目的基于网络药理学及分子对接技术,预测清肺养阴药对北沙参-玉竹改善卵巢早衰(Premature ovarian failure,POF)的关键靶点及作用通路,并通过动物实验验证有关结果。方法通过人类在线孟德尔遗传数据库(Online Mendelian Inheritance in ...目的基于网络药理学及分子对接技术,预测清肺养阴药对北沙参-玉竹改善卵巢早衰(Premature ovarian failure,POF)的关键靶点及作用通路,并通过动物实验验证有关结果。方法通过人类在线孟德尔遗传数据库(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)、Drugbank、GeneCards数据库收集卵巢早衰相关靶点;通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Database and Analysis Platform,TCMSP)筛选北沙参-玉竹药对的有效活性成分,SwisstargetPredicition数据库中预测作用靶点。利用STRING平台对药对-卵巢早衰交集靶点进行蛋白质相互作用分析,根据拓扑参数筛选关键靶点。基于Metascape数据库、Cluego插件进行基因本体(Gene Ontology,GO)分析和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析。通过Autodock vina 1.1.2软件对关键靶点和有效活性成分进行半柔性对接。使用雷公藤多苷片诱导小鼠卵巢早衰疾病模型进行实验验证。结果得到药对16个有效活性成分,协同作用于38个靶点,参与血管内皮细胞迁移、磷脂酶活性的正调控,自噬、细胞凋亡的负调控,以及肽基-丝氨酸磷酸化的调节、雌激素代谢等44个生物学过程,涉及PI3K/Akt/mTOR、Foxo、HIF-1、TNF、IL-17、MAPK、NF-κB等51条信号通路。分子对接结果显示关键靶点与有效成分间均有较强的结合能力。动物实验结果证明,北沙参-玉竹可通过上调蛋白激酶B(Akt)、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K),下调磷酸酶-张力蛋白基因(PTEN)、核转录因子-κB(NF-κB)的表达改善卵巢功能(P<0.01),验证了网络药理学部分预测结果。结论北沙参-玉竹可通过上调Akt、PI3K,下调PTEN、NF-κB的表达改善卵巢功能,初步证实北沙参-玉竹治疗卵巢早衰的部分作用靶点,为其临床应用及作用机制研究提供了思路和依据。展开更多
文摘目的基于网络药理学及分子对接技术,预测清肺养阴药对北沙参-玉竹改善卵巢早衰(Premature ovarian failure,POF)的关键靶点及作用通路,并通过动物实验验证有关结果。方法通过人类在线孟德尔遗传数据库(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)、Drugbank、GeneCards数据库收集卵巢早衰相关靶点;通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Database and Analysis Platform,TCMSP)筛选北沙参-玉竹药对的有效活性成分,SwisstargetPredicition数据库中预测作用靶点。利用STRING平台对药对-卵巢早衰交集靶点进行蛋白质相互作用分析,根据拓扑参数筛选关键靶点。基于Metascape数据库、Cluego插件进行基因本体(Gene Ontology,GO)分析和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析。通过Autodock vina 1.1.2软件对关键靶点和有效活性成分进行半柔性对接。使用雷公藤多苷片诱导小鼠卵巢早衰疾病模型进行实验验证。结果得到药对16个有效活性成分,协同作用于38个靶点,参与血管内皮细胞迁移、磷脂酶活性的正调控,自噬、细胞凋亡的负调控,以及肽基-丝氨酸磷酸化的调节、雌激素代谢等44个生物学过程,涉及PI3K/Akt/mTOR、Foxo、HIF-1、TNF、IL-17、MAPK、NF-κB等51条信号通路。分子对接结果显示关键靶点与有效成分间均有较强的结合能力。动物实验结果证明,北沙参-玉竹可通过上调蛋白激酶B(Akt)、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K),下调磷酸酶-张力蛋白基因(PTEN)、核转录因子-κB(NF-κB)的表达改善卵巢功能(P<0.01),验证了网络药理学部分预测结果。结论北沙参-玉竹可通过上调Akt、PI3K,下调PTEN、NF-κB的表达改善卵巢功能,初步证实北沙参-玉竹治疗卵巢早衰的部分作用靶点,为其临床应用及作用机制研究提供了思路和依据。