层析,从黄鳝内脏中提取出电泳纯的碱性磷酸酶。用PCMB,NBS,PMSF,TNBS,SUAN,DTT及IAA在一定条件下选择性修饰该酶的各种氨基酸残基,并对酶活力的变化作出测定。结果表明,PMSF,NBS,TNBS,SUAN和DTT的修饰能显著抑制酶的活性,且酶活力降低程度与修饰剂的浓度相关;IAA和PCMB的修饰不表现对酶的抑制作用。初步认为,Ser,Lys和Trp残基为黄鳝碱性磷酸酶的必需功能基团,部分二硫键对保护酶的催化能力是必需的。